Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25381 LG6 19699321 19704161 PREDICTED: calcium/calmodulin-regulated receptor-like kinase 1 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 19699397 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
T/C 19699398 5_prime_UTR_variant
G/A 19699521 5_prime_UTR_variant
T/A 19699679 5_prime_UTR_variant
C/G 19699709 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/C 19699850 5_prime_UTR_variant
C/T 19699939 intron_variant
C/G 19699962 intron_variant
T/C 19700061 intron_variant
T/A 19700066 intron_variant
C/T 19700086 intron_variant
T/G 19700135 intron_variant
T/G 19700214 intron_variant
G/T 19700387 intron_variant
G/T 19700600 synonymous_variant p.Val16Val
G/T 19700670 missense_variant p.Gly40Cys
G/A 19700826 missense_variant p.Gly92Ser
T/G 19700883 intron_variant
G/C 19700941 intron_variant
G/C 19700996 intron_variant
A/T 19701019 intron_variant
C/G 19701052 intron_variant
A/T 19701068 intron_variant
T/G 19701101 intron_variant
C/G 19701119 intron_variant
A/T 19701129 intron_variant
A/C 19701136 intron_variant
C/T 19701197 intron_variant
G/A 19701343 intron_variant
T/A 19701344 intron_variant
G/A 19701413 synonymous_variant p.Thr117Thr
C/T 19701720 intron_variant
A/T 19701853 missense_variant p.Gln181Leu
C/G 19701931 intron_variant
G/A 19702105 missense_variant p.Gly222Asp
C/A 19702106 synonymous_variant p.Gly222Gly
C/A 19702196 splice_region_variant&intron_variant
G/C 19702338 intron_variant
A/G 19702347 intron_variant
A/T 19702354 intron_variant
C/T 19702361 intron_variant
T/A 19702370 intron_variant
G/C 19702452 intron_variant
C/T,* 19702482 intron_variant
C/A 19702557 intron_variant
T/C 19702656 synonymous_variant p.Ala270Ala
A/T 19702847 intron_variant
T/C 19702858 intron_variant
A/G 19702917 intron_variant
A/G 19702931 intron_variant
T/A 19702940 intron_variant
C/T 19703016 intron_variant
A/T 19703017 intron_variant
A/C 19703026 intron_variant
C/T 19703306 intron_variant
A/C 19703438 intron_variant
G/A 19703549 intron_variant
T/G 19703556 intron_variant
A/G 19703601 intron_variant
C/T 19703681 synonymous_variant p.Phe343Phe
G/A 19703698 missense_variant p.Ser349Asn
G/A 19703712 missense_variant p.Val354Ile
