Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25099 LG6 14473458 14478837 PREDICTED: homeobox-leucine zipper protein GLABRA 2-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 14473563 intron_variant
T/A 14473566 intron_variant
C/T,* 14473602 intron_variant
C/T 14473604 intron_variant
T/A 14473656 intron_variant
C/T 14473664 intron_variant
G/T 14474129 intron_variant
A/G 14474156 intron_variant
C/T 14474249 intron_variant
G/A 14474276 intron_variant
G/C 14474318 intron_variant
G/A 14474359 intron_variant
A/G 14474384 intron_variant
C/T 14474451 intron_variant
T/C 14474470 intron_variant
G/T,* 14474766 intron_variant
C/A 14474805 intron_variant
T/A 14474993 intron_variant
A/G 14475011 intron_variant
C/T 14475034 intron_variant
A/T 14475203 synonymous_variant p.Ala191Ala
G/T 14475373 intron_variant
T/A 14475378 intron_variant
A/G 14475802 downstream_gene_variant
G/A 14475900 downstream_gene_variant
T/C 14475908 downstream_gene_variant
T/A 14476068 downstream_gene_variant
T/C 14476292 downstream_gene_variant
T/C 14476351 downstream_gene_variant
T/A 14476552 downstream_gene_variant
A/T 14476554 downstream_gene_variant
T/C 14476671 downstream_gene_variant
C/T 14476779 upstream_gene_variant
T/A 14477155 missense_variant p.Leu432His
T/G 14478163 upstream_gene_variant
T/A 14478232 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25099.1
MGADMSNNPPPTSHAKDFFASPALSLSLAGIFRHAGVAAEAEAATSNMEVEEWEDGSGGGERLEEISSENSGPTRSRSEDDFEGEGEHEDADADADGDRKKKKKRKKYHRHTADQIREMEALFKESPHPDEKQRQQLSKQLGLAPRQVKFWFQNRRTQIKAIQERHENSLLKSEIEKLKEKNKTLRETINKACCPTCGVPTTSRDGAMPTEEQQLRIENAKLKAEVEKLRAALGKYAPGSTSPSCSSGHDQENRSSLDFYTGIFGIDNSRIMDIVNQALEELIKMATMGEPLWLRSFETGREILNYDEYVKEFAVENSSSGKPKRSIEASRDTGVVFVDLPRLVQSFLDVNQWKEMFPCLISKAATVDVICNGEGPNRNGAVQLMFAELQMLTPMVPTREVYFVRFCKQLSAEQWAIVDVSIDKVEDNIDASLVKCRKRPSGCIIEDKSNGHCKVIWVEHLECQKSAVHSLYRTIVNSGLAFGARHWITTLQLQCERLVFFMATNVPMKDSTGVATLAGRKSILKLAQRMTWSFCHAIGASSFHTWTKVTSKNGEDIRISSRKNLNDPGEPLGLILCAVCSVWLPVSQNVLFDFLRDETRRMLSIANLSKGQDRGNAVTIQTIKLKENSVWILQDSCTNPYESMVVYASVDITGIQSVMTGCDSSNLAILPSGFSIIPDGLESRPLVITSRQEEKYTEGGSLFTMAFQILTNASPTAKLTVEAVDSVNTLVSCTLRNIRTCLQCEEG*


CDS Sequence:
>Vu_25099.1
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Promoter Sequence:
>Vu_25099::LG6:14471458-14473458(+)
