Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25255 LG6 15616603 15619715 PREDICTED: AP2-like ethylene-responsive transcription factor At1g16060
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category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 15616867 downstream_gene_variant
C/G 15616870 downstream_gene_variant
A/G 15617009 downstream_gene_variant
T/A 15617189 downstream_gene_variant
T/A 15617192 downstream_gene_variant
T/C 15617221 downstream_gene_variant
A/G 15617269 missense_variant p.Glu94Gly
G/T 15617277 missense_variant p.Asp97Tyr
G/A 15617743 downstream_gene_variant
T/C 15617856 downstream_gene_variant
C/T 15618140 downstream_gene_variant
A/T 15618258 downstream_gene_variant
C/T 15618270 downstream_gene_variant
A/G 15618286 downstream_gene_variant
T/C 15618298 downstream_gene_variant
A/G 15618328 downstream_gene_variant
T/A 15618349 downstream_gene_variant
T/G 15618396 downstream_gene_variant
T/A,* 15618484 downstream_gene_variant
G/A 15618510 downstream_gene_variant
G/A 15618600 downstream_gene_variant
A/G 15618601 downstream_gene_variant
A/G 15618617 downstream_gene_variant
G/A 15618682 downstream_gene_variant
T/C 15618925 downstream_gene_variant
G/A 15619188 downstream_gene_variant
T/C 15619431 missense_variant p.Ile191Thr
T/C 15619474 synonymous_variant p.Asn205Asn
T/A 15619481 missense_variant p.Trp208Arg
G/A,* 15619523 missense_variant p.Ala222Thr
T/A 15619538 missense_variant p.Phe227Ile
C/T 15619580 missense_variant p.His241Tyr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25255.1
MLKKKRPRKTIPRDTPLPRTSPYRGVTRHRWTGRFEAHLWDKTSWNQSQNKKGRQGAYDDEDAAARAYDLAALKYWGPETVLNFPLSNYEEQLKEMEDQSKEEYIGSLRRKSSGFSRGVSKFRGVARHHHNGRWEARIGRVFGNKYLYLGTYGTEEEAAVAYDMAAIEYRGLNAVTNFDLSRYMKWLRPKDQSQPQLQAHDDSPSPIPSGPESRNATSTLGPPPPPPPSSPSTSNLPPRPPRTFPEDIQTLFETQDSAGIYTDTDDIIFGDLTSIASPIFHCDLNA*


CDS Sequence:
>Vu_25255.1
ATGCTCAAGAAGAAGCGCCCACGCAAAACCATTCCAAGAGACACTCCCTTGCCACGAACCTCACCCTACAGGGGTGTTACCAGGCATCGATGGACAGGTCGATTCGAGGCTCATCTCTGGGATAAAACTTCCTGGAATCAATCGCAGAACAAGAAAGGAAGACAAGGAGCATACGACGATGAAGATGCTGCGGCACGTGCTTACGATTTGGCAGCATTGAAGTATTGGGGTCCGGAAACCGTCCTCAATTTCCCTCTATCAAATTATGAAGAACAGCTTAAGGAGATGGAGGATCAATCTAAGGAAGAGTACATCGGATCCTTAAGAAGAAAAAGTAGCGGCTTCTCTCGGGGCGTCTCAAAATTCAGAGGCGTAGCAAGACACCATCATAATGGAAGATGGGAAGCACGAATTGGCAGAGTCTTCGGCAATAAATATCTATACCTTGGAACATACGGTACAGAAGAAGAAGCAGCAGTGGCATACGATATGGCGGCCATAGAATACCGTGGACTTAATGCTGTTACCAACTTTGACCTCAGTCGTTATATGAAATGGCTACGTCCAAAAGACCAATCTCAACCTCAACTTCAAGCCCACGATGACAGCCCAAGCCCAATACCATCTGGACCTGAATCTCGAAATGCCACCTCAACATTGGGCCCTCCGCCGCCGCCGCCACCTTCTTCACCCTCCACCTCAAACCTTCCTCCTCGTCCTCCTCGCACATTCCCCGAAGATATTCAAACTTTGTTTGAAACTCAAGATTCAGCTGGAATCTACACAGACACTGATGACATTATATTTGGCGACTTGACCTCCATTGCTTCACCAATTTTTCATTGTGACCTTAATGCTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_25255::LG6:15614603-15616603(+)