G/A 19703777 synonymous_variant p.Val375Val
G/A 19704050 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25381.1
MREESIGIVIGVSIGVVIGLVLAIFAFFCHRYHRKRSQIGNSSSRRAATIPIRAHGADSCTILSDSTLGPESPIKSGRYGLPFWLEGFKKSGNMLPASGLPEYAYKDLQKATHNFTTVIGQGAFGPVYKAQMSTGETVAVKVLATNSKQGEKEFHTEVMLLGRLHHRNLVNLVGYCAEKGQHMLVYVYMSNGSLASHLYGSDVNEALCWDLRVNIALDVAKGLEYLHDGAVPPVIHRDIKSSNILLDQSMRARVADFGLSREEMVDKHAAIRGTFGYLDPEYISSGTFTKKSDVYSFGVLLFEIIAGRNPQQGLMEYVELAAMNIEGKVGWEEIVDSHLQGNFHVKELSEVATVAYKCINRAPNKRPSMRDIVQVLTRILKSRHHGNHHKSSLSATDEVFIDPDQLETMISVTDHRREESKDNPATEVYDE*


CDS Sequence:
>Vu_25381.1
ATGAGAGAGGAGTCAATAGGGATAGTTATTGGGGTTTCCATAGGGGTGGTTATTGGACTGGTTTTGGCAATTTTTGCATTCTTCTGCCACAGGTATCATCGGAAGCGTTCACAGATAGGCAATAGCAGTTCTAGAAGGGCTGCTACCATTCCAATCCGCGCACATGGTGCTGATTCTTGCACCATTCTATCAGACTCAACCTTAGGTCCAGAGTCACCCATAAAGTCTGGAAGGTATGGCCTTCCCTTCTGGCTTGAAGGGTTTAAGAAGAGTGGTAACATGCTCCCAGCATCTGGCCTACCTGAATATGCATACAAGGATTTGCAGAAAGCAACACATAATTTTACAACGGTCATAGGACAAGGTGCATTTGGTCCTGTTTATAAAGCTCAGATGTCTACTGGTGAGACTGTTGCAGTTAAAGTTCTTGCAACTAATTCTAAGCAAGGGGAGAAAGAATTTCACACAGAGGTCATGTTGTTGGGAAGGTTACACCACAGAAATCTGGTGAATTTGGTTGGATATTGTGCAGAAAAGGGGCAACATATGCTTGTATATGTATACATGAGTAATGGTAGCTTGGCATCCCACTTGTATGGTAGTGATGTGAATGAAGCACTGTGCTGGGATTTGAGGGTCAACATAGCTTTAGATGTGGCAAAAGGCTTGGAGTATCTTCATGATGGGGCAGTTCCCCCTGTAATCCATAGAGACATCAAATCTTCCAATATTCTGTTGGATCAATCCATGCGAGCCAGGGTTGCTGATTTTGGACTTTCAAGAGAAGAGATGGTGGACAAACATGCAGCTATTAGGGGTACCTTTGGCTATCTTGACCCTGAATATATATCTTCAGGAACATTCACCAAGAAAAGTGATGTATACAGTTTTGGAGTATTGCTCTTTGAAATTATAGCTGGCAGAAATCCTCAGCAGGGTCTTATGGAATATGTTGAGCTTGCAGCAATGAACATCGAGGGAAAAGTTGGGTGGGAAGAGATTGTGGATTCTCACCTTCAAGGAAACTTCCATGTGAAGGAACTGAGTGAAGTTGCAACAGTAGCTTACAAATGCATCAACCGTGCACCAAATAAACGTCCTTCCATGAGGGACATTGTGCAAGTGTTAACAAGGATCCTTAAATCAAGGCACCATGGGAATCATCACAAGAGTTCCTTGTCAGCAACAGATGAAGTTTTCATTGATCCTGACCAGCTAGAGACCATGATTTCAGTCACTGACCACCGGAGAGAAGAATCTAAGGATAATCCTGCGACAGAGGTGTACGATGAGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_25381::LG6:19697321-19699321(+)
