Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24852 LG6 12375976 12376680 PREDICTED: zinc finger protein ZAT12
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 12376111 missense_variant p.Lys37Ile
T/A 12376154 missense_variant p.Asn51Lys
C/T 12376377 synonymous_variant p.Leu126Leu
G/A 12376531 stop_retained_variant p.Ter177Ter
T/G 12376588 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24852.1
MKRDREEGELDNMANCLMLLTKVGESEANATSKGRDKRDGEIGDFKCKTCNRRFSSFQALGGHRASHKKPKLMITDLSCRHQLPCTPTTKQQPRMHPCPICGLQFAIGQALGGHMRKHRTAINDGLLNRRDSDSLSILKKSKNGGRLNLCLDLNLMPLEDDDLKLNLRTPVLNCFI*


CDS Sequence:
>Vu_24852.1
ATGAAGAGAGACAGAGAAGAGGGTGAGTTAGACAACATGGCTAACTGTCTGATGCTATTGACCAAAGTTGGTGAGAGTGAAGCCAACGCAACATCTAAGGGTAGAGATAAAAGGGATGGTGAAATTGGTGATTTCAAGTGCAAAACTTGCAATAGAAGGTTTTCTTCTTTTCAAGCACTTGGTGGGCACAGAGCAAGTCACAAGAAACCAAAGCTCATGATCACTGATCTTTCGTGCCGTCACCAGTTACCTTGTACTCCAACCACCAAACAACAACCTCGGATGCACCCGTGTCCCATTTGTGGGCTTCAGTTTGCCATTGGACAAGCATTGGGAGGGCACATGAGGAAACATAGAACTGCCATTAATGATGGTCTGTTGAATAGGAGAGATTCGGATTCTTTGTCCATTCTGAAGAAATCTAAAAATGGTGGAAGGTTGAATTTGTGTTTGGACTTGAACTTGATGCCATTGGAGGATGATGATCTTAAGCTCAATCTAAGAACACCCGTTCTCAATTGTTTCATTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_24852::LG6:12373976-12375976(+)
AAGTATGGCCGGGCGCACCGCCTACGGTGTTTGATTAGATTGATGCACAGTGTCTTACGTTTGCATACATGTCACACACGTTTCCCTTCTCGTTTGTCTTATTCCAAACATTCGATCTATTAACAGCTACACCCTTAATTGTTTTATATTGCAAAATGATTTTTTGGACTCTCTACAATCTACGAACATTTATAAAGTGGGAAATAAAAGAAGTGTAATTATAATAAAAAATGTGATGTGGTAGAAAAATTTTAAAATTACGAGAGTTAATACTATTTATAAAAATAAAATTGTTAATTACCAGTAGCAATATTTTGGAGTTCCTTATTTATATTTGAGATTTTCGTTAATAGAGCTGTTTAACAAAATTGGTTCAAATTAAATGAGGATGTTTACCAAAAAAGTTATCATTAAAATATATGTGATGTAAGTTTCTTCTACAAACGAATCTTATTTCTTATTGTTGTAGATAAAGTCTTTCGAAAATCCATCGCGAAACATTCGTGTGCGTCTATGCTTTTATATTATAATTAAAAGTTTATTTATAGAAAGAAAATATCACTAAGATTCTATTAGAACCAATAACTTTATATTGTTTACAGTCAACACAGATTAAATATTCTTTTTACTCTTTAAGATGTTTTTTAAAAATATAATTTGTGATAAAATTTTAAGTTTATATGGTGATTAACCTTAACCACATTGAATTTGAAATTGAAACATTGATATTCATTGCGAGACTGACTGATAATATCGTTCTGAAATAAGTTATTCGTTTCTTAAATTTTTTATTGAAAATGACCAACTTGAAATCAAAATATTAAATCTACCATGAAATCGATAATGAGATTATATGATAAATCATCAGTTTTTTAAATTCTTAATTAAGAATACACGTCAATAATTATATATTACTTAAGAGTAAAAATTTAAGAAACTTTAAATATTTCTTCTTTTTTTTTTGAGATATTTTATAAGGTCCATATTTTAAATGTATGATGATTAATTTTAAGTGTCTTTTTTTTCTTCGTTGAATATTTAAATCAAATTTACTTAAAAAATTCACATTGTTTTAAGAAATAAATTTTAAAGTTTAAATCAATATTATAAAATAGATTTTTAATAAGAAATTAAATCTCATGTAAAAAAAATTTACAATAATGTATTTATTAAAATACTGTATCGGTTTTATCATTTTCTTCATCGGACTATCATCTACTCTCACGTGAGAATAGATGATAGTCCGATGAAGAAAATGATAAAACCGATGCAGTATTTTCTATATTATACACACTATTATATGTTGCTGCTTAATGTACACACTGTTATACTCTCCTTTTTCTTCCTTTCATACTGATCAAATTTTTCTAGGCCCACACGCTATCTCTCATATTATTCTTTGTTCCATTTGAAAAACTTAATTTTCATTATTGAAATTGATACATAATTTCACTCCAAAGAATATATATTCTTTCTCCATTTCAGACCGCATTTGGTTTAGTTTCTTAACATGAAAAGGAAGTTGGAATATAAAAGAAAAGAGGCAATCATAATAAACAACAAGCTCTGGGACCCAAACAAGACCACTGTGACGAAGTTGGCGTTAGTTTCGTTGAAAAGTTACAGAGAATATAATGGGAACATTGCATATTATAGATGAGAATAGTAGTTCCAGCTCCACTATTGATTATTCAGCACAGACAAATAAGTGTATACTTCACTAATGATCTGTTTGATTAAGGAAAATAGGTCTTGCCCCTTTCGACACGCGTTCACGCAAACTTAGCTACCAACGACCAAGTAACCAACCTTGTACAAATTAAGAATGTTTTCGTCTATCGATTCTTAATTGCAAAGGAAAAATAAGGGTAGTTATGCCACTCTCTCCGCGTAATTCCGAACATCAATCACAGTCACACCAACATAACATGCACCTTCCTCACACATTCCCACACATCTCTCATGTATATATTTAAGAGTGTAGTGTCTTCAAATTCTCA


Gene Sequence:
>Vu_24852(+)
ATATTCTCATTCTTTTTTGGTACACCATGAAGAGAGACAGAGAAGAGGGTGAGTTAGACAACATGGCTAACTGTCTGATGCTATTGACCAAAGTTGGTGAGAGTGAAGCCAACGCAACATCTAAGGGTAGAGATAAAAGGGATGGTGAAATTGGTGATTTCAAGTGCAAAACTTGCAATAGAAGGTTTTCTTCTTTTCAAGCACTTGGTGGGCACAGAGCAAGTCACAAGAAACCAAAGCTCATGATCACTGATCTTTCGTGCCGTCACCAGTTACCTTGTACTCCAACCACCAAACAACAACCTCGGATGCACCCGTGTCCCATTTGTGGGCTTCAGTTTGCCATTGGACAAGCATTGGGAGGGCACATGAGGAAACATAGAACTGCCATTAATGATGGTCTGTTGAATAGGAGAGATTCGGATTCTTTGTCCATTCTGAAGAAATCTAAAAATGGTGGAAGGTTGAATTTGTGTTTGGACTTGAACTTGATGCCATTGGAGGATGATGATCTTAAGCTCAATCTAAGAACACCCGTTCTCAATTGTTTCATTTGATTGGAAATTTTGTACTTATCCAGATTCTTTTTTTCCTTACACAGTTCTTGTGTGTTTTTTCGTAATTTATTATATGCATATGAACCTACTTGTAGTTCATTTTGTAGTCGTATCGTGTTTATATGAAATTTATTAGTATCAATTATGC