Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25214 LG6 15309639 15311057 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 15309692 upstream_gene_variant
T/A 15309740 upstream_gene_variant
A/G 15309741 upstream_gene_variant
C/G 15309939 upstream_gene_variant
A/C 15309963 upstream_gene_variant
C/T 15309966 upstream_gene_variant
A/G 15309975 upstream_gene_variant
G/A 15309982 upstream_gene_variant
C/A 15310031 missense_variant p.Gly153Val
T/C 15310040 missense_variant p.Asp150Gly
C/A 15310055 missense_variant p.Arg145Met
C/T 15310068 missense_variant p.Gly141Ser
T/C 15310071 missense_variant p.Arg140Gly
G/T 15310255 upstream_gene_variant
G/T 15310322 upstream_gene_variant
C/T 15310406 upstream_gene_variant
A/G 15310456 upstream_gene_variant
A/G 15310855 missense_variant p.Val68Ala
G/A 15310921 missense_variant p.Pro46Leu
C/T 15310949 missense_variant p.Ala37Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25214.1
MAVISRTTTTYSYRHLSRRHFDKETKAFAANTFSRSAWVSAKKPSPTQRIVTRGGRVIVAASPPTKDVVVVTDPLTKKDIVDYLASGFCGHANDNSAAVVAAVSVGNKAEGNDGGAAKKLVLFGNAAITFDLEDLLRASTEVLGKGTFGTTYKAVLEARPVVAVKRN*


CDS Sequence:
>Vu_25214.1
ATGGCAGTCATTTCGCGAACTACCACCACCTACTCCTACAGGCACTTATCCCGACGACACTTCGATAAGGAAACCAAAGCCTTTGCTGCCAACACTTTCTCACGCTCTGCCTGGGTTTCTGCTAAGAAGCCTTCTCCGACGCAGAGGATTGTCACACGTGGGGGAAGAGTGATTGTTGCTGCTAGCCCTCCCACTAAAGATGTCGTGGTTGTCACGGACCCACTCACCAAGAAGGATATTGTGGATTATCTTGCCTCAGGTTTTTGCGGTCATGCCAACGACAATTCTGCGGCGGTTGTGGCTGCAGTTTCGGTGGGGAACAAGGCGGAAGGGAACGATGGTGGGGCAGCGAAGAAGTTGGTGCTTTTCGGGAATGCGGCTATAACGTTCGATTTGGAGGATTTGCTCAGGGCTTCGACAGAGGTTTTGGGGAAAGGGACTTTCGGGACGACGTATAAGGCGGTGCTTGAGGCAAGGCCGGTGGTGGCGGTGAAGAGAAATTAA


Promoter Sequence:
>Vu_25214::LG6:15311057-15313057(-)
AAACGAAAGGGCAAAAGAAATTGAGTGTATCCCATACGATCAAAGCTAGAGAACGAAAGCGGCTTTAATCCCATAAGGGAATCCAAGATGCAAGAGAAAAAATCATAAAGTGTTTTATAAAAGGAAAGAAAAGAAAGAAAAGTCGAAATTAAAATACACATAAAAGCTACAGACTTTAAAACAGCAGATTCCGAAACTTGGAAGAGAGAGAAAGGGTTTCGAGAAGCTCTCACCTTCAAAGCTCCGAGTCACATGGGAAGCAAGGTCCCCGAATATAGAACGCACCACCACACCACACCAAGAGAGAAACCCAAAAGACCAGACCTTTCTCTCTCTCTCTTCTCTTCTTTTCCACTTTCTCTCTCTTGCAAGAAATGTCTTAATATACTCTCACTCACTCTCTATCTCTAATTACCAATCTCTATATATATATATATAAAGGACACATGAACTTGCTGAAATAGGTTATTTTATATAGGACGCGACAGGGAAGGGAGACGATAAGTCGTTCTGCTTATTATTACAAGTTATCATAATTCTAGATAAGCTATAAGAGAGCGACACTGACTTATATTTCAAGTTCAGTTGGATGTGGGTCCCACTAAGCCGGCTTCCTTTTGTCTAAATAATCGGCTTGGAATCTGGAGCTGACAGCTGTCGTTCGGCTTGTAGTAAAAGTTGGAGATGGGTAATAATTTCCTACATCTACACCTAGAGTTTTATGTCGAATATGAACCGTATATAAGATTTTCACTGGACAGAAAAGGTCATTTGAGAGATCGTAGGGTGAGAGAACATAGCGAAAATGTTTGGGCGAAGGAGCGAATAATTTCCGGAAAGCCAATTTTACTGGGTTCAGATACCCCGAGTAACGACAAAGTTTCTCGGACGAGTCTCGAAAGTGTTTGGACTCAGTTTTTGGGAAATATTACGGTTTCTGCCATGGAGGGATGGCACTTATTGTATCACGTGATACGGCGATATAGTTCATGATTGCGATACGATATTATGAGATGAGATGATACTATACGAGAGTTAATAAAGTAAGTGAAGTGAATTAAATGTGTGGTGAGAGCGTGTGTAGGTTATTGTCCCTGTCAGATGTGTACGTTCACCTCTTTTCCCAAACCAACCATAAAATGCGTTAATTACTCTTCATTTTATAGTTATGTTTCTTTAATAAAAATTTAAAATTTAAAACTAGCTAAAAATAGAAAATATTAAGTAATATTATTCAACTATAAATACAAAATTAAAAAAAAAACACATTTTTAACCAAAATGAGAATCTGTATTAGAAATCTTATCTTAAGGTTATTGATATTTACATTGACATAATATTATTAAAATTAATTATCATATTTAAAACATTAATCATTTTAAGATTTAGAATTGCATTACAATTTTAATTCTAAAAGAAATTTTAAAAATTTTAAAAAATAATATTTAAATCATCTATAATTTTGATGTACAAATAATGTAAAATTATTAGACTTACTAAAAGAAATACTTAACAGTAATAAATACATTTATCTTATAGTTATAATATATTTTAAAAAATTTAAAAAGTACCGAACGCATTTAATATTGAACTGGCAATACAAATTAACTATTTTTCTTAATTATAATACACGAATGGATTCTTTTATGGTTAAATATGTTTTTAATTCTTAAACTATTAAGCGAATTTGTTCTTAGTCTCTCTTTCAAACTAAGGTACACTTTGATCCTTCGGAAACTATAATTTTTCATCCTTAAAAACTAATTTTTCGTCCTCACAACTCACGGCGTTAAAAATCAAGTGAGGTGACTAATGGTGATGTGCCACGTCAATTATTCTTTTCTTCTCCTTAAGAGAAACACCTTCCTCCACACTTTCTTTTCTTCTTCTTTCTTTCCATTGCTCACAGTCAATTCCTCAACCCTAATAATCGTTTTCCTCGCTCTTCTCTCTCCCGATTTCTAACATTCCTCCGCCTTTCGCTCCTTCCGGCCACCGCC


