Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25041 LG6 13884365 13890757 PREDICTED: inactive protein kinase SELMODRAFT_444075
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 13884460 3_prime_UTR_variant
T/C 13884681 3_prime_UTR_variant
T/C 13884724 3_prime_UTR_variant
G/C 13884805 3_prime_UTR_variant
C/A 13884951 3_prime_UTR_variant
C/T 13885013 3_prime_UTR_variant
A/T 13885553 upstream_gene_variant
T/C 13885580 upstream_gene_variant
G/A 13885956 stop_gained p.Gln578*
G/T 13885986 splice_region_variant&intron_variant
A/T 13886191 upstream_gene_variant
G/T 13886487 upstream_gene_variant
T/C 13886503 upstream_gene_variant
C/A 13886505 upstream_gene_variant
T/A 13887281 synonymous_variant p.Arg358Arg
G/A 13887525 missense_variant p.Ser277Leu
G/A 13887783 missense_variant p.Ser191Leu
G/T 13887832 missense_variant p.Arg175Ser
G/T 13888025 intron_variant
A/G 13888049 intron_variant
T/A 13888050 intron_variant
T/A 13888053 intron_variant
T/C 13888060 splice_region_variant&intron_variant
T/A 13888061 splice_region_variant&intron_variant
G/A 13888091 missense_variant p.Ala137Val
T/A 13888094 missense_variant p.Lys136Ile
C/G 13888535 intron_variant
A/T 13888730 intron_variant
A/T 13888736 intron_variant
A/T 13888751 intron_variant
G/A 13888787 intron_variant
A/T 13888791 intron_variant
T/C 13889042 5_prime_UTR_variant
G/C 13889161 intron_variant
T/A 13889179 intron_variant
G/C 13889416 5_prime_UTR_variant
G/T 13889749 intron_variant
C/A 13889956 intron_variant
T/C 13890020 intron_variant
A/T 13890027 intron_variant
G/T 13890468 intron_variant
A/T 13890474 intron_variant
A/T 13890500 intron_variant
A/G 13890609 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25041.1
