Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25235 LG6 15470509 15472682 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 15470590 synonymous_variant p.Arg22Arg
C/T 15470643 synonymous_variant p.Phe39Phe
T/C 15470656 missense_variant p.Cys44Arg
A/G 15470705 missense_variant p.Asn60Ser
C/T 15471017 downstream_gene_variant
A/C 15471278 downstream_gene_variant
G/A 15472199 missense_variant p.Gly211Arg
T/A 15472360 synonymous_variant p.Leu264Leu
A/T 15472367 missense_variant p.Thr267Ser
T/C 15472436 downstream_gene_variant
G/A 15472679 3_prime_UTR_variant
T/A 15472680 splice_region_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25235.1
MEDEVLNECLCQTKTFDEEFLRDILQQPQEGAAPDLNTFGETSCVIRAGGGDKLMMKNSNSSMMNNLCGENKNKATASPTTYVLSFDKSDDPHSVSAWKDVSHKLPLSSTRTNQGTKKIRSASESMDHIMSERKRRQELTRKFIALASTIPGLKKMDKAHVLREAINYVKQLKERVEVLEEDIQKNGAESSITITRSHLCIDDTNSDEWYGSNEAVPAEVEARVLGKQVLIKIHCGKQKGILLKILSQLERLHLLISTSNVLPLGSTIDITIIAQMGDEYKMVVKDLVKELRQVAMMKSCVSQ*


CDS Sequence:
>Vu_25235.1
ATGGAGGATGAGGTGTTGAATGAATGTTTGTGCCAGACGAAGACCTTTGATGAAGAGTTTTTACGAGATATTCTGCAGCAGCCGCAAGAGGGTGCAGCTCCAGATCTTAATACTTTCGGTGAGACAAGCTGTGTGATAAGGGCAGGTGGTGGTGATAAGTTGATGATGAAGAACAGCAACTCATCCATGATGAATAATCTTTGTGGTGAAAATAAGAACAAGGCAACCGCATCTCCAACCACCTATGTACTGTCTTTTGACAAATCCGATGATCCTCATTCTGTGTCTGCTTGGAAAGATGTCTCCCACAAGTTGCCTTTGTCCTCGACAAGGACCAACCAGGGAACCAAGAAGATTCGAAGCGCTTCTGAATCAATGGATCACATCATGTCAGAGAGAAAGAGGAGACAGGAACTCACCAGAAAATTCATAGCACTTGCTTCCACTATCCCTGGCTTGAAGAAGATGGACAAGGCACATGTACTAAGAGAAGCAATAAATTACGTGAAGCAACTGAAAGAACGTGTAGAAGTGCTAGAAGAAGATATCCAGAAGAACGGTGCAGAATCATCGATCACCATAACAAGATCTCATCTATGTATTGATGACACAAACAGTGACGAATGGTATGGGTCCAATGAAGCAGTTCCTGCTGAAGTTGAAGCCAGAGTCTTAGGGAAGCAAGTGTTGATCAAAATTCATTGTGGAAAACAAAAGGGTATTCTGCTCAAAATATTGTCTCAGCTTGAACGTCTTCATCTCTTGATATCCACTAGCAATGTCTTGCCACTTGGAAGTACCATTGACATCACCATCATTGCTCAGATGGGTGATGAATACAAGATGGTGGTGAAGGATCTAGTGAAAGAACTGAGACAAGTGGCTATGATGAAGTCATGTGTGTCACAGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_25235::LG6:15468509-15470509(+)
