Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25238 LG6 15490428 15491832 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 40 isoform X2
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 15490511 missense_variant p.Met278Leu
A/G 15490519 missense_variant p.Val275Ala
T/C 15490617 synonymous_variant p.Ala242Ala
G/T 15490691 missense_variant p.Pro218Thr
A/C 15490814 downstream_gene_variant
G/T 15490842 downstream_gene_variant
C/T 15490886 synonymous_variant p.Pro187Pro
A/T 15491014 downstream_gene_variant
C/G 15491393 missense_variant p.Ser50Thr
C/T,* 15491430 intron_variant
G/T 15491431 intron_variant
T/C 15491476 intron_variant
A/G 15491715 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25238.1
MDYSSRINTSLDLNINPHRLHEELPKKEVEHNFFSLGVKKSSVKEQQSSSALVEELKRVSAENKKLTEMLTEMCENYNAMRSNLMEYMRKNPDKEQSSSKKRKSESSFNNSAPKSMNGNSESSSTDEESCKKPKEDIKTPVSKVYVRTEASDTSLIVKDGYQWRKYGQKVTRDNPSPRAYFKCSFAPSCPVKKKVQRSVDDQSVLVATYEGEHNHPHPSQMEPTAGSNRGVTPCSGSLSSSAPTVTLDWTKSKSSTDSKNITPKMEAPQIPQVLVEQMATSLTKDPNFRAALVAAISGKMLHNN*


CDS Sequence:
>Vu_25238.1
ATGGATTATTCATCACGGATTAACACTTCATTGGATCTCAATATCAATCCTCACAGGCTGCACGAAGAACTTCCCAAAAAGGAGGTGGAACACAATTTTTTCTCTTTGGGGGTGAAGAAATCCTCTGTAAAAGAACAGCAGTCTTCCAGTGCCTTGGTGGAGGAGCTGAAGCGGGTGAGTGCAGAAAACAAGAAGTTGACCGAAATGCTGACGGAGATGTGTGAGAACTATAACGCCATGCGAAGCAATTTGATGGAATATATGAGGAAGAATCCTGACAAGGAGCAAAGCTCATCGAAGAAAAGGAAGTCAGAAAGCAGCTTCAATAATAGTGCTCCGAAGAGCATGAACGGAAACTCCGAGAGCAGCTCAACCGACGAAGAATCATGCAAGAAACCAAAGGAAGACATCAAGACACCAGTTTCAAAAGTTTACGTGAGGACAGAAGCATCTGATACAAGCCTGATTGTGAAAGATGGATATCAATGGAGGAAATACGGACAAAAGGTTACCAGGGATAACCCTTCTCCAAGAGCTTACTTCAAGTGCTCTTTCGCTCCGAGCTGCCCGGTCAAAAAGAAGGTGCAAAGAAGTGTGGATGATCAATCTGTTCTGGTTGCAACGTATGAAGGAGAGCACAATCATCCTCACCCTTCTCAAATGGAGCCAACCGCAGGCTCCAACCGTGGTGTGACCCCATGTTCAGGGTCTCTCAGCTCTTCCGCACCAACAGTAACCCTTGACTGGACGAAATCCAAGTCCAGCACCGATTCCAAGAACATAACTCCCAAAATGGAGGCACCACAAATCCCTCAGGTTTTGGTAGAACAGATGGCCACTTCCCTCACCAAGGATCCTAATTTCAGAGCAGCACTGGTTGCCGCAATCTCAGGAAAAATGTTGCACAATAATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_25238::LG6:15491832-15493832(-)
CCTTTTTATGGTTGGTTAATTTATTTCTTGTTTGGGTTATTTGAGGTTTAATAAACTTACGTTTCTATCATATAAATGTATCTTTAAGATATTTTTAATGGATAATTTGATAACAGATGAAATAATATACCTAAGAAACAATAAATATTAACGTGGACTTTCATACACATGTATTTTGAAATTTTATTTCATTGGATTATTTTAAAACTTAAAGGATAAAATCAGCCACTTAGTACTTTTCACCATTAAGGATTTGAAATCTTAATTAATGCTTATGATGTTTATTTGGTTTTTAATTGCGTATAAGATGAGATTTAAATAAATAAAAGAAACTAGTATACAAATTAAAACACTCTCACTGATTTTTTCAAATCCATCTATAATAAACTAAATTTTCAAACTCTTTTTTTTCTTTTCAGATAATTCAATCATCAACCACTCCTACGGATATCTTCAACGCAAGGTAAATTACGAATCAGTCTTGCATGTCTGAAAAAAAATAATTTAATACGAAACATAAATAAAGTGTAATAATTTATTTCGATAAATTCTAATAATTGAAACGATAGATGACGCAACGTGGAAAATGTTTGGAATAGTAACCTTGACAAGAAATAAAGAAAGGACCCCACCTAGAAACAAAAGTATGACCAGGACAAATTAAGACGACTTCGGGTCAATATAAAACTTCTGTCGACTTCTCATTTTTTAAATATCTATCACTATTTTCAATTTTCTCTAAAAGAAGTTGATTTTGATTTTTAAAGAATACAAGAATATTAAGTAATAGAAAAAAATATCTAATTATTATGAATTAAACATACTTACGTTATGTTTCGAATAATGGATTCGAGGTTAAGTTTTCTTACATGATTTATTTTTTAACTTCAAATTTAGGTCGTAGTTATGTTTTTAACTTTTCTCACACTGTTTGATCGATTGAATTTACCTAAAAGAACACTTATACATTCAAGTTAATATATATTTAGTTAATTTTAACAATAAATATGTAAAAAAGCATAATAAACTATCTAAATATCAATATTTATAAACTTTTAAAATAAATTTTTTATTAGAACTGATCTAAATTACCGTTTATATACCCATGACTTAAATTATTATTAACTTAATTACTCTTAATAATTAATTTGGTTTGGTTATATAGATCAATTTCTTCACAATTTTATTATTGAATGATAAACTTAATTACCCAAGCATTCATATGGTACACATAACACTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAGAAATGCAGAGTCGACGGAAAGAGAAATAAACTTTTGATGTAGTAGAGTATGATGGAGTATCTGTAATGAATAATTTAGTGCAGAATTTTCAAGGCGGGCTTGACTTTGAAATTTGAATTCCATTTGATGTACCTACAATTTCACCGACATATATTTCTGACGTCAAACCTATTCCTTTTAATAATATTATTATTATCGGTGGGTGATTTATTTTAGAAAATAATAAATGGAGTGACACGTTCTTCTTATCTTATTTAGTAGTACAGTCCAAAGCTAGCTCTCTAAGTACATATAATAAGGACGTGTTGAAATTCAAATAATAATAATAAATAAAAAATTAAAAAATAAAATAAAATGCCAGCTCTTAAACAGACAAGTAGTTGGATAGATTGGTAGTGTCGTCTTCTTCTCTCTCCTTCCTCTCAGTTTCCTTCTTCAACTTGTGCTCCTTTCAACTTGCGCTCTCGCTTTCTTCCCCTTATATAAGCCTCTTCCAATTTGTTTACTACAAACTTCACAAATCTTGAATCTTTCACCTTCCTCTATATTCTCTTCATCTGGGTATTGCTTGATTTCAAAAAAATCTAGCTACAGTTTGACTTTTTTGCGTAAAACAGGAGCTTTTCAGAATTGAAGCTTTATACAAGAGTGCTTAATATCACGGGAAAAAGCTTCTTCTTCTCTTTGACTTTAATTGCAAGTC


Gene Sequence:
>Vu_25238(-)
ATGGATTATTCATCACGGATTAACACTTCATTGGATCTCAATATCAATCCTCACAGGCTGCACGAAGAACTTCCCGTAAGTGTAAACAATCCATTCCGATGATGTGAAGATCTTCTGTCAGTAGTTTCCCCTCAGAATAATGTTTGATATGGGAAATAATTCTTTCTTCTGTGTCTGTTCATTTCAGAAAAAGGAGGTGGAACACAATTTTTTCTCTTTGGGGGTGAAGAAATCCTCTGTAAAAGAACAGCAGGTTAGTTAGTTCTGCCAAATCCTCTTCTTTAAGCTGTCTTTTATTTGGGTTCTTCCGAAGCTCACCATTTGGTTGAGCAATTCTCTTATCAGTAATTAAGTTCAGTGTGGAAGCTAGATATTGGCTCTTTTTCCCCTTTTTAGAGCTGCGTAATGATCACGTGTGTGCTGCCATTTCAGTCTTCCAGTGCCTTGGTGGAGGAGCTGAAGCGGGTGAGTGCAGAAAACAAGAAGTTGACCGAAATGCTGACGGAGATGTGTGAGAACTATAACGCCATGCGAAGCAATTTGATGGAATATATGAGGAAGAATCCTGACAAGGAGCAAAGCTCATCGAAGAAAAGGAAGTCAGAAAGCAGCTTCAATAATAGTGCTCCGAAGAGCATGAACGGAAACTCCGAGAGCAGCTCAACCGACGAAGAATCATGCAAGAAACCAAAGGAAGACATCAAGACACCAGTTTCAAAAGTTTACGTGAGGACAGAAGCATCTGATACAAGCCTGGTAAGATTCTGAGCATAAAACATATGTAACTGGTGGTAACCATTAAGACTGTTGTGCATTAGTTTGACAGGCTTTTCATTTTTTCGTGTTTCCAGATTGTGAAAGATGGATATCAATGGAGGAAATACGGACAAAAGGTTACCAGGGATAACCCTTCTCCAAGAGCTTACTTCAAGTGCTCTTTCGCTCCGAGCTGCCCGGTCAAAAAGAAGGTAAATCCATGAGCTAATTAAGCATAACTAAGCATTCAAACTCCTCTATATGGAACTGGATGATCAATCTGAAGCTAAATTTGTGTTTGTAATTCAATATTCAGGTGCAAAGAAGTGTGGATGATCAATCTGTTCTGGTTGCAACGTATGAAGGAGAGCACAATCATCCTCACCCTTCTCAAATGGAGCCAACCGCAGGCTCCAACCGTGGTGTGACCCCATGTTCAGGGTCTCTCAGCTCTTCCGCACCAACAGTAACCCTTGACTGGACGAAATCCAAGTCCAGCACCGATTCCAAGAACATAACTCCCAAAATGGAGGCACCACAAATCCCTCAGGTTTTGGTAGAACAGATGGCCACTTCCCTCACCAAGGATCCTAATTTCAGAGCAGCACTGGTTGCCGCAATCTCAGGAAAAATGTTGCACAATAATTGA