Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24870 LG6 12569970 12574479 PREDICTED: U-box domain-containing protein 33-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 12570033 downstream_gene_variant
A/G 12570116 5_prime_UTR_variant
T/G 12570119 5_prime_UTR_variant
T/G 12570121 5_prime_UTR_variant
A/T 12571002 synonymous_variant p.Ala155Ala
T/C 12571020 splice_region_variant&intron_variant
C/T 12571521 missense_variant p.Thr200Ile
T/C 12571575 missense_variant p.Leu218Ser
G/T 12571584 missense_variant p.Arg221Ile
T/C 12572319 synonymous_variant p.Asn328Asn
G/T 12572326 missense_variant p.Asp331Tyr
G/T 12572437 stop_gained p.Glu368*
A/T 12572817 missense_variant p.Lys494Asn
C/T 12572824 missense_variant p.His497Tyr
A/T 12573327 synonymous_variant p.Pro592Pro
A/G 12573330 synonymous_variant p.Glu593Glu
G/A 12573334 missense_variant p.Val595Ile
A/T 12573339 synonymous_variant p.Leu596Leu
G/A 12573413 missense_variant p.Arg621His

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24870.1
MELLKPLHPHHAPILCLPFHGHPSSSQSQSQLPLPMPPKVHVAVGKSIDKAVTLLQWTFNHFQNAEIVILHAYQPSLTIPTLLGKLPASQASPAVVSAFRCVEREQTMKLLDKYLTVCRTARVKASVIVTEVDQVQKGIVDLVVKHNIQKLVIGAVPENCMKVKRNSGKANYTAKNAPPFCEVWFLYKGKVIWTREASETPCSSSLSAQPEIATAESLRCRSFQYGKNELFDSECLQPNSARSATGFGISETGATFSSKASSCSSHCSSQNSSRAHLDTYLEAMEEKINNQLIETKREAEAVADEASAELLKCERLEVEAMEAIRKVNLFDSAHVREVKLRKEAEDALRATVEEQQKLLSESEEIASELQMTMRNIALLDSRAQEANRRRDEAADELSLIQESISTLWQERQQIRRQKMESLRWLERWRSRGQVGAAHCNGVIGFPEELPELAEFSSSDLQNATCNFSNSFKIVQGGFGCIYKGEMLGRTVTIKRFHQHNMQGPMEFRQEVQVLGSLQHPHLITLLGVCPEAWSIVYEYLPNGTLQDYLFRKSNNSPLTWNTRARMIAEIASALCFLHSFKPETIIHGDLKPETVLLDSSLSCKICGFGFCSLVSEESLLRPSFRLSTEPKGAFTYTDPEFHRTGILTTKSDIYSFGLIILQLLTGNTPVGLAALVRNAASCGKLSSILDSSAGEWPSPVASRLVELGLQFCQQNRRDRPDLTPTLVRELEQMHASEERPVPSFFLCPILQEIMHDPQVAADGFTYEGDAIREWLENGHDTSPMTNLKLNHLFLTPNHALRLAIQDWLCKS*


CDS Sequence:
>Vu_24870.1