TAAAATTGAAATATATTAATTTTTTTATAAGTTAGAATGAAAATATAGATTTTATAAAATGAAATGAAAATCATTCTTATCAACATACAAACTTGATACTTTTAAATTTTAAATCTTTTTTATTAAAAAAAAAGGTGGTGTGAAAGGTATATTAGGATTAACAATAGACATCTACTTTTTGTTATCCAATTTTAAGGTCTTAATGTAAAGACTTTTTGTCTTCTAGTAAATGTACTAATCCATAATGTGTGGTTAAGAGATTTCTTTTATTAGCTTTTTTATCGAGTAAGATTTTAGTGATATTAAAAAGTTTTGAATTTGCATGTGAACAAGATAAAAGGTAATTACAAATTAAGATAATTACAAATTAAGGTAATTGCAAATTAAGATTTCGTTTGAAATTCCTAATCACTTATGGAAAAATATAATTGGAGTGAGGAAACATCATAATACTTTAAATGCACATTAATTAATAAATATAAACAAAGAATTGATTGTTTTTTTTCTCTCACTCATACATCGTATTGATTGTTCGAGTAACATTAAATTGGAAAGACTAAAAATCAATATTAATTATCCTCACTCAAATTGTTGCTTAGTCAATCAAAATTTTCAATTTAATTCTTCAAATTATCACTTGAGTATTAACCATATTCCCTGATTGATATATGTAAATGATAACAATTTAATAACTAAGTTAGTTAAGTAAAAAAATCTAAAAATATCTATCCAAACAAAAATCATAATAAACAAATCATTAATTCTTTAATTCACTCAAACACTACATTCAACATCAAAATTCAATATATTTATTTTCTTTTCTGTATATAGAATAATATTATTTTATCTTTTACATAAATATATACAACATTAATTAAAATAATTAAATTATCTTAAACTTTTTTATTTATACTTGAAACACTAATGGTTATTTTATCTGTTCGCAACGCTTTAAGAATCAATATATATCTCGTCGAAATAAAAAATGTAACATTTTTTCCTTAGTTAAAGAACTAAGAAAAGAAGGAGTCTATTGGCACAGTTCATATATATATTTTTACTGGTGTGAAAACAAGTCTTTATACTATATCTCATAAAAAATGTCGGATGGGTCAGCTATCAACCCGTAAAAAATCTTAGAAAAAGTTATAATTATTTATTTTTTAAAGTTAATATAAATAAATAAAATTAGTTAAAAGATTAAATATACTAATAATTTAGTTTAAAATTTCATCTGTTCAGTAACTTTTACTACTACCAGAGAAATATATATTTTTTAAATAAGCTAACAATATTAAAAGAAATATAATTTTAATATTTAAGAATGTTAAAACCTTATACAGTCACTGGTAAGAGTTTAAAACTTGAGTTTTTAAAGTAATTTTTATTTTTTTCAGAAAAAACCACCTTACCAATTTCTCCTAAGATGTTGAATCGGTGGGCCTGAAGATCGAAAAGCAAATCCTTTAAATTTAATGTTTTAAACTTAAAGGTTTCTTGAGCATTTAATGAAAGCTAAAGACATTCTTTTATTTAAATTCCTTTCACGATTTGTTAAAATTAATTTAAAAAAAAATACTTATCCGAGAATTATCTGCTCCATTTATTTAGGTGGTGAAAGTAAAAAGCAAAAGATAAATGGAGAATTTAAGAAAAAGATACCGTTGAAGTCTTAAATTCAACTGCCCAAGTTAGTTGGGTCTCTTCTCTTCCTCACACTGCTTTCTCTTTATCTTATCTAACAGTCAATCCTACCAGTATTCTCTTTCTCTCACTCACTCCACATTTTGCATAAGAAACAAATAAAATACAATAAATGACAATAATATATATTTAAATAACCTTAGCGAGTTCCTTCCTTTGTTTTTATATTCTTAAATCCATTCTTCGCTACGTCTCTTTCTCTCTTTCTCTCTTCTTTCCCACACAACACAAACTCCACCATTTTAATCTCTTCTTCCAACACATTCTCCATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCAA


Gene Sequence:
>Vu_25099(+)
ATGGGCGCTGACATGTCGAACAATCCACCACCCACTTCTCACGCCAAAGACTTCTTTGCCTCCCCAGCTCTCTCTCTCAGCCTTGTAAATTCTATTATTCTCAGTTTTTCTTTCTTTCCTGTTATGTGTATATATATATATATACACACACACATGTTTTTCGTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTGTTTTTATCTCTCTCACGGCTCTCCCTCCTGCATTCAAGGCTGGGATTTTTCGCCATGCCGGTGTGGCGGCGGAGGCCGAAGCTGCCACTTCGAACATGGAGGTGGAGGAGTGGGAAGACGGGAGTGGAGGAGGTGAAAGGCTGGAAGAGATTAGCAGCGAGAATTCCGGCCCCACGAGATCCAGATCAGAGGATGATTTTGAAGGAGAAGGTGAACACGAGGATGCTGATGCTGATGCTGACGGTGACAGAAAGAAAAAGAAGAAGAGGAAGAAATATCACAGACACACTGCTGATCAGATCAGAGAAATGGAAGCGTTAGTATAATAATATACAATCTCACTGTTTTACGTCTCTGCACCATTAAGCCTGAGTTCGCAAACATCATTAACACATTCTCTCTTCTGTCCCAGAAAACTCTTTACTAATGATTCAAATTCATTAAAAAATTCAAAATTTTATGGCTTTATTTTCTGTCTTTTTAGAGGGTTTTACAGTTCCCAACAAAGTGTGATATAACGTGTTGAGCTGAGTTTGGATTATTGGCATTGATTAATGGAAGAAAATACAAAATTTTCTTCCATTTTTGCTGAGTTTCTGTCATTCCTCCTGCATATACTTCTATATATAGGCGTCGTCATCATTACTGTTACCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGCTATAGTTAGTATTTCTTAATCGAGAACCCTTTGGGGTGGTTTTCTTTGCTCGTGTCATTAGATATAATCAGTCATTGATTTAGGTTCACCTATAAAACCAAGCAATGATTTGCAAGCGAGAGTTATCAGTGGTGACTTTAAAGCATGGCTGCTCAGTTTGTACCCTACTACTGGCCACGGTTCATAAGAAAATTATTGATATCATATGGTTAATAAAAGGACGATGATGAAAAGCAAAGCTTGAAATTCTTAGCTTTGAACTGCTTTTGCTTTATTTCTTTGTTTTATATTAGGATTCTACACCTATGAAACACATGATGAAAAATTATATTTTTAACTTTTAAGCTGATTCTTCCTAAATCATTTCATATTTCAAAATAAAAGTATTATATCGGCACCTTGATATCATGGATGGGTGTTCTTGTTTGTGTTACATTCTTCGTTTGATTATTTTATGCCCTATTTGTTGGAAAACTGTGCCTATAAAATAAGTGATCAAGAGAAAAACTGACATGAATGTAATGTTGTTTTACAGGCTTTTCAAAGAGTCACCACATCCTGATGAAAAGCAGAGGCAACAATTAAGCAAGCAATTAGGCCTTGCTCCAAGGCAAGTCAAGTTTTGGTTCCAAAATCGTCGAACCCAAATCAAGGTAATTAATTTAATTTAATTTATTCACTTACTCACAAACCCAGGTACTCCGTTGACCCTAGTCCAGTTTTTGATAATTTTTTTGGTACCTTTTTAGCTTATTATGTATACATAAGCGTTGGCTTTTGCAGGCAATACAAGAGCGTCACGAAAATTCTTTGTTGAAGTCAGAAATAGAGAAACTAAAGGAGAAAAATAAAACCTTACGAGAGACAATAAACAAAGCATGTTGCCCCACCTGCGGCGTGCCCACCACAAGCAGAGATGGAGCCATGCCGACCGAAGAACAACAACTACGTATTGAAAATGCCAAACTCAAAGCCGAGGTTTACTTGTTAATTTACGTTGTTAGTTTCCTTATTTTCTTGATTATAAAACAAAAGCTAACGTTGAAAAGATTTTCACTCTCACTCATCACACGTACTGTTTGTAGGTAGAGAAGCTTCGAGCAGCTTTAGGGAAATACGCACCTGGGTCAACGTCCCCTTCGTGTTCTTCTGGCCATGACCAAGAGAACAGAAGCTCTTTGGATTTTTACACTGGAATTTTCGGAATCGACAATTCAAGGATAATGGATATAGTCAACCAAGCATTGGAGGAACTGATTAAGATGGCTACCATGGGAGAACCATTATGGCTACGTAGCTTCGAGACTGGTCGCGAAATACTTAACTACGACGAATATGTGAAGGAGTTTGCAGTTGAAAACTCAAGCAGTGGAAAGCCAAAGAGATCCATTGAAGCCTCAAGAGACACTGGAGTTGTTTTTGTGGATCTCCCTCGGCTTGTCCAAAGTTTTCTAGATGTGGTAAGAATATATAACACACCTATATGCATGTATATATTTTTTTAAATCATAAACATAATCTTGAAGAACCATATGAATACTATGATGTCTCATTAAGTAAACCGAAGCTTGTCTTGAGAGTAGTACTTCATGACTCGTGAAAATCTTGCAGAATCAATGGAAAGAAATGTTTCCATGTTTGATATCTAAGGCAGCAACAGTCGATGTTATATGCAACGGAGAAGGTCCTAACAGGAATGGTGCAGTGCAACTGGTAAGAGGAAAATGTTATTACCGTTTTTCTTTCTTCTTACATGGTTTCTGTCAGTAATTAATTCTCCTCCATCAAACACTGAATTCACCGTACCACAAACTGCACACTGAATTTTATTGCGATAATAATGTAAAAAAGTGATGAACTGCATACCTACACCGGCTGCTCGTGTTCCACGTGCCTGCAAACTATGTTATATTATATTAAATTCACCGGGTCCTACTTAGTGAAAGGTTTGATATAATATTAAAAAGTTTAGGCAGTCACGCTCAATCGTTTTCGTTCAGCCAAATGTTTTTAATAAAATTTATTTTCCGTTTCAATCGAGAAACAACTCTTCAAACGTGGATTTATTGTTATGCAAATTTATTTTCTCAGTGGTCCACGTCCACCCATTGAAAACAAGAGAAGAAGATGCTTTCGAGCTACTTCCGTACATTTTAACGTTTTGTCTTAAAGTTGTAAATGTTTAAGGTAAAAAGCTTGAGTTGCATGAGTAAACATACGCTTCCACTCACAGAAATTACGGTTTCATAACCCCATGCTCATGCAATGGTCTTCTGTTTCAAAGTGCGAACTTTTTTTTGGCGCCTTTCAAAATACGACCTTTATTTATTTATATCACACAAAGTATAGAGACAAAGTCGCAGAAGGTTTTAAAATGATAGTAACATAATATACCCATGTACTATGTATAACTGTCGCCATTTTCCAATGTGTGTGTCCAGCTGGAATCTCTTTCTCTGTCTCTTTCTCTTACGTGTCCTTTATGAAAAGAGTTATGGTAAATGCCAACAAAAAAAACATAAATCAGTGTTTAATAGCTTATACCCCACCATGCATGAACAGAGAAAGACGATAATGACCTTGTCGAAGTTCTAAATTGTGGACAAGACTAAAGCTTTTACCCAGTACTATGGTTTTAATTTGACAAGAAACTATAAACCTTAATTTTGTATATATTGGGTGCAGATGTTTGCTGAGCTGCAAATGCTCACTCCAATGGTGCCCACAAGAGAAGTCTATTTTGTCCGTTTCTGCAAACAGTTGAGTGCTGAGCAGTGGGCAATCGTCGATGTATCCATAGACAAAGTAGAAGACAACATTGACGCATCCCTCGTGAAATGCAGAAAACGCCCTTCCGGTTGCATTATTGAGGACAAGTCCAATGGCCACTGCAAAGTATGTACAAGTCAAGTCATACATTGATTCACACTTCTGTTACATTCGGACCCATGAAAATTTCAACCTCAATATTTTGTTTTTAGGAAATGCATTCGTCGTTATAGTCGGTGCAAAAACTAATCAGTGAGAAAATTAAATAAACTATATGGGTACAGAAACTAGGTGGTACCATTAGGAATTTCGTCGGTGGTAACATAATCATTACTTGAATGAAGCAAAGCTATATATAAAGCTGTTATGTTAATAAAATAAGGAAGACAGTTGATGTTTTGTGATCAAACATTTAGTTAGAAGAACAGTTGGTGAAGTGGATTTGGAGTTATTGAAGTAAAAAAGGTAATAGAGAGTAGACTAGGTATTGATCTTTGTTTTGTCTTTAGGTAATATGGGTGGAGCACTTGGAATGCCAGAAGAGTGCAGTTCACTCCTTGTATCGTACCATTGTGAACAGTGGCCTAGCCTTTGGAGCAAGGCATTGGATTACGACTCTACAACTTCAATGTGAGCGTCTGGTTTTTTTCATGGCAACTAATGTTCCCATGAAGGATTCAACTGGTGAGTAATCAATTCTAACAAGTTACTTTGTTTAAGATTACTTTACTAAGGATCATCTACAAATAAAGAGTGCTGCATGCATCACAAAATGTTACTTAGGTGTTGCCACATTGGCTGGGAGAAAAAGCATTTTGAAGTTGGCACAAAGAATGACATGGAGTTTCTGCCATGCAATTGGCGCATCAAGCTTCCACACATGGACTAAGGTTACAAGCAAAAACGGGGAAGACATAAGGATAAGTTCTAGAAAGAATTTGAACGATCCTGGTGAACCTCTTGGGTTGATACTGTGCGCTGTTTGTTCTGTATGGTTGCCAGTCTCACAAAATGTTCTGTTTGATTTCTTGAGAGATGAAACACGCCGAAGTGAGGTACCACTCTTGTCTTCTTCCTTCTTAATCTTTTTTGTCAGTTTTGGTTTAATAAATTTATTGGCTAAATTTGCTGATACTTATCATATATATATATATATATATATTGTCTAAGTGGGATATCATGTCAAGTGGTGGGACAGTGCTGTCCATTGCAAATTTATCCAAAGGACAAGACCGAGGCAATGCAGTTACCATTCAAGTAAGTTGTTTCGGTTCAAATTTCAATACTTCACGAAATGAAAATGTGAACTGCATTCAGATCAAACTATGGTGCTAAGTGAAATATGGGATTATTTATTCCACAGA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