Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24815 LG6 12013255 12017506 PREDICTED: ethylene-responsive transcription factor RAP2-7-like isoform X2
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 12013399 3_prime_UTR_variant
C/A 12013401 3_prime_UTR_variant
A/G 12013424 3_prime_UTR_variant
T/C 12013478 3_prime_UTR_variant
A/C 12013504 3_prime_UTR_variant
T/A 12013544 3_prime_UTR_variant
A/G 12013835 synonymous_variant p.Val406Val
A/G 12013949 intron_variant
T/A 12014141 intron_variant
G/A 12014567 missense_variant p.Pro355Ser
C/T 12014681 intron_variant
A/T 12014741 intron_variant
A/G 12014989 intron_variant
C/A 12015050 stop_gained p.Glu297*
C/T 12015998 intron_variant
C/T 12016364 intron_variant
T/A 12016476 missense_variant p.Arg146Trp
C/G 12016606 synonymous_variant p.Val102Val
A/T 12016907 stop_gained p.Leu2*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24815.2
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>Vu_24815.1
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CDS Sequence:
>Vu_24815.2
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>Vu_24815.1
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Promoter Sequence:
>Vu_24815::LG6:12017506-12019506(-)
GAAAAAACAACAGAAATGAAAGGAGAAATAAAAAGCAAAATATCTATTTCATTATTAAACTTATTTTAATAGAAAATATTGATTTGATATGACTTTTTGATATATTATGGTTTAGACGAGGGTCAACTTGTACTTACTCGCAAAACGAAGATTTTTTTAGGGTTAGAATTTCTTTCGTAGAAACAAGACGAGAAAGTGCAACATAGCGGCTTGAAATTCATAAAACAGATTAAGAGTTCTAAAGCTTCTACTATGTTATGTTAAGGAAGTGTAGTTCAATTATTCAACAAACCTCTACAAAATTCTCCATACCCATTTACGAACTTTTTTTTTTCATTTTAAGAAGAATATTATTAATAACTTGATTTCTCTAACCCTATAAAAATTTTAAAAAATTTATAAAGTTACTGTAACAATAATGATAACTCTATCACACCAATGAATATAAACACTAACTTCATATATAATGAACTCAAATTTTACATAACCATGATGTCAAATATAAAATTATGTAACTTTTACTCGTTTTTTCTTTTCAACACAGGTTAAGCATACAAAATAATTACATTATAAAGATGTAATATTAACTCCATTGATATTGAAATGTTTTTTAAACGGCAATTTATTTCTAATCTTTTTCGCACTCCAAATAGTTTATATAAACTTTTAAAAGATAACTCATGAGTCCATCTTCACTTAAACGTTCATAATTGAAAAGGATGATCATATTTATCTAAATCTTGACCACAACAATGTAAAATCATCTCTCTTTTAGAATTTCAAATTAAAAAAAAATCTAGAATTAAAAACACATTTTGTTACCGAGAAAATTAAGTGAAAGAAAGTTTTTTAAACCTAATTTTTTTAATATAATAATAAAAAATCTAAATTTTATTCGTAGGCTTTATTTTTCTATTCAATTAAATTCTATTATTAAAATATTTCTATATTTTTACAACTATAAATTAAAGTCATTTATTAGTATTTTTTCAATATTCATATGTAAACGTTTACTTTTATTTAGTATACACATCCAATTTGACTTTTCTATCATATGTTTTTCTTGTACTTCTTCAAGGATTTATTATCGTAATATTTTGTATGCATGTATATCAGGTGATATTATTTTATTCATCCAACATGGAAGGATTAGCTTTCCAAGAAGATTTTCTTTTTCTCTAATCTGCAAGATTTGAAAATTACAAATAGCGCAAAAGGAGTCGAAGATATGCCATTTTAATTAATCTCTATATAGTTAATATAAGGAAGAAAAATACTGTAACGTCGTACATTCTTTAGTATATTTTTACAAGAAAATAATTGCACATTCTTTAATCTGTATGCCTTTTAAGTATATATACTATTAACTAATAATATATTGAGATTATTACTAAATTAATAAATTTAGCATGCATATTAATTTAGAATTAAATAAAAATATAAAATGTTATATGGTCGAACATAAATTATTTTCTTACATATACTACATTTGTTAAAAAGATTATATCACACACTTAAAAAAAGCAAGATAAAACAGAACCTTTATATATATAAAAAAAATCATTACTACCTTACACAATAACATACAATACTATTGCATAATTCAGAATAAGTAAGATGTAGTGAAAGTTTAATTTATTTTATGGCAATCTGGAATTAATACTGTTATGAAGTGAGTTTGTTTACAATAGTATTTAGTTATTAGTGCGTGAGAGAGATGAGAAAAATTTGTTGTAGGGTAAAAATTTGGGCATGTGATACTTTGTACCAAAAACGCCCTTATTACCTCTTTCTGATACGTATAACAAGAAACCCAGCCGTTAGTGGTGGATGGCTGTTTCCGTCGATGAGACCACAACTGGACTGTGTCACAGAGTAATGAAAATAAAAATAAAAAAATAAAAAACTCCTTCGCTTGACCGGTGACCGTACCAACCGGTTCGAAGTTGGAACCATGAGAGAGAAAATGTTTATATATTCCATCATCTCATAAAATGGGT


Gene Sequence:
>Vu_24815(-)
CAGAGCTTTTATATTAAGTGTCCCGGATCCTGTTACCTCTCTCACTCTCTCTCCGGTGCCATGGAATCCCGTAGCCCCCAAAGTTTTATTCTCTCCGGTTCTCAAATCATCGCAAGGGAACTATAAATGTAACTACCAAACCTCGCAGTGCTTCCTTCTCACGCCTTCTGTGAGTTTTTCTCTCTTCCTCCTCCTTCGCTCTTCCGGTCGCCGGATAATTTCTCCGTCGAACTCACAGTGGCCGGATATCCTACTAATTCTCTTTTCCCTCTCTTTGCTTCTGTTCCACTGCAGATTCCTTGTTCGTCGAAGAAGCTCTTTATACACCAAAATATAACCTCAGATATCGCGTCTTCAACCGTTTAGGTTACATTTTACGTGTAATAATTGGTTGTTTCCTTTTATTGGATCGATTTTCCTTCTTGTAACCATCGGTTGAAGAGAAAAAGAGATTCTCCGCTGACGCTGAAGAAATATTTGTTTGCTATGTTGTAGTTCGAATTAATAATAATAATAAAGCGCGTAAGTGATACAAATAATAAAATAGAAAGAAAATCAGAGTTGAAAAATACTTAGTAGAAGAAGATTTAGCGCCATGTTGGATCTTAATCTGAATGCCGACTCGACTCAGAGCCAAGACTCGGTGATGCTGTTGGACAAGTTTCCCGAAGCTTCTTCGGGAACTTCGAATTCCTCCGTGGTGAATGCGGAAGGGTCGAGTAACGAGGACTCGTGTTCGACACGCGCCGGCGAAGTGTTCACCTTCAATTTCGGAATCCTTAAGGTCGAAGGTGCCGACGACGTCGTCGTCTCAGCGACGAAGGAGCTGTTTCCGGCGAGCGCGGAGAATAGGCAAGGACAGAGTTCGACGTCGTCGTTTCAGGCTAGGAAGAGTTTGGTGGATCTCTCGCTGGATCGCCAAAACGGCGAGGTGAAGGTGGTTCAGGTTCAGCAACAACCACAGGTGAAGAAGAGTAGGAGAGGTCCACGGTCTCGGAGCTCTCAGTACAGAGGAGTCACCTTCTACAGAAGGACCGGAAGATGGGAATCGCATATCTGGTTCGTGCAGTTCTCATTGTTCATTTTAGCATCTCTTGATTATTGATTATTATATATTATATTCCCTTTTTATTAGGGTTTGAGTTGAAGTAACTCTGATTATTTGCTTTGAAATTTTAATGTAGTTAATCATGGTGGAATTTGAAAGTACAACAGAATTGACCTAAATTAGTTTCTTGTTTGATGTAGGGATTGCGGGAAACAAGTCTATTTGGGTATGGATTTGTATTTTTGATTAATTGTATTTTCCATTTATATATTTATATAATTGAGTTTTTTCCATTTACATATATTATTTTTGATTAATATACGTATAGATATATATTTGAGTTTGTTATTCGATGCTTCCTTGCTATTTTTAGCGTCTTGTGATTAGATTGTTATTCATTGTAGGCGGATTTGACACCGCTCATGCCGCAGCCAGGTAAACTTTTTGCCCATATTTTAATGTCCTTTGTCGTAGTTTTGTTTATTAATGAAATCTGTCCTTCGTTTGATTGGTGTCTTCCTTAATTGACTCGGAATTTTCAAATTTAGGGCCTATGATCGAGCTGCAATTAAGTTCAGGGGACTTGATGCGGATATCAATTTTAATCTTGTTGATTATGAGGAGGATTTAAAACAGGTTGGAAAAAGCATAAGCTTTCTGTGAATTTGAATCTAAGTGGAGCTTGCGATTGGTTTTTCACTAGTTATTAATGATGAACAGATGAAAAATCTTTCCAAGGAGGAGTTCGTGCACATACTCCGCCGTCACAGTACCGGTTTCTCAAGGGGGAGTTCAAAATACCGGGGAGTGACACTTCACAAATGTGGCCGGTGGGAAGCTCGAATGGGACAATTCCTTGGAAAAAAGTGAGTATCTATTTTTTTTTTGTACTGATGTAGCAGTATGCCTACGTTTATGGAATTTATACGTTGTACGAGCAAAAGCTATTAGTACGATTTTAAGTTCCTATTGCAATCAGCTGTACCTGTTGGTATAACTGAAGTACGAATTCGAAGGGAATTGTTTCCAGCTTGGTAGTCAATCGGTCTTTACTCTATAGGCTTTTTTCCACGTTTGGAGAAACTTCTCTAGGATGCCTGTTTCACAGAAACGATTGGCAGAGGTGTTTTTGTTGTTTTAGAGATTGCAATGCTTTCGTGCAGGTATATATATCTTGGGCTTTTCGACAGCGAAGTAGAAGCTGCAAGGTCCTAATGATACATGAATTACATTTTTCCTGCACTGAACCCTTTCCCTGAATTTTCAAAGCTAATTACGGTTCGAACCAACATGTCTCCCTTTTGATTTTCTGGAAAGCAGGGCTTATGACAAGGCAGCAATCAAGTGCAATGGAAGAGAGGCAGTGACTAACTTTGAGCCAAGTACATATGACAGCGAAATGAAACCTGAAGCTATCAATGAAGGTAGTACTTCATAGCAAGATACTCTTCTGTTATATTTATTTCCAATTGATTGTCAGAGTTAAAATTAGATGGTAAATGTTAAAATTCAACACAGGTGGCAATCACGATCTTGATCTCAATCTGGGCATAGCAACTCCAGGACATGGTCCCAAAGAAAACATAGGTCATCTTCAGTTCCAGCAAGTCCCATGCAGCACGCAACCCGGAAGAATTTCAAGGGTATAATTGAACTTTTCGTCTTTGTTTACTTTAAGCTCGGGGGCAAATGTCTATATCACATTATAACCTTTATTTGCTTTAGCTAGCTCCGTAGCACTCTTCATAGGTCATGAATGGTGGGAAACATGGTTTCCGGTATTGTTTGGTAATTGCTTCACATTTATATGTTAGTAATTAATTAATGGTCATGATAGGGTGATTCTCTTTATTTACAGATGGAGACTAATTTTAGTTCAGTTATTGGTGATCCTTCTTTGAAAAGGCATGTTGTAACTGAAGAGCGTCCTTCTGTATGGAACGCCGCACATTACACTTTCTTTCCCAATCTGGTGAGTTCAATTGCCTGTGCAACCGATTGCTTGTTTCGTTGTTAAATGCTTCCATATAAACATTTACGATAGTGTCTGTCTACCTTAGGTCAAACAGAAACGTTTAACTTTTCATTTTGACATAACATTCGAAGTTGAGTTTTATGTCCGTTGAATCCTCCTTAGCGTTTACATACGATCTTTATCAACTTTTGGTGCAATCTAACTTTTCAAGGAATTTGTCTCTATTTGATAAATAGCTGTCACTTATTCCTTTTTGACAAGAAGAGTTGTTCCCAAATACGTTGAAAAACTGTACTTAAAGTGGTGAGTCCATAAATTGGTTATTGTAATTCATAAATATATATTTGTAATGAGCTGTATTTGGAAACGGCTAAAAATTTAATGACAAACCATCTCGGCATGGGAATAATATTTCCGTCGACATTCCTTTCGGCGTTCCTTTTCAAATTTGTATCCTACATGGAGGAGATACTCCATGCATTAATACGACTTGATACCAGCATTACTGTGTGGTTTGTGGCACAGGAAGATAACTATATGCGTATGTTTGAAAGATTGTTGAAATATTTTACAGGAAATAGCAGAGAGAATCGGCATAGATCCTTCAAAAGGAGTCCCCAACTGGGCGTGGCAAACACATGGCCAGGTTACTGCCAACCCAGTACCACCGTTCTCTTCTGCAGCATCATCAGGATTCTCAATTTCAGCTACCTTTCCACCGCATGCCATCTTTCCAACAAAATCAGTGAACTCAATTCCGCAGAACCTCTGTTTCACTTCAGCCAGTGCACCAGGTAGCAATACACCGCAATTATATTACGAGGTCAAGTCCACTCAGGCACCATCCCATCCTATCTAGTAATGCAAGTAAAAATGGTAAATTGCAACAGACCTTTGCGCTTATAACTCGTTGTATAATTCTGTTACTGCTTGATGAATACTTAGATACTGATTGCTCCTCTTGGTTAAGAACCATTATTCCCAATCGTGTATGAAGAAAAGAAAAAAACGATTTTCGAGAGCACCAATTCTATACTAGAATTCTCTTATCTTCAAAACTAGTAAGAGGCTATCAAAACTAGGGTATTCGCCCGCCAATTTTGTGAGTGTGGGCTCTTTGTGTGCAACCCTGGCTTTGGGAGGAAACCAATCTGTGTTGTATTTTTCATTGCACATTTCACAACTTTATTTGACTACCCCAGCGCTCTTGCATCTCTTCTTTGGGAGTT