ATGGAACTTTTGAAACCTCTGCACCCTCACCATGCACCCATTTTGTGCCTTCCCTTCCACGGCCACCCATCTTCTTCCCAATCTCAATCACAGCTTCCCCTCCCCATGCCTCCCAAGGTTCATGTAGCTGTTGGCAAATCGATTGATAAAGCTGTTACCTTGCTCCAATGGACCTTTAACCACTTTCAGAACGCTGAAATCGTTATATTACATGCTTATCAACCTTCTCTCACGATCCCCACTCTGTTGGGGAAATTGCCTGCATCACAGGCTAGTCCTGCTGTGGTGTCTGCTTTTCGATGTGTGGAGAGAGAACAGACCATGAAGCTTTTAGACAAGTACTTGACCGTTTGCCGCACAGCTAGGGTTAAGGCAAGCGTTATAGTAACAGAAGTTGATCAAGTCCAAAAGGGAATTGTTGATTTGGTCGTTAAGCATAATATTCAGAAGCTTGTCATTGGAGCAGTGCCAGAAAATTGCATGAAAGTGAAAAGAAATTCTGGTAAAGCAAATTACACTGCCAAAAATGCTCCTCCTTTCTGTGAAGTATGGTTTCTCTATAAAGGAAAAGTCATCTGGACAAGAGAGGCTTCTGAAACACCATGTTCTTCATCCTTGTCCGCTCAACCTGAGATTGCCACCGCAGAAAGCTTGAGATGTAGATCTTTTCAATATGGTAAGAATGAACTATTTGACTCAGAGTGTCTTCAACCAAATTCGGCAAGATCTGCCACTGGTTTTGGAATCTCTGAAACTGGAGCCACTTTTTCATCCAAAGCATCCAGTTGTAGCAGTCATTGTTCCTCTCAAAATTCTTCTCGGGCTCATTTAGATACATACTTAGAGGCCATGGAAGAAAAAATTAACAACCAACTTATTGAAACCAAGAGAGAAGCCGAGGCAGTAGCAGACGAAGCCTCTGCAGAGCTATTAAAGTGTGAGAGGTTAGAAGTTGAAGCCATGGAAGCCATCAGGAAGGTCAATTTGTTTGACTCTGCCCATGTTCGTGAAGTAAAGCTTAGAAAAGAGGCTGAGGATGCACTCAGAGCTACGGTAGAAGAACAACAAAAGCTCTTGAGTGAGAGTGAAGAAATTGCTAGCGAGCTTCAAATGACCATGAGAAATATTGCGCTGTTAGATAGTCGTGCTCAGGAAGCAAATCGTAGACGTGATGAAGCTGCAGATGAACTATCACTAATTCAAGAATCCATCTCAACCCTGTGGCAAGAAAGGCAGCAGATAAGGAGACAGAAAATGGAATCCCTACGTTGGCTTGAGCGGTGGAGAAGTCGAGGACAAGTTGGAGCAGCTCATTGCAACGGGGTCATTGGCTTTCCTGAAGAATTACCTGAGTTAGCGGAGTTTTCATCATCAGATCTTCAAAATGCCACATGTAATTTTTCCAACAGCTTTAAAATTGTGCAAGGTGGATTTGGTTGTATATACAAGGGGGAAATGTTGGGTAGGACTGTTACTATAAAAAGGTTCCATCAACATAATATGCAAGGACCAATGGAGTTTCGTCAAGAGGTTCAAGTTCTTGGTAGTCTCCAGCACCCTCATTTAATCACTTTGCTTGGTGTTTGCCCTGAAGCCTGGTCAATTGTATATGAGTACCTCCCCAATGGAACTCTTCAAGACTACCTATTCCGGAAAAGCAACAATTCTCCTTTAACATGGAATACCCGAGCACGAATGATTGCTGAAATCGCTAGTGCTCTCTGCTTCCTACATTCTTTTAAACCCGAAACTATTATCCATGGTGATCTGAAGCCAGAAACTGTACTACTTGATTCTTCACTTAGTTGCAAGATATGCGGATTTGGATTCTGCAGTCTGGTAAGTGAGGAGTCTCTCCTCCGTCCTAGTTTCCGTTTGAGCACTGAACCAAAGGGTGCTTTCACATATACTGATCCAGAGTTTCATAGAACTGGAATACTAACAACAAAGTCTGACATCTACTCCTTTGGGCTCATCATTTTACAACTCCTCACTGGTAATACTCCAGTTGGATTAGCAGCTCTAGTACGCAATGCAGCTTCATGTGGAAAATTGTCTTCAATTCTTGATTCTTCAGCTGGAGAATGGCCCTCGCCTGTGGCATCGCGTTTGGTCGAACTGGGATTGCAATTCTGTCAACAAAATCGTAGAGACAGACCAGATTTAACACCTACACTAGTGAGAGAATTGGAGCAGATGCATGCTTCAGAAGAGCGACCGGTGCCGTCTTTCTTCTTATGTCCAATCCTTCAGGAAATAATGCATGATCCTCAAGTTGCAGCAGACGGATTTACCTATGAAGGAGATGCCATACGTGAATGGTTGGAAAATGGGCATGACACTTCTCCCATGACTAATTTGAAATTGAATCACCTGTTTCTTACTCCCAACCACGCACTTCGACTTGCCATCCAAGACTGGCTTTGCAAATCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_24870::LG6:12567970-12569970(+)
