Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25047 LG6 13938907 13940518 PREDICTED: dof zinc finger protein DOF1.7
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 13938924 5_prime_UTR_variant
G/C 13939495 5_prime_UTR_variant
T/A 13939859 synonymous_variant p.Val104Val
G/T 13939863 missense_variant p.Gly106Cys
T/C 13939865 synonymous_variant p.Gly106Gly
G/C 13939991 synonymous_variant p.Ser148Ser
C/A 13940128 missense_variant p.Ala194Glu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25047.1
MQDPALFQPLKPHFPEQEQLKCPRCDSVNTKFCYYNNYNLSQPRHFCKNCRRYWTKGGALRNIPVGGGSRKNAKRSSSSANTKRASPSPAPEPDPTRVCPSPVVGGGGNFGSLLASGAHLGNLLVGLKSSGANLKAVQMEEFGEDVSSGHLVDPGSGRNPVLEIERNGNAASFLSMQNGDSSCWNGTNGWSNLAIFTPGPSYENL*


CDS Sequence:
>Vu_25047.1
ATGCAGGATCCAGCGTTGTTCCAGCCCTTGAAACCCCACTTTCCCGAACAAGAGCAGCTTAAGTGTCCGCGTTGCGATTCCGTCAACACCAAGTTCTGTTACTACAACAACTACAACCTCTCGCAGCCGCGCCATTTTTGCAAGAATTGCAGAAGGTATTGGACCAAAGGAGGTGCTTTGAGAAACATCCCCGTCGGGGGTGGAAGCAGAAAGAACGCCAAACGATCATCCTCATCCGCCAACACCAAACGCGCTTCCCCGTCACCTGCTCCAGAACCCGACCCGACTCGTGTTTGCCCTAGCCCGGTTGTTGGTGGTGGTGGGAATTTCGGTTCCCTTTTGGCATCGGGTGCTCATTTGGGGAACCTCTTGGTGGGTCTGAAATCAAGTGGGGCGAATCTAAAAGCTGTGCAAATGGAAGAATTTGGGGAGGATGTTAGTTCGGGTCACCTGGTGGATCCGGGTTCTGGTCGGAACCCTGTGCTGGAGATTGAAAGGAATGGGAATGCAGCAAGTTTTCTGAGTATGCAAAATGGTGATTCAAGCTGTTGGAATGGTACTAATGGGTGGTCTAACCTTGCAATTTTCACTCCTGGGCCTAGCTATGAAAATTTATGA


Promoter Sequence:
>Vu_25047::LG6:13936907-13938907(+)
AATTTTATCTAATTTTCACAAGCATAATGACATCCGAAAGAATTGGTAATTGGCCTGGAGGGTTTTTTTTAGAGATGATGATTCAACGTGATGAAATTAGAGAAATTAGTCAAGATGGTGAAATTAAAGAGATCTTAAATGAACCTTTGCCTCAAAATATGTCAATGACTCAATTCACTGAAGATTTTAATCTCTGTAAAAGTTTTAATACAATTACTTAATTTGTTAATTTGTATTTAATGACAACTTATTACTCAATGACGAAAAATGTCTTAAAGAATTTGAATTTAAAATTTATTTATTTTGTGAAATCAAAAGTATATTAATTCATTTATTATTAACTTTCTTAGTTTTGTTCCACTTAAAGAATACATTATTTTTATTTCTGTTATTTTGATTGTGTTTGCTTCTATTGTTGATCTATTACGATGTTGAAAACTTGTGAATTTAATTTACACCCACAACATTATTTTTTCTTAACTCGAGAGACTTTATATTTTTTTATTGGATAGTTTTATTTCATAAAAAAAATTAAAACTAAAAAGAAGTGGACTTGTTTTCTGTATATTTAATAACAAGAATAAACAAATAAAATAACTATCTACTTTTATTTAAATGTAAACTTGACTATTTCCATTAGAAATAAAAGGTAAATTTCAGTAGGTTGGTCATAGAGTCACATAAATGATTATGTGAATTACATATATCTCAACGAATTGATTTTTCAAAATTTATTTATCCGTTAATCTAATATCTGGTAAAATAAAATCAGGTCTTCTAATCGGATTTAAATCAATTCATAGATCTAGTTGTAAATGGGGCCCACTTAATCATTCAACTATGCGGTGTGCGCACGAGGACGGTGCCTCTCTTCAATTGTAATCCATCAACCATATCAAATCATGGCCGTCCAAATAATTCGTTACAACAGTAGGACCCACGTGCTTCCTTAGCCTCACCCTCCACGTCACAGTCACCACCCAGTCAAAAACCCAATTGGAATACAAAATCCTGGGACCCACCTTCTTTAACGTCTCACCCGCGTGTCGATCTAGCATTTCCCAATACCAAATTTACCACTATAGCCTTATCACCAGCAGCTCCCACTTACTGCTAGTGCGTGTGCCACTTATGGGGATCTGCCACATGTCGGAGGTGACACTGACCGTGGCTATGTTGGGGTGGCGATAACTCAACGCAAGAACCCTTCTCAATCCCATCGATACGATTCAACGGTCCAGATCCATTGATGAAAACCACATCATGATGGATGGCTCTTGCTTTGTTCACGCGCAAGCCTGTCGTGGACTCACTGGGCCACAGTTGCCGGCGGCTCTAACCCACTCGCCTGGCTGGGCTCACCCAACTCATCAAGCTTCGATCTACGATCTACGATCTATGTCGGTCATGTCCCTTTCTTAAAATACATGTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTCAAGAGAATAAAGTAAAACAAAACAGTGATGAGGTCATTTTGGATGATATTCTATTAATCTGATAATTAAGTTAACAGAGTCATTCCAACATCGCAAACATTCAAAAGAAAAAATAAAAAAAGAGTGTTGAGGTGATTCGATAGTCACATGTTTATTAGTTTATAACCACACAGGGAATATATGTTCTTATGGTTAATTCTTCCCTCGATATTCTTGTTTGTCTCTTTACCAGTTTTTTTATTACATCATTGTTGTACTTGTATTTAATTGTACAGTTCTTGTACCAGATGTTGAATCAAACCAACTAAAATTTATTGTTTGTTGTCCGTTTGTTTTGAACTTATTGACCAACGAGACAAGGGTAGTTATTCACAATAGTCATCTGTGTATTTTTCTAAGGATGATTTGTCATTGATGATAGGGATCTTGCACCTAAAGCACACCGTTTTAATGAGTGTTATACATGATATGTATGAAGAAGAAGAAGAAAAGATGAGTGTAAAAAGAAAAAGTTGTTATTTAACTTGTTAGTTAAGTTTGGTTAAGTG


Gene Sequence:
>Vu_25047(+)
GGATTCGGGAATATAGCAGAAGAGTGATGGAAATCTTTGGAGCAGTGTGCAGAAGAGAAGAGACTGTGCACTTTCCCTTTCTATCTGAAGGCTGCGGAGTGAGAGGTAGTTATCATTCACGCGTCACATTCACGTTAGGTCATCTCATATCTCTATAATCTCTATAATCTCTATAATCTCATCAACATTTTCAAACTCACTCTTCAAATATCCTTACTTTCCCTAATTTCTCGAATCTTGTTAGCTATCTGCTTAGCCCAGTTAAATCAGTGCCTATTTTTTCAGCCAGTTTCCTCCCTCCACAAGCCAACTTCCTCAATCACCTCACAAATCAATCTCTCTGCCTTTCCACTCATCCATCACACCCTTGTAGCTTTCTGTCCCTTTGAGCTTTTCTTTTCTTTATCTTCAAACACACAACAACTTCGTCCTGGATTTCGTTCGCTTCTGCATACAAAAGGTTGTTTCTTCACCTTCATTTATTACGATTTTGGTCGGTTCTCTACTTCAGCCCAAACCAACCCTTCTCATCCTTTCAACAAAAATCCCACCTTTTTGTCTTCTTTCTACTTTCCCCTCACTTCTTCTGAGATCTTAAACAAAAGGTGCTTCCAAAGTGAAGTCCTTTTTCGAATACGAGAATGCAGGATCCAGCGTTGTTCCAGCCCTTGAAACCCCACTTTCCCGAACAAGAGCAGCTTAAGTGTCCGCGTTGCGATTCCGTCAACACCAAGTTCTGTTACTACAACAACTACAACCTCTCGCAGCCGCGCCATTTTTGCAAGAATTGCAGAAGGTATTGGACCAAAGGAGGTGCTTTGAGAAACATCCCCGTCGGGGGTGGAAGCAGAAAGAACGCCAAACGATCATCCTCATCCGCCAACACCAAACGCGCTTCCCCGTCACCTGCTCCAGAACCCGACCCGACTCGTGTTTGCCCTAGCCCGGTTGTTGGTGGTGGTGGGAATTTCGGTTCCCTTTTGGCATCGGGTGCTCATTTGGGGAACCTCTTGGTGGGTCTGAAATCAAGTGGGGCGAATCTAAAAGCTGTGCAAATGGAAGAATTTGGGGAGGATGTTAGTTCGGGTCACCTGGTGGATCCGGGTTCTGGTCGGAACCCTGTGCTGGAGATTGAAAGGAATGGGAATGCAGCAAGTTTTCTGAGTATGCAAAATGGTGATTCAAGCTGTTGGAATGGTACTAATGGGTGGTCTAACCTTGCAATTTTCACTCCTGGGCCTAGCTATGAAAATTTATGAATATTCTGATATATATGTATATTTAAACATGTTGTGAAAAGATTTATATATATCAGTAGCTTAAGTTAAAGTCTTTGGGATATCGGTATATCATATATATCGTGCTATGGAGATCACAAACGAGTAAGCCACTGCAATAGGATCGATTTTAAAGTTTCTTTTGTGTTGGATTTTTATGTTTGTGGATGGTGGTGTTCTTCACTTTTACCAATGATGGAAGAAAGAAAGACAGCATGTATTTTCTTAGATATGAATGTTGTTGTAGTGAGATTGTTTTCAATGTCATCACGTAGAAGTGCTGCCAATGCCATGACTTGGAGATTCTAATTTATTTACCGTATCTGTGTATTTTA