Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25067 LG6 14183427 14188282 PREDICTED: lysM domain receptor-like kinase 3
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 14183620 5_prime_UTR_variant
T/C 14183812 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/C 14183817 5_prime_UTR_variant
A/T 14183818 5_prime_UTR_variant
A/T 14183819 5_prime_UTR_variant
A/T 14183824 5_prime_UTR_variant
T/A 14183833 5_prime_UTR_variant
A/G 14183844 5_prime_UTR_variant
C/T 14184044 5_prime_UTR_variant
T/G 14184047 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/C 14184122 missense_variant p.Arg10Thr
T/A 14184216 synonymous_variant p.Thr41Thr
T/G 14184217 missense_variant p.Ser42Ala
A/C,G 14184390 synonymous_variant p.Leu99Leu
T/A 14184995 downstream_gene_variant
A/T 14184996 downstream_gene_variant
C/T 14185440 missense_variant p.Ala248Val
A/G 14185519 synonymous_variant p.Arg274Arg
C/A 14185561 missense_variant p.Phe288Leu
T/C 14185569 missense_variant p.Phe291Ser
A/T 14185588 missense_variant p.Leu297Phe
A/C 14185645 missense_variant p.Gln316His
C/G 14186059 downstream_gene_variant
C/T 14186241 downstream_gene_variant
A/G 14186566 downstream_gene_variant
G/T 14186638 missense_variant p.Arg449Met
C/T 14186732 synonymous_variant p.Asn480Asn
A/G 14186735 missense_variant p.Ile481Met
C/T 14186894 missense_variant p.Thr508Ile
C/T 14186922 synonymous_variant p.Tyr517Tyr
C/A 14186955 downstream_gene_variant
A/G 14187203 downstream_gene_variant
T/A 14187213 downstream_gene_variant
G/T 14187251 downstream_gene_variant
G/A 14187279 downstream_gene_variant
C/G 14187333 downstream_gene_variant
A/G 14187466 downstream_gene_variant
G/T 14187503 downstream_gene_variant
A/G 14187732 upstream_gene_variant
T/A 14187740 upstream_gene_variant
A/G 14187750 upstream_gene_variant
C/T 14188020 synonymous_variant p.Ser628Ser
C/A 14188021 missense_variant p.Leu629Ile
T/C 14188134 3_prime_UTR_variant
G/A 14188185 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25067.1
MNPSIKQRLRLLLLYVILLRLCCTSSYPTPTNCTDTSRVCTSFLAFKPKPDQTLAVIQSMFDVLPGEITYEDNGWDYLFIRKNCSCDAGMKKFVSNTTLTVKSNGGFVHDLVKEAYDGLALLPNTTHGARKDHGIISLNLFCSCSSGLWNYLMSYVIKNGDSVESLASRFGVSMDSIETVNNGIDNPGGFSVGALYYIPLNSVPGELYHFKNDTPPVPVPSPSVDGFSADQINQKGRMSHEWIVGGFAVGLALIILSVVVCVFLRSPNCLVEARNNATNSAGKISNKFYVFGNPNLLCGCGKPVDQKQTDGESSSQQITVTTKASSLIPHMLDMDRPVVFSYEEIFYSTDSFSDSNLLGHRAHGSVYYGLLRDQEVAIKRITATKTKELMSEIKVLCKVHHANLVELVGYAASHDDFFLIYEYAQKGSLSCHLHDTQNKGHSSLSWITRVQIALDAARAIEYIHEHTKTRYVHQGIKTSNILLDASFRAKISDFGLAKLVGKTNEGETTASKGVNAYGYLAPEYFSNGLATTKSDVYAFGVVLFEVISGKEAIIQTQGPEKRPLASIMLAILRNSPDSDSMSSTRNLVDPTMMDLYPHDCVHKMAMLAKQCVEEDPVLRPDMKQVVISLSQILLSSAEWEATLAGNSQVFSALVQGR*