GTTTTATGGCAGAATTAATTCTTTCATTCGTTTTGTTTTACCATTGTTAATTGTTGAACAGTTGATCTGTAATGATATATCAAAACCATTTCAGCTTATTACTTTTTTCTTCCTCCAAATCATCATATTCTTCTATCTAAACCTAAGTCAGATCCTATAATTCTGTGTATGTTTGAAGTTAATTCGGACATCCTAATCAAACTGGTTTTTGGTTGGGTTATATGACATTAAGCCTCTTGCCCAATAGGCTGAGGAGTTGAGATTTTGAATAAGCAGTTGTTGTGGCAGTAATTCATTTTCACTCCAAGAATTTGGAGCTGGTTAAGATATAGCGTAGAAACATGTGTTTGTGTTTTTGGTTGCTGAGGCAACATTTTGAATATTACACTGTATGTATTTTACTTTGAATGCTTTTCCTAGATGTTGAAATTTCTAAACATTTTAAATACTTAAAAAGTTGAATGTCTTACACAGCAAAGAACAAACAATTCAACAAGGAAGGAATAAAATCTCGTAAGTCGAAAACACCTACCTCGGTTATAGACTTACTGTAACGTGACAATGTATATGAATTTGATTTGCCGTTGAAAACTTACATACTCAGATTCAAAAAGACAAAAAAACGAAACTTCTTATTCAAACATAGGTTATATCTTCAGAAATTTCAATATTGTTTTTATCTTGTGCACTACATGCCTAATTAAGAAAATAAAAGAGTTATTGAAATAAGATAAGATAATTAAGTTAAAGACAAAAGTTAAGATCTTTGCTTCTTTTAAGATTTAAAATTATTGAAGAAAATGAACGAATTTCTTTAACACATGTAACAAAAATAAATTATTAAACACTATTACTTTATAAACAAATGTAAATTTTTAAATATTTTTAAAAAATATAAATGATTGCAAGTGCAAAAGTATATAAAGGATAAAGTCAACATTGTGGGTTGTTAAGAACTGAATTTATCTAAAAAATAATCCAAAAATTATCAGAAAAGTTGATAATAGGTTAAAATCAAAATTTCAGGATTGACTGGAAATTTTTTCGACAATCAAACGGTTTGGTTTGGTTTGACAGTTTAAATTGATTTAAATCAAACTAAAATAATTTTTTTGAATAGTATTATGTTATTTATTATTTTATTCATATACCAGATTAAAATCTAATTTATTTAACTTGATGAGTTACAGAAAAATGTTTAAAAGGAGAAAAAACAAAATCATCTTAATAATTTGAACGTTACATTACATTATTAATCTTAGAAAAGAAAAATGTTAAAGTAAAATAAAAGAGCATTGCAAACAATACAGATAGATTGGTTTTAATGATTATATTTTAAATTTTTACATAATATTGTAGTATGTTTTGCAGAAATTTGGAGATTATCTAAGTATGTCATAATGTATAAAAATGTAGATACTGATTATCTCTCTATAATTTATTTTAGTTCATTCACTGATAAAAATAAATAAAACTGTCATTTTATGCAATATTATATATTCATAAAAATTATATAATGAAACACGTAAAACCGCCGTACTAAACCCCCAAAATTTAGTATAGTAATCCAAACCAAATCTATCTATCTCCATATAATTTGTACGCGGCATCATAAACAACTGTAATAAAGAGAATCCAACAAATATAAAAACAAAAGACGATGTTAGAAATGAGTGTATAAATTATAAATATGTAATTAGTCATATCTCTGAACTGTTAAGGTTAGGATTTTCCTTGGATTAGGTTAGCAACAAGCCTATTGTTTGACCTAAATCAAAGTATCATTTATTTTAAAGGATATTAGCTTTTAATTTTTTTTTATAATAAAATGTCATTTTGAGTGACATTTTGAAGGGCGTGGTATGTCAAAAGCAAGTCACATGTTTAGTTTAGTAGAAAAATGGTAGTTGAGTGAAATTAAACATATAAAACACCATGATTACAACAAAATCTTTGAAGACTGGGTATTAACTAACTAATAAATTCCAGTTATCTGTAGA


Gene Sequence:
>Vu_24870(+)