TTATTATAATCTTTATGTGGTATTTTATTATTAAAAGATGGTTATCAATACATGTTTGTAAGTAAAAATTGTCAAAAGATATTTTTCTTTTAATTTAGATTGCAATTGAAAATTTTGATCAAATTGTTAATCTTTGTCATATAAGATCAACACATAGTTGATTGTGTTTTTATGTGTACATATTGACGTATTGACTTTAGTTTTTTTTTTGGTAAAATTTGTTTGAGACCAAAGTTCTATAAGAGTTTAACATAAAAATGACCTATTTAATAGTTTATTAATATGTCATATTGTTGGCTTAAAGCTCCTCAGACAATCATAGTTAAAATTTAAGAAACAAAATACAATTAATCTCTCAAAGTTTTCCTTTTAATTTCCATAATGATTCCTGAAGATATAACAACTATCTGTATAATACACAAATACAATTATTTTGCACATACCGAGAATGAAAATAATCATGCATTTCATGCTAATATTATTTTTAATTATTTAAAAACCTCTTTAAACTTCATGTCTCCAACTCAGATTCCCAATTATTTTAATTTCATTTTTTGTGAAAAATATTTTTAAAATAAAACTTCATATTTACTTAGAATAAACTTTAATAATATTTTATATTCGGTCATTCAGAAAAATATTAAAAATGGGGATGGCAGTTAGATAGGAAAATAAAAAATAATTTCAGAAAATTAATAAAAAGGAAAATTTCATTAAAAAATGAGTTCGTACAATTTAATAACGAAAGAACCTAACTTCAATCCGGGATGGCCTCTGGAACTGTCATTGTCTGCACCCTTTCAATCTTTGTGTCATCTAATCAAAAAAGTAATATATACATTAACTTTTTTAATATTTTTAATAAATTATATTAAAAATATGTAAAAAAGCTTGATTGCAAATTTTTCTCTTTTAAAAACATAGTTAAAAAAAATTGAAAAGAACAGAGAATGTTAAGGGTTGCAATCGAAACAGCTGTTATAGGGACTTCTGTTGAAATCGTCAGTGACTTTATTCCTGACAACCAAATAGGAAACCCTTCTAACTATTCATTATCCGACAACGCTGCCTCAATCATTTACACTTTAAAAATAATCATTAATAAAATAAATAATATATAAAGTCATAGTATTTTCATAAAAAAAACATAATTTATATTTTTTATATTAACAATCTTATATCCATGCATCATAGTTTATGGAATAATCTCACACATTACTTATTTTTATAATTTTTTATTTCTCTTTTTCTTCTACGTCGTATACGTAAAAATGAGGTACTATACATGGTTTATTATACCTAATTCATTAATCAGACACTACTCATCTGGTTGCTTGCATGTTGTTCTTCGTGTAACCTTCAGAACTATGTAGACATCTTTCATTTGTAAGTTCAAGTTTTAAGGAAATATTGTTTATTGTAATGCCTCAAAAAGTTGACATCACGTAGACAGAAACAAAAAGCCTTTAGTCTCTGTCTTGTCTTGTCATTGATAATCAACCTTTAAAATTATTAACCGAATAGAACATTAATTAATTAAAACCATTAAGATAAGTAAACAATGATTAAGCTTAATTATGTTGAAAGAGCTTCACGATAACTGTTAACCAAAAAGACTAGTATTTTATACATTAACGAAGATGATTTTCTGAATTTATAACCAGTAATACAATAAGGAGTAATTTCTTGTCTCGATCAATTATTTTTCTTTTTTCAATGCACTCGGTGATTATTTATTGATGACGAGAGCGCCTTTTTCCTCACGCATCTTCTTCTTGGACCAGAACAGTCACACGTATAGGTCCACACCCGCCATACTTCACCTTCTTCCGTGTCCAAATAATGGAGGAAAACCACTGGGGGAAGTTGTCTTCCCATATGGTAATAACTGATTGCAATATATTAATCGCATGATATAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAGTGTAACTTGATCAATTATTGTTTCTGAAAATTGTTG


Gene Sequence:
>Vu_25235(+)
