Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25267 LG6 15702018 15705346 PREDICTED: receptor-like protein kinase
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 15702118 missense_variant p.Met34Thr
A/G 15702533 synonymous_variant p.Gln172Gln
G/T 15702608 missense_variant p.Arg197Ser
C/T 15702845 synonymous_variant p.Ile276Ile
C/A 15702851 synonymous_variant p.Pro278Pro
A/G 15703040 synonymous_variant p.Ser341Ser
C/A 15703135 missense_variant p.Pro373Gln
T/C 15703137 synonymous_variant p.Leu374Leu
T/A 15703523 synonymous_variant p.Thr502Thr
C/G 15703526 missense_variant p.Asp503Glu
T/A 15703689 missense_variant p.Phe558Ile
G/A 15703955 synonymous_variant p.Leu646Leu
T/C 15704039 synonymous_variant p.Ile674Ile
T/G 15704256 missense_variant p.Leu747Val
G/A 15704391 missense_variant p.Glu792Lys
C/T 15704396 synonymous_variant p.Asn793Asn
T/C 15704398 missense_variant p.Leu794Pro
T/A 15704409 missense_variant p.Tyr798Asn
T/A 15704411 stop_gained p.Tyr798*
C/A 15704632 upstream_gene_variant
C/T 15704636 upstream_gene_variant
A/C 15704939 upstream_gene_variant
C/A 15704959 upstream_gene_variant
C/T 15704969 upstream_gene_variant
G/T 15705133 missense_variant p.Val864Leu
C/G 15705137 stop_gained p.Ser865*
C/T 15705266 missense_variant p.Ala908Val
A/G 15705269 missense_variant p.Tyr909Cys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25267.1
MHSTIFTMWLIFLSCFFCAVSALNSDGVTLLSLMRHWKSVPTSINTTWLASDSTPCSSWVGLQCDHAHHVIYLNLTGYGISGQLGPEIGNISRLQYLDLTGNNLNGPIPHSLKNLHSLQFLSLAQNQLSGEIPHSLSQIPGLQLVDLSYNLLRGSIPTSIGNMSELLLLYLQSNQLSETIPSSIGNCSKLLELYLDRNQLEGVLPQSLNNLGLLDHFDVSGNRLTGTVSLGSTSCKNLVVLDLSDNDFSGGLPSSMGNCSSLSELVAVNCNLIGNIPPSFGLLTKLSILYLPLNRLSGKIPPEIGNCNSLTELQLYSNRLEGNIPSELGKLRKLVDLQLFSNQLTGEIPLSIWKIKGLQSLHLYNNSLSGELPLEIAELRQLKNITLFNNQFSGVIPQNLGINSSLVLLDFTSNKFTGNIPPNLCFGKKLKILNLGINQLQGSVPPYVGSCTTLTRLILKQNNFTGPLPHFKSCQNLVYMEIGNNKIHGAIPLSLGNCTRITDLILPMNKFTGPIPSELGNLVNLRTLNLAHNNLEGPLPSQLSKCTQMDKFDVGFNFLNGSLPSSLQSWTRLTTLILSENRFSGGLPSFLSEFKMISELQLGGNLFGGKIPISVGAMQNLIYGLNLSSNGLTGEIPVEIRNLKMLRTLALSHNNLTGSIEVLGELISLVELNISYNSFSGIVPKALMKLLNCPLSSFLGNPGLCIRCSTSDCLACSERSSLKSCDDKSAKRKGLSKVQIVKMFLGLSIFLGLSLLALVCVVVFGRTAKQENHISSEQGSSSLLNKVMEATENLNDRYIIGRGAHGIVYKVLIGPDKAFAVKKIRFTASQENAYATSSRESDVYSYGVVLLELITRKKAATDPSYQDGVLVDWVRSVWRETGQIHQIADSILSCEFADTHIMENLTKVLMVGLRCTEKDPHKRPTMRDVINQLN*


