Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_25024 LG6 13754401 13755051 PREDICTED: LOB domain-containing protein 22-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   biological_process
Cellular Component   located in   nucleus
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 13754426 missense_variant p.Arg9Met
G/A 13754757 synonymous_variant p.Ala119Ala
T/A 13754805 synonymous_variant p.Pro135Pro
G/T 13754997 synonymous_variant p.Pro199Pro
C/A 13755010 missense_variant p.Leu204Ile
T/C 13755011 missense_variant p.Leu204Pro

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_25024.1
MEGGTSSSRSTIPACAACKFQRRKCGPNCILAPFFPHYRQKQFLNAHKLFGVGKITSMIKPLDHVNRNSAIDAIIFESDMRAKDPVGGCLRTILYLQSVIASAESELQFLLQHLAFFRAQALDSIATPQPPPPPPSSSHDPYHQGMSLQESKDPSQLHPQDLGNDPSQIQQQEQPKDSCFNYNALQEDMNVSDIDSLVPFSPWLSPLDDISQYQDP*


CDS Sequence:
>Vu_25024.1
ATGGAAGGTGGCACGAGTTCCTCAAGGAGCACCATACCGGCTTGTGCTGCTTGTAAGTTCCAACGCAGGAAGTGCGGACCCAACTGCATTCTCGCACCTTTCTTTCCTCATTATCGCCAAAAACAGTTCCTTAATGCTCACAAGCTTTTCGGAGTTGGCAAAATCACCAGCATGATCAAGCCTCTTGACCATGTTAACAGAAACTCAGCCATCGACGCCATTATCTTTGAGTCAGATATGAGAGCCAAAGACCCTGTTGGGGGCTGCTTAAGAACCATTCTATACTTGCAATCTGTCATCGCTTCTGCAGAATCTGAACTCCAATTTCTCCTTCAACACCTTGCCTTCTTCAGAGCGCAAGCTCTTGATTCCATCGCCACACCACAACCACCACCACCACCACCTTCCTCCTCCCACGACCCTTATCATCAAGGAATGTCACTTCAAGAATCAAAAGATCCGTCACAACTTCACCCACAAGATCTTGGAAATGATCCCTCACAAATTCAACAACAAGAACAGCCAAAAGATTCGTGCTTTAATTACAATGCATTGCAAGAAGATATGAACGTGTCGGACATTGACAGCTTAGTACCGTTCTCTCCGTGGCTATCGCCGCTGGATGACATCAGCCAATATCAAGATCCCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_25024::LG6:13752401-13754401(+)
AAAGAGATGAGTGGTGCAGGTGAGAGAAAGAGTTTTCAAAAATCTGGTTTTGTAAATCTCACGCTCGTTTGAACGAACGTGTCCCAAGTTGACACCTGCACACCAAACTCTGATTTCCGAAACTTCTCCCGCGACACGTGGCGTGCGTGCATGTGTGGCTTGGTGCGTTTTTAATGTTGCAGAGAATGATTGTAGCTTGGTTTCAGTGCAAAGCAGAGGGGTTTATTAGATTTGGAAGTGGGTTTTAATGGCTGAGAAGTGATGTGGCGTGCATTAATGGTGAGGTGTCAGAATTAATTTATACTAATTATTAAGGTTTCACATAGACAAACAAAAAATAATTCCTTATATATATATATATATATATATAGGTATAAATGAATAATGGTTTTTACTATTATAATTTCTAGTTGTTATGATTGTTAACATCAAATTTCATTAAAATTAAACAATAACATCAACAAAATTTTCTTTACACTTTTTTAAAAGAAAAATATTTTTAACCATTAAGTTAGTTTCTATTTGTTCTTTCTCTCACCCAACTTTGTTTCTTTTTTATAGTTTAGAACAATATTAGTAGTTTTTTTAATTTAATAAATAATAAATTTTCGTCCCACTTACCACATTCAATTAATAATTACATTTAGAACATATTTTTCTAAACCTATCAATAGTTATTTTGTTATGATAGACATTATTAAAAGTTAAAATTGACTTTATGTAAAATATTCATCATAAATCTAAAACGTAATTTATATAGCTACAAAAATCTAATTATTGTAAAATTTAATTCTAATATTATTTTTTTATTTATTATAAATCTTATGTAAAAATAACCATTAATTTTTTATACACAAATACCTGTTGAGATTTTTTTTCACACCAAAACAAAAATATATTAAGTAGAATATTAATGGGTTAACCAAACCTGTATACATAATTAATATATGTATTATTATTCTGTATTTAAGCTTTCTCTCATTTAATCATATCTATCATAACTCATACCTATTTCAAAAGAGCATTTTTTTTAATATTATTATAAGAAACAAAAACAAACATATCTGTCTATTCATGATTTAAAAAGGGATTGAAACACCAATAGGAGGAAATTGAACTGGATATTATTGGGATGAGTAAATTACATAAATGGTTGAAGAATTAAACTAACACAGTATAATTTGTTTAGGTGAACTGAATTAAACTGTCTAATATCTACATAAACTGAATTGAACCATAACCAAATTATCTCAAAATTTAAATTATCCTTATATATATAGATATATTTAAACATATATTTTAATTTTGTAACCTACATTCCAATTTAAATATTTTAGTTAGGAATATTACACTTTTTAGAAATTAAACTAAAAAACAGCCCAGTTTCAGTTTTTATTTTCAAAATAATTCAGTTTTTTTAATGTAACCAACTATCAATTTGATTCAATTAATTTTGTAAACCATAGCATATTAAATTCAAGTGAATCTTATATGTAGACAGTCACATTAAACAACATTTATGTATGTGTAGTTTACAACATACTAATTGTAACACATAAAATATTAGTTTCTTTAAAAGAAAAGTTACATTTTTTTCACTTTGATTTAAAAAAAAAACACTACTTTAATCTTTCAAATGCTATCTAAACATTGTCTTTCCTTTATAAAATACTATTTAATCAAATTTAATAGATTTTAAAGATAAAGGGACTTAAAATAGGTAATCTTTTAAAAGGTATAAAACTGAATTTTGAACATTTCACATAAAAAAAACCACACACCATTAGAGTATAATTAAATTACTAATCACTAATGAGTAAGTAACGAACAACTATTACGAAAAAAAAAAAGACTTATGAAAAGAAGATTGATTTGGTATTACTTGATGATCTAAAAATATCATTTGGCATAACAGAATCTGTTGAGATAAATGAGATATATAAAGAATAAGTAGTGAGAAATTAAAGGCTCTCATTTCGGCTTAAAATTTGCAGATACCA