AGAATGTTGTGACTTTGCCCAATGGAATTGGTCTCGCCGACAGGTTCATCTTTTCTACCATTAGTGTTACTTAGTACTCACGAATACGACAAACAAAACGAGATTCAGAGTAACATTCTAATTTGCAGGTATTTAGAAATATGTTAATGTATGAAGAAAGAAAGGACATGAAAAGGTTTGGTTTTTCACTGCAGTGGAAAACGAGATGACTCCAATTTCCACACGCCATTGGCGTGGAGTCAACTAAAAAGTCAAACGTTTAACGGGGTTCCATTTCAATTCAATTCAATTCGCATCCCAATCCAGCAAATGATGCGATTTCTGTTCCTACCATCCAATAATTCAGTTCCTGCACTGCACCAATGGAACTTTTGAAACCTCTGCACCCTCACCATGCACCCATTTTGTGCCTTCCCTTCCACGGCCACCCATCTTCTTCCCAATCTCAATCACAGCTTCCCCTCCCCATGCCTCCCAAGGTTCATGTAGCTGTTGGCAAATCGATTGATAAAGCTGTTACCTTGCTCCAATGGACCTTTAACCACTTTCAGAACGCTGAAATCGTTATATTACATGCTTATCAACCTTCTCTCACGATCCCCACTCTGTGTAAGCTCGTTTCTTTCAATTCTCGTTGTGAATTATGGTGGTTTCTACTTTGCCCCCATTTTTCGCTTACTGGGTCTCTTTGAATTTTGTTGTGTAGTGGGGAAATTGCCTGCATCACAGGCTAGTCCTGCTGTGGTGTCTGCTTTTCGATGTGTGGAGAGAGAACAGACCATGAAGCTTTTAGACAAGTACTTGACCGTTTGCCGCACAGCTAGGGCAAGCCTCTTCTTTTTATTTTCATTTTAATGACTGAATTTATTTATGTTGTAACTTATGGTAAGAAATCTATTCTTAGCTGTGCTTTTAATATAAATTTTCTCGTCAGGTTAAGGCAAGCGTTATAGTAACAGAAGTTGATCAAGTCCAAAAGGGAATTGTTGATTTGGTCGTTAAGCATAATATTCAGAAGCTTGTCATTGGAGCAGTGCCAGAAAAGTAAGTTATTCATTCAATGTCTATTATGCCAGTGTTCTTTGCAATTGTCTGTTATTCTTTCTTTTCCTGCATTTTTTTTTTTTTTGGGGTTGGAGGGAGGGAGGGAGAGAAGGATGATTATGTCTTCTGTATAGAACTGCCAAGCTACTAGTTAGTCTTCCCTGTAGTTTGGATAGAGTTGATTTTATTCTTGTGACTCTCATGAATTTCGTATCCTCGTGTCTATTGTTTCTGTAGAGAGTTGAGAACGTCACAACTGGTTTTATTTTCTTTTGATAACTTGGAGGCTGCAATCTACTTCTGTAGTGTCCGTTTTTGTCCCATTTCTTTCACCGAATGGATCAATAAATCTTTCCACTTACAAAATCATCGTGGAAAATTGCAGTTGCATGAAAGTGAAAAGAAATTCTGGTAAAGCAAATTACACTGCCAAAAATGCTCCTCCTTTCTGTGAAGTATGGTTTCTCTATAAAGGAAAAGTCATCTGGACAAGAGAGGCTTCTGAAACACCATGTTCTTCATCCTTGTCCGCTCAACCTGAGATTGCCACCGCAGAAAGCTTGAGATGTAGATCTTTTCAATATGGTAAGAATGAACTATTTGACTCAGAGTGTCTTCAACCAAATTCGGCAAGATCTGCCACTGGTTTTGGAATCTCTGAAACTGGAGCCACTTTTTCATCCAAAGCATCCAGTTGTAGCAGTCATTGTTCCTCTCAAAATTCTTCTCGGGCTCATTTAGATACATACTTAGAGGCCATGGAAGAAAAAATTAACAACCAACTTATTGAAACCAAGAGAGAAGCCGAGGCAGTAGCAGACGAAGCCTCTGCAGAGCTATTAAAGTGTGAGAGGTTAGAAGTTGAAGCCATGGAAGCCATCAGGAAGGTAAGCAAAATCTAGTGATTGTAAATCATTGAAGATTTCTGAAGCCAATAACCTTCTGGCTTTTGCCCTTATTGCTCCTTTCTAGTCATGTGAATGAGGAATTAAGTATTTTTTTTCCTTAAGTTTTTCAGAAACTTTGACAAAAGCATTACAACAAGACAGAATCCCTCCTGAAAGTACTGAGATTCTGCAAACAATTTTCTGAACCTAACATTTTCAGGCCAGAATTGTAGAAGAAGCAACATTTTTAATATTTGCTTAAGTGAAATTGTGTGGAAATTTCTATGACGGGATATTGTATGATTTAGCTGTATCCTTTCTATCTCCAAACCATTTTGAACTGTAATGGATAGTGAGTCTATAGTTTAACTGATTTCTTAAGCTCCCTACGAAAGTTATATTCTATCTTACAGGTCAATTTGTTTGACTCTGCCCATGTTCGTGAAGTAAAGCTTAGAAAAGAGGCTGAGGATGCACTCAGAGCTACGGTAGAAGAACAACAAAAGCTCTTGAGTGAGAGTGAAGAAATTGCTAGCGAGCTTCAAATGACCATGAGAAATATTGCGCTGTTAGATAGTCGTGCTCAGGAAGCAAATCGTAGACGTGATGAAGCTGCAGATGAACTATCACTAATTCAAGAATCCATCTCAACCCTGTGGCAAGAAAGGCAGCAGATAAGGAGACAGAAAATGGAATCCCTACGTTGGCTTGAGCGGTGGAGAAGTCGAGGACAAGTTGGAGCAGCTCATTGCAACGGGGTCATTGGCTTTCCTGAAGAATTACCTGAGTTAGCGGAGTTTTCATCATCAGATCTTCAAAATGCCACATGTAATTTTTCCAACAGCTTTAAAATTGTGCAAGGTGGATTTGGTTGTATATACAAGGGGGAAATGTTGGGTAGGACTGTTACTATAAAAAGGTTCCATCAACATAATATGCAAGGACCAATGGAGTTTCGTCAAGAGGTTAGTTCCCCCCATAAAGGTTTTTCTGCCAGTTTATTATCTTAAAATATAAAGATGGCTTCAGAGGAATGAATTTAGAAACTTTAATTTTGAGGCATTTTACATTCTACCTTTTTTTTCACAACACTAATAATGGAGTTGTTTTCTATTTCCCTCACTCGTTTCTTTTTCCTGTGTTTGTTAGATTCCACTGATGTTATCCTTTTTTGTGATCAGGTTCAAGTTCTTGGTAGTCTCCAGCACCCTCATTTAATCACTTTGCTTGGTGTTTGCCCTGAAGCCTGGTCAATTGTATATGAGTACCTCCCCAATGGAACTCTTCAAGACTACCTATTCCGGAAAAGCAACAATTCTCCTTTAACATGGAATACCCGAGCACGAATGATTGCTGAAATCGCTAGTGCTCTCTGCTTCCTACATTCTTTTAAACCCGAAACTATTATCCATGGTGATCTGAAGCCAGAAACTGTACTACTTGATTCTTCACTTAGTTGCAAGATATGCGGATTTGGATTCTGCAGTCTGGTAAGTGAGGAGTCTCTCCTCCGTCCTAGTTTCCGTTTGAGCACTGAACCAAAGGGTGCTTTCACATATACTGATCCAGAGTTTCATAGAACTGGAATACTAACAACAAAGTCTGACATCTACTCCTTTGGGCTCATCATTTTACAACTCCTCACTGGTAATACTCCAGTTGGATTAGCAGCTCTAGTACGCAATGCAGCTTCATGTGGAAAATTGTCTTCAATTCTTGATTCTTCAGCTGGAGAATGGCCCTCGCCTGTGGCATCGCGTTTGGTCGAACTGGGATTGCAATTCTGTCAACAAAATCGTAGAGACAGACCAGATTTAACACCTACACTAGTGAGAGAATTGGAGCAGATGCATGCTTCAGAAGAGCGACCGGTGCCGTCTTTCTTCTTATGTCCAATCCTTCAGGTAACTTCTTTTCTATAAATAAAAGAGCTTCACATAACATGGTTCAGGTAACTTTTATAGTGCTAAAAGACAAAGATGGTTATTTATTCTATTTTGCTCTTGAACTTTGGATTCCTTCTTCAGGAAATAATGCATGATCCTCAAGTTGCAGCAGACGGATTTACCTATGAAGGAGATGCCATACGTGAATGGTTGGAAAATGGGCATGACACTTCTCCCATGACTAATTTGAAATTGAATCACCTGTTTCTTACTCCCAACCACGCACTTCGACTTGCCATCCAAGACTGGCTTTGCAAATCTTGAAGCTTCTTTTGTTCATTTAGGGCTAAAGTGCTCTTTTTTATCCTCATTAGTTTGGGGCCAGTTTCGTTTTGGTCCCAAGATTTTCTTTTGTTTTGTGTGTGTGGTTGTAAATTTATTTTGTATGCCACAAAAAATTGTCAATTTGATCTGATCCCAGCTTACGCCATTCAAATAGACAGAAAAGAAATTGTATTTTGGCCACAATTTGCAGCCAGAGAAAAAAAAAGGAAGAAGTCTGTGCACCCGTCATTATTATGACTTGAGTATTTTATGGGATTAAACTGACTATTGTCACATATTTGAGGGGCAAAAGAAACAATTTAACCTTTTGGATATGCAAATATTTGTATATATTCTATTTTTCACATT