Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24966 LG6 13332192 13335007 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 13332577 missense_variant p.Thr281Ile
T/A 13332586 missense_variant p.Glu278Val
C/T 13332914 downstream_gene_variant
G/A 13333298 stop_gained p.Gln174*
T/A 13333558 missense_variant p.Asp87Val
T/A 13333565 missense_variant p.Thr85Ser
A/T 13333969 downstream_gene_variant
T/G 13333980 downstream_gene_variant
C/T 13334079 downstream_gene_variant
A/G 13334142 downstream_gene_variant
A/T 13334239 downstream_gene_variant
C/T 13334366 downstream_gene_variant
G/A 13334540 downstream_gene_variant
T/A 13334579 downstream_gene_variant
T/A 13334580 downstream_gene_variant
G/T 13334770 downstream_gene_variant
C/G 13334782 downstream_gene_variant
G/A 13334828 downstream_gene_variant
C/G 13334938 missense_variant p.Val22Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24966.1
MNLLSLHGTQKHKSKFSQSRSVPTTIEFASASILMEFGIDGSINGETVGNVTLGEINSCSTPDENKVGCSSFNPAYKHDHDDNITQDSSGGDTIPSGIPAVSVVSADEPYVGQEFDSEAAAHAFYNAYATRVGFIIRVSKLSRSRRDGSAIGRALVCNREGYRMPDKREKIVRQRAETRVGCRAMILVRKVSSGKWVVTKFIQEHTHPLTPGKGRRDCIYEQYPNEHDKIRELSQQLAIEKKRSATYKRHLELIFEHIEEHNESLSKKIQHIVDSVKEMETKEQQSHR*


CDS Sequence:
>Vu_24966.1
ATGAATCTGCTCTCTCTGCACGGAACACAAAAACATAAAAGTAAATTTTCACAATCACGGTCGGTTCCTACGACAATCGAATTTGCGTCAGCCTCAATTCTCATGGAGTTTGGGATTGATGGCTCCATTAATGGTGAGACAGTAGGAAATGTTACTCTAGGGGAGATTAACAGTTGCAGCACACCTGATGAAAACAAAGTAGGTTGCAGCTCTTTCAATCCTGCTTATAAACATGATCATGATGATAATATAACTCAAGATTCTTCTGGAGGGGACACAATCCCATCAGGAATTCCTGCAGTATCAGTTGTTTCAGCTGATGAGCCCTATGTGGGACAGGAGTTTGATTCTGAAGCTGCAGCACATGCATTCTATAATGCATATGCCACCCGTGTTGGATTCATCATACGTGTGAGTAAGCTCTCACGATCAAGGCGTGACGGATCTGCTATTGGACGGGCTCTTGTTTGCAACAGAGAAGGTTACAGAATGCCTGACAAACGTGAAAAGATTGTAAGGCAAAGGGCAGAGACTAGGGTTGGTTGCAGGGCAATGATTTTGGTGAGGAAAGTAAGTTCCGGTAAATGGGTTGTTACTAAGTTTATACAGGAGCACACTCATCCTTTAACACCTGGAAAAGGTAGAAGGGATTGCATTTACGAGCAATACCCGAATGAACATGATAAAATTCGAGAACTGTCTCAGCAGTTGGCCATTGAGAAAAAACGGTCTGCAACCTATAAAAGGCATCTTGAATTGATATTTGAGCACATTGAAGAGCATAATGAAAGCCTTTCAAAGAAAATACAACACATAGTGGACAGTGTGAAGGAGATGGAAACCAAAGAACAACAGAGTCATAGATAG


Promoter Sequence:
>Vu_24966::LG6:13335007-13337007(-)