CDS Sequence:
>Vu_25267.1
ATGCATTCCACCATCTTCACCATGTGGCTTATTTTCTTGTCTTGCTTCTTTTGTGCTGTATCTGCACTCAACTCCGATGGGGTCACCCTGTTGTCACTCATGAGGCACTGGAAATCCGTGCCTACTTCCATAAACACCACCTGGCTTGCCTCTGATTCCACTCCATGCTCCTCCTGGGTAGGACTTCAATGTGACCATGCCCACCATGTCATCTACCTTAACCTCACAGGTTATGGGATTTCTGGTCAATTAGGTCCTGAAATTGGAAATATTTCTCGCCTACAGTACTTAGACCTTACAGGTAACAACCTCAATGGCCCAATACCTCACTCCTTAAAAAACTTGCACAGCCTCCAGTTTCTCAGCCTTGCTCAAAATCAGCTATCTGGTGAAATTCCACATTCCTTGTCTCAAATACCTGGACTGCAGCTTGTTGATCTATCATATAACCTTTTAAGGGGTTCCATCCCCACCAGCATTGGGAACATGTCTGAGCTCCTGCTGTTGTATCTCCAAAGTAACCAGTTGTCCGAGACAATTCCTTCATCCATTGGGAATTGCAGTAAATTGCTAGAATTGTATCTGGATAGGAATCAGTTGGAGGGTGTCCTGCCTCAGAGTCTAAATAATCTCGGTCTTCTGGATCATTTTGATGTCTCCGGTAATAGACTTACGGGTACTGTTTCTTTGGGTTCAACTAGTTGCAAAAATTTAGTAGTTTTGGATCTCTCAGACAATGACTTTAGTGGTGGCCTTCCCTCAAGCATGGGGAACTGTAGTAGTTTATCGGAACTTGTTGCCGTGAACTGCAATTTGATAGGGAATATCCCACCCTCCTTTGGCCTACTGACCAAGCTTTCTATTCTATATCTTCCACTAAACCGTTTATCTGGAAAAATACCTCCAGAAATTGGCAACTGCAACTCTCTAACAGAGTTACAGCTGTATTCCAATCGACTTGAGGGAAACATTCCAAGTGAGTTGGGAAAACTAAGAAAACTGGTGGATTTGCAATTGTTTTCAAATCAATTGACAGGTGAAATTCCACTCAGCATCTGGAAGATTAAAGGTCTTCAGTCTCTGCATCTGTATAATAACAGTCTTTCTGGAGAATTGCCATTGGAGATTGCAGAGCTCAGACAGCTGAAAAACATCACTTTGTTTAACAACCAGTTTTCCGGTGTCATACCTCAAAACTTGGGAATTAACAGCAGTTTAGTTCTGTTGGACTTCACAAGTAATAAATTCACTGGCAACATCCCACCAAATCTGTGTTTTGGCAAGAAGTTAAAGATCCTGAATTTGGGCATCAATCAACTTCAAGGTAGCGTACCTCCTTATGTTGGGAGCTGTACAACCCTTACAAGATTAATCCTCAAACAGAATAATTTTACTGGGCCTCTTCCTCATTTTAAGAGCTGTCAAAATCTCGTTTATATGGAAATTGGCAACAACAAAATTCATGGAGCAATTCCATTAAGTTTGGGAAACTGCACACGTATCACTGACTTAATTCTGCCCATGAACAAATTTACAGGGCCAATACCATCAGAGCTAGGGAACCTAGTGAATCTTCGGACTTTGAATCTGGCTCACAACAACTTAGAAGGTCCTTTGCCCTCTCAGCTATCAAAGTGCACCCAAATGGACAAGTTTGATGTCGGATTCAATTTCCTAAATGGTTCATTGCCATCAAGTCTGCAGAGCTGGACAAGGTTAACCACGTTAATTTTGAGCGAGAATCGCTTTAGTGGGGGCCTCCCATCTTTCCTGTCGGAATTCAAGATGATTTCTGAGCTACAACTTGGTGGCAATCTGTTCGGAGGCAAAATTCCCATATCAGTTGGAGCAATGCAGAACTTGATCTATGGTTTGAATCTAAGTTCAAATGGGTTGACTGGTGAAATTCCTGTAGAGATTAGGAACCTGAAAATGTTGCGAACACTAGCTCTGTCTCATAACAATTTGACAGGAAGCATAGAAGTTCTTGGTGAACTCATCTCCTTAGTGGAACTCAATATTTCATACAATTCTTTTAGTGGTATTGTACCAAAGGCGCTGATGAAGTTGCTTAATTGTCCCTTGTCATCGTTCCTGGGCAATCCTGGCCTATGCATCAGATGTTCAACGTCAGATTGCTTGGCTTGCTCGGAAAGAAGCTCTCTAAAATCATGCGATGACAAATCTGCTAAACGGAAAGGCTTGAGTAAAGTTCAAATTGTGAAGATGTTTCTTGGATTATCCATATTTCTTGGTTTGTCGTTGCTGGCATTAGTTTGTGTTGTTGTTTTTGGGAGAACAGCTAAGCAGGAAAACCATATCTCTTCTGAACAGGGTTCTTCATCCCTTCTTAACAAAGTCATGGAGGCTACAGAAAACCTAAATGATCGATATATTATTGGTAGAGGAGCCCACGGAATTGTTTATAAAGTTCTGATAGGTCCAGACAAAGCTTTTGCGGTGAAAAAGATAAGATTTACTGCCAGTCAAGAGAATGCTTATGCAACAAGTAGTAGGGAGTCTGATGTGTACAGTTACGGGGTTGTTTTGCTTGAGCTGATAACAAGAAAGAAGGCAGCCACAGATCCTTCGTATCAGGATGGTGTTTTGGTGGATTGGGTTAGGTCTGTCTGGAGGGAAACAGGACAAATTCATCAAATTGCTGATTCAATACTTTCCTGCGAATTTGCTGATACCCATATAATGGAAAACCTTACTAAAGTGCTTATGGTTGGTTTGAGATGTACTGAGAAGGATCCACACAAGAGACCCACAATGAGAGATGTTATTAATCAATTAAACTAG


Promoter Sequence:
>Vu_25267::LG6:15700018-15702018(+)
AAGTGAAAAAAATTAACAACTACTTCAAATATTTAACAAAATTCAAATAAACTTAATGAAATTAAAACATTTTATGTTAAAACTATAATTTTTTTTTCATTATACTCAAATTAAAATACATTGTACTATACCGGGTAACCGATGTCAAGACAAAATAATGGCCAACTAATACGTTTAATGGTCATATTAAATGCGAATATACGCTATTTATTAGTAATTGACTATTGCACAAGAATATGGTATTAATGGATAATTAGCAGGTATTAATGGACAATTAGCAGGTATATTAGCAAGTATTATTGGATTTATTACATATCAAATATGAATTAATGAGTTTGATTGACATAAGCCCTATAAATATAGGGTTAAGGCCCAGGTAAAGACATCTTTTTATATCTAATAAAATATAAATCTCTTTATGAAACATATCTGACTTGAGCGTCGGAGTGTCTTCTGCAGGTCAACAACCCATGGGAGTAGATTGCGTTCTTGGAGAGGATTGGACAATCGAAAGAGACAGCAGAGAAAGGAATGACAACCGACCCTCAGACCAATTCAACCGAAACATTTTGGCTCCACCGTGGGGCCCGAGCGACATCCCACATGATTCCATGAGGAACCAACGTGGCGCTCGGTCTCGACATCGCTACTTTCGAGTCAATACCAGGTTTTGCAACAAGAGTAAAATATTCCATAATAATTTCTAAAGGCATTTCTTTTGTTTTGAAAACTTTCAAGAAGGTTCAGTCCTACGTACGTTCAACCTTGACAGAAAGGGGTTCAGTCCTACGTTCAACCTTGATAAGACTTACGTGTCTACACTTTTGGTATGAATAAAGCCAGACAATTTCCATCCAATCACAGGTTGTGGGGCGATGACACAAAACCCATGGAACGCTCTCCGAGAGCTCCTAGTCCTAAACCGAGCGGTAAAGAATGTTCGTGAACTCTCACTCCTGTCCACAAAACCCAGGGAACACTCTCCGAGAGCTCCTGATCCTAAACCGAGCGGTGAAGAATGTTCGTGAACTCTCACTCTCATCCACAAAACCCAGGGAACACTTTTCGAGAGCTCCTGGTCCTAAACTGAGCGGTGAAGAGTGTTCGTGAACTCTCATTCTCGTCCACAAAACCCAGGGGACGCTCTCCGAGAGCTCCTGGTCCTAAACCGAGCGGTGAAGAGTGTTCGTGAACTCTCACTCTTGTCCACAAAACCCAACGAACGCTCTCCGAGAGCTCTTGGTCCTAAACCGAGCAGTGAAGAGTGTTCCACAAATAAAACCCCCTAAATCAATTATCATTTTAATTTCCCCAATTCAATAACCTATTTCCATGTCACCCTACATTTCATTCACACGTAATTACCAATATTGTCACTATTTTGACACGTTTTATTTCTCAATTATCAAATCATCAGTCACTTAACACGGTTAGTCTGTATTTAACGGAGATGACTTTATTGACACATATTTTTCTATTATTGAATATAATTGACACTTTTAAACCACATGTGGACGAAATAGTAACTTTTTTAAAAAAATGAACGAGTTTAACACACTTCAACCAAACTGCGACAAATCAAGCAATTAAGCCTAAAATTTTACTCCAAAAATAAAATTGTAATATGAAAACCTCATCTCTTCTGTTCGTCCTATCCAAATCTTTCCGAGTGAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCCAGTATTATTATTTTATATTTAGTTACATAAAGAAAGATTAAATACATTCCATAAGCACAATTTTTAAAGTAAAAAGTTAGTTGAATTGACACCGAAAGACCATAAAAAATTCAAAATCCCATCTTCTGAATGTGAAAGCTCGAAGACAACAGAGAGACCATTTATGTGTTTACGACAACAATGAATGATGTTTCAACCATGAGTCAGAGTCCAGAAGAGTTGATTTCCCATTGCAGCGGTGCTTCCCAAAGGTGAGACCTTTATGCTTCTTCACTTCAAGCAA


Gene Sequence:
>Vu_25267(+)
ATGCATTCCACCATCTTCACCATGTGGCTTATTTTCTTGTCTTGCTTCTTTTGTGCTGTATCTGCACTCAACTCCGATGGGGTCACCCTGTTGTCACTCATGAGGCACTGGAAATCCGTGCCTACTTCCATAAACACCACCTGGCTTGCCTCTGATTCCACTCCATGCTCCTCCTGGGTAGGACTTCAATGTGACCATGCCCACCATGTCATCTACCTTAACCTCACAGGTTATGGGATTTCTGGTCAATTAGGTCCTGAAATTGGAAATATTTCTCGCCTACAGTACTTAGACCTTACAGGTAACAACCTCAATGGCCCAATACCTCACTCCTTAAAAAACTTGCACAGCCTCCAGTTTCTCAGCCTTGCTCAAAATCAGCTATCTGGTGAAATTCCACATTCCTTGTCTCAAATACCTGGACTGCAGCTTGTTGATCTATCATATAACCTTTTAAGGGGTTCCATCCCCACCAGCATTGGGAACATGTCTGAGCTCCTGCTGTTGTATCTCCAAAGTAACCAGTTGTCCGAGACAATTCCTTCATCCATTGGGAATTGCAGTAAATTGCTAGAATTGTATCTGGATAGGAATCAGTTGGAGGGTGTCCTGCCTCAGAGTCTAAATAATCTCGGTCTTCTGGATCATTTTGATGTCTCCGGTAATAGACTTACGGGTACTGTTTCTTTGGGTTCAACTAGTTGCAAAAATTTAGTAGTTTTGGATCTCTCAGACAATGACTTTAGTGGTGGCCTTCCCTCAAGCATGGGGAACTGTAGTAGTTTATCGGAACTTGTTGCCGTGAACTGCAATTTGATAGGGAATATCCCACCCTCCTTTGGCCTACTGACCAAGCTTTCTATTCTATATCTTCCACTAAACCGTTTATCTGGAAAAATACCTCCAGAAATTGGCAACTGCAACTCTCTAACAGAGTTACAGCTGTATTCCAATCGACTTGAGGGAAACATTCCAAGTGAGTTGGGAAAACTAAGAAAACTGGTGGATTTGCAATTGTTTTCAAATCAATTGACAGGTGAAATTCCACTCAGCATCTGGAAGATTAAAGGTCTTCAGTCTCTGCATCTGTATAATAACAGTCTTTCTGGAGAATTGCCATTGGAGATTGCAGAGCTCAGACAGCTGAAAAACATCACTTTGTTTAACAACCAGTTTTCCGGTGTCATACCTCAAAACTTGGGAATTAACAGCAGTTTAGTTCTGTTGGACTTCACAAGTAATAAATTCACTGGCAACATCCCACCAAATCTGTGTTTTGGCAAGAAGTTAAAGATCCTGAATTTGGGCATCAATCAACTTCAAGGTAGCGTACCTCCTTATGTTGGGAGCTGTACAACCCTTACAAGATTAATCCTCAAACAGAATAATTTTACTGGGCCTCTTCCTCATTTTAAGAGCTGTCAAAATCTCGTTTATATGGAAATTGGCAACAACAAAATTCATGGAGCAATTCCATTAAGTTTGGGAAACTGCACACGTATCACTGACTTAATTCTGCCCATGAACAAATTTACAGGGCCAATACCATCAGAGCTAGGGAACCTAGTGAATCTTCGGACTTTGAATCTGGCTCACAACAACTTAGAAGGTCCTTTGCCCTCTCAGCTATCAAAGTGCACCCAAATGGACAAGTTTGATGTCGGATTCAATTTCCTAAATGGTTCATTGCCATCAAGTCTGCAGAGCTGGACAAGGTTAACCACGTTAATTTTGAGCGAGAATCGCTTTAGTGGGGGCCTCCCATCTTTCCTGTCGGAATTCAAGATGATTTCTGAGCTACAACTTGGTGGCAATCTGTTCGGAGGCAAAATTCCCATATCAGTTGGAGCAATGCAGAACTTGATCTATGGTTTGAATCTAAGTTCAAATGGGTTGACTGGTGAAATTCCTGTAGAGATTAGGAACCTGAAAATGTTGCGAACACTAGCTCTGTCTCATAACAATTTGACAGGAAGCATAGAAGTTCTTGGTGAACTCATCTCCTTAGTGGAACTCAATATTTCATACAATTCTTTTAGTGGTATTGTACCAAAGGCGCTGATGAAGTTGCTTAATTGTCCCTTGTCATCGTTCCTGGGCAATCCTGGCCTATGCATCAGATGTTCAACGTCAGATTGCTTGGCTTGCTCGGAAAGAAGCTCTCTAAAATCATGCGATGACAAATCTGCTAAACGGAAAGGCTTGAGTAAAGTTCAAATTGTGAAGATGTTTCTTGGATTATCCATATTTCTTGGTTTGTCGTTGCTGGCATTAGTTTGTGTTGTTGTTTTTGGGAGAACAGCTAAGCAGGAAAACCATATCTCTTCTGAACAGGGTTCTTCATCCCTTCTTAACAAAGTCATGGAGGCTACAGAAAACCTAAATGATCGATATATTATTGGTAGAGGAGCCCACGGAATTGTTTATAAAGTTCTGATAGGTCCAGACAAAGCTTTTGCGGTGAAAAAGATAAGATTTACTGCCAGTCAAGGTAAGAACTCGAGCATGGCCAGAGAAATTCAGACCCTTGGGAAAATCAGGCATCGAAATCTTGTCAAATTGGAAGACTTTTGGTTGAGAAAAGATTGTGGTCTAATTTTGTACAGCTACATGGCAAACGGAAGTCTCCATGATGTTTTGCATGAAAGGGCTCCAACACCAACCTTAAAGTGGAATGTCCGGTATGAGATAGCTGTTGGAATTGCTCATGGATTAGCTTATCTCCACTATGACTGTGACCCTCCCATCGTGCACCGAGACATCAAGCCCAGCAATATACTTCTAGACTCCGACATGGTGCCTCACATTGCTGACTTTGGTATTGCCAAACTTCTGGAACAGTCTTCTCCTGCTTCAAATACTTCCATTGCTGTGCCGGGTACAATTGGTTATATTGCTCCAGGTAAGTCTTGTACATTATTATTGATTGGATGTGTGTTTCCTTTACAAATCAGATTTCATAAATCACTTATGCATTAAGTAACATGCTTGTTGGCTTGTTTGTGACATTGACAGAGAATGCTTATGCAACAAGTAGTAGGGAGTCTGATGTGTACAGTTACGGGGTTGTTTTGCTTGAGCTGATAACAAGAAAGAAGGCAGCCACAGATCCTTCGTATCAGGATGGTGTTTTGGTGGATTGGGTTAGGTCTGTCTGGAGGGAAACAGGACAAATTCATCAAATTGCTGATTCAATACTTTCCTGCGAATTTGCTGATACCCATATAATGGAAAACCTTACTAAAGTGCTTATGGTTGGTTTGAGATGTACTGAGAAGGATCCACACAAGAGACCCACAATGAGAGATGTTATTAATCAATTAAACTAG