Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25230 LG6 15445787 15449812 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   phosphorylation, phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   is active in   plasma membrane
Cellular Component   located in   chloroplast, chloroplast
Molecular Function   enables   protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 15446022 splice_region_variant&intron_variant
C/A 15446045 missense_variant p.Asp417Tyr
C/T 15446241 missense_variant p.Ala378Thr
G/A 15446286 synonymous_variant p.Leu363Leu
C/T 15446324 intron_variant
C/A 15446477 intron_variant
A/T 15446551 intron_variant
A/G 15447012 intron_variant
T/C 15447017 intron_variant
T/C 15447250 splice_region_variant&intron_variant
C/A 15447253 intron_variant
G/T 15447266 intron_variant
C/A 15447327 splice_region_variant&intron_variant
G/A 15447336 stop_gained p.Arg321*
G/A 15447350 missense_variant p.Thr316Ile
A/G 15447365 missense_variant p.Leu311Pro
C/T 15447453 intron_variant
C/T 15447492 intron_variant
A/T 15447597 intron_variant
A/C 15447955 missense_variant p.Phe222Leu
C/A 15448088 missense_variant p.Gly178Val
C/G 15448407 missense_variant p.Glu112Gln
A/G 15449045 upstream_gene_variant
A/G 15449240 synonymous_variant p.Phe56Phe
C/A 15449670 missense_variant p.Glu18Asp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25230.1
MGDPEGVREQVYNLKKEEVNSINGDDPHAAKTRFKIEQEKKEASLDNKLFHSTLSPLTRTPQMNLLVLFLPIWVLSISLSLPILHAASFISVSQNAQAESPGIHEVRAVHHQNLNKRILIALVACSGLVGGVFLIIVYVWFRRHKTSKLSRSKSQETTEAAKGETLSSVNAKLNYSRMADKKSSVAIFDYQLLEAATNSFSTSSIMRKSGSRIIYRANFDEHFQAANEVSWLSKMRHQNIIKLMGYCVHGQSRFLVYELVENGSLETQLHGPNRGSSLTWYLRLRIAVDVARALEYLHEHSNPPVVHRDLQSSNVLLDSNFNAKLSDFGFAMVSGMQHKNMKMSGTLGYVAPEYISHGKLTDKSDVYAFGVVLLELLTGRKPMENMTSNQYQSLVSWAMPQLTDRSKLPSILDPVIRDTMDLKHLYQVAAVAVLCVQAEPSYRPLITDVLHSLIPLVPVELGGSLRVTEPISSENSH*


CDS Sequence:
>Vu_25230.1
ATGGGGGACCCTGAAGGAGTTAGAGAACAAGTGTATAATTTGAAAAAAGAAGAGGTAAACAGCATAAATGGTGATGACCCACATGCAGCCAAAACTCGTTTCAAAATTGAACAAGAAAAGAAAGAAGCTTCTCTTGACAACAAGTTATTCCACTCCACTCTCTCTCCTTTGACAAGGACACCCCAGATGAATCTTCTTGTTCTCTTCCTACCTATTTGGGTGCTTAGCATTTCTCTTTCCTTGCCAATTCTTCATGCTGCATCTTTCATTTCTGTTTCTCAAAATGCACAAGCTGAGTCTCCAGGTATTCATGAGGTCAGAGCAGTGCACCATCAGAATTTGAATAAGAGAATTCTAATTGCATTAGTTGCTTGTTCTGGTCTTGTTGGTGGAGTCTTCCTAATCATAGTTTATGTCTGGTTCCGTCGACATAAAACCTCAAAACTCTCCAGAAGTAAAAGCCAAGAAACCACCGAGGCTGCAAAAGGGGAGACTTTAAGCTCGGTTAATGCAAAACTTAATTACTCAAGGATGGCAGATAAGAAGAGTTCAGTTGCTATTTTTGACTATCAGCTGTTGGAGGCTGCCACGAACAGCTTTAGCACAAGCAGTATTATGAGAAAGAGTGGTTCTAGAATCATTTACAGAGCTAACTTTGATGAGCATTTCCAGGCAGCTAATGAAGTGAGTTGGTTGAGCAAGATGCGCCATCAGAATATCATAAAACTTATGGGTTATTGTGTTCATGGTCAATCGAGGTTTCTTGTTTATGAATTGGTGGAGAACGGGTCTCTGGAAACTCAATTGCATGGGCCTAATCGAGGGTCATCTTTAACCTGGTATCTAAGGTTAAGAATTGCTGTTGATGTTGCCAGAGCATTAGAATATCTCCATGAACACTCCAATCCTCCTGTGGTTCATCGAGACTTACAATCTTCTAATGTTCTTCTGGACTCTAACTTTAATGCGAAGTTATCAGATTTTGGATTTGCTATGGTTTCTGGAATGCAACACAAGAACATGAAGATGTCAGGAACTTTAGGATACGTGGCCCCTGAGTACATATCACATGGTAAACTAACTGACAAGAGCGATGTCTATGCTTTTGGGGTTGTCCTTCTAGAACTCCTAACCGGAAGAAAGCCCATGGAGAACATGACCTCAAACCAATATCAATCCCTTGTATCATGGGCCATGCCTCAGCTAACTGACAGATCGAAGCTTCCAAGTATTCTTGATCCTGTTATCAGAGACACAATGGATTTGAAGCACTTGTATCAGGTTGCTGCAGTTGCTGTACTCTGCGTGCAAGCAGAACCAAGTTATAGGCCACTCATAACAGACGTGCTGCACTCTCTCATCCCTTTGGTACCCGTTGAGCTTGGAGGGTCATTAAGAGTTACAGAACCCATCAGCTCAGAGAACTCTCATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_25230::LG6:15449812-15451812(-)
TGTAAAAATATTTTATATAACTCTTGTTTATTTTTATTTTTATTCTATTAGCCTACTTTTTCCTTTTGTTTTTTCTCTTTCTGTATATAGACGAGAGTATTCATAAAAAAAGTATTAATAAAATATCAATAGGTTTCTTCTATCAAAACCGTGATTTTAAATCTTAAATTCACTTTATGCAATGTTGCCAAATATATTAAGCAATTTGGGTGAACTATATTAAAACACAAAATTTATTGATAAAAACAGTGTGTGATTATAAACCCAATGAGTGAGATATTTAAAAACAGAAAACAAATTAGATGCAATGTGTATATTTTAATATAATTAAATATGCCTCCAAACATCAAAGAGGAGGATTTAACTAAATAATTGATATACCAATATACTAAACAAAATATATTCACATTTATATCTAACTATATACTAAACAAAATAATTAAACATAACATTATAGTGTTTTATTAGTCCAATGATGCGATTAGTATATTAATGTTATTATTATAAATATTTTACTATATATTGAATAAAACTGTCTTTAAAATCAAGTATATAGTTTAGAATGTAATCGTGTCTGTGATGATATATTACATCCAATTAAAAAAGTGATTACATCTAAAAAGTGTTGGTCCTTTGGAATGTTTCCCTTCCCAATATAAGAATCTGAATGCAAATTTAATTTGAAAACCTATTTTTCTCTGTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGCTTACTCTTTTTTCTTGCCACTTTTTATCTTATTATTAAAACTATGTTTGGAATTATATAATAACTTGTGTAATTTATTTTGTATATATAATAACAAAATTATATTAGTCATTTTTTAAATTATGAAGGGAGAAGAAGAAGAAAATATGGGGGTGGAGAAAGAAATAACCCAAACCATGGATAGATAGCCCAAATGAAACCCAGTACAGTCCCAACCCAACCCACAATTTATAGACCCATCAAACTCTGCGAATTCATTTAGTGTTCAATGTTGTTAAATATTTTATTAAATACTACACTTCTCAAATTCTTTATTTTTAATACATAACTTTTTTTATTTAATTTATTTTCTCAACCAGTATTATTCATTAACATTTTGTTTTATTACTTTTGATTCTGTAAATCTAAATTTTGTTCTCTCTTTCTATTTATTCTATTGTTTGAAAACTTCATGATAACATAGTGGTATTTTTTTTAAGTATATTTTTATAAAACGAGAGAAAATATTTACAGTACATAATAACAAGCAAGAGAGATCAGAAGTGCATGAAAAATTTAAATAAATTTATGATAGAAAAATGTTAGTGATTGTTTAGTCTGTCATAAACTTAAACACGAGAATATAATATCAGATCAAAACTCAAATAAAACATTGTATATGTTATTAATAGTTGTTTAATGTCTAAAATATGTCTTAAATATATGGTAAAGCCATTTTTAGTTATTTTGCCTATGTTTTCCCGTTTTGATGGGATGAGTTTTTTATGATAAAGGTTCACGTGACGTATGTGACGTTACTGCAACATGCATTTTCCTCCAAAAAGTAATTATACATAATGCATTACATGACTATAATTATGGCCAACTTTCTATTATATTGTTGTTTAGTTTAACTGTATTTCTTTGTTGTTTTCCCCCTTTCCTTCGGCAATGGGTGAGCTGTATTGTTTGGTGAAAATTACATGCCATCTTTCTGATATGGTCACATCCTGTTTCCAATTATTCTGTGAGTATGATTTCAACTTCTAAGTAAAAACAGTGGAAATAGCAGTTAAAATAAGAGTTATATTTCATTTCCAAATTCAGCAATCTAGTGTGTATATAAATATGTGCATTGAGAATTGAAAGATACACAATCCACTACTGCTGATTAAGTAAACACAGAA


Gene Sequence:
>Vu_25230(-)
ATGGTAAGATTTAATTTCAATCTATTCAGAAATGACAAGGTATAATGTGTCTTTGAATATGCACTCTACTTTTATGACAAATTGCCAAACAGGGGGACCCTGAAGGAGTTAGAGAACAAGTGTATAATTTGAAAAAAGAAGAGGTAAACAGGTAAAGAGAAGGCTTAGAACTTTATGTTCCAAAAGTTGGCAAAGCAAGCACCTTAGGAAAATCCTTGCATTAATTTTTGTTGGTGTAGCATAAATGGTGATGACCCACATGCAGGTTGTGCATCTCACAAACCCTGGGTGTCCCAGTAACTTTTGAACTCTCCTCACTCACCTTTAGATAACTGCCACGTGATTTCAGGTTCCATGTTGCCCCCCACCTTCTCTCTTCTGTGAAATCTCTCATCATGCTTCATCAATCAGCAAATTAAAAATGGACTAGAAAGTGCTTTCTCGGTTTTCCTGAAAGAAGAACCTTTGTGGCTTTGTCCATTTCTGCACAGCCAAAACTCGTTTCAAAATTGAACAAGAAAAGAAAGAAGCTTCTCTTGACAACAAGTTATTCCACTCCACTCTCTCTCCTTTGACAAGGACACCCCAGATGAATCTTCTTGTTCTCTTCCTACCTATTTGGGTGCTTAGCATTTCTCTTTCCTTGCCAATTCTTCATGCTGCATCTTTCATTTCTGTTTCTCAAAATGCACAAGCTGAGTCTCCAGGTACCATACCAACAACTTCTACGCTTATTTTTAACATTCCTTTTTTAGTTTCTGCTCGCTTCGTGCTTGGTAGTGCCTTTTATGAGTTAGCATTGGTTCTAAACTCTACAAAATTCTGAACTTGATACCCCCAAACTACACAGCCATACTGTACTGTTTCTACTTTCTATTTTCTGTTATCATGAATTTTCCTTGAATCGTGGTCGGGTGTGATCATTTTCTTGATATATATAAGCGTGGTTTCTGAAAAATGCAATTTTGAAAGTAAAAAGTAGTAAAACATTCATATTTTGGTGCTGAAGTCCTTGGAAAACCATAACCTTTCACTGGCAGTCATAAATTCTGATCAAACAAAACTGTCTCCTCATTTTTCTCTTTAAGTAGACATTTTCTGGCTTTAACGATCTCCCGACCAACTTTTTCATCTTATATTTTATTTTTTGAATTGCAATTCCCATCAACGTTTTCTTTGATTTGAATTTTTATGTAACTTCAGTGTATCGGTTTTAAAAAAGCTCTGGGACCGGTTTTTCAAGTGTCAGCAACTGCAATTGTGTCTGCATTTGTCCGTAATTTTCGGCAATATCAAGAAACATGACGGAAACTGCAATTTAAAACCTTGAAATTGGTGCTTAATGAACTATTTTGCTGTCATACTTTGGAACAGGTATTCATGAGGTCAGAGCAGTGCACCATCAGAATTTGAATAAGAGAATTCTAATTGCATTAGTTGCTTGTTCTGGTCTTGTTGGTGGAGTCTTCCTAATCATAGTTTATGTCTGGTTCCGTCGACATAAAACCTCAAAACTCTCCAGAAGTAAAAGCCAAGAAACCACCGGTATGACTATTTTTTCTGGTGAAACTTTATTTGGGTCTTCTTTTTGTTTTTGTGCAGAGGTAATGCAAGCATAGAAAATTCCTTTTCCGCTCCTCATTCATTTATTTATTGAACTTGTAGAGGCTGCAAAAGGGGAGACTTTAAGCTCGGTTAATGCAAAACTTAATTACTCAAGGATGGCAGATAAGAAGAGTTCAGTTGCTATTTTTGACTATCAGCTGTTGGAGGCTGCCACGAACAGCTTTAGCACAAGCAGTATTATGAGAAAGAGTGGTTCTAGAATCATTTACAGAGCTAACTTTGATGAGCATTTCCAGGCAGCTGTGAAGAAAGCAGATAGTGATGCTGATAGAGAATTTGAGGTGATGGTCCTTTAGAATTATACTTGAACATGTATTTCCTGGGATATGATATTTCTCTTTATTGAATTCGCCTTTAGTTGTTGCGCTAAATTTCAGAATGAAGTGAGTTGGTTGAGCAAGATGCGCCATCAGAATATCATAAAACTTATGGGTTATTGTGTTCATGGTCAATCGAGGTTTCTTGTTTATGAATTGGTGGAGAACGGGTCTCTGGAAACTCAATTGCATGGTACATTTTTCATTAATGTTGATCAAGAAAAAAGGAAAAAGTTCATATATTAGGAACTTAATGATCACATGTTGCTCATTGGTATCAACAATTTGTAGGGCCTAATCGAGGGTCATCTTTAACCTGGTATCTAAGGTTAAGAATTGCTGTTGATGTTGCCAGGTGAATTTAGGATGCCTTTTCTGCTTAAAATTAATTAAGTATTCGTTGCCTCATCTATATTGTCTAATGCATATTTCGTCTGTTAGAGCATTAGAATATCTCCATGAACACTCCAATCCTCCTGTGGTTCATCGAGACTTACAATCTTCTAATGTTCTTCTGGACTCTAACTTTAATGCGAAGGTTAGATTGTTATTGACTTAATAATCTTACATGTTCTCAATTAGTTAATTATATTGTTCATTTTCCTTTCTGAGTTTTGTGATTCAGTTATCAGATTTTGGATTTGCTATGGTTTCTGGAATGCAACACAAGAACATGAAGATGTCAGGAACTTTAGGATACGTGGCCCCTGAGTACATATCACATGGTATGCAGGAATATTTATCATCATGAAAAGACATAACATTAACCTTGCCACACTGTTGCTTCATGCTCTTCCTGTTTGATCACTTCACTTTTCTTTTGAAAATCATTTCTTTCTAAGTTTTTATGTCATTCTTTTTTTCTAGTGACTGCTGCCATTGCTAGGTACTATAATAAATAAGTTCTACAATTGTGATTATCCTGAATGACAATCAGTGAATGGAGTTTTCTTATTTGGGGGAAATTCTTTTTATCCTTGTGCAAGTTGAGAAAGGAAAAGGACATAATCTACTTTTTCTTTTGTTGAAGTTTAGTAACTTACTATCTACAGTATTGTAAAGGAAAATAATCCAATTAAGAGGGATAGAGGAAGACAGGAAACCTAAATGGCTATTTTTGGACTGACTGAAAGGGATGGAATGAAGTGAAATGAGGTGTAGTTGGATGGAATGGAAAGGACCTTTCCCTTTCTCTCCCTTGAATTTGGAGGGCATGGGGATGGTATTATCTATTCCATGATAAATTTCCAAACATAGAAATGGTACCTTTGTCCCGTTTCATTCTATTCCATTCCATTCCCCTCATGCATTTCATTCTTTTATATTCATCATTAGATATTGAAGCCTATCCTTAAAAAACTTCAGTAGAACCCATTAAAAAATCTTGATATAGTGTGTAATTTGCAAGTACTAGCTTACTTTGTGAGGGTAGAAGAGATATTAGTGAATTGAACCGTTTCCCCTTGTAATAGCTTTAAGCTGACTGAAACTATGAAGCTTGATCTTTCCATTTTTCCATTTTCCTTCAAAATGAATGTAACAAGAGCCAGCTTTTCAGGTAAACTAACTGACAAGAGCGATGTCTATGCTTTTGGGGTTGTCCTTCTAGAACTCCTAACCGGAAGAAAGCCCATGGAGAACATGACCTCAAACCAATATCAATCCCTTGTATCATGGGTATGTTTTCTCAGTGGAGAAATCTGAATGAAAACTCCAGTTCTGCAGTACTTGATGGTTAAAACTTTCACCTTGCAGGCCATGCCTCAGCTAACTGACAGATCGAAGCTTCCAAGTATTCTTGATCCTGTTATCAGAGACACAATGGATTTGAAGCACTTGTATCAGGTTCGTTGGGTAGAAGCACTGTTATCACAAGTTTTTCTGCTTAATGATAAATGCAACATCTTAAGTTCATGTTAGCATTCTACAGGTTGCTGCAGTTGCTGTACTCTGCGTGCAAGCAGAACCAAGTTATAGGCCACTCATAACAGACGTGCTGCACTCTCTCATCCCTTTGGTACCCGTTGAGCTTGGAGGGTCATTAAGAGTTACAGAACCCATCAGCTCAGAGAACTCTCATTGA