Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25058 LG6 14082446 14086539 PREDICTED: putative leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g19210
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 14082458 missense_variant p.Arg5Trp
T/C 14082516 missense_variant p.Leu24Ser
G/C 14082518 missense_variant p.Glu25Gln
A/T 14082572 missense_variant p.Arg43Trp
C/A 14082589 synonymous_variant p.Val48Val
A/G 14082815 synonymous_variant p.Ser69Ser
C/T 14082930 stop_gained p.Arg108*
A/T 14082984 missense_variant p.Ile126Leu
C/G 14083048 stop_gained p.Ser147*
G/C 14083081 missense_variant p.Cys158Ser
T/A 14083242 stop_lost p.Ter212Lysext*?
C/G 14083364 upstream_gene_variant
C/T 14083461 missense_variant p.Ala257Val
T/A 14083482 missense_variant p.Leu264Gln
A/C 14083498 missense_variant p.Gln269His
G/C 14083525 missense_variant p.Glu278Asp
G/A 14083549 stop_gained p.Trp286*
G/A 14083581 missense_variant p.Arg297Gln
C/T 14083915 upstream_gene_variant
G/A 14083952 upstream_gene_variant
A/G 14083984 upstream_gene_variant
C/A 14084414 upstream_gene_variant
A/C 14084440 upstream_gene_variant
G/A 14084483 upstream_gene_variant
A/T 14084556 missense_variant p.Lys484Asn
G/A 14084561 splice_donor_variant&intron_variant
G/C 14084565 splice_region_variant&intron_variant
T/C 14084569 upstream_gene_variant
A/T 14084574 upstream_gene_variant
C/G 14084774 upstream_gene_variant
A/G 14085081 upstream_gene_variant
C/T 14085215 missense_variant p.Leu586Phe
T/A 14085546 missense_variant p.Tyr666Asn
T/C 14085701 splice_region_variant&synonymous_variant p.Ala680Ala
T/C 14085715 missense_variant p.Ile685Thr
A/C 14086439 missense_variant p.Ser862Arg

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25058.1
MDGKRRCHWAWIFTLWCVLAYTILEFSGKATENNSMHHKQGRRKLDDVSGSISIDCGIPEEVAYTDEKTQIHYTSDAQFIGTGTRKNIPLKLTSEIPQGVFTTVRSFPEDKRNCYTLRHPEGGNTIYLIRASFMYGNYDDLNMLPQFHLYVGVNFWDSVKFENATHVVIKEILHVPSLDELYICLLNTDMGTPFISALEVRHFDHSSYRTDSKLLSLYRRFDIGSTTNEIVRFEEDTYDRMWYPYNLPDSTPLSTSFSIDSLNHTAYHLPTAVMKTAVRATNENDSLEFDFDTGHPTSDSYVYMHFAEIEDLKENESRVFDITLNGQILSESVSPKYLLSTTIESKQAIRGSKLKFSMYKKPNSTHPPILNAMEIYIVKEFLQSPTDQEDVKAIMSIKSYYKLMSSLGKSWQGDPCAPLKYSWNGINCSNNGYNPPAITALNLASSGLDGPIIDSFLELKFLEFLDLSNNSLTGPLPDFSKLQYLKTLNLSGNRLSGEIPPVLLERSNNGSLMLSVDPDLCPIGPCEEKKNNIVPLVAGILSAVIFFIVLGIVLTIIWRRRNKNPASKQAVRSNEEVVLKTNNNQFSYSQIMTITNNFDKTIGKGGCGIVYLGYLQDGTQAAVKMLSSKSPQGSQQFQTEAQLLMRVHHKNLASFLGYCNEVGRTAIIYEYMTNGNLEEYLSDLKREPLSWRQRIQIAVDAAQGIEYLHHGCKPPIVHRDIKTANILLNEKMQAKVADFGFSKFFSAENESYVSTVVIGTVGYLDPEYYISSRLTEKSDVYSFGIVLLELITGQPAIIKGHQNTHIVQWVNHFLERGDIQQIVDPKMQGDFDFGSMWKALEAAVSCVPSISIQRPSMNHIVSELKESLKMEATREQEGINSIEMNVVDLEADWGPDAR*