CDS Sequence:
>Vu_25067.1
ATGAATCCTTCAATAAAACAACGGTTGAGGTTGCTACTTTTATATGTAATTCTGCTTCGTCTTTGTTGCACGAGTTCTTATCCCACGCCAACAAACTGCACCGACACAAGCCGCGTTTGTACTTCTTTCTTGGCCTTTAAGCCTAAACCGGACCAAACCTTGGCTGTGATACAAAGCATGTTTGACGTGTTGCCCGGTGAGATCACTTACGAAGACAATGGCTGGGATTATTTATTCATCAGAAAAAACTGTTCTTGTGATGCTGGTATGAAGAAATTTGTGTCTAACACCACACTAACAGTGAAATCCAATGGAGGGTTTGTGCATGATTTGGTGAAGGAAGCCTATGATGGGCTTGCTCTCTTGCCCAACACCACACATGGGGCAAGAAAAGATCATGGTATCATATCACTGAACTTGTTCTGTAGCTGCTCCAGTGGACTGTGGAACTATTTGATGAGCTATGTCATAAAAAATGGGGACAGTGTTGAGTCACTAGCAAGCCGGTTTGGGGTTAGTATGGATAGCATTGAGACAGTGAATAATGGCATTGACAATCCTGGTGGCTTCTCTGTTGGTGCTCTCTATTATATACCTTTGAATTCGGTTCCTGGTGAGCTTTATCACTTCAAGAATGACACTCCTCCAGTTCCAGTCCCTTCCCCGTCTGTAGATGGATTTTCAGCCGACCAAATCAACCAGAAGGGTCGTATGTCCCATGAATGGATCGTAGGAGGTTTTGCGGTTGGTCTTGCTCTGATAATATTGAGCGTTGTTGTCTGTGTATTCCTGAGATCGCCTAATTGTTTGGTTGAAGCCAGAAATAATGCAACAAATTCTGCAGGAAAGATCTCTAACAAGTTCTATGTTTTTGGCAATCCAAATTTGTTATGTGGATGTGGCAAACCTGTGGATCAGAAGCAAACTGATGGTGAATCCAGCAGTCAACAAATTACCGTAACAACCAAAGCATCGTCCCTAATACCTCACATGTTGGACATGGATAGGCCTGTAGTTTTTTCATACGAAGAGATTTTTTACTCAACCGATAGTTTCTCTGATTCAAATCTGCTTGGGCACAGAGCACATGGTTCTGTTTACTATGGTCTCCTTCGTGACCAGGAAGTTGCTATTAAGAGAATTACAGCCACTAAAACTAAAGAACTTATGTCAGAGATAAAAGTTCTGTGCAAGGTTCATCATGCTAATCTGGTAGAATTGGTCGGCTATGCGGCTAGTCATGATGATTTTTTCCTTATTTATGAATATGCTCAGAAGGGTTCACTCAGCTGCCATTTGCACGATACTCAAAATAAGGGTCATTCATCTCTCTCCTGGATCACAAGGGTCCAAATTGCACTTGATGCTGCTAGGGCCATTGAATACATACACGAACATACAAAAACTCGCTACGTCCATCAAGGTATCAAGACAAGCAACATATTGCTTGATGCTTCCTTTAGAGCCAAGATATCAGATTTTGGGTTAGCAAAACTAGTTGGTAAAACAAATGAGGGAGAAACCACAGCATCCAAAGGTGTAAATGCATACGGATATCTCGCTCCAGAATACTTTAGCAATGGCCTTGCAACGACCAAAAGTGATGTCTATGCATTTGGCGTTGTTCTTTTTGAGGTTATATCAGGGAAGGAGGCCATCATTCAAACACAAGGTCCTGAAAAACGACCATTGGCATCTATTATGTTGGCAATTCTTAGGAACTCACCTGATTCCGATAGCATGTCAAGCACAAGAAACCTCGTTGATCCTACTATGATGGATCTGTATCCCCATGACTGTGTACATAAGATGGCCATGCTGGCAAAGCAATGTGTGGAAGAGGATCCCGTATTACGCCCTGACATGAAGCAAGTTGTGATTTCCCTCTCACAAATCCTGCTGTCTTCTGCTGAGTGGGAAGCAACTCTTGCAGGGAACAGCCAGGTATTCAGCGCTCTTGTTCAGGGAAGATAG