TTGAAATTAGAAAAAATTGGGAGGTGTAGAATGAACTTAGTGAGGTTCAGGGAGAATCACATGTTTTGTTTTTGGAATCCACTGTGATACATTTTGATCTCAAACTTAAAAAATAATATATGTAATTCTTTTCGTTTAATCGTGTTAGATCTTTTTTATATATTAAATGATATTTCATGTTGATATTTGAGTTGAAATATGATAAATTATGTAAACAATTCATATGTTGTTGGATTAAAAAGACTATATTCATTATTTTTAAAAATTGAAAATCAAAATATATTAAAATTTAAAAGAAAACACAAATTTCAACTTCGACTAAACATTGGTTAGATCACGTGACTCATCCTCATTTTTTGGGAGAAATCTCAAATCAACCCTCTTTTTTATGTGTTTCAATTTAGTTCCTGTTTAGGAAAATTTGATATCATATGCAAAAAGTGTCATGTGTCAATTCGTGATTTGTTTATTTAATTTTTTAATACCTTTTTAATTATATTTTTTTAATTTTCATGAAAATAAAAAATTGTGACGTGTTAAGCTCACAACATACTATGTGACAACAACATTGTGATATGATAGTGACAATGCTACATGTCATTATCACACTAAATATATTGCCTTAGTTTCAATTTTGTTATTTTTATTTTATCTCAGTCATAATTCTTTTTAAAATTAAACAATTTCGTATTTTTTCAAGTTAAAACAAAATTTAATTTTGTATAAATATTATATAAATATTTTTATTAAAATTTTATTAAATATTTTTATTTAAATTTATACTTTAAAATTGTTTTAAAGTTATTAATACAAAGAAATCTTAATAGAAAAAAATTCAAAATTAATTTTAATTAGCTAAACTTGTTTATCGATTACATTTTATAAAATAAAATAAACTTATAAACTTTTTCAATTATTTAAAATAATTATATACTTTTAAAATATGCAAACTTCAATAATTTTTATAAGAGTTAAATATGTTTTTAGTCCCTGCCGTTTCTGGTTTTCATCCCTCTTTCAAAGTAAGGTACAATTTGGTCCTCATTCTTTTCGAAACGTGCGTTTTAGTCCTCGGAATTTTGGTTTTAGTCCTCATTTGTTGCTAAATGAGGACCAAATTTTTAAACAGTGTTTAGTTTTCGAGGACTAAAACGAATGTTTTCGAAAAGAATGAGGACCAAATTGTACCTTACTTTGAAACAGGGACGAAAACCAGAAACGGCTAATAGTTTAGGGACTAAAAACATATTTAACCCTATTTATAATTATATATTTTTAAAATGTGTAAAATTCAATATTTTTATACAAATGTTTGAATGAGTTTAAAAATAATAATTTTACAAATTCAAAAGAAAATTTTGAAAATAATTTTAAACAATTTTATAACAATTTAAAACAAATAAATTTAAATTTTGAAAACAATTTTAAATAAAATTTAATGTAAAATAGAAATATAAATAAATTTAATATTATTAAAAATATTTAATAAAAATATCAATATTAATATAATTATTTGTATACAAAAACTAAATTTCGTTTCAATTTACAAAAATAAAATTATATTATTTTAAAAATATTGGAACTAAATTTAAAAAAAATAAAAATATATGAATCAAATTATGACTAAAATAATGAAACTTAACATTACAATAACATGAAACATTATTAGTGTTACTACTCCATATATGACACGATATTAATTTAATAAGTAATAATATTTTTATTTTATAATTAAAAAAAATAAAAATAAAGATAAAAAGAAGGGATACTCTTTAACTTTATAATAAAAATCAAATTAATATGTAATTAAAAATGACCGATTGATTTAAAAAAAATGGAGAGAAATATTATGATATAACAAAACATTTTATCCAATAAGAATTTTCGTAAAGGATAATCATTAATTAAACTCGTTGACGCTTTTAAAGAAGAAAGATGCTTGGAAAAGGTTTAGCATTGGTCGCTGGAAAATTTCCAAGGGGCACGAGTTTACCTAATCA


Gene Sequence:
>Vu_25381(+)
AAGGTGGCATGAATATGAAGAAACAGAAGTGAGAACTTCATACATCATGTCCAGAACAAGTAAGCAAGAATCAAACATGATATCGTGATGATGTGGGCATTGCAAGCATACATGCATATACAACACTCACAAAAATTTCGGTGCGGTTTGTTCACAGCGTGGAACCAATCATTGCTGTGCAGAAGAGAGAAAAAGCAATGGATGAACAGAAGGGGTCCTTCAGCAAATGATCAAGTTTGAATCTACAACAAAGTGAGGGTCCCACATGTCCACCTTGTTCAAAGTTCAAACATCCCTCGCAAGTGCGTGTGTGTGTGTGTGCACTTTATGCTTTTGTTGTTGTAACAACAGCTCCTGCTCCACCTTCATCAGATTCTTCAATTCTTCTCTCTCAGCTTCCTTCTTGGATTCTCACTCACATTTGCTTCACTTTTTTTATCCTTCTCACTGCCACACTGTTGTTTTTGGAGTTCTGTGCTAAATAAAGCCTGTGACTGTCTCAGGGTTACCTCTGTTGTTTTTTCACCTTGTATGAACTGGTGAGTTTATGGTCCAACATGGTACGCGTTTTTCTAGAACATTTTTTTTTGGCCTAACGTTATTGCTGTCGGTGCTTTTCATCTGTCGGGCAATGTTTGTAACGGTGTTTTGTTTTAGCGTTGTCATTTGATCAAAGAGTTGAGTCGTTTTTCATAAATCTCAAAATTTTCTTGTGTTCTCTTTTGGCACAGTAAGATTTTTCTTGTAGAAAGAATTCAGAAAAAGCAAAATATGTATATTTCACTTGGGGAAAATATTGAATTGAACTCCATTTTCGTTGCGTATTTTTTCCCCCTTATGCTGCTTCACCTTTTTTGGCCTTTGATGCCATTCCTTGATTTCTGTATAACTGTTGTTTTGACTAATTGACCTTTCGGATTTACAAGCTGGGTTGTTATCTTAAATCTTTCATTTAGTATTTTTTACAATTTGCTCTGTTATTCAACACAGTTTTGCCAAGCTGTAGCTTTTAAGTTTTTGTTCGGTGTTGTGGTTTTCAACAATGTATTGAAAAGAATTTATTGGGGGCAGTGAAATCAGGAGTAATAGCCTAACAAATCAAGTTTCAAGATTAACATTTACTATGTTATTAAATATTAAGTATGATTTGTGGTTTGTTTATGTATCTTTTGGCAGACCTATGAATGGATTGGAAGATCAACAGGGAACAATAGCAAAGAAGTGAAGAGGAAATGAGAGAGGAGTCAATAGGGATAGTTATTGGGGTTTCCATAGGGGTGGTTATTGGACTGGTTTTGGCAATTTTTGCATTCTTCTGCCACAGGTATCATCGGAAGCGTTCACAGATAGGCAATAGCAGTTCTAGAAGGGCTGCTACCATTCCAATCCGCGCACATGGTGCTGATTCTTGCACCATTCTATCAGACTCAACCTTAGGTCCAGAGTCACCCATAAAGTCTGGAAGGTATGGCCTTCCCTTCTGGCTTGAAGGGTTTAAGAAGAGTGGTAACATGCTCCCAGCATCTGGCCTACCTGAATATGCATACAAGTAAGAGTTTGTTTCTTATATGAACTTGCCTTCATTTGCCTTTCTTTTTGTTTTGGGAAGAGCCTATTTTAGTCTGCTTGAGTCTAAGAACTATAATTTTCTCTTTATTTTCTCATAATGGAATATGAAAATGGTCCCTTAAACTTGCAATGCATGCTTCTTGAATCATCATGATCTGTATACTATAATCAGAAATAGACTCAAGTTATGAGGTTGAAACAGTTTGGAGCCTTAGTTTTAATACCACTACGCATTGTACATACTAAAATAGATGCTTGATTCGGCTTTAGGAATGAACATTTGGACTCATGCTTGATATGCATCTGCCACATAAATGCATATGCAAACATAAGTTTTAACCTATCATATCTGTCTTTTAGGATAAGCCAAAAGTAACTGTTTTGTTGGATATTTTTAATTTTTAGTGACTACAAATTGTAACCAAGTGAAATTAAAAATGTTTGACTATGTTTGTCATTCTATCTATTGAATGTTTTATTTAAAATTCAGGGATTTGCAGAAAGCAACACATAATTTTACAACGGTCATAGGACAAGGTGCATTTGGTCCTGTTTATAAAGCTCAGATGTCTACTGGTGAGACTGTTGCAGTTAAAGTTCTTGCAACTAATTCTAAGCAAGGGGAGAAAGAATTTCACACAGAGGTTGGTTGGCACTGTCATTTTCCATTACTTGGCCACATCATCAATATCATAAATAAGAAAAGTTTATGTTGTTTCTGCTGTGCTACTTCAGATAATCAGTTACTTTTAGATGAAGTTAAGGACTCTTGGAGTAACAGATGATATTGCAGTTTTACAGTCCTTATCATATTCATTCATTTTCTGCACCGCCTTTCTTTTCACTCCAGGGTAATTTCCAATTGCAACTTTTAATGTTCTACTTTTTCTCAGGTCATGTTGTTGGGAAGGTTACACCACAGAAATCTGGTGAATTTGGTTGGATATTGTGCAGAAAAGGGGCAACATATGCTTGTATATGTATACATGAGTAATGGTAGCTTGGCATCCCACTTGTATGGTAGTAAGTTATCTATCTCACCTTTTGAATGACATGTGTACACTGTTCTTCTATACAAACTTTGGTCCCTGAATGTGTTCACGGATTGCAATAATAGATTGAACAATATGCTTTTCTTGTCTTTATATTCAGGTGATGTGAATGAAGCACTGTGCTGGGATTTGAGGGTCAACATAGCTTTAGATGTGGCAAAAGGCTTGGAGTATCTTCATGATGGGGTAAGTTTCCATGTGATCTGAACCAATCAAACTATAACTTATATATTGCTATAATTGTTTGTATTCTCCCTTCAGGCAGTTCCCCCTGTAATCCATAGAGACATCAAATCTTCCAATATTCTGTTGGATCAATCCATGCGAGCCAGGGTATGTCCTTGTTACTCATCCACCATCTTCTTTATCACTAAAAAAGTAGCTTGTAAATTGCAAGAAACACACACACTATACAGTAGCATTGCAACTTGTCATTGTCAGTTGTTGCTGTCAAGAGTCGAGTCCAGATTCTCTAGTCATTTTTTTTTGTGTTGTCTTGTGTCGATTCTTGAAAATACACTAATGTTGGTATATTAAAATCAATGTCAATCGATATATTTTAAAGGCACAGCATAGGAACAATACCAAAAATTCAGCAAAGAATCCAAATTCGTTCAGAGTCAGATGCTTCTGAATGTTTAATTGTTAATGTTGAATCAAGCAGGTTGCTGATTTTGGACTTTCAAGAGAAGAGATGGTGGACAAACATGCAGCTATTAGGGGTACCTTTGGCTATCTTGACCCTGAATATATATCTTCAGGAACATTCACCAAGAAAAGTGATGTATACAGTTTTGGAGTATTGCTCTTTGAAATTATAGCTGGCAGAAATCCTCAGCAGGGTCTTATGGAATATGTTGAGCTTGTAAGACCTCTTTCTCTCCTTCCACAGCACACTGAGAATAACTGTTAGTGGTTACAATCATAATCATAGGTATATTCTTAGGAGTAGTAGAATGAGTTACTTAAAGTGGTACTTAAATTTTGAGAGTTTCTTCTCTCTAATGATTAGGTTCTCTTCTTGTGCTTAAGTCCTTATATATGTATGTAAAGATAACATTCAAAATTAGGCTGCAATTTTTGAAGAAATCTATTAGGGTCACATCAATATATTGGTTAAAGATATTGGTGTGTCTAATTTATATATGATTTTTTATTTTTGTTATAATAAATATTTTCACTTTCTAATTCAATAATTAGAGTTTGTTAAGAAGAAACTATTAGGTGGTTAGGAATCATCATGGTCCCTCTTGATCGCTTGTGATGAACTAAAAATGTTATTAGTTTCTTTTTTTCTGTAAATTAAAATTTTGAATACATGTTACATCAGATTGATTGGATGAGATCATAATTTCATGAAGATCCATTGAGATTATGAACTCGATACTAAATTATCTAACAATTTAATCTTGTCAAGGCAATTCAATACGGTTCTTAAGATGCTTTTAATATTGTTTTACTGTTGGAATTGAAATTTAACTTCAATAATCTACCTAATAAGATATGCATTAAACACACATTATAAGAGAACTTCCATTCAAGAATGGCCACTTGATGACTCTGTCTGATGAAAACGTCAAATCTTGGTTGAATGAAAGTGTCATGGTGAAGAAATAAAACATCATGCATATTCATTTTGTGGGCTAACCAATGTGATTGATGGATGATTAGGCAGCAATGAACATCGAGGGAAAAGTTGGGTGGGAAGAGATTGTGGATTCTCACCTTCAAGGAAACTTCCATGTGAAGGAACTGAGTGAAGTTGCAACAGTAGCTTACAAATGCATCAACCGTGCACCAAATAAACGTCCTTCCATGAGGGACATTGTGCAAGTGTTAACAAGGATCCTTAAATCAAGGCACCATGGGAATCATCACAAGAGTTCCTTGTCAGCAACAGATGAAGTTTTCATTGATCCTGACCAGCTAGAGACCATGATTTCAGTCACTGACCACCGGAGAGAAGAATCTAAGGATAATCCTGCGACAGAGGTGTACGATGAGTAGAATGTTGTTTCATCGTAACCTCATTTTTTTAGTTAACTTCACCTTTTGATTTTGGATTTGCATGTACATGGTTGTAGATTTGGTTTCTATACGGTTGAGTAGATGTTCCATCTTTTTTTTCTTTGCATTGTCTTGCAGAAATGATACACCCAAATTTGTAAACTAGTACTTTCACTAATGGAAGTGAAGAGAAAGATAATTTTTTCCCAAATT