CDS Sequence:
>Vu_25058.1
ATGGATGGAAAACGGAGATGCCATTGGGCTTGGATCTTCACCTTATGGTGTGTCCTTGCATATACCATTTTAGAATTTTCAGGAAAGGCCACAGAGAACAACTCTATGCATCACAAACAAGGAAGAAGGAAACTGGATGATGTCAGTGGTTCTATTTCCATTGACTGTGGGATACCAGAAGAAGTGGCCTACACTGATGAGAAAACTCAGATTCATTACACTTCAGATGCACAGTTTATTGGCACTGGAACAAGAAAAAATATACCCCTCAAGCTCACTTCTGAAATACCCCAAGGAGTTTTCACTACTGTGAGAAGCTTCCCCGAGGATAAAAGAAACTGTTACACACTACGACATCCAGAAGGCGGAAATACTATATACTTGATAAGAGCTTCTTTTATGTATGGAAACTATGATGACTTGAACATGCTGCCACAATTTCATCTCTATGTTGGGGTCAATTTTTGGGACTCTGTGAAGTTTGAAAATGCCACTCATGTTGTAATCAAAGAGATTTTACATGTGCCGTCTTTGGATGAATTGTATATTTGTTTATTGAATACTGATATGGGAACTCCTTTTATATCAGCACTGGAGGTGAGGCACTTTGATCATTCCAGTTATAGAACAGACTCTAAACTCTTATCCCTATACAGACGTTTTGACATTGGATCAACAACCAATGAAATAGTGAGATTTGAAGAAGATACTTATGATCGAATGTGGTATCCTTACAACTTACCAGATTCTACACCACTCAGTACTTCCTTCAGCATTGACTCCTTGAACCATACTGCTTATCACCTTCCAACAGCAGTAATGAAAACTGCTGTGAGAGCAACAAATGAAAATGATTCCCTGGAATTTGATTTTGACACTGGGCATCCTACTTCGGATTCATATGTCTATATGCACTTTGCTGAAATCGAAGATCTTAAGGAAAACGAAAGCAGGGTATTCGACATTACACTGAATGGACAAATTTTGTCTGAATCTGTTTCTCCCAAGTATTTGCTGTCAACTACGATAGAAAGTAAACAGGCCATTAGAGGAAGTAAGCTCAAGTTTTCTATGTACAAGAAACCAAATTCCACCCATCCTCCCATTCTAAATGCGATGGAGATTTATATTGTTAAAGAATTCTTGCAATCACCCACAGATCAAGAAGATGTTAAGGCTATCATGTCCATCAAATCATATTACAAGTTGATGTCGTCGTTGGGTAAATCTTGGCAAGGAGACCCTTGTGCACCGTTGAAATACTCTTGGAATGGTATCAACTGCAGCAATAATGGATATAATCCACCCGCAATAACTGCATTAAACCTAGCCTCCAGTGGATTAGATGGCCCGATAATTGATTCTTTTTTGGAGCTCAAATTCTTAGAATTCTTGGATTTATCAAACAATAGCTTAACAGGACCACTGCCTGATTTTTCAAAGCTGCAGTACTTAAAAACTCTCAATTTATCAGGGAACAGACTCTCGGGTGAAATTCCTCCAGTTCTCTTGGAAAGATCAAATAACGGTTCCCTTATGTTGAGTGTGGATCCGGATCTCTGCCCGATAGGGCCATGTGAAGAGAAGAAAAACAATATTGTTCCACTTGTGGCAGGCATTCTTTCAGCTGTGATCTTTTTCATTGTATTGGGTATTGTGCTGACTATCATTTGGAGGAGACGCAACAAAAACCCAGCCTCAAAGCAAGCTGTGAGATCAAACGAAGAAGTTGTGCTGAAGACAAATAATAATCAGTTCTCGTACTCTCAGATAATGACTATAACCAATAACTTTGACAAAACAATTGGGAAGGGAGGGTGTGGAATTGTCTACCTTGGTTACTTACAAGATGGCACACAAGCTGCTGTCAAAATGCTCTCGTCTAAATCTCCTCAAGGATCTCAGCAGTTTCAGACAGAGGCTCAACTCTTAATGCGTGTTCATCATAAGAACTTAGCTTCCTTTCTTGGATACTGTAATGAAGTCGGACGCACAGCCATCATTTACGAATACATGACTAATGGTAACTTGGAAGAGTATCTTTCAGATCTTAAAAGAGAACCATTGAGTTGGAGACAGAGGATTCAGATAGCAGTTGATGCTGCTCAAGGTATCGAGTACTTGCATCATGGCTGCAAGCCACCAATAGTCCACAGAGACATAAAGACTGCAAACATTTTACTGAATGAGAAAATGCAAGCAAAAGTTGCTGATTTTGGTTTCTCAAAATTTTTCTCAGCTGAAAATGAAAGTTACGTATCAACTGTAGTTATTGGCACTGTTGGATATCTTGATCCAGAATACTACATATCCAGCAGGCTGACTGAAAAAAGCGATGTTTATAGTTTTGGCATTGTACTTTTGGAGCTAATTACTGGGCAGCCAGCCATAATAAAAGGTCATCAGAACACTCACATTGTGCAATGGGTTAACCACTTTCTTGAAAGAGGAGATATACAACAAATTGTTGATCCAAAGATGCAAGGAGATTTTGACTTTGGTTCTATGTGGAAGGCCTTGGAGGCAGCAGTATCTTGTGTGCCTTCAATCTCTATCCAAAGGCCATCAATGAATCACATTGTCTCTGAACTGAAAGAGTCCTTAAAAATGGAAGCAACTCGAGAACAAGAAGGCATCAACTCGATTGAAATGAACGTTGTTGATCTTGAAGCTGATTGGGGCCCAGATGCAAGATAG


Promoter Sequence:
>Vu_25058::LG6:14080446-14082446(+)
CAATGATGCAAAGATGTGATTACTATGACTTTAGAGTTGGAGGAGGTGGAAAAAGAGAAGAGAAAAGATAAGTCAGAAGTGACAATGCTTGACATGAAAGTGACGACACCAAATCACACTTTTTATCAATGAATTTTACTAACTATCCGAATTCTATAATAATTACGGATAAATATTTATCAACAAATATTTATTAACTATCGACAGATAATGAAATTTATTAGTAAAAATTATCCACTATCACTTTTCGATGAATTTTTAATCATCAATAATTTATTTTAATAAATTATTGATTGGTTGTATCCATGAACTAGATTAGTGACTCTTAGTTCCATGTTACTCAAAGTTGTTATGATTGGATAAGTGGTGATAAATGTGTTATCGTTACTATGATACTACTATGAGGTATGTGTTTTCGGTGGATGAATTGAGAGAGTAGTTTAATATTCTTATGAGGAAGATTATTTAATATGAACAAATTAATAATAATAAAGATAATATAAATAGATAGTTTTATTTTTATTAAGACAACATTATTTATTATTTTTAGGCTTAATTATTAACCTAGTCCTTATATTCGTTTGAATTATTTAAGTAGGTTTATAATTTTTATTTGGTAAAGTTAACGTATTTGTAAAAAAATCCAATTAAGGTTTTTCATGTTAGATTAATTTTAATGTCGGATTCATACATATTAAGTGACAATTTATAATATTTTTAATTTTTTTTCTTCGTGACACTAAGTGTCACAAATACATATAAAGCCACTAGCCTCCGGGCATTAAGCAGCCAGTTTGGACACTGAGAGCTATGAAGTGAGTAAGATCTTTGTGTTTTGGGTGCTGAGGAGATACTCTAGCCCACCTAGCGTTGTGCTCTCTGTTTAGTAGTTGTTGAGCGAAAGATGTTCATGTTGAGTGGAGAAAGATGTTTACCATAAAAAGATAACACGAGACTTGAGTCTCCAACACTTTTAATTTAAAACTTTAAGAGAATAGATTGATAGGTCTTTTTCTTTATATAATATTTTATTTTTTTATTTCTATTTAACGTATAGTTGAATTTCCAGTAATCCATAGTGTTTCTGATTTGAATTTCTGAGAATAAACTTGTTTTAAAACCAAAAGTGAAGGTCTACATATTATGGGTAAGTTGTGAGTATTCATAAGGTTTTTTCAATAGTTAATTTTTTTTTCAAGTACTTTCATTGATGAGAAAAATGGATTTTTTTTAGACTTCTGTTACTTGGTTTAATTTTTAAAATGGGAATATAAAATATAATCATGGAGAAAATCCTCATTAACAAATAAAAGTTAATCATAAAAGAAATATACCCACATAGGATTCTAACGTACATTTGAAGTCCAACTCATTTTTGGATAGAAGAAAAAAAGAATTTAAAATATTTTAATTGTAATCCTAAAATATCCGTTTCGAAATTTTAATTTCCAAGGATAAAAATTTGATTAACCTTCCAAATTTCTCTGCTCTATGTGGGTCAAAACTTGGTCAGATTCAACTATAATTTTTTCATGTATGAAACTTGAATATAAAATCTCACTTTTAAGAGATCGATATTTAGTTGAGTATTAAAATGATGTCATGCATAACACCTTGTTCTAATATCCTTAATTGAGTATTAATGAAGTATCTAATCACCCTTTATTGACTGTTATCTAGTATGTCATCATCTCACAGTCACCATTGCACAAGGCATCTCTTGAATCTTAATTTTGGTGACTGCACACAATTTCACTGAAACTGGTAACTTCTCCTCATTGATCCTGAACTGTTTCGGGTCCACGAAATTAATGCACTTCAAAGTTTAAACATCAATATGCGAGGTATCATAAATATCTTCCTAAATAAATTTCCCAACCACCCCATAGGAGTTTATGGAGTAAATGCCTTATCATTTTATTCTAATCACAAAAAATATCAACTGTTTGATAATATCTGCTTATACCAAATAGCAAATGTGATCTCTTTATGAAATTTCA


Gene Sequence:
>Vu_25058(+)
ATGGATGGAAAACGGAGATGCCATTGGGCTTGGATCTTCACCTTATGGTGTGTCCTTGCATATACCATTTTAGAATTTTCAGGAAAGGCCACAGAGAACAACTCTATGCATCACAAACAAGGAAGAAGGAAACTGGATGATGTCAGTGGTGAGGATTTTCTGCTACTGCTCTGAGCTTGTACAAAATTGTCCGAAAAATTATACGTACTTATTAAATGCTTAATCTAAAAGAAAGGGTTAAAGAAAAGTACTGAATTTTTTATTATTATATCCATATATTCTTCTGATGTCAGTTTGTGTTGATTGTAGGTTCTATTTCCATTGACTGTGGGATACCAGAAGAAGTGGCCTACACTGATGAGAAAACTCAGATTCATTACACTTCAGATGCACAGTTTATTGGCACTGGAACAAGAAAAAATATACCCCTCAAGCTCACTTCTGAAATACCCCAAGGAGTTTTCACTACTGTGAGAAGCTTCCCCGAGGATAAAAGAAACTGTTACACACTACGACATCCAGAAGGCGGAAATACTATATACTTGATAAGAGCTTCTTTTATGTATGGAAACTATGATGACTTGAACATGCTGCCACAATTTCATCTCTATGTTGGGGTCAATTTTTGGGACTCTGTGAAGTTTGAAAATGCCACTCATGTTGTAATCAAAGAGATTTTACATGTGCCGTCTTTGGATGAATTGTATATTTGTTTATTGAATACTGATATGGGAACTCCTTTTATATCAGCACTGGAGGTGAGGCACTTTGATCATTCCAGTTATAGAACAGACTCTAAACTCTTATCCCTATACAGACGTTTTGACATTGGATCAACAACCAATGAAATAGTGAGGTAAGTAGCATAATCACAGATGTTAAACAAGTTTAATTTCTTTACATTGTTTAGCTTTTAATCTTGTCTGATTACATGTAGATTTGAAGAAGATACTTATGATCGAATGTGGTATCCTTACAACTTACCAGATTCTACACCACTCAGTACTTCCTTCAGCATTGACTCCTTGAACCATACTGCTTATCACCTTCCAACAGCAGTAATGAAAACTGCTGTGAGAGCAACAAATGAAAATGATTCCCTGGAATTTGATTTTGACACTGGGCATCCTACTTCGGATTCATATGTCTATATGCACTTTGCTGAAATCGAAGATCTTAAGGAAAACGAAAGCAGGGTATTCGACATTACACTGAATGGACAAATTTTGTCTGAATCTGTTTCTCCCAAGTATTTGCTGTCAACTACGATAGAAAGTAAACAGGCCATTAGAGGAAGTAAGCTCAAGTTTTCTATGTACAAGAAACCAAATTCCACCCATCCTCCCATTCTAAATGCGATGGAGATTTATATTGTTAAAGAATTCTTGCAATCACCCACAGATCAAGAAGATGGTTAGTGTTGTTCCTTGTCCTTTCTTTGATTTCCTTTTTGTTTTTTGTAGTAACAGCTACAACTGTTAGAAAGGTAGTAAAAGTATAAATCACGTTACAAGTTAGAAAAGTTGGTTAACGAAATAACAGACATTGACATTATATGCTTGTGAGAATTATAGTTAAGGCTATCATGTCCATCAAATCATATTACAAGTTGATGTCGTCGTTGGGTAAATCTTGGCAAGGAGACCCTTGTGCACCGTTGAAATACTCTTGGAATGGTATCAACTGCAGCAATAATGGATATAATCCACCCGCAATAACTGCATTGTAAGTTCTATTTTCCAAATTTGGAATTTGCATTGTTTAAATCACCGCAGACCAAAACTTATTTGAACTTCGTGCAGAAACCTAGCCTCCAGTGGATTAGATGGCCCGATAATTGATTCTTTTTTGGAGCTCAAATTCTTAGAATTCTTGTAAGTGTTAATTTGACAACCGATTGAGTAGATTCTGTTCCTTCCCAAAAAAGGTTGGAAAATATGATATTTCTTCTCTAAAGTTGGACTTAGCCTTTAACATGGATTCTTTAAACAATTATTAGTCTACCATAATTTTAGTTTAACATAAAAACAATGCTTTGCTTTTCAGGGATTTATCAAACAATAGCTTAACAGGACCACTGCCTGATTTTTCAAAGCTGCAGTACTTAAAAACTCTGTAAGTTATAGAGATTTCAGTATCTGTGTTTGTCAGTGGAAATCAAAATAGTCATCTGACATATGCTATGTTAGCAGCAATTTATCAGGGAACAGACTCTCGGGTGAAATTCCTCCAGTTCTCTTGGAAAGATCAAATAACGGTTCCCTTATGTTGAGGTTTGTTTTGGTTTGAAATAATGATGATAATAAGTTTCTCACTAACCTACTTTTTCTTGTAACTTGTTTATTTTGCTTTTCTTCTTCAATCTTTTGAAACAAAATTGTTATGACCATAGTGTGGATCCGGATCTCTGCCCGATAGGGCCATGTGAAGAGAAGAAAAACAATATTGTTCCACTTGTGGCAGGCATTCTTTCAGCTGTGATCTTTTTCATTGTATTGGGTATTGTGCTGACTATCATTTGGAGGAGACGCAACAAAAACCCAGGTCTGAAAATAGATAAAACTGTCTTACTTTGAAGCTAAACTGAGGATCTCACAATCATTGACTTCAAAATGCATTAAACTCCTTTTGTACAAAGAACAAACTAAACTTTTTCACTTCAAATGACAGAGCAATAATAAATTTTTTATTACTTTGTTTAGCCTCAAAGCAAGCTGTGAGATCAAACGAAGAAGTTGTGCTGAAGACAAATAATAATCAGTTCTCGTACTCTCAGATAATGACTATAACCAATAACTTTGACAAAACAATTGGGAAGGGAGGGTGTGGAATTGTCTACCTTGGTTACTTACAAGATGGCACACAAGCTGCTGTCAAAATGCTCTCGTCTAAATCTCCTCAAGGATCTCAGCAGTTTCAGACAGAGGCATGCTTCTCACCATAGAAATTTGAAATGGCATATTTTGAATTTAAGGAAATATTATAGCTAAGATGGCATGCTTCCACGTATTTGCAGGCTCAACTCTTAATGCGTGTTCATCATAAGAACTTAGCTTCCTTTCTTGGATACTGTAATGAAGTCGGACGCACAGCCATCATTTACGAATACATGACTAATGGTAACTTGGAAGAGTATCTTTCAGGTATATTAATTTGTTTCCCCGTTCATTTCATGCTTGCATTGCATAGCTACTTCATCGATGACTATATTCAAGTAAACAAGACACAATACTCTATTTTGTGTCTGAGTAGATCTTAAAAGAGAACCATTGAGTTGGAGACAGAGGATTCAGATAGCAGTTGATGCTGCTCAAGGTTAGTGGTGTATCAGACTCTTTTATTTTCTCATTCCTCACTTTGATGTGATTAAAGGATGCTGAATTACTGTATTGGAACTTGTACTTATAGGTATCGAGTACTTGCATCATGGCTGCAAGCCACCAATAGTCCACAGAGACATAAAGACTGCAAACATTTTACTGAATGAGAAAATGCAAGCAAAAGTTGCTGATTTTGGTTTCTCAAAATTTTTCTCAGCTGAAAATGAAAGTTACGTATCAACTGTAGTTATTGGCACTGTTGGATATCTTGATCCAGAGTAAGTTTGATCAAACAAACATGGTGCGGTTTCTTATATTTACAAGAAGGTTTTAAGTTGAACATATCGTTTTTAACCTTTTTGAGTTTGCTTTTACAGATACTACATATCCAGCAGGCTGACTGAAAAAAGCGATGTTTATAGTTTTGGCATTGTACTTTTGGAGCTAATTACTGGGCAGCCAGCCATAATAAAAGGTCATCAGAACACTCACATTGTGCAATGGGTTAACCACTTTCTTGAAAGAGGAGATATACAACAAATTGTTGATCCAAAGATGCAAGGAGATTTTGACTTTGGTTCTATGTGGAAGGCCTTGGAGGCAGCAGTATCTTGTGTGCCTTCAATCTCTATCCAAAGGCCATCAATGAATCACATTGTCTCTGAACTGAAAGAGTCCTTAAAAATGGAAGCAACTCGAGAACAAGAAGGCATCAACTCGATTGAAATGAACGTTGTTGATCTTGAAGCTGATTGGGGCCCAGATGCAAGATAG