Promoter Sequence:
>Vu_25067::LG6:14181427-14183427(+)
TCTGATCAGCCAGTGACTGATATGCTTTACGAAAATGTGATACTTGTTTGAAAAACCTTCATTTATACAATCAGCCACGGGGAAGTATTTTCTTTCTTTTTTGTCATAATTGTTAATGCAACAAGATTATGTTTTGTATTCATTTTCCATTTCTTCACTTAGGTGTCAAGTCATATTGAATGCTATTTTTTACGGATATCTTCTGGACCAGGTAATCTGTTTGGTGGCAGGCAACATGGCGGTACAGATGGCTACTGGACAACTATTTTTCTGTATCATGTCTCACTGGAATTTTGTTATCTAAACCATGTAGACCCCCTTTTCATCTGATTTTATTTTTTAAAAGTAATTTTTACTATTTTTTAGAACAAAAAGGTTACTGTAATAATTGATGACCATGCTAACTTTATTAACTGCTATTCCAGTGCTACAGTGACTACGATGTCATCAGGCATTTCAAATTCCATTAGTGGAAAAGCGGGAGATAGCTCAAAGGATCGCAATTTGGGCGATAAAGGATCCAATGTTCAGAAGAGAAGATCCTTTAACGGGAGCATTCCTTCATAGTACGAGTACATTGCATTAAGCAGTTCTGGTTCTTGAAGTTCAGAGTTTCGCTGTGATCTGGATCCAGAATTAGTTGCAATACCCTGATGTGTTATACTCCCCTCACTCACGCTGCTAATAACTCTTCCGTTCATTGAAGTTTTAAACTTAGGTTATGCCTAGTTTAGGCGAAAGACAGTGTAAAATAAAGTTGAAAAATTAAAATGTAGTTTTTGATAGAACAAGAGTTCTACCTATAATCATTTTATGTATCTATTTTTGCCTTTAAGCAGGAAGAAATAATGTGATTTTTTTTTCTTCTTAATTACTCAGATATATGTACCACTCTATTTAATCGTTTTTTATTTTACGGAATTGAAGTTGATAAAAAATATGCTGATTAACAAGTGAAAATACATTTTATATATTATATCACTTTTCATTCCAAAATTATTTCTGATAAAGATTTAATTTAGTTATCTTAACTGAAATGAAATTTAAAATTTGTAAAATAACAATATATAGAATAAAGAGAAAACACCAAAACATCAATGATCGGAGATATTGGAGCTTAAATGTACTAAAATAATTATAAATTTCATGTGTTAATTAATATTTAGATAAACAATATTTTAACATTCCTATTTTTGTTCAGAATTTGAAATAGGTCCCTTTATTTTTTAGCGTCTCAATTGGGTCCTTATTTTTGTTAATTTGATGCAAATAAGTCATTTCCGTCAATTTCATCAAACGGCGTTAATGAATGTGTAACGTGGCCTGAGGACAATATTGACACGTGTAAGGCCACATCACACATTCATTAACGTCGTTTGATGAAATTGACGGAAAGGACTTATTTGCATCAAATTAACAAAAATAAGGACCCAATTGAAACGCCAAAAAATAAAGGGACCTATTTCAAATTCTGAACAAAAATAGGAACCTATTGAGACATTAAACCTTATTATTATTAATTGTGGAATAATTTTGCATCAATCACAAAATGACACATAGATAATATTAAAATATTGTGAAAAAAATGTTTTCAAAAGTATCATTATTATTATATTTATTAATGGAATATATATTTTCTGAGCTCTGAACTGAAAGAGTGGGATCCAAGTAATATTTATAGCAGCAAACACTTTGTCTTGAGTCCATGTGCGACACTGTCCTAGACTCCATTTTAATGTCTTCCGAGAGTGTCTATTCTCTACAGCCGTCACTACGATACTCCTATCTTCACATCCAATCATTCTTCATTCCTTCACTCTAATCACCACACTTCGCTAATTCCCACTTCCTATCTGAATGTCCACCTCTCTTCAATGCAACTAGGAAGCAGCAAATAACTCTTTTGTGTCGGCTGCAGCTAGTCAACGGCTAGTTCGGTGACCTTGTTACCGACGCAGGCCTTTCATCATTTAAGACCAAAACGTTCTTCCCTCTGTTCA


Gene Sequence:
>Vu_25067(+)
