Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25396 LG6 20179946 20183685 PREDICTED: transcription factor ILR3-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 20180062 5_prime_UTR_variant
G/A 20180266 intron_variant
A/G 20180267 intron_variant
T/G 20180298 intron_variant
G/A 20180465 intron_variant
A/T 20180947 intron_variant
A/T 20181127 intron_variant
T/A 20181185 intron_variant
T/C 20181234 intron_variant
A/C 20181240 intron_variant
A/T 20181241 intron_variant
T/C 20181261 intron_variant
T/G 20181297 intron_variant
A/G 20181451 intron_variant
T/A 20181594 intron_variant
G/A 20181816 intron_variant
A/G,* 20182296 intron_variant
G/T 20182374 missense_variant p.Arg83Leu
A/G 20182678 synonymous_variant p.Leu147Leu
C/A 20182841 intron_variant
C/T,A 20182904 intron_variant
T/A 20182906 intron_variant
G/T 20183015 intron_variant
A/G 20183269 missense_variant p.Glu166Gly
A/G 20183276 synonymous_variant p.Leu168Leu
A/C 20183356 missense_variant p.Gln195Pro
G/T 20183359 missense_variant p.Gly196Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25396.1
MVSRENTNWLFDYGLIDDIPVPDASFTVPSSGFTWPPNALNATSNVGVEADGSLVDSDGLKESGSKKRVRSETCAASSTKACREKLRRDKLNDKFVELGSILEPGRPTKTDKAAILIDAVRMVTHLRGEAQKLKDSNQGLQEKIKELKAEKNELRDEKQVLKAEKEKLEQQLKSLNAQPSFMPPPAAIPAAFAAQGQAHGNKLVPFISYPGVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA*


CDS Sequence:
>Vu_25396.1
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Promoter Sequence:
>Vu_25396::LG6:20177946-20179946(+)
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Gene Sequence:
>Vu_25396(+)
AACTTCAAAACGTGCAAGCAAACCTTACGCACACCACACACCTACGCACACCACGCGCAGCCCCTGGAAAACAAAGCAAAAACGCGTTTTCCGTGCGGAAAATCCTCAATTTTCCGGGAATCGAATCTGCACAATGGTTTCCCGGGAAAACACCAATTGGCTCTTTGATTACGGCTTGATAGATGATATTCCCGTCCCGGATGCCTCCTTCACCGTCCCTTCCTCCGGCTTCACATGGCCTCCTAATGCCTTGAATGCCACTTCCAATGTCGGGTATATGCAGATCGTTTTGCCAATTGCCTTTTCCTTTTCAAGCTTTCGATGCTGTATTCTCTGATTTTTCTCCTTGACGTGATTAGGGTTTGTGCTTTGTTGTTTGATTGGTTTGACTTTGTGAATATTTGATTTTAGGGCTGTGTTTAGGAAGCTCTACGGCTGTAGGATTTTGTCTTTTCCAATACATGTGATTTATTTATTTATTTTATTTTTTTGATTGGGAGGTTGTATTTGATGATTTTTGTTTTTAATGTTGCGTGATGGAATCTGGCCTAAAGGGGTGTATAATGTTATGTTTGAATTGAAGTTTGAAAAATGCTCTGATGAATTTTGATGTACTAAATGAAGAAGAAGAAAACTGTTTCTTTTAGAGGAATGGTACTTTTAAACTCTCCCAACTTCAATCCAGACATGGACTGGCTGGAATTAATTCTAGCGCCTCGGGACATTCTTGCATGAGATAGCTTTAATTTCTTAATTGACTGTTTAGATTATTCTATTGATGTATTTTTCTGTCTTGTTTTCAAGGCAATGTGTTGTTTTGGAACTGTGGATTGTCTTAATTCAAGCTTTTTTAATCAATATTTGTGTAATTATGTTGATTGTATATGAAGTTGAAGATCATTTTCTACCTCCTAGCTAGGTGGTTAGTTACTTTCTTAAGTTATAGGGTCATCTTAATTCTCATATAGGAGTCCAGCTAGGTGGATCAAATGAAGATGTGCATCAGTCATAACTTATAATCGTGGAGGTTATTGTTTAAGACTAGGTGAGATTATTCTGTGTAGTTATGACTTACAATTTTTAATGCACTAATGAAGTGAATGTTATGGATAAGAAATGAATGTGTAAGAGACTAGAATGATGAGGTGAATCATTGGATTGGTGAAAGTATGCAATGAGAGAGGTTTGTAAGAGGAGAAGGGAATATTCTAGTTTGTGTTATGAGACACCATTAAGAAATGTGTTTTGTAAATGGTTTTACTAAAATTTGGCTACTGCTAGAGCCAAATAAAGCAACACCTGAGATAAATTAGATTATTGTTCTAACTCCCAATAGTGAAATTTTCCTCTGTAGGTTTTAACAATATGAGAATGAGAAATGATTTTATACATAATCATGCTGATAATTTATCAATTCTGTAATGAATTTTGTAAGATTCCTATAAAATATGGAATGCTACATTTTTAATACCATTCTTGTTAATATATTCTTATGTAAAGCATATATTTCAATTCCCGTATACTCAAATGTTTTCTTTTACATTTTTTGTCACTTGAGGCCATACACTTTTTGTTTGTCAAACATGGCTTCTGAAATTGTTCATAATACATTATTCAGATTTCTATCTACCTCTTTATACATGTCCTCTTAATAAACAATTTCTTTTACTGCCTTGTCTTTCTTACACCATTATGTTCTCCTAGTGTTGAAGCTGACGGTTCACTGGTGGATTCTGATGGTCTCAAAGAGTCTGGCTCAAAGAAGAGGTACACAGTGTTCTATTAGCCTTTCATTTTTATTGAATGAAATAATTTTGTTAAAGGAAAAAAAAGAATCAACATGTGTATCTTATTCTGAAACACCTCTTCTGTAGCTTTTTTTTCTTTGCTTGATTTCCTAATCTCTCTTTTGCTTGAGTGCTTCTTTATATTACAAGTATTAAGATGATTTAGTGTTTATTTTTTTCGTTTTCTTTCCTTTTATACGGTAATAAATTAATAATGATTGCAGAATGAAGTGAAATCTTGAGGCAATACTAGTTGCTTAACTAATTTACAAAATTTGCTAGGCAATTGTCATAGATTATCTTCTATGAACTGACAGATGTGTAGTAATGTAGTGCAGTCATAGGGTGAGGCTAATTGGTGCAGTCAACATATTGCAAATCCTTGCATTGCATGTATTATCTTTTTCGAGTATAACATTATTTTTCTTGGCATAAGATCAGATTTCCAAAATCATTTTTCTTGTCTTACATCATTGACTCACTAATTTGGAATACAAAATTTGATCAAATGATTAAACTTCTGAAAAAGGAGTGAATCCAATCTAGATAGCTTTTGCATGGAAAAAGTTATATCCTCATATTCTTGTTCATTTGCAGGGTTAGATCGGAGACATGTGCTGCTTCTAGCACCAAGGCATGTCGGGAGAAGTTGCGAAGAGATAAGCTTAACGACAAGTATACTTTCTACTTCAAAATTTCAACTAGTTCCTGTCTTTCTATACTCATCTTGAGCTTTTATGTGAATATGTAGCTGAGGCATGTACCTAATATGATGGACATTGTTAGGTTTGTTGAATTGGGCTCCATTTTGGAGCCTGGAAGGCCTACGAAAACTGATAAGGCTGCTATCCTGATTGATGCTGTCCGTATGGTGACACACTTACGGGGTGAAGCGCAGAAGTTGAAAGACTCTAATCAGGGTCTTCAAGAAAAGATTAAAGAGTTAAAGGTGATACTCATATTTGAATGACTTTTTGGGTTGGGAGTTACATATTGTGGATCACTTGGGGAGAAATTTGTTTAAGGAAGTATTTCCTGTTTGAGAAATGATAACAACATACTCTACTATAAGTTAGATATTTTGGAAATTCACAAATTTTGGTTGGTTCCACTACTTTTTTAGTGATTCTCTCCTGATATTGTAGTTCTCAAGAATTTTAGACAATCATAACGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAGAGAGTGTGTTCCTAGTTCTCCTCTTTCTGTTTTCACATTAAATTACATAAGTTCCACCCTTATTTTTATTGTTTTCAAAGATTTATATAGCAACGAAGCAAACTGTTTCCTATCAAACTGTTGAAATAAAGTGGAAGCAAGATGACATTTCTGTAACTAAAGTAAAAGTAGTAACATATTTTTCGAATTCAATGGCAGCGTAAGTTTTCTGCCTCCACTTTTTTTCCTAACAGACTGAAAAATTCACAATTCTAATTGTTTCTGAAATCAAATTCCTTTCATGTTGTGTAGGCTGAGAAGAATGAACTTAGGGATGAGAAACAGGTGCTCAAGGCAGAGAAGGAGAAGTTAGAGCAGCAGCTGAAATCTTTGAATGCACAACCCAGTTTCATGCCTCCCCCTGCTGCTATCCCTGCTGCATTTGCGGCGCAAGGCCAAGCCCACGGAAACAAGTTGGTACCTTTTATTAGTTATCCAGGAGTTGCAATGTGGCAATTTATGCCACCTGCTGCAGTGGATACCTCACAGGATCACGTACTCCGTCCACCAGTTGCCTAAGCTGGCACTGTACAATTCTCTGAGCTTGCATTTTGGCCCAGAGTTGTATCCATTTTACCAATACCTTCTTGGCTTTGTTAGTTCTCTTCCAAGTATTCTAACTGGACCCAGTGGTGACAACGGTCTGTATTTGGCATATGATACTATTATGATTAATGTTGTTATTTGCTTGTAAATGTTAAATAAGCTTGTCTGTCTAGCT