Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24999 LG6 13551249 13554015 PREDICTED: U-box domain-containing protein 35-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   ATP binding, kinase activity, protein kinase activity, protein kinase activity, ATP binding, protein kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 13551456 upstream_gene_variant
C/T 13551583 missense_variant p.Ser64Phe
A/T 13551768 missense_variant p.Ile91Leu
T/C 13551857 synonymous_variant p.Arg120Arg
A/G 13551905 upstream_gene_variant
T/G 13551948 upstream_gene_variant
A/G 13551982 upstream_gene_variant
G/A 13552187 synonymous_variant p.Lys186Lys
A/G 13552260 upstream_gene_variant
T/A 13552267 upstream_gene_variant
G/A 13552272 upstream_gene_variant
T/G 13552287 upstream_gene_variant
A/T 13552452 missense_variant p.Met204Leu
T/C 13552462 missense_variant p.Leu207Pro
T/A 13552728 upstream_gene_variant
G/A 13552760 synonymous_variant p.Lys278Lys
A/T 13553023 missense_variant p.Gln366Leu
C/T 13553043 upstream_gene_variant
T/C 13553050 upstream_gene_variant
A/C 13553054 upstream_gene_variant
T/C 13553060 upstream_gene_variant
G/C 13553075 upstream_gene_variant
T/G 13553339 missense_variant p.Leu382Arg
G/A 13553343 synonymous_variant p.Leu383Leu
C/T 13553353 missense_variant p.Pro387Ser
A/T 13553378 missense_variant p.Glu395Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24999.1
MIMGSNAAEEESTLIAIDSDQNSQHAVKWAVEYLFKNNSSCTLLHVRTKNLYHNDLEVFPKQGRPPTEEELQQIFLAFRGFCARKRVAVKEIVLQDTDVVNALTNYIILNSINNVVVGASRSNALLRKFKDVDVPTGLLRSVPQSCMVHIISKRKVQSIRPAGHSHQNISIAPSKSLKAIRESFRSKDLNRRSLQIKFWQSSNNDGVSPMTPHKNNGETDSTKLSDETSSLQTSSNQSFLKEDTSRLFDHQTSETSHGKQNVVINSNCRSKSSKKPPTTKHENIRQEEGDMHEEEERNKPSNEIAPNKVLFKRYNIREIEVATNYFNNALKIGEGSYGPVFKGVLDNIVVAVKALRPDITHGEKQFQQEVSVLSTIRHSNMVKLLGACPEYGCLVYEYMENGSLEDRLFQKDNTPVIPWKVRFKIASEIATGLLFLHQTKPEPIVHRDLKPANILLDCNYGSKITDVGLARLVPPAIPDKTTQYHKTTAAGTFCYIDPEYQQTGLLGVKSDIYSLGVVLLQIITGKPPMGVAHFVQEAIEKGTFSEVLDPNVMDWPVEDTLSFAKLALKCCEMRKRDRPDLASVILPELSRLTNLGVVITFPKDKIMV*


CDS Sequence:
>Vu_24999.1