AAGAAAAGAAATCATTTATTGGTTCTATTAATGATTTCACTCTTCCTTGGAATCTTAAAACAATTGCAGAGCAAAACCAATTTGTTCCTTTTTCATATGTAAAAATGTTACTACTATGCTATTAATTTTAGCTGCAAGAAAATATCGAGATGTCCCCATCATAGTAGGTTCTTAAAGTTTTCTTGTTTCATTGCTTTCAGTTCAAAATAAATCTTGTGCTTACCTTCTCTTCATTACTTTCTTCTTCCATTAACAATGCAGCATACGTTTCCGTTGGTTGCTTGTCAAATTTAGCACATACCCGTTTACCATTTCATCAATCGTTACATTATAACGTATCTTGTGATGATATTTCTTTTGACCCTGTTTGGATTGTTTCAAATTCTTGAAGAATAAGAAAAAAAAATAGGTTTTTTAAGTTGGAACTTGGAACTGCCACCCTTCATCAAACATTTATATCTTGCTTTCAAGTTTGTACTCTGAATCTGTACTTGAATGTTCCATTAGCCTTCAAACTTGGATAAACTTTCCTCCTTTATTGTCCTTATTCTTTCATTCTAACCTACTTTCTCTAAACCAAGTTCCACTATTTTCTCCTCAACTCAAATTTTTTGTTACTTTATCACAGACTTGGAAACTTCTATTCTCGTTTGTTTTAAGAAAAGAGATGAATCCTTCAATAAAACAACGGTTGAGGTTGCTACTTTTATATGTAATTCTGCTTCGTCTTTGTTGCACGAGTTCTTATCCCACGCCAACAAACTGCACCGACACAAGCCGCGTTTGTACTTCTTTCTTGGCCTTTAAGCCTAAACCGGACCAAACCTTGGCTGTGATACAAAGCATGTTTGACGTGTTGCCCGGTGAGATCACTTACGAAGACAATGGCTGGGATTATTTATTCATCAGAAAAAACTGTTCTTGTGATGCTGGTATGAAGAAATTTGTGTCTAACACCACACTAACAGTGAAATCCAATGGAGGGTTTGTGCATGATTTGGTGAAGGAAGCCTATGATGGGCTTGCTCTCTTGCCCAACACCACACATGGGGCAAGAAAAGATCATGGTATCATATCACTGAACTTGTTCTGTAGCTGCTCCAGTGGACTGTGGAACTATTTGATGAGCTATGTCATAAAAAATGGGGACAGTGTTGAGTCACTAGCAAGCCGGTTTGGGGTTAGTATGGATAGCATTGAGACAGTGAATAATGGCATTGACAATCCTGGTGGCTTCTCTGTTGGTGCTCTCTATTATATACCTTTGAATTCGGGTTAGCATCAACAATCTTCTTCAACACTACAATCTTCTAGTGTTCAATGGTTGGGATTTGGTTATAGGGAGTGCTGTACTTTTTAGCATTAAAGTTGAAGATTCTTTTGATCACCTAAGCAAATGTAGTTGGCTAAATTTTTTAAGTGCATTGCAGTTCCTGGTGAGCTTTATCACTTCAAGAATGACACTCCTCCAGTTCCAGTCCCTTCCCCGTCTGTAGATGGATTTTCAGGTATGGATCAGCATATAATGGAAGAAAGGGAGAAACCATTTTAGTTTTCCCTCAGAAAAATAAAAATAAAAATCAGTCGTGTCTTTATCTTAGCACAAATAGTAAAGGTTGAAGTTTTGTTTACAAACATATCTTATGTTATCTTGTTCTTTTAGTTTATGCTTAACTGTTCTGCCAGTGTCACTAAGCTCTGAAATTCCATAGGAAACATTATTTAGTTAACAAAATTCATGTTAAAAAAAAAGTATTTTTGGCAACTTCTGCATTTATTTATTTATTCATTAATTTAAGACAGTATTGTTTGTACACCTTTTCTATTACATAAGTCCTAACTCAGTTCCCTATTAATTCATAAAACAATAACAAGTACGTCCCAATGCACGTTTCTTTCTTCTTTTTTTCTCAATTATTATGCAAACATTGAGTGTCTAATTGTCTTTTCCTACAGCCGACCAAATCAACCAGAAGGGTCGTATGTCCCATGAATGGATCGTAGGAGGTTTTGCGGTTGGTCTTGCTCTGATAATATTGAGCGTTGTTGTCTGTGTATTCCTGAGATCGCCTAATTGTTTGGTTGAAGCCAGAAATAATGCAACAAATTCTGCAGGAAAGATCTCTAACAAGTTCTATGTTTTTGGCAATCCAAATTTGTTATGTGGATGTGGCAAACCTGTGGATCAGAAGCAAACTGATGGTGAATCCAGCAGTCAACAAATTACCGTAACAACCAAAGCATCGTGTAATCATTGGATTGGACTCTCAAGCATACACTTTTTTTTCTGAAGTCTACACATGTTAATTGACCTCAGATTTGTATTCAATTCTTTGAACTTGTACCACACACGCGCACTCATCTCTATGTGACAATTTTAGATTAACATTGATTAAAATTTGACATTGCAGCCCTAATACCTCACATGTTGGACATGGATAGGCCTGTAGTTTTTTCATACGAAGAGATTTTTTACTCAACCGATAGTTTCTCTGATTCAAATCTGCTTGGGCACAGAGCACATGGTTCTGTTTACTATGGTCTCCTTCGTGACCAGGTTTGTCACCGTATACTTTTAGTTGTGTTATAGAAAAAAGCAAGTGCTTGAGAGCATAAGTAAATAATGAGACAACTATTATACTCCTACTGATTTGGCCTGAATTTAAATCTTCCAGGAAGTTGCTATTAAGAGAATTACAGCCACTAAAACTAAAGAACTTATGTCAGAGATAAAAGTTCTGTGCAAGGTTCATCATGCTAATCTGGTAATGCCTTATTGTTCGCAATAAATTACACGCTTTGTTTTCAGAATAACCTCCTTGCAGCAATTCAAGAGCTTGAGTCCAATTTCTTATTAATTTTGTCAAGGTAGAATTGGTCGGCTATGCGGCTAGTCATGATGATTTTTTCCTTATTTATGAATATGCTCAGAAGGGTTCACTCAGCTGCCATTTGCACGATACTCAAAATAAGGGTAAGATCGCGCCAGCTGCTAATTTACTGTAAAACATCTTTGTTTTTACTGCAGAAATACTTGAATAAAATTTCTAGTGGTATAATCAGTGGTACTGATCAAAACTTCTTATTCAACGATGAGAAGGCTTGAATTGGCGTTTTGTCGTCTTGCCTGAACTTAAGGAATATATGGTTCAAGACCTTTTTTTTTATTTTGTCTTGCTGTTAGGTCATTCATCTCTCTCCTGGATCACAAGGGTCCAAATTGCACTTGATGCTGCTAGGGCCATTGAATACATACACGAACATACAAAAACTCGCTACGTCCATCAAGGTATCAAGACAAGCAACATATTGCTTGATGCTTCCTTTAGAGCCAAGGTACTAACAAATTTGGACACCATTAAATTATTTGTAAAGGTTTTACAGCTGTGCTGATTGCCAGATCTCGCTATTTCAGATATCAGATTTTGGGTTAGCAAAACTAGTTGGTAAAACAAATGAGGGAGAAACCACAGCATCCAAAGGTGTAAATGCATACGGATATCTCGCTCCAGAGTATGTCTACTTGTACAGAAAAACTCCTCTTATATGGAAGGAGAAAAAAAAATGATTTTTTTCCTATTTATAATATTTTGCAGATACTTTAGCAATGGCCTTGCAACGACCAAAAGTGATGTCTATGCATTTGGCGTTGTTCTTTTTGAGGTTATATCAGGGAAGGAGGCCATCATTCAAACACAAGGTCCTGAAAAACGACCATTGGCATCTATTGTAAGTTCCCTTGAGACATTATTGTGTAAAAACTATCACTGGCATATATTGGAATATTGTTAACTAATCATAGCCGTCAAGTCACTAATATTTCTGGTAATGATGGTATATAGGATAGGTTTTGCTTGGTTTGAGGATACAAAATTTACGTACGACAAGTAAACCTTAAATCAAATGCGATGAAAACTAAATAGCTTCTTTGCTTTGACTTTTGATGTATTACATATATTCTTTTTTTATTCTAAACTAGGCAGCTGCAACATCTGTGTTTTCTGGCAACATGTTAAAAATGTCGGATTTTTAATTTAGTATGTACGTCTACATTTTCTCCTTGTTTCATTTATAATGCACGTTCTTGAGGTTTATAGTTGCGAATTGCAACTGTTTTCTTAGGCAAAACCTTAATATTTGTTAAATTACAGATGTTGGCAATTCTTAGGAACTCACCTGATTCCGATAGCATGTCAAGCACAAGAAACCTCGTTGATCCTACTATGATGGATCTGTATCCCCATGACTGTGTACATAAGGTAAGTTGACTTCTCCATTTTTCTATTATTATGTTTATGGTTTGGGATATTTGGTTTTTCACCCAAGAAGCTTGAAGATTGTCCAGCTCACAGCGTAATCAAGAAAATGTTAATTTGTTTCATAGTTTCTCTTGGACTAATGAAAATTAAAAATAAAACAAAACTACATCCACTTTGAAGTGACATCAAGGGATGACATTCTGCATAAGATTTTACTCTACTGGCTCATTGATCTTGGTGTTTTGTTGTGTTTTACATAGATGGCCATGCTGGCAAAGCAATGTGTGGAAGAGGATCCCGTATTACGCCCTGACATGAAGCAAGTTGTGATTTCCCTCTCACAAATCCTGCTGTCTTCTGCTGAGTGGGAAGCAACTCTTGCAGGGAACAGCCAGGTATTCAGCGCTCTTGTTCAGGGAAGATAGTTTACACACCATCATCATCATTTTCCCCCACTACTCCATTATCTTTTCCTCCCCCTTTTACAATATAGAGATACGATAAAATATGAGCTAAGACTTCACATGAAACCGATGGGTCAATTGTATTTTACAGGACAAAGTTTTGGTAATTAAAATATGTTGTGATTGAGTTGAG