Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25123 LG6 14642690 14644576 PREDICTED: trihelix transcription factor ASIL1-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 14643022 missense_variant p.Lys358Met
C/A 14643270 synonymous_variant p.Gly275Gly
T/A 14643365 missense_variant p.Ser244Cys
C/G 14643686 missense_variant p.Ala137Pro
A/G 14643704 missense_variant p.Ser131Pro
C/T 14643819 synonymous_variant p.Glu92Glu
T/A 14644225 5_prime_UTR_variant
A/T 14644232 5_prime_UTR_variant
C/T 14644543 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25123.1
MDGIEDDASYHPNPYRIISQQRGYGYQNSPYSLPVNTEYAHHHDEDEEQEQLEGDDEVDQSNSLQLPQKDGDEENGIDGVGDENEDEEEEVEDDKQIGYYAIKSEDDLEWPPKKQKLKSLISTYELASRVSAPSAAAPVPSAPKPSSGGRNSLTDWTEHETFVLLDAWGDTFLQLGRKSLRCEEWQQVSKMVAQVSKIERTDTQCRNRLDTLKKKYKKEKAKFQESDGGDCKWVYFKRMDELMSSPPQQVGISCGLDSGDYVFMNRGVYLNQANGLDELRDSPENVESTGEEGSDGLQLQAKKRKGRSSGEASSFRLLADSIQKFSRIYEKIENNKRQQMMELEKMRMDFHKELETQKRQILGNLQSEISKLEQRNDENEDSAENGM*


CDS Sequence:
>Vu_25123.1
ATGGATGGCATTGAGGATGATGCGAGCTATCACCCTAACCCATATCGCATCATCAGTCAACAACGAGGTTATGGTTATCAGAATTCTCCATATTCCCTCCCTGTTAATACTGAATATGCCCATCATCATGATGAAGATGAAGAACAAGAACAGTTAGAAGGAGATGATGAGGTTGATCAAAGTAACAGCCTTCAGCTTCCCCAAAAGGATGGGGATGAAGAAAATGGCATAGATGGGGTTGGTGATGAAAACGAGGATGAGGAAGAGGAGGTAGAGGATGATAAGCAGATTGGTTATTATGCCATTAAGAGTGAAGATGATTTGGAGTGGCCTCCAAAGAAGCAAAAGCTGAAGAGTTTGATTTCAACCTATGAACTTGCTTCTCGTGTGTCAGCGCCATCAGCTGCAGCTCCAGTTCCTTCTGCTCCCAAACCATCTTCTGGGGGTAGGAATTCACTTACTGACTGGACTGAGCATGAGACGTTTGTTCTGCTCGATGCATGGGGTGATACGTTTCTTCAACTTGGAAGGAAGAGTCTTCGATGTGAGGAATGGCAGCAAGTATCGAAAATGGTAGCACAAGTTTCAAAAATTGAAAGGACGGATACTCAGTGTAGAAACCGCCTTGACACACTGAAGAAAAAATACAAGAAGGAGAAGGCTAAATTTCAAGAGAGTGATGGTGGAGATTGCAAATGGGTTTATTTTAAAAGAATGGATGAGCTAATGAGTTCACCCCCTCAACAAGTTGGTATCTCTTGTGGTTTGGACTCGGGAGATTATGTTTTTATGAACCGTGGAGTTTATTTGAATCAAGCTAATGGGTTGGATGAATTGAGGGATAGTCCTGAGAATGTGGAATCTACCGGTGAAGAAGGTTCAGATGGACTTCAACTTCAAGCAAAGAAAAGGAAAGGAAGGAGCAGTGGCGAAGCTTCTTCCTTCAGGTTGCTTGCTGATTCCATACAAAAATTCAGTAGGATATATGAAAAGATAGAAAATAATAAAAGGCAGCAGATGATGGAACTGGAAAAAATGAGAATGGATTTCCATAAGGAATTGGAAACACAGAAGAGGCAGATATTAGGGAATTTGCAGAGTGAGATATCAAAACTAGAGCAGAGAAATGATGAGAACGAAGATTCTGCTGAGAATGGTATGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_25123::LG6:14644576-14646576(-)
