Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24822 LG6 12091376 12094191 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 12091487 upstream_gene_variant
A/C 12091555 upstream_gene_variant
T/G 12091619 upstream_gene_variant
T/A 12091654 upstream_gene_variant
G/C 12091693 upstream_gene_variant
G/A 12091735 upstream_gene_variant
T/A 12091837 upstream_gene_variant
T/A 12091852 upstream_gene_variant
T/C 12091857 upstream_gene_variant
G/A 12091887 upstream_gene_variant
C/T 12092018 upstream_gene_variant
A/C 12092081 synonymous_variant p.Ser41Ser
T/C 12092123 synonymous_variant p.Phe55Phe
A/G 12092786 upstream_gene_variant
G/A 12092798 upstream_gene_variant
T/C 12092908 missense_variant p.Trp192Arg
A/G 12092926 missense_variant p.Arg198Gly
G/A 12093294 upstream_gene_variant
T/G 12093307 upstream_gene_variant
G/A 12093589 downstream_gene_variant
A/T 12093594 downstream_gene_variant
A/G 12093597 downstream_gene_variant
C/G 12093598 downstream_gene_variant
A/T 12093622 downstream_gene_variant
C/G 12093631 downstream_gene_variant
C/T 12093655 downstream_gene_variant
T/A 12093712 downstream_gene_variant
G/A 12094025 missense_variant p.Arg401Lys
A/C 12094026 missense_variant p.Arg401Ser
T/C 12094030 missense_variant p.Cys403Arg
G/A 12094154 missense_variant p.Arg444Lys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24822.1
MGCFSCTGKPSKKSNNVNRTQKHIAAVVKINLKVNGKSEDNHHRKPDQLSVDVKNLNLQEVSDEVNVRSYRAQTFTFDELAAATRKFRSDCFLGEGGFGKVYKGCIEKLNQVVAVKQLDPYGHQGIREFVVEVLTLSLADHPNLVKLIGFCAEGEQRLLVYEYMPLGSLEKRLQDLPRSRKALDWNTRIKIAAGAARGLEYLHDKMKPPVIYRDLKCSNILLGEDYHPKLSDFGLAKVGPSGDKTHVSTRVMGTYGYCAPDYAMTGQLTFKSDIYSFGVVLLEIITGRKAIDHMKPPKEQNLVAWAKPLFKDRKRFCEMVDPLLEGRYPVRGLYQVLAIAAMCVQEQPSMRPVIADVVTALNYLESQKYDPQVHLIQSSRNGYYSSRARSQNRRAAGYGSEPRPCKVGHKLLVSDGNSSSGSESESYIKGLSSPRTRSEGHQHFYRNNDSGTDSSAD*


CDS Sequence:
>Vu_24822.1