ATGATTATGGGTTCAAATGCAGCAGAAGAAGAGTCTACCTTGATCGCCATTGATAGCGATCAGAACAGCCAACATGCAGTCAAATGGGCTGTGGAATATCTCTTCAAGAACAACTCTTCCTGCACCCTCCTTCACGTCAGAACTAAGAACTTATATCACAATGATTTGGAAGTTTTCCCTAAGCAAGGTCGTCCGCCAACAGAAGAAGAATTGCAACAGATTTTTCTTGCCTTTCGAGGATTTTGTGCTCGAAAAAGGGTCGCAGTTAAAGAGATAGTTCTGCAAGACACTGACGTAGTAAATGCGCTTACTAATTACATAATTCTGAATTCTATCAACAATGTTGTCGTTGGTGCTTCTCGTTCCAACGCTCTTCTAAGGAAATTTAAAGATGTAGATGTGCCAACAGGCTTGTTAAGATCTGTGCCACAATCTTGCATGGTGCATATCATATCAAAAAGAAAAGTGCAGAGTATTCGACCAGCAGGTCATTCTCATCAGAATATTAGTATCGCACCATCAAAATCTCTAAAAGCCATCAGGGAAAGTTTTCGGTCCAAAGATTTAAACAGAAGATCGCTCCAAATTAAATTTTGGCAAAGCTCAAACAATGATGGGGTATCTCCAATGACACCACACAAGAACAATGGAGAGACTGATTCTACAAAACTATCTGATGAAACCAGTTCTTTACAAACTTCATCCAATCAAAGTTTCCTTAAAGAAGACACTTCAAGGTTGTTTGATCATCAAACGAGTGAGACATCACATGGAAAACAAAATGTAGTCATTAATTCGAATTGTAGGAGCAAATCTTCCAAAAAGCCTCCGACAACGAAGCATGAAAATATAAGGCAAGAAGAGGGAGACATGCATGAAGAAGAAGAGAGGAATAAACCATCAAATGAAATTGCACCAAACAAAGTTCTATTTAAAAGATACAACATTAGAGAAATCGAAGTAGCAACTAATTACTTTAACAATGCCCTGAAAATCGGTGAAGGTTCATATGGACCTGTTTTCAAAGGGGTGCTTGATAACATTGTTGTTGCTGTCAAGGCTCTCAGACCTGACATAACCCATGGGGAGAAGCAGTTTCAACAAGAGGTTAGTGTTTTGAGCACAATAAGACATTCAAACATGGTTAAGCTTTTGGGTGCATGTCCGGAGTATGGATGCCTTGTGTATGAGTACATGGAAAATGGAAGTTTAGAAGATCGTCTATTCCAGAAAGATAACACACCAGTAATTCCATGGAAAGTTAGATTCAAAATAGCATCAGAAATTGCCACAGGCCTTCTTTTCCTTCATCAGACAAAGCCTGAGCCTATTGTGCACCGAGACCTGAAACCGGCAAACATTTTGTTGGACTGTAACTATGGTAGCAAGATCACTGATGTGGGTTTGGCAAGGCTAGTTCCACCTGCTATACCGGACAAAACCACTCAATACCATAAGACAACTGCAGCTGGTACATTTTGCTACATTGATCCAGAATATCAGCAAACAGGACTATTGGGGGTTAAATCAGACATTTACTCACTGGGTGTAGTGCTGTTGCAAATTATAACTGGAAAGCCTCCTATGGGTGTGGCTCACTTTGTTCAAGAGGCTATAGAAAAAGGTACATTTTCTGAGGTTCTTGATCCTAATGTCATGGATTGGCCTGTTGAGGACACTTTGTCATTTGCTAAGTTGGCTTTGAAGTGTTGTGAGATGAGAAAACGAGATAGACCAGATCTTGCTTCTGTCATTTTGCCAGAGTTGAGTCGGCTTACAAATTTAGGAGTAGTGATTACATTTCCCAAAGATAAAATCATGGTGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_24999::LG6:13549249-13551249(+)
GACATTAAAATAAGTTAAATTAGTTATGATTTTCTTAAAAGACAACACACTATAAGATAATCAATTTAGAAAGATAATCAATTTAACTCCTAATTTTCGGAGTTAAATATTTTATAATATTCATTTTTAAGATTAATTTGATAGTTTACTTGCAAAAAACATTACGTATGTTCTAGCATACACCAAGATGAAGATAATAATGTATATGATAAGTAACGAAAAAGATGAAGAGGATTAATAAAATATGTTATTATTAATTTTTATAATTAAATAAAAACTGGTGTGATTTAGATACAAAATTCAGTAAATAAAATCAATAAATATTAAAACTAGATTACTTATATTTCTTTGTTAAAAAAAGGCATTATTTGATTCCATTGTATAATGTTGAAGGAAAGCGTGTTGTGTAATGGATAGCTTTGTTTTTGTTGTTTTATTAATTACGTTAAAAGGAACCTTAATGAAGCATGTTTAATTTTTTGGCCTTTGTTACGTTTTGTGCAAAACATGTTTTCTAGACATATTATTTGACTTTATCTTTTAGTTTATGATCCTATGTACAAGGAACATTCTTCGAATTTTCCTTTATATTTAAAAGATCTACAATGCATAATTTAAAAAATATAGTCGGTGGATAAACTATTTATAGGATTAGAATTTGAGTAAAAAAATTGAAACAAATGCATATAGTGTCTATTAATTTTCGCACTTAATTAATGGTAAATTATGAATTATTATGATTAGATAATTTATTATTTAAAAGTCAAATTATTTTTTTCTATATGTTTTTAAGGAAAAAATAGTTTATGGCAAAATACATTTCTCTCATTAATTCTAATATACAACATGTAATAATATATATAGTTGATGAATTTTTATGATAAGAGGAGTGAAAATTAAACTGTTAAGTTTCATACTTTTTTTTACATGCTTCTTTTCCAAGAAAAAGGAAAGCAACGTATAAGAAAGAATCCTTCCATTAATAGTTAAAATTGACTTTGAATATAAAACTAAAATAATCAAGAAAAATGTGGCTGTTCACTATATGTTAAAAGGATCAATAGCTGTTAGAAAGATAATAATTAAAAGAATTATTTAAGTTTAAAATTTCTTGGTAAATTTAAATATTTTTAATTTAACTTTTATTTTTTTATTATATATTTAAAATTTTATATTTCGTAATTAAATTGTCATTTAATTTTTCTTTAAACTAAATTAGTGAAAAGACAAATAAAAAAAATGTAAAGTAAAATAACAATTACGTGATTAATAATGAAAAAATTAAATTAAAAAATATAATGTTTTAAATATAAATAAATTATTTTAATTAAAATTATTTGAATCTGATTTTTCTTATTAATTGTATGAAAAGTAGTATAATTTATTGATTGTTGTAATTTATGTTTTTGTTGTTACTTAAAAATGTAAAGATTGATAAAAAAGAGTACGTGTGTGAGACATGGTTATAAGAAAAATTATACCATATAATACAAAATTCACTTTACAATTATTATAGTAAATAATGTGTTTATTTTCTTATAATAATAAAAAATAATAAATGTATTGTTATTATAAAATTGAATATTAATAATTTTTATAATCTTTTATTTATTTTGTAAAAAAAAATATTAAGTTGAAATAACGATTAAATAAAAATGGTAAAATTTAAAATAAATATGTTATTAATAAATTAATTATTTTAAATTTCAAATAAATTATTTAAAAGATAAAATTAAAAATAAATTCAAAGACCAAAAGTATATGTATGCATAAAAGAAATATAATTAAAATATTAATATATTCAGTTATGAACAACTTTTGTATTTTTCCTGATTGTAAATACGCTAAAGTTGGGTTTACATTCAAGATACAACCGGATTAAGGTGCATTCATGCTAAAAATATAATAAAAAGGTTCAAAACCCCTCAGACATGAATGAATGACATAACAACTACATTGGTTATTGCAGTCATAGATTTTTGGGAAACCAACGTTGTTGA


Gene Sequence:
>Vu_24999(+)
ATGATTATGGGTTCAAATGCAGCAGAAGAAGAGTCTACCTTGATCGCCATTGATAGCGATCAGAACAGCCAACATGCAGTCAAATGGGCTGTGGAATATCTCTTCAAGAACAACTCTTCCTGCACCCTCCTTCACGTCAGAACTAAGAACTTATATCACAGTACGTACATTGCTCAAACTCATGCTTCACCAATGCATTGTATTTTTTATGAACACCATTTAAATTCTTGCAAGAAATAGAATCATTTTTTGTAATTTATCATGCATAGAATTTTTAATTTTTTTTTCTTTGGGTTGCGTAGATGATTTGGAAGTTTTCCCTAAGCAAGGTCGTCCGCCAACAGAAGAAGAATTGCAACAGATTTTTCTTGCCTTTCGAGGATTTTGTGCTCGAAAAAGGGTGCTGAATTCATTACCAAGTTTGAAGCTTTGAAAATCTTTAGTTTTAATATGAATGCAGATGTCTTATATCAGTTTTTTTATTATGAACACTGAAAATTTCAGGTCGCAGTTAAAGAGATAGTTCTGCAAGACACTGACGTAGTAAATGCGCTTACTAATTACATAATTCTGAATTCTATCAACAATGTTGTCGTTGGTGCTTCTCGTTCCAACGCTCTTCTAAGGTCATTATTCTCTTTCTCTCTCACATACAGAAGTTTCTGCAGAAATCATAAAGAACTGCATATTTTATTTTTTTTGTGAATTTTCTGGTTTATCTCTTCAAACAAATAATCTTGCTAATTATATTGTACAGGAAATTTAAAGATGTAGATGTGCCAACAGGCTTGTTAAGATCTGTGCCACAATCTTGCATGGTGCATATCATATCAAAAAGAAAAGTGCAGAGTATTCGACCAGCAGGTCATTCTCATCAGAATATTAGTATCGCACCATCAAAATCTCTAAAAGCCATCAGGGAAAGTTTTCGGTCCAAAGATTTAAACAGGTTTGAACACAAAAATGTTTATAATTTGATGGTTAAAGAAGAAAATGATTTGAACATCCTAAATGATATTAGAAGGTGAAATCAATTTATACAAGTTTACTAATTTTATATAAATTCTAGACATAGATGCAAGTTTATACATGTTTCTGTGCTTATTTGAACAAGTTTCTGTGCTTGCTAAATGTTGTTACATGTTTTATATTGTATAAACAGAAGATCGCTCCAAATTAAATTTTGGCAAAGCTCAAACAATGATGGGGTATCTCCAATGACACCACACAAGAACAATGGAGAGACTGATTCTACAAAACTATCTGATGAAACCAGTTCTTTACAAACTTCATCCAATCAAAGTTTCCTTAAAGAAGACACTTCAAGGTTGTTTGATCATCAAACGAGTGAGACATCACATGGAAAACAAAATGTAGTCATTAATTCGAATTGTAGGAGCAAATCTTCCAAAAAGCCTCCGGTAGGTGATATTTTGCATCATATATAATTTTTATTAATTATAATCCTCAAAACAGTTTTAATGATTAATGTTTCTCATTCAGACAACGAAGCATGAAAATATAAGGCAAGAAGAGGGAGACATGCATGAAGAAGAAGAGAGGAATAAACCATCAAATGAAATTGCACCAAACAAAGTTCTATTTAAAAGATACAACATTAGAGAAATCGAAGTAGCAACTAATTACTTTAACAATGCCCTGAAAATCGGTGAAGGTTCATATGGACCTGTTTTCAAAGGGGTGCTTGATAACATTGTTGTTGCTGTCAAGGCTCTCAGACCTGACATAACCCATGGGGAGAAGCAGTTTCAACAAGAGGTTGTCATGTTTTCGCTTTAAATAACAGGATGTTTTTACATTCATTTGACATATAATACAATTTTACGTTCATTTGACATACAAGGATAAATATAATACAATTTTACGTTCATTTGACATACAAGGATAAAAATGATACAAGGATAAAAATGATCAGATCATAAATTTTTATATTTTTTTCCAAGAAAAACTAAGTAACATCTTGAGTCCTCTTTACTTGACAACATGGGTCATTATAAGTAATCGTTTGTTCTGGTACATGAGACAGGTTAGTGTTTTGAGCACAATAAGACATTCAAACATGGTTAAGCTTTTGGGTGCATGTCCGGAGTATGGATGCCTTGTGTATGAGTACATGGAAAATGGAAGTTTAGAAGATCGTCTATTCCAGAAAGATAACACACCAGTAATTCCATGGAAAGTTAGATTCAAAATAGCATCAGAAATTGCCACAGGCCTTCTTTTCCTTCATCAGACAAAGCCTGAGCCTATTGTGCACCGAGACCTGAAACCGGCAAACATTTTGTTGGACTGTAACTATGGTAGCAAGATCACTGATGTGGGTTTGGCAAGGCTAGTTCCACCTGCTATACCGGACAAAACCACTCAATACCATAAGACAACTGCAGCTGGTACATTTTGCTACATTGATCCAGAATATCAGCAAACAGGACTATTGGGGGTTAAATCAGACATTTACTCACTGGGTGTAGTGCTGTTGCAAATTATAACTGGAAAGCCTCCTATGGGTGTGGCTCACTTTGTTCAAGAGGCTATAGAAAAAGGTACATTTTCTGAGGTTCTTGATCCTAATGTCATGGATTGGCCTGTTGAGGACACTTTGTCATTTGCTAAGTTGGCTTTGAAGTGTTGTGAGATGAGAAAACGAGATAGACCAGATCTTGCTTCTGTCATTTTGCCAGAGTTGAGTCGGCTTACAAATTTAGGAGTAGTGATTACATTTCCCAAAGATAAAATCATGGTGTAA