AAAAAAAAAATCAAAGAATGTGTATATAATATAGAAATAAATAAATAAATAAATAAATAGGATAACATATGTGAAACTCATAACATAGTTGTATTCATCTATATTAATAAACGATTCACATCTTCAGCTGAAATGAAAGAATAGTAAAAAGATAACAATTATCTAATGAGTACCTCTCTTACTTTTTATGCATGTTTTGCAACACAAGAATATTATAATGCAGGGAAGAACAATGATTCAATGAATCATTGAAGAGAAAATAATTAATTTAATAACATAAAAAGTTAATATTACATTGAATTACGATAATATACATAATTTTAAAATTATTTTGTATAATTAAAGCTGTAGTCATCTTAAATTAGAATAATAATATTTTTAACATGATTTGTAATGTTTGAGTGATGTGTATGAACCTTATCTCATAAAAAATGGTCAAAATTATTACGAGATCAGAAAAAAAAATCTACAAGAAAAACGATTAATTTGTAAAAATAAATCACATAACCCTTATGGAATGTGTTTATTTTTCAGTGACTAAATCATATAATATAATTATTTTTATGCATGTTTATTTTTCTTAGTGACTAAAACATTATGTTGTATCAAATAGTTTTAAAATTAAATTATTTTAAATAATTATAAGGCAATGACAAATATATTTTTTTTCCAAAAATATATTAAACCTATTAGTAGCACTTCCTAACATGTCAAAATTATTTTTATTTTATTTTTATTATATTCTTTTTATTTTAATTATTTGTACTAAAAAAAGTAGATATTTTTTACATTTACTTAAAACCATTGATTACTTCCATAACATAATCGATTATATACATATATATTAAAGATATAATGATTTTGTCTTTAAATGTAATGAATCAGATATAAATTTCACTGATATATAGACAGGATATACAAGTTAATTTTAAAAATACTCTTGTATTAATTTAAGAAAAAGGAAAAAGAAAAACTAAGTCATGTAGCCATTAGAAAACTCTCTCTGATAATCCAATCCTTAATTTGTTGGTTCTTACTAGATAATGATTCTGACAGTAATAACTTGAATATATTCTGTATCTAATAAAAAGTAGCCATTGTCATCACAAGTGCAGTTGCAGAAAGAATGAAAGCTCCACTAAGATTCTGAAACACTGATAGTGCTGTAAAAATACTCAATCTACCTGATCAGACTCCATGTATCATGATTCGGTTATTTAATTAGTCAATTAATTCAATTCATTTATTAATATGTAAAAAAATTAATGGTTAAACGACTTTAACTCATTTTATTATAATTTTTTTAATTATAAAAAAGTAACAAAACTTTTAATTTAAATTTAAGTAAAAAGAAATAATTTTAAATTATATTTATAATTAATTAAATATGAGATTTCATTATGTTACAAAATATTTTCAATTTAAATTTGTTTTTGTATAATTGTGTAAACTTTTCATGTTGTTTAATTGTTATTTTATATAAAAATAATTTCGTGCAATTTTTGTTTTAATATTTTGTAAAATGACTGATTTAACAAAAAAATACTTATTAAAAAATTATGTAAATTGATGAGTTATTAACCACCAGTTCAACAAGATGAGCAAGATTTTTAGTGAATCAGATTCAAAATTAATCCATATCAAAATTTCAAACTTTTTCTTCAAAATCTATGAAAATAGTATTTTTTATTTTATCATTAATTACTCATAAAATAATAAAATTATAAATATAATTCTATCAAAATAAGAATTTGTAAGTTCATTTTGTTAATCTTATAAGTGGACAATGTTAGAAAAAAGAAACTGCCAACACGGGTGGGTTGTTAAAATGGGCCAAGTGCAAATCACACGGACTCAGCCCGTGTCCACTTCAGGACTTGGGAAAATTGACTAAATTGAGAGGGTTGACTTTTTATGGGATTCCAACGAGGAACTGACACGTAAGGTGAGGTACACAGGAGGGTTGATATGGTTGCCCTCAGGTGAACCCCTCTCCTCTG


Gene Sequence:
>Vu_24966(-)
TTCTGAATGAATCTGCTCTCTCTGCACGGAACACAAAAACATAAAAGTAAATTTTCACAATCACGGTCGGTTCCTACGACAATCGAATTTGCGTCAGCCTCAATTCTCAGTAAGTTTTTTTTGTCTTACCACTTTAACGACTTCTCCCTCTTCTCTTTGGCCACTCAATTGCTTCAATTCCATTCCGATTTAGTTTTAGGGTTTTCCTTCTTTCGCATTCTTAAAGGACTGCGTTGCCAGTATTCAATTGAAGCGCTTTAATTATTCTTCCTTGTAATTATTATTTTTTTTCCAATGGGAATTAACCAAGTAGCTGACTTTCTGAGTTTCGTTAGAACTGTAGTGTGTAAGAACTGTACCCCAAGACCTGGAAATTCGCATTAATACTCTGTTTCTTGAGTGAGAAAATTTTGAAAGAGGGTAAAAAAATCAATCTTTTTTTCTCTCTTTTGGATGGAACGTGTAACCAAACTAATACATTACACTCCTCTGGGATGATGGAATGTTTTGGGGTGCAAAAGCTTTATTCTGTTAGGAAATGATGGATTCTTAAAAATGTTAGTTGGCTTGAATTTTTCTCTCATTTTTTTGGAAAATGATTTGCAAATTTCAGTTCTTGTTAACTCTTGGATTAGCTAGTGGTTCTTAATTATTGATTCCATTTGATAATCAAACTCAAAATTCTAGCAGTCTTTTGTATGTGGTGTTATTGGTGTTCGATTTACAATAAGCTTTGAAATGCTTCTTTTAGTATGTTTTGAGTCATAATTTTATCGTATTTTTTCTCTTTTATTCTGTGGAAGCATAACTTTTGTGTATTAAAAACAAAAAGAAACTTGTTTGAAGTTGACTAATGTTTTCCAGATGATGACATGATTGTTTGTCATACTTTTGAAAGACACATTCTTCCTTCAGATTGATTTTGTGAGAAGTCTTTGAATTGAGCTTGGTTACTGCCTAACTGGTAAATCCATTTTAACTGTTGTAGTTGTAGCGGAGTGTATTTGTCCTCTGTTAATGACTTTGAATCGTATGATTTTCTTTCTCTGATACTTTGTAGTACTTACTTATTACATTATATGACGTTTTGTACTCATTTTATGCTGTCTGCAGTTATGCTTTCTTCTTAAAACGAAAACATCACTTACGAATTTTTTTAATCAGGACAATATAGTTCTCATTTTCTTCATCATTTTTATCTCCAATGAAAGAGTGATTTTATCAATTTTATACCCTGTTGTGTAGCATACCACCTGGCCTGAAAATCTGATAGAAGATGTTTTGTTGCTGCAGTGGAGTTTGGGATTGATGGCTCCATTAATGGTGAGACAGTAGGAAATGTTACTCTAGGGGAGATTAACAGTTGCAGCACACCTGATGAAAACAAAGTAGGTTGCAGCTCTTTCAATCCTGCTTATAAACATGATCATGATGATAATATAACTCAAGATTCTTCTGGAGGGGACACAATCCCATCAGGAATTCCTGCAGTATCAGTTGTTTCAGCTGATGAGCCCTATGTGGGACAGGAGTTTGATTCTGAAGCTGCAGCACATGCATTCTATAATGCATATGCCACCCGTGTTGGATTCATCATACGTGTGAGTAAGCTCTCACGATCAAGGCGTGACGGATCTGCTATTGGACGGGCTCTTGTTTGCAACAGAGAAGGTTACAGAATGCCTGACAAACGTGAAAAGATTGTAAGGCAAAGGGCAGAGACTAGGGTTGGTTGCAGGGCAATGATTTTGGTGAGGAAAGTAAGTTCCGGTAAATGGGTTGTTACTAAGTTTATACAGGAGCACACTCATCCTTTAACACCTGGAAAAGGTAGAAGGGATTGCATTTACGAGCAATACCCGGTGAGTTAGTGTTCTTTTCATCACTGAGATGCAATCCGTGGTTATGTGCTACTTTATCCTTGATAGATAATAGCTAGATAGTTGCTCACTCACTTAGCACTAGCCCATCATACAAGAGTTTGAATTTTGCTTAACAGAATTCCCACCTTACACAAATTACCGAAAATTGTTTTCAAATGTAAAATCCTTGATTTTTATGCCTACTGGTTATAGATTGCAATTTTAGTTGATGTTTGAATTTCCCTATTAAGATGAATGGAAAATGTTTTGACAGCATCTTCTGTTTGGCCTATATGCTTGTTAGATCTTATGTGAAGAGTAGCTTGAACAATTTGAAGATCCTCTCTTTGAATTGAGTTTTTTCTCATTCTTACATCTTATGTTCTATGCAATTTCCAGAATGAACATGATAAAATTCGAGAACTGTCTCAGCAGTTGGCCATTGAGAAAAAACGGTCTGCAACCTATAAAAGGCATCTTGAATTGATATTTGAGCACATTGAAGAGCATAATGAAAGCCTTTCAAAGAAAATACAACACATAGTGGACAGTGTGAAGGAGATGGAAACCAAAGAACAACAGAGTCATAGATAGATTCAGCTCAGTATCCAGTTTTTTTAATTATTTTTCACTGGATGTAACGCAGAATCAACTGTCAGGGTCATAAGTGCCGCTAGAAATGTCGTGCAATAATACAGTTGCTGACCTAGATATTTACTTCTTCAAGCTTTAGGTGTCAGGTGAGTTCTGTAGTTCAGTTTGCAAAGTTCAATGGAACTCAATAATTCATTAGATTGCTTCAAATTCTGTGATATTTTAGTTGTAGAAGAAACTAGTTCAGTCAATGTACAGGTCCTTTGAATCCATTCTTCTCAAGTTAAGCTAACAATGTGCAACTCATAACAGGCATGCACATGCCTTTACAGAATTAAAATGTTCCATTGTTGATGTTGT