MNREQQKRGKQEICSDGAEKVIVAVKASKEIPKTALVWSLTHVVQPGDCITLLVVVPSQSSGRRLWGFPRFAGDCASGHKKSSSGSSSSEQKCDITDSCSQMILQLHDVYDPNKINVKIKIVSGSPCGAVAAEAKKAQANWVVLDKQLKHEEKQCMEELQCNIVVMKRSQPKVLRLNLVGKKKKDLEELCSLPSEQDQVLGKQTKNKSDSLNSLKGPVVTPSSSPELGTPFTATEAGTSSVSSSDQGTSPFFISEINSESKKEETIKENPELDDSISDTDSESLSTSSASLRFQPWITDLLLHQRSSQPKEERTERSHSRNQLSTTRALLEKFSRLDREAEIEISTYKTDLDFSGNVREAIALSRNTPLGPPPLCSICQHKAPVFGKPPRWFTYAELELATGGFSQANFLAEGGFGSVHRGVLPDGQVVAVKQHKLASSQGDLEFCSEVEVLSCAQHRNVVMLIGFCIEDKRRLLVYEYICNGSLDSHLYGRQRKPLEWSARQKVAVGAARGLRYLHEECRVGCIIHRDMRPNNILITHDFEPLVGDFGLARWQPDGDTGVETRVIGTFGYLAPEYAQSGQITEKADVYSFGVVLVELVTGRKAVDLNRPKGQQCLTEWARPLLEEYAIEELIDPRLGSHYSEHEVYCMLHAASLCIRRDPYSRPRMSQVLRILDGDTVMDPNYISTPSYDVGNRSG*


CDS Sequence:
>Vu_25041.1
ATGAATCGAGAACAGCAAAAGCGAGGGAAACAAGAAATATGTTCTGATGGAGCTGAAAAGGTCATTGTTGCCGTTAAGGCATCAAAGGAAATTCCAAAGACTGCTCTTGTTTGGTCCCTGACTCATGTTGTGCAACCTGGCGATTGCATTACACTGCTAGTAGTTGTACCTTCACAGAGTTCGGGCAGAAGATTATGGGGTTTTCCAAGATTTGCTGGTGATTGTGCCAGTGGTCATAAGAAATCTTCTTCAGGATCATCAAGTTCGGAACAGAAGTGTGATATCACTGACTCTTGCTCTCAAATGATCCTTCAGCTCCATGATGTCTATGATCCTAACAAGATAAATGTGAAGATTAAAATTGTTTCTGGATCACCATGTGGAGCAGTGGCTGCGGAAGCCAAGAAAGCCCAAGCCAATTGGGTCGTTTTAGACAAACAGCTCAAACATGAAGAAAAACAATGTATGGAAGAGCTGCAATGCAACATTGTGGTCATGAAGCGTTCACAACCTAAGGTACTCCGCTTGAATTTGGTTGGAAAAAAAAAGAAGGATCTTGAAGAATTATGTTCACTACCTTCTGAACAAGATCAGGTGCTTGGAAAACAAACTAAGAACAAGAGTGATTCTTTAAATTCCTTAAAAGGTCCAGTTGTCACTCCATCTAGCAGCCCTGAGCTAGGGACACCATTCACTGCAACTGAAGCTGGTACTTCATCAGTTTCAAGCTCTGATCAAGGAACTTCGCCATTTTTCATCTCTGAGATAAACAGCGAGTCCAAAAAAGAGGAAACTATAAAAGAAAATCCAGAACTTGATGATTCTATATCAGACACAGACAGTGAAAGCTTATCCACTTCTTCAGCAAGCTTGAGATTCCAGCCATGGATCACCGATTTACTTCTGCATCAACGATCTTCTCAACCTAAGGAAGAAAGAACAGAGAGATCTCATAGTAGGAATCAATTGTCTACTACTAGAGCTTTGTTAGAAAAGTTCTCGAGACTTGATAGAGAAGCTGAAATTGAAATCTCAACCTATAAGACTGACTTGGATTTCAGTGGGAATGTACGAGAAGCAATAGCGTTATCTAGAAATACTCCGCTTGGTCCACCTCCCTTGTGTTCAATCTGTCAACACAAGGCTCCTGTTTTTGGAAAACCTCCAAGATGGTTTACCTATGCTGAATTGGAGCTTGCCACTGGTGGATTTTCACAAGCCAATTTCTTGGCAGAAGGAGGATTTGGATCTGTTCACAGAGGTGTTCTACCAGATGGACAAGTTGTTGCTGTGAAGCAACATAAATTGGCCAGTTCTCAGGGTGACCTTGAATTCTGCTCGGAGGTAGAAGTCCTGAGCTGTGCTCAGCACCGAAATGTTGTTATGTTGATTGGTTTCTGTATAGAGGATAAGAGAAGGCTATTGGTTTATGAGTACATATGCAATGGATCATTGGATTCTCATTTATATGGGAGACAACGAAAACCATTAGAATGGTCTGCCCGGCAAAAAGTTGCTGTTGGAGCTGCCCGAGGGTTGCGATATCTTCATGAAGAGTGCAGAGTGGGTTGCATTATCCACCGTGACATGCGACCGAACAACATTCTTATCACTCATGATTTTGAACCTCTGGTTGGTGATTTTGGACTGGCAAGGTGGCAGCCTGATGGTGACACAGGAGTGGAAACTAGAGTGATCGGAACATTTGGGTATTTGGCTCCTGAATATGCTCAAAGCGGCCAAATTACTGAAAAGGCTGATGTTTATTCATTTGGTGTTGTATTAGTGGAACTTGTTACAGGGAGAAAGGCTGTGGATCTGAATAGGCCAAAGGGACAGCAGTGTCTTACTGAGTGGGCACGACCACTGTTAGAAGAATATGCCATTGAGGAACTGATTGATCCAAGGTTGGGAAGTCACTATTCGGAACATGAGGTCTATTGCATGCTGCATGCTGCCTCATTGTGCATAAGGAGAGATCCTTATTCTAGACCTCGCATGTCACAGGTTCTGCGAATACTGGATGGTGACACGGTTATGGACCCAAATTATATTTCAACTCCCAGTTATGATGTGGGAAACCGGAGTGGTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_25041::LG6:13890757-13892757(-)
ACAACCTTCCAAAAGTTGAATTGGGAATAGAGATAGTAGATTACTAAATGGGTTCATATTTTATTGTTTTTTTGTTATGCACCACATTGTCTTTTGTTCATGCATGTTGTACACCTACACATTCAGCAGATGCTGCTGCTGCTCATACTCATCTTCATTTCATGCAGTGCAGTCAATGCTTTCACAACATTTCATCTTTTCTTTTTTGTATTTTTTGTTTGCAAGATTCTGCTGTTAATGAACCAACAAATAGATAAAGCATACCACTACAGTATACAAAAAATTTGTCAAGTAGTAATCAATAATTAATGATGTGGTTAAGCAGTACATTATTGTTATTTTTATTATAAATAAGGACATCAAAATCACAGTTAGAAATTCTATGATTCAGAAAATGATGATGAGGCTAATGAGTGTTGTCTCTTATCTTGTAACTGTTGAGACGAATAGAAGCAGCAGAACAAAACATAATGACTGCGGTTTTGTTATTAGAAACACAACTTAGTAAAAATCATGATATAGAGTATAGGTCATATCATTTCACTGAATCATAGGTTTGCATTATTATTTTGTTAGAATTAGTACATGCATTTGTGTAAAAAAAAAAATCCATTTTCCAATCCTATGCTGATTTGTTTTTAAATAAATGTAAGTTTTTCTTTTTGTAATTTCATACTTTTGTTTTTTTAGGTTTTAATAAGTTTTTCTTTTATGATTTAAGGAAACTTCTTTTTAACATTTGACACATACTTTTAAAGAGATAAATTCAAAATAAAACAAGTACAATAACTGCAACTAAAACCAAACAATGTAAGGATCAATATATTAGGAATATAATTTTTCTTATATTCTTTTTTTATTTTAAAAGACTTATGTTTTCTTCATCCTGTAAATAATAACAACCAAACTCAAATTTTAAAAATAAAATTTTTCAATCTTTATTCCAAAGAGCAAAAAATAATCTATAATATTTATTATAATGTATCATCTAAAATATTTTATTCAAAGAACAACTAACGCAAATAATTAACAGAGTGTTGTATAAATGAATATTTTATTTCAAAGAACATTTTACTTTAGAGAAAAATAAATAAAATTACTTTTAGTATTTTAAAAACATAAAGTATTGAATTTAACTTCTGTGTATTATTAATATTTTTTTATATTATCAATTATTTAAATGTGTAATAAATATGAGTTATAAAATAATTTTTTATAGCATACTTACATAGTGGTTGTTGTAAGAAAATGATAAATATATATACAATAGTAATGCATAATTAAACTATAGTATAATTATTTTTATACAATTAATAAATATATTATTTATCCAATATCTGATATGTTCCTTAATTTACATAAAAAAATTATGTAAAATATTGCAAATAATTCAGACTTGTTATATGTGTCATTTGAATTCTTTACTTGCCTATATCTCGTGTTCAGTTATGTTCAGTTATTCTATAACATAAATATTATTATTTATTTTTAAATAAATATTAAAAAAATTATAGATGAAAATTTCTTAAAATGTTTTATGAAGAATAAGTCTAACACAATATATGAACACTAAGAAAGTTATTTCAAATTTTATATAAATGAAATAATATTATAAGTAAAAGTAAAAAAGTAAAAAATAGAAATTAAATATTAGTACTACTTTTATTATAGATAATATTTTTATATCTTTGTCTTATGTCAAGTATCTTTTGTAGCATTCTTATGATATATAATCTTCTTTTAATTAATACAATGTTGTGTTAACATATTGTTAGATATAATATTTTCATTCCATATTTTATCCTACTTTCAGATAAACATATCATTTCTGATAACATAGTTCAGGTTTAATATACACTATATAACACACACATAGATATAATACACTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGGAAAAGCCATTTCAGAAATGATCACAGTTGA


Gene Sequence:
>Vu_25041(-)
CAAGTCGGACACACATGTAGACGGCGATTTACAGCTTAGCTTTCTCTGCTCTGCACAAAATCTGAATTTCTCTCTCTGCATTCAAAGTATGTCATGTCCCATGCGTGTGTGCATTTCATCTTCTACACCAAATTGCAACACCATTGCATTTCATAGTAATAAATTACTCTTACAATTTTTGAAAGGATACAATACTATATTTCTGTCCCAGTTTGGTCTTAACTCTCTCTATTCCTCAAACCAACAAATTTCACCTCTTCTCTTCTTCTTTTCTCCAAAACCATTTTTCCACTCTTTTCATTCTCCCAGACCTTAAAACCTTTGGGTTGTCCAACCGTGGCTAGTTTCATGTTTTCTTTTCATACTTGTGGATTCTGTTATCACTCAAATGTAAGAGGAGATTGTCGCAAAGTAAGCAAGAAACCTTAATGACAAAGCTTTGGGCTTTTTCTAACTTTTGACAACAGTATAAAAGGGTCAAAATTCGTCACTCTTTATCTTTTTTAGTTTTTGCAAACAATAATTTGAGCGAGTTCGATTATCAGACACTTCTTTCTTTTGGTTGATGCTTGGCTGTGAGGATATTGTTTTATTTGGTTAGGTTTTGATTTTGATTTTTTTTTTCTGTTATTTGGTTGAGGATGTTGTTTTATTTGAAGTTTAACTGTATGAATTTTCTTTGAAAATTTCCAGGTTCTGATGATATGACTAGCCTAAACAGCGAAATGTATGTTATTATTTGTTTTGGTTGCTGTTGTTTTATTTTGTTATTTTATGCAGGATGTTCATTGTCCTGAGGATGGACATGGTATATACTAGCATGACACAATAATGGAGAAAAAGAAAGTTTTGGATCTTCTTGAGAGATCTCTCTTATTGTTTTCTACTTGGATCCTTAGTGATATTTTTTATATTCTTAAGCAATCAAAAGGTTGCTAGTGATTACTTATCTGTATGTCTCACACTGACATGCATTTTTCTTCTTCTTTAGACTCTGCATTATTGATGCTATTATTATCTCTATTTCCAACTTTTAAAGTTGATTCCTATGTCACTGTGCAGGGTAAAAACTGATGCTGAGTTTTCAGTGACTCGGAGAACTACAAGACCTCTCTACCTTTAGTCATATCAAATAGTGATTCAAACTCTTGATATATGAAGGACATGCCACTGTTTATGTAGTGGAATCTTTTGGCAGGGCTTCCTCTGGAGGATCATCAAAAGCAAAGCCAACTAGTTGAAGCCAAATTTTTTGACTTGTAAAGAATAATTTGAAGACTCCACAACATAGCTAGTGTATGCAACTGTTCTCGTGCAATGAATTATCTCATAGGCCTTCCCCAGCAGTGCTTTTAACCCTGTAGAATTTCTGAAACTTGAGATGCACAGTATGGTAAACTTGGGGATGCAACGTCTTGCTTTCTGAACCAAAAAGGTATCTGATCCGATTCTTGACAGATTTGATTCTATTTTGGTAACATGGATTTGATAAAAAAAGTTTACTTGCCAATCTGTAGCACTAATGATTTGAGTTCGGGTTAAAAGAGTCTTGTCAGTGATTGTTCTGTTCCTATTGGAAGCATGTTGCATTGTGGTCTGGTTATATATGATAATCCTGGTAGAGCTTGAACACGACAGAAAAAACTAGTGATCTTGAACATGCTCTTGCGTTTCATCCCCTTGTTGTTTAAAATGTAGGAACATCTGGGTTTGAAAGTTATTGAGTGACATCTGTTGAGCAAGACAGTTTTTGTGGGATTGCTGGCCCTGATGAATCGAGAACAGCAAAAGCGAGGGAAACAAGAAATATGTTCTGATGGAGCTGAAAAGGTCATTGTTGCCGTTAAGGCATCAAAGGAAATTCCAAAGACTGCTCTTGTTTGGTCCCTGACTCATGTTGTGCAACCTGGCGATTGCATTACACTGCTAGTAGTTGTACCTTCACAGAGTTCGGGTAATGAAATTTTTGCCTTAATTTCTTTATCTATTTGCTCTTTTGTCAGACATTATTTATTAAGGTGTGGTCATTATGGTTGCCTATTTTGGCAAGCAAATAATATATTAGTTGGGTCCTAAGGATATGTCACTCCCTTTTTTATATGGATTGTTTTGTTTTGAATAAGAATTATGAACAAATGGATCGCAGGCTGACATTTTATATAAACCCTTGTGTGATAATTTTGTTTACTTTCTTGCTTGTGGTGGATGACTATAGTTATTTAGTATTGCTGTATCTTGTGTGTGTCTCTTATTTCAGCTTAAATTCTTGATGCATGAAAGAACCTTTACTCTGTTATTTTTTTTATTGGTCATTTGAACCTGCAGTCTTCCTTTATTCTGTGTACCTAACTATTGTTCTGCGCCTATGTAGGCAGAAGATTATGGGGTTTTCCAAGATTTGCTGGTGATTGTGCCAGTGGTCATAAGAAATCTTCTTCAGGATCATCAAGTTCGGAACAGAAGTGTGATATCACTGACTCTTGCTCTCAAATGATCCTTCAGCTCCATGATGTCTATGATCCTAACAAGGTTAGTGTTAATATAAGAGTTTTCACATTCAATGTTGCATCTATACGCCAACCTAACAGTTATTCAACAGATAAATGTGAAGATTAAAATTGTTTCTGGATCACCATGTGGAGCAGTGGCTGCGGAAGCCAAGAAAGCCCAAGCCAATTGGGTCGTTTTAGACAAGTAATTTTCTATCATATTTTCCCCCACCTAAAGGCGTGCTTGTGTAATAAAAACAAACTTGAACTCTTCATTTCTGGTTTCACTATTTTATTGATGTGATTATAATTCAGTATGAATTGTTGGTATTTCAATTTTGCTTTGTACAGACAGCTCAAACATGAAGAAAAACAATGTATGGAAGAGCTGCAATGCAACATTGTGGTCATGAAGCGTTCACAACCTAAGGTACTCCGCTTGAATTTGGTTGGAAAAAAAAAGAAGGATCTTGAAGAATTATGTTCACTACCTTCTGAACAAGATCAGGTGCTTGGAAAACAAACTAAGAACAAGAGTGATTCTTTAAATTCCTTAAAAGGTCCAGTTGTCACTCCATCTAGCAGCCCTGAGCTAGGGACACCATTCACTGCAACTGAAGCTGGTACTTCATCAGTTTCAAGCTCTGATCAAGGAACTTCGCCATTTTTCATCTCTGAGATAAACAGCGAGTCCAAAAAAGAGGAAACTATAAAAGAAAATCCAGAACTTGATGATTCTATATCAGACACAGACAGTGAAAGCTTATCCACTTCTTCAGCAAGCTTGAGATTCCAGCCATGGATCACCGATTTACTTCTGCATCAACGATCTTCTCAACCTAAGGAAGAAAGAACAGAGAGATCTCATAGTAGGAATCAATTGTCTACTACTAGAGCTTTGTTAGAAAAGTTCTCGAGACTTGATAGAGAAGCTGAAATTGAAATCTCAACCTATAAGACTGACTTGGATTTCAGTGGGAATGTACGAGAAGCAATAGCGTTATCTAGAAATACTCCGCTTGGTCCACCTCCCTTGTGTTCAATCTGTCAACACAAGGCTCCTGTTTTTGGAAAACCTCCAAGATGGTTTACCTATGCTGAATTGGAGCTTGCCACTGGTGGATTTTCACAAGCCAATTTCTTGGCAGAAGGAGGATTTGGATCTGTTCACAGAGGTGTTCTACCAGATGGACAAGTTGTTGCTGTGAAGCAACATAAATTGGCCAGTTCTCAGGGTGACCTTGAATTCTGCTCGGAGGTAGAAGTCCTGAGCTGTGCTCAGCACCGAAATGTTGTTATGTTGATTGGTTTCTGTATAGAGGATAAGAGAAGGCTATTGGTTTATGAGTACATATGCAATGGATCATTGGATTCTCATTTATATGGTAATTTCTTTTGCTTTCAGACCAAGTTATGCTGTGGCAAGGTCATGTTTCTGAATTGGCTTGAACTTCGTTAACATTCATATTCATGTTGTCTGTGAAAGGTCGAGGATTTATCTATTTGAAAAGTTATGCATCACCTAATATATGGGAATTTGGTTTGATGTGGTAGATTAACTTTTGTAAAGCTAATCAGATTGACGTCTTTATATATACTCCTATATAAAACTTGGTTTCATCACACATATTTTAATTAGCACGCATTTATGCTTTTGGTTGGAGTTGGACTTATCTTGTTCTTGAAGACTAGTAATGCAGAATATGTAAATATTTTGTCATTTTCACATTAAATATAATGATTGCAATCATGTAGTATAGGTTGCATTTTACTGATACCGGCTCAATTTGTTAACTGGATAACTGGACATGACTTGGAACTCTATCAGGGAGACAACGAAAACCATTAGAATGGTCTGCCCGGCAAAAAGTTGCTGTTGGAGCTGCCCGAGGGTTGCGATATCTTCATGAAGAGTGCAGAGTGGGTTGCATTATCCACCGTGACATGCGACCGAACAACATTCTTATCACTCATGATTTTGAACCTCTGGTATGGGTTGTCTGTCACCTGCTATTGTTCTATGCAGTCAGCTGTTTTATAGTTTACATGTGAAAGGCACCACTGCTTCATGTCTTTCTTTCACAAAGTTTTCAGTTAATTAAGTTGTGTTAAATTATTCCAGGTTGGTGATTTTGGACTGGCAAGGTGGCAGCCTGATGGTGACACAGGAGTGGAAACTAGAGTGATCGGAACATTTGGGTATCCGCTGTATTAATCCTTATTTAGTTTCATTGTCTTGTTAGTCTGCACAATATCAACAATTTAACTAAGCTTTGTTGGTGCTATGCAGGTATTTGGCTCCTGAATATGCTCAAAGCGGCCAAATTACTGAAAAGGCTGATGTTTATTCATTTGGTGTTGTATTAGTGGAACTTGTTACAGGGAGAAAGGCTGTGGATCTGAATAGGCCAAAGGGACAGCAGTGTCTTACTGAGTGGGTAAGTCAAATGATATTAATATCTAATTTATTATGATTTTAATTGTGGCAATGGCATCATTTATGTGAGCATT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