Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25258 LG6 15646706 15648697 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 15647130 missense_variant p.Ser142Thr
T/A 15647943 downstream_gene_variant
A/T 15648297 missense_variant p.Asn224Ile
A/T,* 15648430 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25258.1
MDKVCLNSDAVGDEEGESNVHVHVPVAPAVGMEFESYEDVYYFYNWYAKEQGFGIRVTNTWYRKTKERYRAKLSCSSAGFKKRTEANRPRPETRTGCPAMIKFRLMDSTRWRIIEVELDHNHLINPTSGKFYKSHKQVALGSKRTFHFDATAAQQVHKIRMFRTLIIDAEDDASTKRQLEALADLDSKSCSFAAKSRSYFELQINVDGAVMTYIVEEQVEVEGNHRGARDYEIVKVVEEGKKSHDHYETALQAMENILRKLHIVNVEDPDNIMSKH*


CDS Sequence:
>Vu_25258.1
ATGGATAAAGTTTGTCTGAACAGTGATGCGGTAGGAGATGAAGAAGGCGAGAGCAATGTCCATGTCCATGTCCCTGTTGCTCCTGCGGTTGGGATGGAATTTGAGAGTTACGAGGATGTCTATTACTTCTATAATTGGTACGCCAAGGAACAGGGATTTGGGATTAGGGTTACAAATACCTGGTACCGCAAGACCAAGGAACGTTACAGAGCGAAACTTAGCTGCAGCAGCGCAGGCTTTAAGAAAAGAACGGAGGCTAATCGCCCCAGACCCGAAACCAGAACTGGTTGTCCTGCTATGATCAAGTTCAGGTTGATGGATTCCACAAGATGGAGAATTATTGAAGTTGAGCTTGATCACAATCACTTGATTAACCCCACCAGTGGCAAGTTTTACAAGTCCCATAAGCAAGTTGCTCTTGGCAGCAAAAGAACCTTCCACTTTGATGCTACTGCTGCTCAACAGGTTCACAAAATTAGGATGTTTCGAACTCTCATAATCGATGCTGAGGATGATGCCAGTACAAAGCGACAACTGGAAGCTTTGGCAGATTTGGATTCAAAATCTTGTAGCTTTGCAGCAAAATCGAGGTCTTACTTTGAATTGCAGATAAATGTTGATGGAGCGGTGATGACGTACATTGTGGAAGAACAAGTTGAAGTTGAGGGAAATCATAGAGGTGCAAGAGATTATGAGATTGTGAAGGTTGTTGAGGAAGGTAAGAAATCTCATGATCATTACGAGACTGCACTACAAGCAATGGAAAATATATTGAGGAAGCTTCATATTGTAAACGTTGAGGATCCCGACAACATAATGTCCAAGCATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_25258::LG6:15644706-15646706(+)
AATATAATGACTTTGAAATTTTTCTAAAAATTTACATGCATAATTTTGATGAAAAAGTTGATAAATTATGGATTATAATAATAAAAATGAAAAAAATGAGCAAACATTTTAAAAATGAGCAAAAAAAATGAGCAAACATTATGTATTAATGCTATTATATTAAAAAAATAAAATGAAGAGTGTTGGAATTTCACTACCTTCATCCAAAATATCAAGTTAATTATTTATTTATTAAAATATTAACATTATTTTAGAAAATTATAAATATCGTATATGACCTCTTTCAACCTTTTAACTTATATAAGTTAAATTCTCGAATTACCATTAAGCTTAAACCTATAAAAAAACATTTAAGATAATAATTAAAGCTACATTCTACAGTGAATTGTGAATATTGATGTCTAAATTTAACTTTAAATTATAAAGTGAACAAGTATTAAATTCAATCTTTTCAATATTGTTTTTCATTCAAGACAACCAAAACTTTTCCTCGTTATGCCACTGTAAAATCCAATAACTCTCTTACTTCATGTACAACAAGAAAAGGTTGAGAGTCATGAAGGTCATTTTCCATGTTAAACCAAATTCCATTAATTTTTTTCTCAGTGCGATCGAGTGTCTACTTCTTCAAATTCCTCAAAACCTAAACGTAATCCTCCTGACACAATTTGAAATTGGAGTTAGAGTTTTCATTGTCTTCGTTGAAAAAAGAAAGAATGACACAAACATCACAATGACAAAAGGTGTTTCAGATTGTCTTCTTCGTCATTGCAATATTAATCTTGGTGGTGTAATCCTCTCTCGCGTAAAAATCCTCTCCCGCATTAAATACATATTAATGTGATTATGAACGAAATTAACACTCTTTTAAAAACCATGATAAGTAGACACATTATGGTATCCAAACAATTAAACGTAATTTTATCAAAGTTAATAAGATTATTCTTTTAATAAATGTCATTTTTTTTTGTGAAATCTATTGAAGTTACATGCGGTAATTTTTTTTGTAATGTCACATGGGGTAATTTTTTTTTTAAGTTAGTCTAAATTTTTTCTAAGTTAGTCTAAATTTTTTCTAATTTCGACTAATGAAGCTTTTAACGAACTTTGACTAAGATTTAATTCTAATGGCCGATGGAAATTTTTAAGTCCATATAGATAAAAAAAAGTTAGGAAAAAAAAATATAAATAATGATGAATGATATCTTAATATTTCATTTTAAACCATTCTAAATAACTAAATTTTAGTTAAGGATAGAACTCGAATAGTGCTAAGACAGTTTAATCTTAATTCAACAAATCAATCAAATAATCTCAAACTAATCTTCTTGATTAGAAGATGACTAAACTTTAGTTAAGGATTCTTTCTGGTAAGATAATTCAAGTTTTTGAATAGCTCCATAACCTTAGAAATAAGAGATTATTTTTGAACATTCATGACTATCATAAAAAATGAAACCCCATGCTTAACAAATTTGATTCCAGGGTTCACAAACTTATTTCAGGCTTTAATTAAGTATGCTTTTTAGAAAATCTTGAATTTTTGACTTTAAAGATGTGATCTTGATGTTAGAAACCATGACAGATGCGAGCTAGCAAGACGATGGTTTGATAAATTAAAACTTAAAAGTGAAAGAAAAAACAAATATATTTTTAGGGGATTATATATGAACCCTATATTTTTAATTCAGAAGAAAAGGGCAAATGTGGACAATGCTGTTATTATACTTCAGTTGACTCCAATTGAACTAGGTTAGAAGCAAGCAGGAAGTGAATTTGAAAAGAAAAGGGAAGAAAAATGGAGAGGGTGTGATGTGGAATGGAATCTCCAGATTGCAATTGGGTAAAGAAGCAGTGAAGTGGAATCTCCGAAGTCAAAAGTAATAATCTTAATAAGGTAATGACGTTGTTTCTTCTGTCATGTAGTTGATTGTGGTAAAGAATAATGGTGTAGTTTAAAGGGGTGTGGTTTTAGGGTTTGTGTTGGCATTGGATTTGGA


Gene Sequence:
>Vu_25258(+)
ATGGATAAAGTTTGTCTGAACAGTGATGCGGTAGGAGATGAAGAAGGCGAGAGCAATGTCCATGTCCATGTCCCTGTTGCTCCTGCGGTTGGGATGGAATTTGAGAGTTACGAGGATGTCTATTACTTCTATAATTGGTACGCCAAGGAACAGGGATTTGGGATTAGGGTTACAAATACCTGGTACCGCAAGACCAAGGAACGTTACAGAGCGAAACTTAGCTGCAGCAGCGCAGGCTTTAAGAAAAGAACGGAGGCTAATCGCCCCAGACCCGAAACCAGAACTGGTTGTCCTGCTATGATCAAGTTCAGGTTGATGGATTCCACAAGATGGAGAATTATTGAAGTTGAGCTTGATCACAATCACTTGATTAACCCCACCAGTGGCAAGTTTTACAAGTCCCATAAGCAAGTTGCTCTTGGCAGCAAAAGAACCTTCCACTTTGATGCTACTGCTGCTCAACAGGTTCACAAAATTAGGATGTTTCGAACTCTCATAATCGATGCTGAGGATGATGCCAGTGTACATCCTGATGAAGGGAAATCTCCAAATCCGAAAGGCTTGTACTCCAACAATCAGTTGAAGCTGAAGAAAGGTGATGCTGAAGCAATTTTGAATTTTTTCAGTCACCAGCAATTGGCTGATCCAGACTTCTTCTATGTGGTCGATGTCAATGAGAGAGGGTGTTTCAGGAATTTGTTCTGGGCTGATGCAAAGTCCAGGGTTGCATACAGTTATTTCAGTGATGTTGTAGCTATTGACACTACATGTTTGAACGATGCATATGAAGTTCCCCTGGTTATGTTCCTTGGGATAAACCACCATAAACAATCCATCTTGTTTGGCTGTGGACTGCTTGCTTGTGAAACGGTTGAATCATACACTTGGCTGTTCAGGGCGTGGCTTACTTGTATCTTAGGACGCCCCCCACAAGTTATCATTACCAACCAATGTGGAATCTTGCAAACTGTGGTTGCTGATGTCTTTCCAAGATCTACACACTGCCTTTGCTTGTTTAATATCATGCAAAAAGTTCCAGAAAAACTGGGAGCCTGCGTACAGTATGAAGCAATCAATGCAGCTTTGAGCAGAGCAGTATATTCCTCTCTCAGGGCTGAGGAATTTGAAGCAACTTGGGAGGATATGATGAAAAGCAGCGAAATTAGAGGCAATAAATGGCTCCAATCTTTGTATGAGGAACGGAAACGGTGGGCTCCAGTTTATCTGAAGGAAATCTTCTTGGCAGGAATATTTTCAGTTCAACAAAGTGATGATGCTGTATCATTTTTCTTTGATGGGTACCTCGATGAACAGACTTCTCTGAAAGAATTTTTAGAAAAATATGATCAGACTTTACAGACAAAGCGACAACTGGAAGCTTTGGCAGATTTGGATTCAAAATCTTGTAGCTTTGCAGCAAAATCGAGGTCTTACTTTGAATTGCAGGTTTCAAAGTTATATAGTAATGAAATATTAAGAATGTTTGAAAGGGAAGTGGAAGGAATGTTTTCTTGCTTTAACTCGAGACAGATAAATGTTGATGGAGCGGTGATGACGTACATTGTGGAAGAACAAGTTGAAGTTGAGGGAAATCATAGAGGTGCAAGAGATTATGAGGTGTGTTATAATGAAGCTGAAATGGAGGTCTTCTGCATCTGTGGCATGTTCAATTTCAGAGGTTACTTGTGCAGGCATGCTTTGTTTATTTTAAGCCAAAATGGGATAAAAGAGATCCCAACGCAGTACATTGTTTCACGGTGGAGAAAAGATATGAAGCGGAGCAATGTGTACGATCACAACTCTAGTGGCATTGATATAAGTAATCCAGTTCATAGGTATGATCATTTATACAGACAGATTGTGAAGGTTGTTGAGGAAGGTAAGAAATCTCATGATCATTACGAGACTGCACTACAAGCAATGGAAAATATATTGAGGAAGCTTCATATTGTAAACGTTGAGGATCCCGACAACATAATGTCCAAGCATTGA