Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24831 LG6 12181542 12184906 PREDICTED: receptor-like protein kinase HERK 1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 12181653 3_prime_UTR_variant
A/T 12181692 3_prime_UTR_variant
A/T 12181698 3_prime_UTR_variant
T/C 12181707 3_prime_UTR_variant
G/C 12182007 synonymous_variant p.Leu772Leu
A/T 12182058 synonymous_variant p.Gly755Gly
T/A 12182522 missense_variant p.Ile601Phe
A/C 12182533 missense_variant p.Leu597Arg
T/G 12182592 synonymous_variant p.Gly577Gly
A/G 12182913 synonymous_variant p.Tyr470Tyr
G/C 12182992 missense_variant p.Ala444Gly
C/T 12183150 synonymous_variant p.Ser391Ser
G/A 12183345 synonymous_variant p.Asp326Asp
C/T 12184041 synonymous_variant p.Ser94Ser
A/T 12184095 synonymous_variant p.Ser76Ser
C/T 12184278 synonymous_variant p.Ser15Ser
T/C 12184338 5_prime_UTR_variant
C/*,T 12184380 5_prime_UTR_variant
C/T,* 12184382 5_prime_UTR_variant
C/T 12184384 5_prime_UTR_variant
C/T 12184386 5_prime_UTR_variant
A/G 12184410 5_prime_UTR_variant
A/C 12184414 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
A/G 12184564 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
C/T 12184762 5_prime_UTR_variant
T/G 12184770 5_prime_UTR_variant
T/G 12184774 5_prime_UTR_variant
T/C 12184885 5_prime_UTR_variant
G/T 12184893 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24831.1
MIDRRNLGFFLCALSIFPLVCFSATFVPVDNYLIDCGASANTTVGRRNFTADNLFKDLLSTQEDILANSSSKSSTSSSDDWPLYQTARIFNGPSKYTFPIRQKGRHWIRLYFFPFTHEKYNLGAANFTVATQDHVLFSSSSMQKDPVMKEYSVNVTSDNLVITFAPSGNSTAFVNAIEVVSAPDDLIVDVYSGLDPSVTLSGLVTQSLETVWRVNMGGPTVTPVNDTLQRTWIPDQRFLLEPNLAKSFSNIAAVKYEKGGSTTENTAPATVYGTLSEMNSSSDPRSNFNVTWKFDVSPGFQYLVRFHFCDVVTNGLNSLYFNIYIDSKMAAADFDLSTHTNNALGVPYHMDLVTPLAVNNTLRVSIGPSGLNKDYPNAILNGLEIMKMNNSMGSLITGTVPAAIGIGSSSKSIGMIVGVVVGVVGAVVLAGLIFVLCMRRRKLARQRQSKTWVPLSINDGTTSHTMGSKYSNGTTLSVASNHEYRVPLVAVQEATNNFDESWVIGIGGFGKVYKGELSDGTKVAVKRGNPRSQQGLAEFQTEIVMLSQFRHRHLVSLIGYCDERNEMILIYEYMEKGTLKSHLYGSDLPSLSWKERLEICIGSARGLHYLHTGYAKAVIHRDVKSANILLDEKLMAKVADFGLSKTGPEIDQTHVSTAVKGSFGYLDPEYFRRQQLTEKSDVYSFGVVLFEVLCARPVIDPTLPREMVNLAEWAMKWQKKGQLEQIIDERLAGKIRPESLRKFGETAEKCLADYGVDRPSMGDVLWNLEYALQLQEAVVQGDPEENSTNMIGELSPQVNNISQDASASITQFEGTSLDDLSGVSMSRVFSQLVKSEGR*


