Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25320 LG6 18252213 18253185 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 18252518 upstream_gene_variant
T/A 18252583 upstream_gene_variant
A/G 18252584 upstream_gene_variant
C/T 18252599 upstream_gene_variant
G/A 18252616 upstream_gene_variant
A/G 18252623 upstream_gene_variant
A/G 18252640 splice_donor_variant&intron_variant
T/C 18252646 missense_variant p.Thr152Ala
C/T 18252649 missense_variant p.Ala151Thr
G/T 18252656 synonymous_variant p.Ala148Ala
G/T 18252697 missense_variant p.Pro135Thr
T/C 18252703 missense_variant p.Thr133Ala
G/T 18252784 missense_variant p.Leu106Ile
G/A 18252809 synonymous_variant p.Cys97Cys
T/C 18252845 synonymous_variant p.Gln85Gln
G/T 18252964 missense_variant p.Pro46Thr
T/A 18253113 splice_region_variant&intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25320.1
MHKSKIDINKYVVINALEPWNLLTLAGELCRGDTEKWFFFSPAQESQAKGGRPSRTTTSRYEKATGSPSSLLPQALPMCLQDRPFNSHPDVVADIENADIWDWDSFSPYSWGIGHQVEPMEESTAEEPSSCLQRNLYPPRRPNLGPNQPSPPRRDDEGDHDASGRATGNKPFVAE*


CDS Sequence:
>Vu_25320.1
ATGCACAAAAGTAAAATAGACATAAACAAATATGTGGTTATCAATGCCTTGGAACCATGGAACCTCCTAACACTTGCAGGGGAGCTTTGTCGTGGGGATACAGAGAAATGGTTTTTCTTTTCGCCTGCGCAAGAGAGCCAAGCCAAAGGAGGGAGACCTAGCAGAACTACAACTTCTAGGTACGAGAAAGCTACTGGTTCACCATCTTCACTACTTCCTCAAGCTCTCCCTATGTGCCTTCAAGATCGTCCTTTCAACTCCCACCCTGACGTTGTCGCTGACATTGAAAATGCCGACATTTGGGACTGGGACTCTTTCTCTCCCTACTCATGGGGCATCGGCCATCAGGTCGAACCCATGGAGGAATCTACAGCGGAGGAACCATCGTCATGTCTCCAACGCAACCTTTATCCACCTCGAAGACCAAATCTAGGCCCAAACCAGCCATCCCCGCCACGAAGAGACGATGAAGGAGATCACGACGCAAGTGGCCGAGCAACCGGAAACAAGCCCTTTGTCGCAGAATAG