Gene Sequence:
>Vu_25214(-)
ATGGCAGTCATTTCGCGAACTACCACCACCTACTCCTACAGGCACTTATCCCGACGACACTTCGATAAGGAAACCAAAGCCTTTGCTGCCAACACTTTCTCACGCTCTGCCTGGGTTTCTGCTAAGAAGCCTTCTCCGACGCAGAGGATTGTCACACGTGGGGGAAGAGTGATTGTTGCTGCTAGCCCTCCCACTAAAGATGTCGTGGTTGTCACGGACCCACTCACCAAGAAGGATATTGTGGATTATCTTGCCTCAGGTTGCAAGCCCAGGGGAAAATGGAGTTGTCCTTTTCTTGTTTTGTCATTCGACCTTTCTTTAACACGTGTTTTGCTACATGATTGTTTTGTTTTGATGTGCTTCTTTCTCTTTTCTTATTTGGTTTAAGAGTATTAATCATGCTCCTTTTTATATCACTTTTTTTTTTACTTTCCACTTGGTCCACGCATTAAAGCTAACAACCAAGAACTAATTTGTGTCTAGCCGCCCCAGCATTATTCTAACATGCAAAAATTCAGCACTTCGGTAATGGATTCTGAGTGTACCAGGTCTACCTTTTGTCCAACTGTTGGTTCAAGAGGCTTTGTTTTTTTTGTCACCTTGAAGCTGTTGTAGTAGAATTAAGATGATTATTAATTAATCTCCTTTATTGACTTGGTTTATGGTTCTAATGTGGTAAGTCTTGTTTTTTTGGTCTTGGTTTTGTTTTCTATTTCCGCAACAATGTGACTATTACTGGTCCCCCGAGTTTTACTGTGGAAAGAATACGGGTAACAAAGTAGAAAATGTAAGTATATCTAACCGTAATTGCAATTGTAACACAGAGGTTTTTGCGGTCATGCCAACGACAATTCTGCGGCGGTTGTGGCTGCAGTTTCGGTGGGGAACAAGGCGGAAGGGAACGATGGTGGGGCAGCGAAGAAGTTGGTGCTTTTCGGGAATGCGGCTATAACGTTCGATTTGGAGGATTTGCTCAGGGCTTCGACAGAGGTTTTGGGGAAAGGGACTTTCGGGACGACGTATAAGGCGGTGCTTGAGGCAAGGCCGGTGGTGGCGGTGAAGAGGTTGAAGGATGCGACGATTTCTGAGAAGGATTTTAAGGAGAAGATTGATGGAGAGTGAGGGAGAAAAACTGGGAAAAATTGATTTGGTGTAAAAAGAAATTACGTGACATACCACCGTTAGCCACCTCAGCTAATTTTTAACATCGTTGATTTTGAAGGACGGAAAATTATAATTTCTTTAAAGAAAATGATCAAAGTGTACCTTAGTCTAAAAGAGAAACTAAAAACAAATTCACTTTATAATTTAGAAACTAAAATCATATTTAACCCATTTTTTTATATTTACATGACTAGTTAACTACTATCTTTGACTCAACAATTAATGTTTGCGATTGTGTTTATGAATAGAAATTAA