CDS Sequence:
>Vu_24831.1
ATGATTGATCGGAGAAATCTTGGTTTTTTTCTCTGTGCTTTATCGATCTTCCCTCTTGTATGTTTTTCTGCCACCTTTGTTCCAGTTGATAATTATCTTATAGACTGTGGAGCATCTGCAAATACTACAGTAGGTAGGCGCAATTTCACAGCAGATAATTTGTTCAAGGATCTCCTTTCTACACAAGAAGATATTCTTGCCAATTCCTCCTCAAAATCAAGCACTTCTTCCTCTGATGATTGGCCTCTCTATCAAACTGCAAGAATCTTCAATGGACCCTCGAAGTACACCTTTCCAATTAGGCAAAAGGGGAGACACTGGATCCGTCTATATTTCTTTCCTTTTACTCACGAAAAGTACAATTTGGGTGCTGCAAATTTCACTGTCGCCACGCAAGACCATGTTCTTTTCAGTAGCTCCAGCATGCAGAAAGATCCTGTGATGAAGGAGTACTCTGTGAATGTAACCTCAGACAACCTCGTTATCACCTTTGCCCCTTCTGGCAATTCCACTGCCTTTGTGAATGCCATTGAAGTTGTTTCTGCTCCCGATGACCTAATTGTTGATGTTTATTCCGGCTTAGATCCGTCGGTAACCTTATCTGGGTTGGTGACGCAATCACTGGAGACAGTTTGGAGGGTTAACATGGGTGGTCCAACTGTGACCCCCGTGAATGACACCCTTCAAAGAACTTGGATTCCAGATCAAAGGTTCCTTTTGGAACCTAACCTTGCCAAATCTTTTAGTAATATCGCTGCTGTCAAGTATGAGAAAGGTGGTTCAACAACAGAAAACACCGCTCCCGCTACTGTTTATGGTACCCTCTCAGAGATGAACTCGTCCTCTGATCCCCGAAGTAATTTCAATGTGACATGGAAGTTTGATGTGAGTCCTGGATTTCAGTACCTTGTTCGATTTCACTTCTGTGATGTGGTCACCAACGGTCTCAATTCACTCTACTTCAATATTTATATTGACTCCAAGATGGCTGCTGCTGATTTTGATCTCAGTACTCATACTAATAATGCTTTGGGGGTTCCATATCATATGGATTTGGTTACACCGTTGGCTGTGAACAATACACTTCGTGTAAGTATTGGTCCTTCTGGTTTAAATAAGGATTACCCGAATGCAATTTTGAATGGGCTGGAGATCATGAAAATGAACAATTCGATGGGCAGTCTCATCACAGGAACAGTACCTGCAGCTATTGGTATAGGTTCAAGTTCTAAGAGTATTGGCATGATTGTGGGTGTGGTTGTTGGTGTAGTTGGTGCAGTTGTCTTGGCTGGACTTATCTTTGTATTGTGCATGAGGAGACGAAAGTTGGCTCGGCAAAGGCAGTCAAAGACATGGGTTCCTTTATCCATCAATGATGGAACTACTTCTCATACCATGGGAAGTAAATATTCTAATGGCACGACACTAAGTGTTGCTTCAAACCATGAGTACCGAGTGCCTCTTGTTGCAGTTCAGGAGGCTACAAACAACTTTGATGAGAGTTGGGTTATTGGGATAGGTGGCTTTGGTAAAGTGTACAAAGGAGAGTTAAGTGATGGCACAAAAGTGGCAGTTAAGAGGGGAAATCCACGGTCCCAGCAGGGGCTTGCAGAGTTCCAAACTGAAATTGTAATGCTGTCTCAGTTCCGCCATCGCCATCTGGTGTCTTTGATTGGTTATTGTGATGAAAGGAATGAAATGATCTTGATATATGAGTATATGGAGAAAGGAACTCTCAAGAGTCATTTATATGGCTCAGATCTGCCTAGCTTAAGCTGGAAGGAGAGGCTTGAGATATGCATTGGATCAGCCAGAGGACTTCATTATCTTCACACTGGCTATGCTAAAGCTGTTATTCACCGTGATGTGAAGTCTGCAAATATCCTACTTGATGAGAAACTAATGGCTAAAGTCGCTGATTTTGGACTGTCAAAGACGGGGCCTGAAATTGACCAGACACATGTGAGCACAGCTGTGAAAGGTAGTTTTGGGTACCTGGATCCAGAGTATTTCAGGAGGCAACAACTGACAGAAAAGTCAGATGTGTATTCATTTGGGGTAGTTCTGTTTGAAGTTCTTTGTGCAAGACCTGTCATAGATCCAACACTTCCCAGGGAAATGGTAAACTTGGCAGAATGGGCAATGAAATGGCAGAAGAAGGGGCAGTTGGAGCAGATCATAGATGAAAGACTTGCAGGAAAAATCAGACCAGAATCTCTCAGGAAGTTTGGAGAAACTGCTGAGAAATGCTTGGCTGATTATGGTGTTGACAGACCTTCCATGGGAGATGTCTTGTGGAATTTGGAGTATGCTCTCCAACTTCAAGAGGCTGTGGTTCAAGGTGATCCTGAAGAAAACAGCACCAATATGATTGGTGAACTCTCTCCACAGGTCAACAATATCAGCCAGGATGCAAGTGCTTCTATTACACAATTTGAAGGCACAAGTCTTGATGATCTCTCTGGTGTTTCTATGAGTAGGGTCTTCTCACAATTGGTGAAGTCTGAGGGTAGATAG


Promoter Sequence:
>Vu_24831::LG6:12184906-12186906(-)
ATATATATATATATATATATATATATATATAATGTCGATTTTAATTATATAAAAAGATATATTAAATAAATTTAGATTATTATCAAAATTAAAGATGATAATGGGTTGACACGATTTTAATTATCTTATCTGTCTTAATTTTTAAGAGCGGGTTTAATTTAGCATATAAGTATAATTATGAGAATTACTTTATTCTTTAAGTTAGATATATACGTGTATTAATATTTTATAGATAATTTAAAAATATATTTTATAATAACCAGTTGTATTTTTACTTTTGGTAAGTAAATAACACTGATCAATTTTACCATCTTAATTAAAATATATTAATTTTTATTTAATGTAAATTACCGGGCGGTGATAAATATTCTTTAAATCTTGACATTAATTTTTGTCTTTATATGTTTTGAATATGAAATTGACCTAATGTACTTTATATAATAAAAAAATAGCAAAAAAAATATTCGAGAAAAGTACAGTGTCACTCATTTTGATTGCCATGTGTCAAACAGAGAGGCGTACTGTCTGAGGTCCACACAGAAAACAAAAACCTAAATCAATGCTACATTCACTTCCCCCACGCGTTCTCATTTTGCTGGCTAACACTTTTTTTTAATGTTATTTATTTTTAAGTCATTATGCTTTCAATCATCAAACTTTATATTAAACCTGTATTTATCTACCTTTTCTAAGTATATTTTTTATTATTTTATGACTATTATTTCAATAACTCTTATTAATAAAAAAAATTCAATCTAGACTCGCCTTAAATTTCTAAAGACATAATAACTTAGTCCATCCACCGAAACATACATCAAATTCATCACTTACACTTTACCAGACAAAAGTTGACCTACTCACATACGTGATGGGAACTATCATTTACCTGTTAAAAAGAATTAAAGTTTTATATAATTTTAAAACCACCATTTACATAGTATAAATAATTATATTAATATTAAAAAATAAATTTTAAAAAATAATTTGTAAAGTAAAATTTACGTTTAAAATAGATTCTAATTATAATTCTGATACTAAATTAAAAAATAAATTTTAAATATAATTTAATTTTACAAAATTAATTTATAAGATGAGATTTATATTATTTATTTAACATTTTTATTAATTAAATTCTTAAATCACACACCACAATTATTGTCCATCTATATCTCTTGGAAGCATTTTCAAATCGGTGGGAGAAATTTCGTATAATGTTTGAGGACGGCCTCTCCAAAACAATAAAATCATCTTTTAAGAAAATAAACCAAGAATTTTTCATTTTAATTGGGAGCAAGTCAACAAAAGATTCAATTTTTTAAATTATTAGTGAGAAAATTTTCAAGTAATAAAAGACTAAATTTGGTATCATGGAATGGTAGTAATCAATTATCAAACTTGACATTGGTAATTTGTTCACGTGCTAGAAGAATTTCGTATTCCTCCGTATACGCAAGAATCTCCGGAGAGAGTATACACAATACATTCTCTTATTACTTTTAAGGTATGTTGTTCAGTAGAATGAAAAATTTTAGAATTATATTTTTCTTGTGTTCATAATTTACATGAACAATAATTTTTTAATAAGAAAAAAATTAATCTTTTAAAAATGATTAGTTAATTACGACCAAGTTTTGAAGTCTTGGTAGTTAGTGGAGTTTGAGAAGCTTCAGTTTCACGCGATAAGATTACGCTGGATTCAACTTTTCTCCACTTTTGCATGTTGGCACTTCTACTATCATGTTTCACACTGCAACAACGACTTTCCCTTCTATTATTTGCTTCATCCATTTCCATTTTCACATCTACACATCAATTTACTTTAATGCAAAAAAAATAAAAAAGTTTCTTTAATAAAATAAGATATTAAAGTTCAAACTACGTTACCAAAAGAACCAAAATTGTCAAATCAAACGACTGAGATTTTTTTATTGTTAATTTTATAATTAAAATATTAGTATTCTTTTTTTCCTTTTTATTGCTCTGGAACATCTTACCTAAAC


Gene Sequence:
>Vu_24831(-)
ACACACTACCTGGCCTATCTCAGTTTTGTTTATTGCAAAACACATGCTTTCACCGAAAAATCTCTCGCAACAAACCCTTGTGTTCTGACCCTGCTTCCACCGATTTTTCCTTCACCAGCTCTCTGTTTCTTTATTTATTTATTTGATTTCGGAATATTAAAAAAGTGTATGAATGAATGTGTCAATAGTTAAGGTTGTCATCTGGATAATTCCAGCTTGTGCTGAGCTAGATTCTTGCTGAAATGGATTTATTCTTCTCGTGTCAGTAGCTGTACTGAACTTTCTCTCAAAACAACAAAAAGGGTCACTTCAGAATTCAGATTTCCCTTTTGCTCCTCTACCTTGATTCAAGTTGCTTCTGCATAATAACAAAGGTGCCATCTTTTTCTGTCTTTGTTATCCGTCTTTTTCTGTTGTTTGACTTGAATGATTTTCTGGTTGATGAGTGCAAGGTTTATCAGTTCTTTTCCTGCTTGTGCCATAAACTTCAATTAGCTTCACACTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATTAATATCCCCAGTGGTCTCTATTCATTTGTTGAGGCCACAATGATTGATCGGAGAAATCTTGGTTTTTTTCTCTGTGCTTTATCGATCTTCCCTCTTGTATGTTTTTCTGCCACCTTTGTTCCAGTTGATAATTATCTTATAGACTGTGGAGCATCTGCAAATACTACAGTAGGTAGGCGCAATTTCACAGCAGATAATTTGTTCAAGGATCTCCTTTCTACACAAGAAGATATTCTTGCCAATTCCTCCTCAAAATCAAGCACTTCTTCCTCTGATGATTGGCCTCTCTATCAAACTGCAAGAATCTTCAATGGACCCTCGAAGTACACCTTTCCAATTAGGCAAAAGGGGAGACACTGGATCCGTCTATATTTCTTTCCTTTTACTCACGAAAAGTACAATTTGGGTGCTGCAAATTTCACTGTCGCCACGCAAGACCATGTTCTTTTCAGTAGCTCCAGCATGCAGAAAGATCCTGTGATGAAGGAGTACTCTGTGAATGTAACCTCAGACAACCTCGTTATCACCTTTGCCCCTTCTGGCAATTCCACTGCCTTTGTGAATGCCATTGAAGTTGTTTCTGCTCCCGATGACCTAATTGTTGATGTTTATTCCGGCTTAGATCCGTCGGTAACCTTATCTGGGTTGGTGACGCAATCACTGGAGACAGTTTGGAGGGTTAACATGGGTGGTCCAACTGTGACCCCCGTGAATGACACCCTTCAAAGAACTTGGATTCCAGATCAAAGGTTCCTTTTGGAACCTAACCTTGCCAAATCTTTTAGTAATATCGCTGCTGTCAAGTATGAGAAAGGTGGTTCAACAACAGAAAACACCGCTCCCGCTACTGTTTATGGTACCCTCTCAGAGATGAACTCGTCCTCTGATCCCCGAAGTAATTTCAATGTGACATGGAAGTTTGATGTGAGTCCTGGATTTCAGTACCTTGTTCGATTTCACTTCTGTGATGTGGTCACCAACGGTCTCAATTCACTCTACTTCAATATTTATATTGACTCCAAGATGGCTGCTGCTGATTTTGATCTCAGTACTCATACTAATAATGCTTTGGGGGTTCCATATCATATGGATTTGGTTACACCGTTGGCTGTGAACAATACACTTCGTGTAAGTATTGGTCCTTCTGGTTTAAATAAGGATTACCCGAATGCAATTTTGAATGGGCTGGAGATCATGAAAATGAACAATTCGATGGGCAGTCTCATCACAGGAACAGTACCTGCAGCTATTGGTATAGGTTCAAGTTCTAAGAGTATTGGCATGATTGTGGGTGTGGTTGTTGGTGTAGTTGGTGCAGTTGTCTTGGCTGGACTTATCTTTGTATTGTGCATGAGGAGACGAAAGTTGGCTCGGCAAAGGCAGTCAAAGACATGGGTTCCTTTATCCATCAATGATGGAACTACTTCTCATACCATGGGAAGTAAATATTCTAATGGCACGACACTAAGTGTTGCTTCAAACCATGAGTACCGAGTGCCTCTTGTTGCAGTTCAGGAGGCTACAAACAACTTTGATGAGAGTTGGGTTATTGGGATAGGTGGCTTTGGTAAAGTGTACAAAGGAGAGTTAAGTGATGGCACAAAAGTGGCAGTTAAGAGGGGAAATCCACGGTCCCAGCAGGGGCTTGCAGAGTTCCAAACTGAAATTGTAATGCTGTCTCAGTTCCGCCATCGCCATCTGGTGTCTTTGATTGGTTATTGTGATGAAAGGAATGAAATGATCTTGATATATGAGTATATGGAGAAAGGAACTCTCAAGAGTCATTTATATGGCTCAGATCTGCCTAGCTTAAGCTGGAAGGAGAGGCTTGAGATATGCATTGGATCAGCCAGAGGACTTCATTATCTTCACACTGGCTATGCTAAAGCTGTTATTCACCGTGATGTGAAGTCTGCAAATATCCTACTTGATGAGAAACTAATGGCTAAAGTCGCTGATTTTGGACTGTCAAAGACGGGGCCTGAAATTGACCAGACACATGTGAGCACAGCTGTGAAAGGTAGTTTTGGGTACCTGGATCCAGAGTATTTCAGGAGGCAACAACTGACAGAAAAGTCAGATGTGTATTCATTTGGGGTAGTTCTGTTTGAAGTTCTTTGTGCAAGACCTGTCATAGATCCAACACTTCCCAGGGAAATGGTAAACTTGGCAGAATGGGCAATGAAATGGCAGAAGAAGGGGCAGTTGGAGCAGATCATAGATGAAAGACTTGCAGGAAAAATCAGACCAGAATCTCTCAGGAAGTTTGGAGAAACTGCTGAGAAATGCTTGGCTGATTATGGTGTTGACAGACCTTCCATGGGAGATGTCTTGTGGAATTTGGAGTATGCTCTCCAACTTCAAGAGGCTGTGGTTCAAGGTGATCCTGAAGAAAACAGCACCAATATGATTGGTGAACTCTCTCCACAGGTCAACAATATCAGCCAGGATGCAAGTGCTTCTATTACACAATTTGAAGGCACAAGTCTTGATGATCTCTCTGGTGTTTCTATGAGTAGGGTCTTCTCACAATTGGTGAAGTCTGAGGGTAGATAGATGGCTCTGGATTTATCCAATCTTATAAATTATGTCACAGTGCTCTTATGTTATGATTTTTATTGTTTTTCTTCTGATCACTAGTTCTCTTCCTGCACATGGAAGACTAGGCATTTCATAGATTTGTAAAGAAATATTGAGTTGAAACATGTATGGTGAAAATCTTGTGTAAGTTATGCAGAAACACCTGAACCAAAAAGTGTGGCAAAGTTTGTATAATTCCTTGTTTGTTTAATCTCTTTAAAAAAGGGTTCTTAGTTTTCT