Promoter Sequence:
>Vu_25320::LG6:18253185-18255185(-)
AGACGGAGAAGTGTGAGGATATGTGTCGTGAAATTAGAGAGAGAATGTGAGGATTAAGTATTATGGGTTGAAGAAAAGAAAAGAAAAAAATAAATAGAAGAGTTATTATGTGGTGTGTGAGATGAAGTAAGTGAGAGAAGGAGAGGGGTGGTATTATTGAATGCTTCTACGTAAAAGTGAGAGTTAGTGTGTTTGGTGAGTGAAATAGTGGAGTGATGGGTTCCACAATGAGTGAAATTATGTTTATTCATGGTGGATAGATACGTTCAACCTAAAAGTGAAGCCAAAAAAGACATATCTTCTATGTTTGATCAACGCTGCAGTGAATGATGAGCTCTTTTTCCGCATAGCAAACCACACCATGACAGTCGTTGAAGCTAATGTTACATATGTTAATGGGGTGTTTACACCATGGACTTCCCAATTGTGCCTCCCTTCTGCAGTATGTGCAGGTGTAGGACCTTGGAAGTGTAGGGGTGTACGGAGATTTAGAGTTTTAAAAAGGTAAATTAAATTAAATAGTAAAAGTTAAATTAATAAGGATACTTTTGGAACAAAAAAAAATAATGGGGAGGTGTAGGGAGCACTTGGGGTGGTAGAGGGAACAACTCTAAAAAAATAATTCATCCGCTACCCATACAAATATCCGCTTAAAAAATATTCGCAAATATTTTAAAACCTGTGGATATCCGTGGATATCCGCAGATACCCGCAAATATTTAAAAAATATATTTATTTTAAATTATTAAAATAAAATTTAAATAAAATTACAAAAATATATAAAATATAATATAAATTAAAATTTAATTTTAATTAAATTTAACTATAAATATAAATTAATTTTAATTTTAATTAAATTTAACTTAATAAAATATAAATTAAATTTTTATATTTATTTTTTTGGGTAGAGGATATTTGTAGGTACGAATAGTATAATACCCGCACCCGACCCATTTATAAGCCGGTATTAAAATATCCGCTACCCACAACCGCAGACAGTAAATATTCGTGGGTACCAACTATTCGTCGTGAATTTTATTCGTGAATATCGCGGGTGCAGATTTTTTTGCCATCCCTAATTATAAGAGAAATTTCAAGAGAATTCTCCTTTGATTAAACCATTCATGTTTCTATTTTATTCCTTATAATCTAATTATTGTTAACCAACGTTTTAAGAGTAATCACTATTTTGAATATTTTTTTAATAAAACTCAATTATAATTAATAACTGAACAAATGGTAAGTTAAAATATAATTTTAAAACTATTTATATAATATTAAATGTTAGTAGCTTTTATTTTTAATAATTTAGTATATTTTGCTTATAAAATTTAAAATAATTTATATTATTTTGTGAAGTTATAAGCAAACAAAAATAAAAAGTATGTAAACTAAAATTATCTAATAATTTATAAAATGAATTTATTATATTAAATCAAACATTTTTATATTATTTCCTCACTTTAAATATAATACCAGTGCAACAATTACATAATAATATATATATAGAGAGGTTTAAACTATTAAATTGTCCTCATATTTGTTGGAGAATCTCAAGTGGGTCCTCGTTTTTTAAACCGTCAAAATTGGGTCTATATACTTGTAAAATTGAGTCAATTTTTTCCTCTCCGTTAAGTTTTGACAAACGACGTTAAATTGTGATCACGTGTTTATGCTGATGTGCATTATTTGATTATGTGAAATTTTTATTTATATTAAAAGATTATGACATGGCAAAATTGAAATGGTTTATGTTAAAATAATAGATTAGGGACTGAAAAGTGTCAGGCCATTAACCACTGTGCGTTCTTCATCCAGTCAGGCCATGGGCCTCGCCGCCAGTCGCCGGTCACAGTTGGAGCTTCGCCGACGGTAGTCATTCTTGGACTCTTCGTGTTCTTCATCGTCGTGACACGGTGAATCTCTCTGCCCCACCACCCTATCTTTTTCTCCTTCAATCCCCTTCTTCGTTTATACATATATATTCACCTCATTCCAAT


Gene Sequence:
>Vu_25320(-)
ATGCACAAAAGTAAAATAGACATAAACAAATATGTGGTTATCAATGCCTTGGAACCATGGAACCTCCTAAGTATGTGATTCATAAACAAATAAATAAATAAGCCAACTTTTGTGCATATGATTCACTCATTTTTGGTAAAAAGGTTGTTTGCAGCACTTGCAGGGGAGCTTTGTCGTGGGGATACAGAGAAATGGTTTTTCTTTTCGCCTGCGCAAGAGAGCCAAGCCAAAGGAGGGAGACCTAGCAGAACTACAACTTCTAGGTACGAGAAAGCTACTGGTTCACCATCTTCACTACTTCCTCAAGCTCTCCCTATGTGCCTTCAAGATCGTCCTTTCAACTCCCACCCTGACGTTGTCGCTGACATTGAAAATGCCGACATTTGGGACTGGGACTCTTTCTCTCCCTACTCATGGGGCATCGGCCATCAGGTCGAACCCATGGAGGAATCTACAGCGGAGGAACCATCGTCATGTCTCCAACGCAACCTTTATCCACCTCGAAGACCAAATCTAGGCCCAAACCAGCCATCCCCGCCACGAAGTAGAAGACCAAATTAAGTGTCTCACCAAGGACCCTCAGGTCGTTCCTACTCTGGTCTAGCAACATGCACACCGTCAAAACCCCAACATCCGCTTCCACCGCCGCTAACAACGCCCTTCCAACGCATCCATCGACAGTCGCGACCTGAACACTTCTCCACCTGCATCATCGGACACCACCATGACCTCGTCAACGAATCCCACCTCTCCCACATCGTTTCCCCCTTCCCCCTTCCACTCCAAGATTCGACTAAGCCCCAAAGCCCCAAAAAAAAATCAAACAATTTCCAATCTTTACCAATTTTTATCCTTTAACAGAAAAGTGTTCAATCAATTCACAACACCTGATTAAGTGCTACCAGGAGACGATGAAGGAGATCACGACGCAAGTGGCCGAGCAACCGGAAACAAGCCCTTTGTCGCAGAATAG