AAACGAATTCAATTTTTTTATCTCACTCAACATTTAAAAATTAACATATTTAATCTTAAAAATAAATTTCATTATTCACACTAAATGAAAATTTAAAATATATACTTTTAATAATAAAATTTAACATATACGAAAAATGGTATGAAATATTATGATTTATTTACTAAATTAAATATATATTTCTTAAATTTTAAATAAAAATTGTATTTTATTTTTATCATAAATATTATATCAATTTTATCCATAAACTTTACAAATAAATGAATGTCGTCCACAACTATAATGATAATTTTCTTTATTATTGTAAAAATAGAAATGTGATTCTTACTTGTCTTTCATTTATATATTTTTGTGTCTTTATTGTTCAATAATTATTATAGAAGACAACGTGGTAAAATATTTTAAATTATACATTCATTCATAAAGATTGAAAATACAATTATATAAAATTTTTGACAAAACAAAACATTAGTCTCAATCTAAAATTTAGAAACTGAAAACAGCATTAATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATTATAATAAGGATAAATCTCTTTTTCTTTACATAATGTAAAATGAGTTGAAAATTTAGTATTTATTTACAATAAGTTTTTTTTTAAGTAAGTTTGTCGATTAGTCATACTCCTTTTTTATTTAAAAATAAAAATCTAAATAATTTTTAATTGTTAATATTTTTTATCAATAAGATAAAAATTACTATTATGGAAATAGATTGCATAAATTAATCTAGAAGGTAAATATCGTGAAACTAATAGAAAATACTTCAAATACTTATACACATTACTTGTAAGTATATAAGAAAATTACTTGCTTTATATTAATACGAATTCCTGATGGTTTGCAATATACACACAAAAAGAGAAAAAATTGAAAATGAAAAAACCACAATGTATAATCGATTATATTAAAAAAGATAAATAATTTTATTATAAATATTTCAATAATACTTTTATACGTAACATATAACATAATTTTAATACAAATGTTTATATCACAAATATTTCACTAATATTCATATCTTTAATTTTAATAATAATAATAATAATAATAGTAAATAATATATCCAAGTAATATTATCAATAGTGTTTTCTTTTTCTTTTTCACTCTTTTTTATTTAATCAAAGTAATTTTACCTTATCCAATTTTTACTTGTTTCCTTTTATCTTTCTTTACTTTTTGTTTTATTCCTTCTCTTCTTATTCTCTGTCAAAAAACCAAAACATTACTATGCAGTTCCTCCCCGATTCAATGTTTGGATGAGACAAATGAAATATATTACTAAATGTAAAATTTAATTTTACTCATAAATTAAAAAAATTTAAAAAAATAAAATGAGCAACGAAAATTAAAAAAATATGGATTATTTGAAAATATATCGAAAAATGATTTTAACGTGATAATGTGGTGTGATGAAAATTTCAAAATCACATGCTCAGAAAATACTGCAATTAATTGGTTTTAATTTAATTTTGAAAATAAAAAGACAACAGCGCGAAATTGGTTTGAATGATAAGTAAAATACATTTCAATTGTAGAATATTGATTTGAAAAGGATTTAAAATTTAGATTAACAGCACTAAGATTAAAATAAAAAAATGAAATAATGCTTTAATAAAAAATAAGAGAAAAGAAAGGCGACATTTTTCACATTTTATTTCTGTCAAATATTATTAGCTATGACCCTTTATATATATTTATCAAATACACAAATATTGGAAAGCTAATTTCATCATTTTTATTTTTAATATTATTTTTATAATTACTTTATTTTAATAATAAAAAATATTTTTATTTATTTTACTGTTTTTAAAATAAAACACTTTTAATTTTAAATTTTGAATGAAGTCATGTACGAAGCATGACGTGTTGGAAAGTGAATCGAGATTTTTGGTTTACAATGCGTCAAAATGTGATAGAAAAAT


