Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24885 LG6 12687105 12689635 scarecrow-like protein 14
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 12687641 missense_variant p.His82Gln
A/T 12687773 synonymous_variant p.Pro126Pro
C/A 12687816 missense_variant p.His141Asn
G/C 12688008 missense_variant p.Val205Leu
T/C 12688009 missense_variant p.Val205Ala
A/T 12688010 synonymous_variant p.Val205Val
A/T 12688014 stop_gained p.Lys207*
A/T 12688019 synonymous_variant p.Thr208Thr
G/T 12688029 stop_gained p.Glu212*
C/A 12688153 missense_variant p.Ser253Tyr
T/G 12688158 missense_variant p.Leu255Val
T/C 12688223 synonymous_variant p.Tyr276Tyr
T/A 12688346 synonymous_variant p.Pro317Pro
G/A 12688520 synonymous_variant p.Val375Val
A/T 12688563 missense_variant p.Ile390Phe
T/C 12688564 missense_variant p.Ile390Thr
G/T 12688721 synonymous_variant p.Thr442Thr
G/T 12688988 missense_variant p.Lys531Asn
C/G 12689568 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24885.1
MDRRVSSTINIANDEAESFFDESDVSAVLGYIKQMLMEEDTEEKYSMFHDSLALQHTERSFYQVITHQKSSSPSSTHHHHVHSNPSYRVESPEQNVSGCSSDNSTGSYGSTSISSDSQWSVDYNTPPLPNTFTFPDNFAFHSNSTSTTQSSTNTGFGFLDNTLLDSAFQEQFKRGLEQGTSFLPKHTPFIVDTDSTAFSAVPTVVIKTETEESVEEEHFLSVSRRRNRDREEYEADGRIRKTSATYVDESELSELLDKVVLGTGLGKRVPSDTALYQKDETFLANMFGGEVRKSNEEVVDLRALLMLCAQAVASDSPSFAKQLLKQIKQHSSPIGDDTQRLAHYFGNALGACLDGTGFQVYSVLSSKRISAKDMVKAYCAYASVCPFEKITIIFANKSISFQSENAETVHIIDFGIRYGFKWPSLISILSKRPGGPPKLRITGIDQPQPGFRPEERVLETGRRLEHYCKRFNVPFEFNAIARKWDTIRFEDLKIEKNEFVAVNCMFELEHLLDESVVLDNPRDAVLRLIKKANPGIFVHSIVNGSHDVPFFVSRFREALFHYSALFNMLETNIDREDPTRLMFEKDLFGREIMNIVACEGCERVERPQTYKQWQLQNMRIGFRLLPLDQRVIDRLKKRLRQDAHDTNFMLEVDGGWVLQGWKGRILHASSCWVPA*


CDS Sequence:
>Vu_24885.1
ATGGATAGAAGAGTCTCCTCCACCATCAATATTGCTAATGATGAAGCAGAATCTTTCTTTGATGAGAGTGATGTCTCTGCTGTCCTTGGCTACATAAAGCAAATGCTGATGGAAGAGGACACAGAAGAAAAGTACAGTATGTTCCATGATTCCTTAGCTCTCCAACATACTGAGAGATCATTTTATCAGGTCATCACTCACCAGAAATCTTCTTCCCCTTCTTCCACACACCATCATCATGTTCACAGTAACCCCAGTTACAGAGTGGAGAGCCCTGAGCAAAATGTCTCTGGTTGCTCCAGTGATAATAGTACTGGTAGTTATGGCAGTACATCCATCTCCTCTGATTCTCAGTGGAGTGTTGACTATAACACCCCACCACTGCCAAACACTTTTACCTTTCCGGATAACTTTGCTTTCCACTCAAATTCAACCTCCACCACTCAATCTTCCACGAATACTGGATTTGGATTCTTAGATAATACCCTTCTTGATTCTGCATTTCAAGAGCAATTCAAGAGAGGTCTAGAGCAAGGTACCAGCTTCCTTCCTAAACATACTCCGTTCATTGTTGACACGGACAGCACAGCCTTTTCAGCGGTTCCAACTGTGGTAATTAAGACAGAAACAGAAGAAAGTGTTGAAGAGGAGCATTTTCTGTCTGTGTCAAGAAGGAGAAATCGGGATCGGGAAGAGTATGAAGCAGATGGGAGAATCAGGAAGACATCGGCAACGTACGTGGATGAAAGTGAGCTATCTGAATTGCTTGATAAAGTGGTGCTAGGCACTGGTTTAGGAAAACGGGTGCCTTCTGACACAGCCCTTTATCAAAAGGATGAAACATTCTTAGCAAACATGTTTGGTGGGGAGGTCAGGAAAAGTAACGAGGAAGTTGTAGATCTGAGAGCACTATTGATGCTTTGTGCACAGGCTGTTGCTTCTGATAGTCCTTCATTTGCAAAGCAACTATTAAAGCAGATTAAGCAGCATTCTTCTCCAATAGGGGATGATACTCAGAGGCTTGCACATTACTTTGGAAACGCCCTTGGAGCATGCTTGGATGGAACCGGTTTCCAGGTTTATAGTGTTCTATCCTCCAAAAGAATCTCTGCCAAAGACATGGTGAAAGCTTACTGTGCATATGCTTCAGTGTGCCCGTTTGAAAAGATTACTATAATTTTTGCCAACAAATCAATTAGTTTTCAATCTGAGAATGCAGAAACTGTTCATATCATAGACTTTGGTATCCGCTATGGCTTCAAGTGGCCTTCACTTATCAGCATCCTATCAAAACGTCCTGGTGGACCACCCAAGCTTCGCATCACGGGTATAGATCAGCCACAGCCAGGTTTCAGGCCAGAGGAAAGGGTGCTGGAGACGGGGCGTAGGCTTGAACATTATTGCAAGCGTTTCAATGTTCCGTTCGAGTTCAATGCTATTGCAAGAAAATGGGACACCATCAGATTTGAGGACCTCAAGATAGAGAAAAACGAATTTGTGGCTGTGAACTGCATGTTTGAGTTGGAGCATCTACTTGACGAGTCTGTGGTGTTGGATAATCCAAGGGATGCTGTTTTGAGGTTGATTAAGAAGGCAAATCCTGGCATATTTGTGCACAGCATTGTCAACGGCTCCCATGATGTGCCATTCTTTGTGTCACGGTTCCGAGAGGCTCTCTTCCACTACTCTGCACTGTTTAACATGCTTGAAACCAACATTGATCGTGAAGATCCTACGAGGTTGATGTTTGAGAAGGATTTGTTTGGACGAGAGATCATGAACATCGTAGCTTGTGAAGGTTGTGAGAGGGTTGAGAGGCCACAAACATACAAGCAATGGCAGCTTCAAAACATGAGAATTGGGTTTCGGTTACTTCCTTTGGATCAACGAGTCATTGACAGATTAAAGAAGAGGTTGAGACAGGATGCGCACGACACCAATTTCATGCTTGAGGTGGATGGTGGTTGGGTGCTACAAGGTTGGAAGGGTCGAATTCTACATGCTTCCTCTTGTTGGGTTCCGGCATAG


Promoter Sequence:
>Vu_24885::LG6:12685105-12687105(+)
TATATCTATATACCTATATTTAATAGGTATAATTAAGATTTTTATTACATCTTTATCCCTATTAGATAATAGATATATTTATATTACAAATATGGAATATCAAAATATTTAAAAGTAAATTATAATTGTATTCATTTTAAATTAAATTCTAAATAAAACTTTATGAGAACCAAAATATTTATTAGGTTTATAAACGTTAATCAAACAAGTTGATAAAATTAAAAAATAATTTTCAAAAGTTATAAAAAAAGTATCTAAATTTAAAATATTTTAAATTTCTCTTTAGTTTCTTTCTCTAAATTCTAATGAAATCACATAAAGATCAAGAATTAAATGGATAATAATAATTAAATTTTAGCATATATATTTGATATTTTGAATTTCTTGAATCATGATAAATAAAATTTATGACAATGACATTAGTTTATTATATTATAATAAATAAAATGTCTTTATATAATAATTAAGGTGATAAAATACACTTATAATAATGAATTAGAAAATAAAATAAAAAATAACAAAAATAATATTTTACATAATAAAAATAAATAACAAATAAAAATAGTAAAAAAAAGTAAAAATGATCAAATGTGTGTTTTATTAAAAATAATTTAATGTACCATTCAATAAAATCATACAAAGAAAAATAAAATATATAATTAAAGGCATGATAAAATTAAAAGTATCTTAAAAATCTAATAAATGTTTTTCACATGTCAAACTAGTTGAATTGTTAAGACATAATGAAAATTATTTTTGTAAAACAAAAGTTATTTTAATGAAACAAAAATTAAAGATAAAAAAGAATAAAAGATGTGTTTCGGTAAGGTTGAGATCCCTTACTCAAAGCATTCCAAGTGGTTTGCTCCATCATTCAGGTTACGTTGTTCTCTCTCTTCTCCTTGTCCTAGTCGAGGGAGAGGTGCCCAGAAGATACTCTGATGCTCAAGTCAATGATTTACTTAATGAATTCTATAATAAGAATGAACGAGTTAAATTACCTGCCTTTTTTCATAAGACATATATTTATAAATATTATAATGAGCTTACCATTAGATTTGATTCATTAATCATTAATAAATTACTATTATTTTCCTTAATTGTCCATTAATTGGTATTATTGTCCAAATTATTTATCAGTTAATGACTGTTCTGAACGGGTAGATTTCCTGCTGGATGATGGATCACTTAGTCTTTAAGTGACCAAACAGGTCATAATTCAAATGTGAAACAAAAACTATTTGATTCAGTGTAATTAATAATACATCATTTAAGTATAATGATACAAAATTTATGAGAAGAGAGAAAATACTTTAAAATAGAAATAAAATTTATAAATAAAAATACGTCAAACAATAGAAAAAAGAAAAAATAAAATTATAAAAATTATAAAAATAAAAACTAAGAAAATAATATATATATAATTTTTTTTAAGATTATCTAATAATGTAATTTAAAAAGGATGAAAAGTATTAAAGCAAGTACGAGAATCAATACAGATTTTGTTTTGTCAAAATAAAAACGAGTTTATTTGTCTTTCTTAATTTAATTATATATTTTAATATCTTGATAAAACAAAATAATTCCATCATAAGTTAATATATTAATATTTGTATAAATATATTATTATATTATTAAAATGGGTGGTTAGAGGGGCAAAGTACTTTCTTTTTCTGTAATCATATCTTAAATTATAATTCATGTGATGGGATTGTTGTGTCGTGAACCACACTCACAAGCTTAGTAAAGAAGTGAAATGTGACGTGGCAAACTCAGGTACACTTGTTGTCATGGCTGGAAACTACAAATTCTTCAAGTTGTTTTTTCGCTAGATATTTTTAAACTGATTAAATTATACAATTTTAAAAATATTCAATATCTTTATATAGTGATTTAATTTAATATTTAACAGATGACAAAATATAAGTTCTAACACTAAAATAATTAGTTTATAAATTTTTTTTGTTATGATATATTCAGAATGAAAATGATGATTTTGT


Gene Sequence:
>Vu_24885(+)
TTGACATGGGGTTGGAATTGGATGGTTTTATCTTCTAATTCTGGGGATTTCCCTGCCTCATTTAAAAGCCATGAGACAGACTGAATATACTGCTCTCTTTTTCCTTCATTTCTTTGCTTTCCTTGGTATGCAATTTTTTTCATTTCCTCTCTATAGTTAATTTTATTTCATCAAAACTTCTTCTCCTTGCCCTTAATTTTAGATCAAACTACACTTTTTTAGAACCATTTGGTATGAAATTGTTTGTCTTGCTTCCTCACCTTAGTCTGTGATCATACTAATAATTTATAGATGGATAGAAGAGTCTCCTCCACCATCAATATTGCTAATGATGAAGCAGAATCTTTCTTTGATGAGAGTGATGTCTCTGCTGTCCTTGGCTACATAAAGCAAATGCTGATGGAAGAGGACACAGAAGAAAAGTACAGTATGTTCCATGATTCCTTAGCTCTCCAACATACTGAGAGATCATTTTATCAGGTCATCACTCACCAGAAATCTTCTTCCCCTTCTTCCACACACCATCATCATGTTCACAGTAACCCCAGTTACAGAGTGGAGAGCCCTGAGCAAAATGTCTCTGGTTGCTCCAGTGATAATAGTACTGGTAGTTATGGCAGTACATCCATCTCCTCTGATTCTCAGTGGAGTGTTGACTATAACACCCCACCACTGCCAAACACTTTTACCTTTCCGGATAACTTTGCTTTCCACTCAAATTCAACCTCCACCACTCAATCTTCCACGAATACTGGATTTGGATTCTTAGATAATACCCTTCTTGATTCTGCATTTCAAGAGCAATTCAAGAGAGGTCTAGAGCAAGGTACCAGCTTCCTTCCTAAACATACTCCGTTCATTGTTGACACGGACAGCACAGCCTTTTCAGCGGTTCCAACTGTGGTAATTAAGACAGAAACAGAAGAAAGTGTTGAAGAGGAGCATTTTCTGTCTGTGTCAAGAAGGAGAAATCGGGATCGGGAAGAGTATGAAGCAGATGGGAGAATCAGGAAGACATCGGCAACGTACGTGGATGAAAGTGAGCTATCTGAATTGCTTGATAAAGTGGTGCTAGGCACTGGTTTAGGAAAACGGGTGCCTTCTGACACAGCCCTTTATCAAAAGGATGAAACATTCTTAGCAAACATGTTTGGTGGGGAGGTCAGGAAAAGTAACGAGGAAGTTGTAGATCTGAGAGCACTATTGATGCTTTGTGCACAGGCTGTTGCTTCTGATAGTCCTTCATTTGCAAAGCAACTATTAAAGCAGATTAAGCAGCATTCTTCTCCAATAGGGGATGATACTCAGAGGCTTGCACATTACTTTGGAAACGCCCTTGGAGCATGCTTGGATGGAACCGGTTTCCAGGTTTATAGTGTTCTATCCTCCAAAAGAATCTCTGCCAAAGACATGGTGAAAGCTTACTGTGCATATGCTTCAGTGTGCCCGTTTGAAAAGATTACTATAATTTTTGCCAACAAATCAATTAGTTTTCAATCTGAGAATGCAGAAACTGTTCATATCATAGACTTTGGTATCCGCTATGGCTTCAAGTGGCCTTCACTTATCAGCATCCTATCAAAACGTCCTGGTGGACCACCCAAGCTTCGCATCACGGGTATAGATCAGCCACAGCCAGGTTTCAGGCCAGAGGAAAGGGTGCTGGAGACGGGGCGTAGGCTTGAACATTATTGCAAGCGTTTCAATGTTCCGTTCGAGTTCAATGCTATTGCAAGAAAATGGGACACCATCAGATTTGAGGACCTCAAGATAGAGAAAAACGAATTTGTGGCTGTGAACTGCATGTTTGAGTTGGAGCATCTACTTGACGAGTCTGTGGTGTTGGATAATCCAAGGGATGCTGTTTTGAGGTTGATTAAGAAGGCAAATCCTGGCATATTTGTGCACAGCATTGTCAACGGCTCCCATGATGTGCCATTCTTTGTGTCACGGTTCCGAGAGGCTCTCTTCCACTACTCTGCACTGTTTAACATGCTTGAAACCAACATTGATCGTGAAGATCCTACGAGGTTGATGTTTGAGAAGGATTTGTTTGGACGAGAGATCATGAACATCGTAGCTTGTGAAGGTTGTGAGAGGGTTGAGAGGCCACAAACATACAAGCAATGGCAGCTTCAAAACATGAGAATTGGGTTTCGGTTACTTCCTTTGGATCAACGAGTCATTGACAGATTAAAGAAGAGGTTGAGACAGGATGCGCACGACACCAATTTCATGCTTGAGGTGGATGGTGGTTGGGTGCTACAAGGTTGGAAGGGTCGAATTCTACATGCTTCCTCTTGTTGGGTTCCGGCATAGTGTATTTCCAGTCTTACACATAATTGCTATACTTTCCTTCAACGAGCAAAAGCAAAATTATAAGTCAGTTTCTACCAACATGTACTTTGTTTTCTACTTACATATCTAACAATCATATGTTCCAGAAGCAATGTCCCCGACTGTCTACCTTCTCAACATGTATATGTCCCCAAAAAACAATAAATGCTAATAAACTTTTCAAGATTACTTTA