Gene Sequence:
>Vu_25024(+)
ATGGAAGGTGGCACGAGTTCCTCAAGGAGCACCATACCGGCTTGTGCTGCTTGTAAGTTCCAACGCAGGAAGTGCGGACCCAACTGCATTCTCGCACCTTTCTTTCCTCATTATCGCCAAAAACAGTTCCTTAATGCTCACAAGCTTTTCGGAGTTGGCAAAATCACCAGCATGATCAAGCCTCTTGACCATGTTAACAGAAACTCAGCCATCGACGCCATTATCTTTGAGTCAGATATGAGAGCCAAAGACCCTGTTGGGGGCTGCTTAAGAACCATTCTATACTTGCAATCTGTCATCGCTTCTGCAGAATCTGAACTCCAATTTCTCCTTCAACACCTTGCCTTCTTCAGAGCGCAAGCTCTTGATTCCATCGCCACACCACAACCACCACCACCACCACCTTCCTCCTCCCACGACCCTTATCATCAAGGAATGTCACTTCAAGAATCAAAAGATCCGTCACAACTTCACCCACAAGATCTTGGAAATGATCCCTCACAAATTCAACAACAAGAACAGCCAAAAGATTCGTGCTTTAATTACAATGCATTGCAAGAAGATATGAACGTGTCGGACATTGACAGCTTAGTACCGTTCTCTCCGTGGCTATCGCCGCTGGATGACATCAGCCAATATCAAGATCCCTGA