Gene Sequence:
>Vu_25123(-)
AATACAAACTAAAATTAAATATAAAATGAATGTGTTAACCAGGGCACGCACCCGGCTCACGTTAGCAAAGAGCACCTTCTATCTCTGTGGAACTTGTGATGGTGCTTTGTCAATTGACAGTTTCTTTTCTTTCAGTCTGTTTGCAATTTCACACTTTTCATTTCCCTGAAATTTCGTTCTCTCAGGTATGAAACACCAATCACAATCTTCTCATGTTTGATGCTATTGCTTTTATCTCATGAAATTCAACGAGAATTGGATGCACATCTGCTTCAATTATTTTTCCTAAATTCTGTTTATTCCACACATACATGGAAGAAAGATAATTGTGAATAAATTCAGGGTCATGCAATTCATTTTAATTGGAATAGGATATTACACTGTACTCAAAGAGGGGTTGTTGAATGGTTGGTTGAGGGAGATAGAGAGAGAGATAGTTGTAGTTTTGTAGCTTTAGTTTCCTACCAAAATTCTGTTTCTGAATGGATGGCATTGAGGATGATGCGAGCTATCACCCTAACCCATATCGCATCATCAGTCAACAACGAGGTTATGGTTATCAGAATTCTCCATATTCCCTCCCTGTTAATACTGAATATGCCCATCATCATGATGAAGATGAAGAACAAGAACAGTTAGAAGGAGATGATGAGGTTGATCAAAGTAACAGCCTTCAGCTTCCCCAAAAGGATGGGGATGAAGAAAATGGCATAGATGGGGTTGGTGATGAAAACGAGGATGAGGAAGAGGAGGTAGAGGATGATAAGCAGATTGGTTATTATGCCATTAAGAGTGAAGATGATTTGGAGTGGCCTCCAAAGAAGCAAAAGCTGAAGAGTTTGATTTCAACCTATGAACTTGCTTCTCGTGTGTCAGCGCCATCAGCTGCAGCTCCAGTTCCTTCTGCTCCCAAACCATCTTCTGGGGGTAGGAATTCACTTACTGACTGGACTGAGCATGAGACGTTTGTTCTGCTCGATGCATGGGGTGATACGTTTCTTCAACTTGGAAGGAAGAGTCTTCGATGTGAGGAATGGCAGCAAGTATCGAAAATGGTAGCACAAGTTTCAAAAATTGAAAGGACGGATACTCAGTGTAGAAACCGCCTTGACACACTGAAGAAAAAATACAAGAAGGAGAAGGCTAAATTTCAAGAGAGTGATGGTGGAGATTGCAAATGGGTTTATTTTAAAAGAATGGATGAGCTAATGAGTTCACCCCCTCAACAAGTTGGTATCTCTTGTGGTTTGGACTCGGGAGATTATGTTTTTATGAACCGTGGAGTTTATTTGAATCAAGCTAATGGGTTGGATGAATTGAGGGATAGTCCTGAGAATGTGGAATCTACCGGTGAAGAAGGTTCAGATGGACTTCAACTTCAAGCAAAGAAAAGGAAAGGAAGGAGCAGTGGCGAAGCTTCTTCCTTCAGGTTGCTTGCTGATTCCATACAAAAATTCAGTAGGATATATGAAAAGATAGAAAATAATAAAAGGCAGCAGATGATGGAACTGGAAAAAATGAGAATGGATTTCCATAAGGAATTGGAAACACAGAAGAGGCAGATATTAGGGAATTTGCAGAGTGAGATATCAAAACTAGAGCAGAGAAATGATGAGAACGAAGATTCTGCTGAGAATGGTATGTGAAATATTATGCATTATAGTTGTCATTGCTGTGTAAGATATCATATTTGAAGCATTTTGACCCTTCTTTCCAGCAATACTGCATTGTACTACAATTAGAACCGGATGGCCCAACCATGACATTGTATCCATATTCAAAACTGTACTCAATGCCTGTCTGGTCTATTTCTTAACTTTTACATTTTTCAAATTCATGAATAATATTCGATGATATGAATTACCTACTAAACGAGTTGGCATTTTT