GGGATCGATCCGTAGGAAATGGAGGATGAGGTGTTGAATGAATGTTTGTGCCAGACGAAGACCTTTGATGAAGAGTTTTTACGAGATATTCTGCAGCAGCCGCAAGAGGGTGCAGCTCCAGATCTTAATACTTTCGGTGAGACAAGCTGTGTGATAAGGGCAGGTGGTGGTGATAAGTTGATGATGAAGAACAGCAACTCATCCATGATGAATAATCTTTGTGGTGAAAATAAGAACAAGGCAACCGCATCTCCAACCACCTATGTACTGTCTTTTGACAAATCCGATGATCCTCATTCTGTGTCTGCTTGGAAAGATGTCTCCCACAAGTTGCCTTTGTCCTCGACAAGGACCAACCAGGGAACCAAGAAGATTCGAAGCGCTTCTGAATCAATGGATCACATCATGTCAGAGAGAAAGAGGAGACAGGAACTCACCAGAAAATTCATAGCACTTGCTTCCACTATCCCTGGCTTGAAGAAGGTTGGTTTATCTTTCACTCAAATCCCGTGCATGCCTTGTTAATATCTGTCAAATTTAACACTATTTGCTTTTAATTTTTCCTCAGGGTATATAGATAGTTATGTTATTATCTTCATGCTTCATATATCTTCCTAAAGCACAACCTTTTTAGAGTACAAGTGAAAGGAAAAAGAGAAAGTAACAGATTGATGGTGGGTTTGGAAACCCATTGGTATCATTGCAGACGAAAATCCCGCTTTTCAAAAAGCAGTAAATAAAAAGTAAGTCTTCAACTGTGGATCGAATAAGCACTATAATGAAAATAAAAACATAATGTAAAAGTGAGATGAAAAAAGAGAAAAGATAATGGAGATCACAATCACTCAAGAGAGAATATAATGAATTAGAATAAACCAAACGATAACAGAAAGTATTCTTTGTTATTATCTCATCTGGGATCATGTGAAGTAATGAGCTGTAGTGAATAGGAGTTATCAGAGTAATTATTTAAAGACACAATTTATAACTCAACTTTAAGATTTATCAAACCTTAGTTCATAAAACATAAAAGAGCAAACTTGGTTTGTTATACAGTCAGAAACTGTGGGATCAAGTATATTGGAAGGTACATCAGATCGTGTCGTGAGGGTAAACCAAATCTCAGAGTTAATAGAGGAATATGCTCATGTCATAGTGTGTTTGGTTTTACAATTTAAATGTGTTTTTCATATTTCCAACGTAGTTTTACAATTTAATAGTGAAGGATTATTGGTGAGGGAAAGGCCAGAATAGTACCATGAAGCTTCTGAAACCTGTTCGTGTAGTCGTGGCACAAGACAACAATGTGTGGTGTGAAACCAAGGACGCAGAGAAGAGTGGCTCGTGGAATGCGTGGGACAGTTATATTTTATTTAAATTGGATCACAGTAACCACTTCAAACGATGAACTATTTTCCCTGATCAACCTAAACAACATTAAGAGTTAAGAGTGAATAAAGATGGTGTAGAAAACTTGCTAAAAACTGCTTTTAAAACTGCTAAAAATGTAATAAAATGTGTGTAGATGGACAAGGCACATGTACTAAGAGAAGCAATAAATTACGTGAAGCAACTGAAAGAACGTGTAGAAGTGCTAGAAGAAGATATCCAGAAGAACGGTGCAGAATCATCGATCACCATAACAAGATCTCATCTATGTATTGATGACACAAACAGTGACGAATGGTATGGGTCCAATGAAGCAGTTCCTGCTGAAGTTGAAGCCAGAGTCTTAGGGAAGCAAGTGTTGATCAAAATTCATTGTGGAAAACAAAAGGGTATTCTGCTCAAAATATTGTCTCAGCTTGAACGTCTTCATCTCTTGATATCCACTAGCAATGTCTTGCCACTTGGAAGTACCATTGACATCACCATCATTGCTCAGGTAATTAATTAATAGCAACATATGAGATAATTAGTTTGTTGTTCAAACTTGTGTATTTTGATCTCTGCAATATATTTGTATTGCAGATGGGTGATGAATACAAGATGGTGGTGAAGGATCTAGTGAAAGAACTGAGACAAGTGGCTATGATGAAGTCATGTGTGTCACAGTGACGAGTCCACTCATTTTAGTTTAAGGACTTGAGAATCTCAACTTATGAAGCCAATAATTCAATGGTTTCTTTTGTTTATGTGAGCCAATAAAATTTGATTTATGTTTTCTCCTGTTA