ACCATCAATTGATTATGTGTAATAAATGGATCAATTTGATTCATTAATGGCTTATGAAAAACTGGGTGGAGTTGACTGACATAATAAAATAGGTTAAAAATCTTAATTTTAATTTTTTGTGTTTTTTATTTTTATATTTATAAAATTTCTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAGTATATTTAGTTATATAAATATTGTTTTTAAAATTTTTAATTAATTAATTAATATATTTTATTAAATAAATTAAAATAATTATTATCTTTAAATATTAAATTATTATATTATAACTAATAATTCAAACTTAATTTATAAATTATAATCCTTTGTTATAATATTATTACGTACTTACATATATTTAAATAATATTATAATACAAATAGCTTATTCTTTTAAACTATTGTTATTTTAATTTTTAATTTTGTTTTTAAAAAGTCTAGTAGATCAGCCAAACCTAATCTACTCACATCCACCAAAATAAATTAATAAGTTAAAATATCAACCTAATCCATCAAATTTTGACATCTTAGTATATACTTTCGATAAATATAATTTACTCCTATTTAAGAATCACTAAAGTATTTATATATATATGAATATTCATCACTAATTTATGATGAATATTAAATGAATCTATATAAAAGACACCGGATGTAATGAATACATATATGGATATTTAATTATTTGTTTATTTATGAGTGGATAAAAGTATTCAACTTGCAAATATCGACTATTCATTAATAATTCAAAATGATGATTATTAGATTGTCACGTCAATAAACACTAACGATCGGTCATAGAGAACTAAATTTATGAATTTCAAAATGAACGAAGATCTAGGTAGAACTTGAAAGATGAATTAAAACTAAAAACATTTAATAGTTTAGAAATAAAAACATAATTAATTATATTTTATATTAGAACATTTTGCATAAGGTTTATTCGTAAGAGAAACATACTCATCATATAATTGATTGGTTTATAATATAAATATAATTACTCTTGCTCTTTTTATTTCTTTCTCTTAAAAAAATAGAGATTAAGGAATTGGTGGATAAACATTAACCATCACCAAGAAAATAAACTGTTTTATCTCAAAAACATCCTTATCCCACAACGATAAAATACCTCCTGCCGAATTAACCATTGTATTTGGTATTTATTCATGCTATATTTTTATATCAATACCATCCAACAACCTTTGTTTCTATCCATCATCTCAATCTTATCCTTCATTATTAATTATTTCACTCTCACTCTTTTAACTCTTCCTCATCAAAACCTATCTTTATGGGAAAATGACACTTGAACAACCATTTTTGACAACATTTAGACACGCGCACACGTGTCAAAATCTGAGTGGTCCATTTTCATTTAATTTTTCCAACTGGACCACTCAGATTTTGACACGTGTGCGCGTGTCTAAATGTTGTCAAAAATGGTTGTTCAAGTATCATTTTCCATCTTTATGTTCCCTCTTTTTCTAACTTACTTCCAATCTCCATTTGCTTAGGAGATACAAATCACCACATCTGCCTCATCAAATATTTTCAAAATTTAATTTTTACATCAGTGAATAATACATTTTTATTTTATCAATCATTTAACTTAATAATAATTCAGTGAAATGAAACATAATATAGTTTTTGTTTGAAAATATATAATCGAGGAAATGGATTTACTTTACAGCGGAGGCAGCCTAAAGACGGCGACGTAATAAAACAATGTTTTTGATTTGTGGCCGGCCGGTTATTATATTTTCGAAATTATTAATGTTATTATTATTAAATAATGATAAATGTGGTAATGATAAACACTGACTCACTGACTCCTCAACTTCCAACTGTTTCTTTCGAAAGTTGTTTCATATTTTATGACATCAGTGTTCTTTGTCACTCTCTTGCTAAATCTCTTCGCTTTTCTCTTCTTATGAGCTTCAATGGCTGCCAAAACCTCACACAAAACCCTCTGCGTCGACTCTCCCA


Gene Sequence:
>Vu_25255(+)
ATGCTCAAGAAGAAGCGCCCACGCAAAACCATTCCAAGAGACACTCCCTTGCCACGAACCTCACCCTACAGGGGTGTTACCAGGTCCATTCATTCATTCTTTTTCGATCTTCGAATCCATTTTCTAAGATTGAAAAATCATCACTCAATGTGTATTCATTCAGGCATCGATGGACAGGTCGATTCGAGGCTCATCTCTGGGATAAAACTTCCTGGAATCAATCGCAGAACAAGAAAGGAAGACAAGGTTCTTTAATTTTTCTCCGTTCCTGTAAAATTATTACCAATTTCATCTCTCATTCTTGATTTTGATCTTCTCGGTTCACGGTGGATCGACGGCGGTGGAAATTGAAACGGCACTGCAGTGTATCTGGGTACGTAATATAATAAATATATAATTTTCACCAATAGTCATTGGAATAATGAACGAGTGCGTGATTTGTTTGTTGCAGGAGCATACGACGATGAAGATGCTGCGGCACGTGCTTACGATTTGGCAGCATTGAAGTATTGGGGTCCGGAAACCGTCCTCAATTTCCCTGTAAATCTTTTCGTTGAATCCTTCAGACGAACTTTCGTTGCTTCATTAATAATTATATATATTATGATAAAAATGCACTGTTCATTCTACGTATATAGCTATCAAATTATGAAGAACAGCTTAAGGAGATGGAGGATCAATCTAAGGAAGAGTACATCGGATCCTTAAGAAGGTTTTTCCTTATCACTGATTTGTGTGTAGTCTTACTGTTCCACCATGAATTAATTTTTGATTTGCAGAAAAAGTAGCGGCTTCTCTCGGGGCGTCTCAAAATTCAGAGGCGTAGCAAGGTATAAGTTAGATAGAATGAACAATATAACCAATAAATAATCGATATAATTAGAATATATTATAGCTCTGATACTTTATTAAATCTAAATTAACCTTACAAAACCAATTTATAAAATAGATTTGCACTCATTTATACTCCGATTGATTGCCGTGGAACTTCCAACCGATATTTGATTTACTTCCTTTTAGAAAAGTAAAAGGAATTGGAGACACATTGAATTTTTGTGGGTCATATTGTGTTGAATAAAAGAAGTTATGGGTGCAACGAAGGACCCAATATTCTGCAAAGCATTATCTGTAGGATAGGTCGTTGGTGTGGATGTGTGTAGCTTCTTTCATCCCTCTGTCGTTCTTTCCATCCACAAGTTCGGTTCTTAATAATGATCATTAATGGAGTGAATGGATCACACAGTGCCCATTTTTCCCGAATAATTAATCTTTTTATTCACTTACACATATTTCCCATACTCTTTTATAAGCAAAATATAATAAATAAAAGGTAGAAAAGATGTCGTGGAATTATTTAAATTATCTTGAATAATAAGTTGAAAATTAGTCTGAAATGTTTGTTGTCACCAATTTATAGACACCATCATAATGGAAGATGGGAAGCACGAATTGGCAGAGTCTTCGGCAATAAATATCTATACCTTGGAACATACGGTAATTTTCCTTGCATTCTTCCATTGCTATCATTAAGGTTCTCCTCCTTCTTTTAGGGTAAATTCAGTTGATAAAGAAATTGATAAACTAAAATATATTAATAATTACTATTTATCAGTACAAATTGTTCAAAATTATAAACCACATGCATATATTTGTTTAGAATTTATTGTCTTACTCATTGCTAGCATTGTTATTTTTTGTCATGAGTTGACAAAATTGGACTCTTTTAGTTTTTGCTTCGAATAAAGATAAGACAAATGGTCGTTTCTTAAAGAGGAAATATATATATATATATATATTATTTTTTTAATTGAATGCATTGGTACTCAACAATTAATTTTTTAAAGATAAAATATCCTTTCTTCCATCCCAAAATAATTGTAATTTTTTTTTCACGTGAATAAAAAACAGAAATGGTTTTATCAAACTAATGATATAATTTATTGAACAAATTAAGGACAAAAATTAATAGTATTTGGTTGAAAATATTCTAAGTGTATGATTGATTGAAAATATCAACGAGTTCAAAATGTTTTTAAAGGCTAAATAAAACTATACTTTAAAACGGGAAGAGTGTATAAAGATTGCATGCAATGATATTCTGTTTATGAAAATTATTGAAATTATTAGTAATAACACAACGAGGTATGTACAAATAGTAAAAGCTAAAGAATATTTAAAATTCAAAAATCAATTATAGAATATATGACGTCTATAATTTAATACAAATTATTAATAATACTTTTATATTCATAGTTTGTTTTATTTACTTTTAAAGAAATGGAAGCACTCCTTTCAGTTGACATTTTAAATTATTACTAAATATTTTCTTAAAACATTTTAATGATAGTGTGTGTTTCCCTAAACATGCATGACAAACAAAGAAGACAATCTTAAAGAAGGACACGAATGTACATGAATCCATTTGACAGGCTTCCTCCAACGTGGGACCCAACAGGTCAAATCAACAAGACAATGAAAATGATGGAAATGTGCAATCGAATATAGGTAGTTAAGAAGTAGATCACCAAACTCAACTGCTCATTAAGGCTACTTAAATATTGTCTATTTCTTTCAAACATTTTTAAGGAGCTGCTAAGTACAACTTATAAAACAAACAATTAAATAAATAAATATTAACTGCAATAAATAAATTATAGAAATATATTTTTTTTAATTAAATAATCTGAATTTTTACTCTATGCAATGCAGGTACAGAAGAAGAAGCAGCAGTGGCATACGATATGGCGGCCATAGAATACCGTGGACTTAATGCTGTTACCAACTTTGACCTCAGTCGTTATATGAAATGGCTACGTCCAAAAGACCAATCTCAACCTCAACTTCAAGCCCACGATGACAGCCCAAGCCCAATACCATCTGGACCTGAATCTCGAAATGCCACCTCAACATTGGGCCCTCCGCCGCCGCCGCCACCTTCTTCACCCTCCACCTCAAACCTTCCTCCTCGTCCTCCTCGCACATTCCCCGAAGATATTCAAACTTTGTTTGAAACTCAAGATTCAGCTGGAATCTACACAGACACTGATGACATTATATTTGGCGACTTGACCTCCATTGCTTCACCAATTTTTCATTGTGACCTTAATGCTTAA