ATGGGTTGCTTTAGTTGCACAGGCAAACCAAGCAAAAAATCCAACAACGTTAATCGCACCCAGAAGCACATTGCTGCTGTTGTCAAAATTAATTTGAAAGTGAATGGTAAAAGTGAAGATAATCATCATCGAAAGCCTGATCAGCTATCTGTGGACGTGAAGAATTTGAATTTACAAGAGGTTTCTGATGAGGTAAACGTTAGAAGTTACCGAGCACAGACATTTACTTTTGACGAGCTTGCAGCTGCAACAAGGAAATTTAGGTCAGATTGCTTTCTGGGCGAAGGAGGGTTTGGCAAGGTTTATAAGGGGTGCATAGAGAAATTAAATCAGGTTGTGGCAGTAAAGCAACTAGACCCTTATGGGCATCAAGGAATTAGGGAATTTGTTGTTGAAGTATTGACATTGAGTTTGGCAGATCACCCTAATTTGGTAAAGTTAATTGGGTTTTGTGCTGAGGGAGAGCAGAGGCTATTGGTTTATGAGTACATGCCATTGGGATCTTTGGAGAAGCGTTTGCAGGATCTTCCACGTAGCAGAAAAGCACTTGATTGGAACACGAGAATAAAAATTGCAGCTGGTGCAGCTAGAGGGTTAGAGTATTTGCATGATAAAATGAAGCCTCCTGTCATCTACCGTGATTTGAAGTGCTCCAATATTTTATTAGGTGAGGATTATCATCCCAAGTTATCAGATTTTGGGTTGGCAAAAGTAGGACCAAGTGGTGATAAGACCCACGTTTCAACAAGAGTTATGGGAACATATGGGTATTGTGCACCAGATTATGCAATGACGGGTCAATTGACGTTCAAGTCTGACATTTATAGCTTTGGAGTTGTTCTTTTGGAGATCATCACAGGCAGAAAGGCCATTGACCACATGAAACCTCCTAAAGAACAAAATCTTGTTGCATGGGCAAAACCTTTGTTCAAAGACAGAAAAAGATTCTGTGAGATGGTTGACCCATTGCTTGAAGGTCGGTATCCAGTAAGAGGTTTGTACCAAGTTCTTGCTATTGCTGCCATGTGTGTTCAAGAACAACCTAGTATGCGGCCTGTCATAGCTGATGTGGTTACAGCTCTAAATTACCTTGAATCCCAGAAATACGATCCCCAAGTTCATCTAATTCAAAGCTCTAGAAATGGTTACTATTCCTCAAGAGCAAGAAGCCAAAATCGTAGAGCAGCTGGCTATGGCTCTGAGCCAAGACCGTGCAAAGTTGGTCATAAACTACTTGTCAGTGATGGCAATAGTAGTAGTGGTTCGGAGTCAGAAAGCTATATAAAAGGTCTATCTTCTCCAAGAACACGAAGTGAAGGACATCAACATTTTTATAGAAATAATGATTCCGGGACAGACAGTTCTGCAGATTAG


Promoter Sequence:
>Vu_24822::LG6:12089376-12091376(+)
AACAACTTCACAATTACATGAGACTTTATCTACTCTTACAAAAACATGATAATGACATATAGTTAGAACTAGTAATCAGTAAAGAGTTTTATTGAACATTCAAGCCTCGTATACAAGTTAGAATAACTCACATACACGTAAAAACTTACATACAAAAGAAAAAAGTAGAAACTAACAGTCTTTTATTAAAAACTGATTGAATAAAGTTGAAAATCTCACCTTAAATATTATTCAGACAATTTTTAATATTCAAATAGATATACAAGATGTTAAAATCTTTAGAAAAAAAAATTAAAAACTCTAGAGAACAAAAGTTTAAAAAGATGACATGATTTTATATAATGAAATTTTTATAAAAATTCTATTTATACTTAAAATTTTTAATATTAAAATAACCTTATCTTATTTTAAAACACATTATCACATTTAAAACAATTTTTTAAGACTATTACAATAATTAAAAGTTATATGTTTATTTCTTATTTCATTATAAAAATTGAAGTTTAAATAAATATTTCCTCTCTTTATATTTTTTTTCTTTTTGGAATAATTAAAGTTTAGTTTTGTTAAGTAATTTTATTTCTGCTAGTGCTTTAAAAATATTTCTCTTTCTTTTCATGTATAAGTGTTTAAAAGAGGTGCTATCAGTTATAGGTTTGAGTTTTGGAAACACATTCGGATTGTTAAGAGCGATTCTCAATGATTCATTGGATAAAACGGGTTTGAATTCAATGCTTTTACATGTTGGTAATATATCCTTGTGATAGTGATAAACATGAAACTAATATTTAATAAGAATATATTTTTTTAAAATATTAATTGATTTACATTCATATATACTGTGTCAATACGCTTACGATATTATTTGCAGTTTTTATTCATATGCAAGGCATATATTCTCCAATCTCCGACTCAATACATTAGCAACGGTGGAGTTAAATCGTTTAGTGGAAAAGAAAAGGAGAAAGGAGATAGTTTTTGTGTTGTAACAATCGAAAACACATCCAAAGCACACGTGTTTATTTTTATTTTTATGTCTGTTATTTTTTATAATAAAAAATAGTAAGTTTAATCTTATTGTTATTATTATATTATAAAATTAAATATAAATTTATAATTTTATTGTAAGTAATTTTTATGTATTTTATAGATAAAGTCTTAATTAAAAAATGGTTAAGTTAAAAAAATAGTCAAATTAAAAAACAGTTAAATATAAATAAATGATCATTTAAAATATAATATTAATAAAATAATTATTTTAATTTTAAAAGAAATTATTTAAATAATAAAATTAAAAACAAATAAGAATTCTTTATACATAGATATACATAATAATAATAATAATAATAATAGTAGTATTGTTATTATTATTATTATGAGATCACATTTTTCCAATAAAAAATGTTACATCTGTTAGAAAGATAGGTTTTACATTTAATAATAATTATATTTAAAAATCATAATAAATATAAGGAGAATGTCTATAAATAATTTATTTGATAGTTAAAAGTAGATTGAGATGAAAATAGTTAGAAATTGGGAAGTTGTAAGGGCCAGACACACATGTTGAATGTTGACCAAGACAATAAATGTTCATACTAAATATGTCAACAGTTAACACCGATGAGCAGAGAAGGTGTCATGTTTTTATAGTGAACCAAACTGAAGTACCAAACAGGCCTTTGAGATTACAATCTTTTGCAAACCTTTTAAGGGACGAAAATACCCTTTATTTTTTCTCATGGCTTCTTTTAATCCGTAACACTTTCTCATTTTTCTTCTACAACCCGTGTAGTGTTCACATAGTTCTACCCAGAATATATATATAAATATATATTTAAGCACCCAGAAAATGGCCACAACACAAAGTTAAGATCCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTTTTTCATACACACTTCGTGATACTCCTTTTTCATGTTTAGGGACTCCGTTCTTGGCTTTGTCTGGTTCAAGCCTTGAACGGAGGGAAAACGGAAAAAAAAACA


Gene Sequence:
>Vu_24822(+)
ATGGGTTGCTTTAGTTGCACAGGCAAACCAAGCAAAAAATCCAACAACGTTAATCGCACCCAGAAGCACATTGCTGCTGGTAAACTTTACAAACGGATTGCAACACGTTAATCTTTTCATGCATTAAGGAACAGGTTCATCTGTTATTTGTCGTCGCATTTTAATTTTTCGTTAATCAAAAAACAAATAAAATTTGGACTTGGGTTTGTCGTGAATTAATCCGGGGTCTGTCTTTTGTATATTTGTGTTTTTTTTTTCATTCTAGAATAAAAAAATTCTTGTTTGGTTTCGACGTATGGAAGAAAGAATTTGAAACTGGTTTCTGTTTGATTTGTTTGATATTGAAATTTGCTTTGTTGGTTTCTTGAAATTTCAGAGTGAGATTTAGATGTGGATGATATAAATATAAACTCTCTAATTGTTCGTCGTTCCATGAACCATAAACGTGGTTTTTTTTTTTTTAAATTTTGTGTTTGTTGATTGAATGGTGCGATCATAATCCAATCATTTGGTTTTACCTTTCCTTTTTGAATTTTAACAGCGATAGGTTTTTATCATCTGTGGTATCCTTAGATGAATCTATGCATAATTTTGTTTGATCTCTGACCTTCACGTGATGTTGATTTTGTATATGCACGTGTGCGCTCAATTTTTTCGTAGTTGTCAAAATTAATTTGAAAGTGAATGGTAAAAGTGAAGATAATCATCATCGAAAGCCTGATCAGCTATCTGTGGACGTGAAGAATTTGAATTTACAAGAGGTTTCTGATGAGGTAAACGTTAGAAGTTACCGAGCACAGACATTTACTTTTGACGAGCTTGCAGCTGCAACAAGGAAATTTAGGTCAGATTGCTTTCTGGGCGAAGGAGGGTTTGGCAAGGTTTATAAGGGGTGCATAGAGAAATTAAATCAGGTACGCAACCAAAATTGTCTTACAATGTTTATGCAACTTTTGTATGACATCACTCTACTTTCATAGTATTTGATAGATACTCATTTTTTTATGTTTTAAAATATATTTAAAACTTTTTAAATATATTTAAAACTTTTTAAATATATTTTGAGAGTACAGAATAGAACAATAAAAAAAACCAGCAAATCATTTGGACTGAGTTTTATATGGTAATAAAGGTTTGGTGATATTGAGGTTTGTTTTTGTCTGCATAGGTTGTGGCAGTAAAGCAACTAGACCCTTATGGGCATCAAGGAATTAGGGAATTTGTTGTTGAAGTATTGACATTGAGTTTGGCAGATCACCCTAATTTGGTAAAGTTAATTGGGTTTTGTGCTGAGGGAGAGCAGAGGCTATTGGTTTATGAGTACATGCCATTGGGATCTTTGGAGAAGCGTTTGCAGGGTATATAGATATATATTTTTCTATCCTATTATCTTAATTTTCTTCAGCTAGAACAAAATGTGTGGGGAAGATTTTCTCTGACCTTGGTTTATAACTTGTTATTTTGTTGATTTTGTCAGATCTTCCACGTAGCAGAAAAGCACTTGATTGGAACACGAGAATAAAAATTGCAGCTGGTGCAGCTAGAGGGTTAGAGTATTTGCATGATAAAATGAAGCCTCCTGTCATCTACCGTGATTTGAAGTGCTCCAATATTTTATTAGGTGAGGATTATCATCCCAAGTTATCAGATTTTGGGTTGGCAAAAGTAGGACCAAGTGGTGATAAGACCCACGTTTCAACAAGAGTTATGGGAACATATGGGTATTGTGCACCAGATTATGCAATGACGGGTCAATTGACGTTCAAGTCTGACATTTATAGCTTTGGAGTTGTTCTTTTGGAGATCATCACAGGCAGAAAGGCCATTGACCACATGAAACCTCCTAAAGAACAAAATCTTGTTGCATGGGTATGTCAATATGGTCTTTCATCCCACTTTCTTCAGAATGTTGCTACACGTCTACTTATAATTCATTTAATAAACTTTGATACTAGTTAAGATTTTCACCATAAGAAAGTTGGAAGCTTTGATTTGCCCATCTCTTGCAAGAAGGTGCTTACTAAATACAGATTAAGATAGGTTAAAGTTGCTTCCTTAAGATGATTGAATATGTTGTTGGAATATTTTTTTCTGGGATAAATAGGAGAGATTGATACCTTTGAGTTATGAGTTGTCTTAACCGTCTCCTCCCAAGGGAGTTAGGTTTTATGGCACATGTTTCTTATATACTATTCAATTTTTCATTTTTATCAGATGTAGGACTTTCAACTCATGTTCTTAACATAAGAAAATGTCAATATTGATGTTGGTGAAGAGAACTTTTTGTTTTTAAGGTTGTTAATGCATTGTCTTCCAAAATCACTAGCTTATAATGCTTTGTATATGTTTTATTACAGGCAAAACCTTTGTTCAAAGACAGAAAAAGATTCTGTGAGATGGTTGACCCATTGCTTGAAGGTCGGTATCCAGTAAGAGGTTTGTACCAAGTTCTTGCTATTGCTGCCATGTGTGTTCAAGAACAACCTAGTATGCGGCCTGTCATAGCTGATGTGGTTACAGCTCTAAATTACCTTGAATCCCAGAAATACGATCCCCAAGTTCATCTAATTCAAAGCTCTAGAAATGGTTACTATTCCTCAAGAGCAAGAAGCCAAAATCGTAGAGCAGCTGGCTATGGCTCTGAGCCAAGACCGTGCAAAGTTGGTCATAAACTACTTGTCAGTGATGGCAATAGTAGTAGTGGTTCGGAGTCAGAAAGCTATATAAAAGGTCTATCTTCTCCAAGAACACGAAGTGAAGGACATCAACATTTTTATAGAAATAATGATTCCGGGACAGACAGTTCTGCAGATTAG