Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24791 LG6 11765979 11771716 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase GRIK2-like isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09165 Substance dependence   C 05034 Alcoholism [PATH:ko05034]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 11766072 3_prime_UTR_variant
T/A 11766259 3_prime_UTR_variant
A/G 11766313 3_prime_UTR_variant
A/T 11766548 intron_variant
G/C 11766571 intron_variant
G/A,* 11766666 synonymous_variant p.Pro349Pro
T/C 11766807 splice_region_variant&synonymous_variant p.Lys335Lys
A/G 11766969 intron_variant
G/A 11767024 missense_variant p.Ala291Val
C/T 11767155 intron_variant
G/A 11767157 intron_variant
G/T 11767191 intron_variant
T/C 11767298 intron_variant
G/C 11767334 intron_variant
A/C 11767485 downstream_gene_variant
T/C 11767557 downstream_gene_variant
T/C 11767610 downstream_gene_variant
T/G 11767646 downstream_gene_variant
C/T 11767795 downstream_gene_variant
A/G 11767876 downstream_gene_variant
A/T 11767881 downstream_gene_variant
G/T 11768182 downstream_gene_variant
A/C 11768446 downstream_gene_variant
A/G 11768722 downstream_gene_variant
C/A 11769491 downstream_gene_variant
T/C 11769611 downstream_gene_variant
G/T 11769696 missense_variant p.Leu133Ile
G/T 11770225 downstream_gene_variant
A/G 11770252 downstream_gene_variant
T/C 11770256 downstream_gene_variant
C/T 11770287 downstream_gene_variant
A/C 11770804 splice_region_variant&intron_variant
T/A 11771127 5_prime_UTR_variant
G/T 11771306 5_prime_UTR_variant
A/T 11771328 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/A 11771383 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
A/T 11771395 5_prime_UTR_variant
A/G 11771462 5_prime_UTR_variant
G/T 11771470 5_prime_UTR_variant
G/T 11771636 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24791.1
MGDYKRFSFSKMIGCCGCFGFVKKPRRRRAKRSINNFLSHGLLYDGETEGDESFSGDVTSNATSGDDNEAHAVRNRSEDILNFRAENGMVCRPHPVKETFELVRSEDEHGNKMINEYIREYKIGSGSYAKVALYRSCFDGNHYAIKSFHKSHLQKLRVAPFETAMTDVLREVLIMKMVEHPNIVNLIEVIDDPESDDFYMVLEYVEGKWVCEGTGRPCALGEETARKYLRDIVSGLTYLHAHNIVHGDIKPDNLLITRHGKVKIVDFSVSQAFEDGNDELRRSPGTPVFTAPECCLGLTYHGKASDTWAVGVTLYCMILGEYPFLGDTLQDTYDKIVNDPLVLPDDINPQLKNLIEGLLCKDPEKRMTLGDVAEHVWVIGNDGPLPGYLCWCKRKSLLAADCDESNIPLLDPH*

>Vu_24791.2
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CDS Sequence:
>Vu_24791.1
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>Vu_24791.2
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Promoter Sequence:
>Vu_24791::LG6:11771716-11773716(-)
CCTAAGAACCAACCTTTGACTTGGTACAAGGTAATATGATTTTCATTTCCTTGTTTTACTGGTTATGAATAAGGAAATTTAAAATTATTACAACTCCCATATCTTCATATAGTTTTACCAGCAATGTCTTCAGCTGTTATCTTCAACTTGCATTAGCATACAATCATTAAACTGAAGGGAATGGTATATTGGGAAAAACACTTCTGCTACTAACTAATGTAGTTCATGTTGGATTAGACAACCTTTGCTGCTCCATCCGGCACAAGTCCAGTAGCAATTGACTTCACGGGAATGAGGAAAGGTGAGGCTTGGGTGAATGGGCAGAGCATTGGCCGCTACTGGCCTACATTTGTAGCTTCAGATGCTGGTTGCACAGACTCTTGCAATTATAGAGGACCTTACAGTGCATCCAAATGCCGCAGGAATTGTGGAAAACCATCACAGACATTGTAAGTGATGGATATCATAAATGAGTGAAGTTGAAAAACGAAAATAATCTTTGGTTGATAATATCACTGAGGCACTCACTAATCCTGCAGGTATCATGTACCACGATCGTGGTTGAAACCAAGTGGCAACATCCTTGTTTTGTTTGAGGAAAAGGGAGGTGATCCAACACAAATATCTTTTGTCACAAAACAGATAGAAAGTTTGTGTGCACATGTATCTGATTCTCATCCACCACCGGTAGAATTGTGGAACTCATACACAGAATCAGGAAGAGAAGTAGGTCCTGTACTATCACTCACATGCCCTCAGCATAATCAGGTCATCTCTTCCATTAAATTTGCAAGCTACGGAACCCCACTTGGAACTTGTGGGAACTTTTACCACGGACGCTGCAGCAGCAACAAGGCTTTGTCTATAGTGCAGAAGGTGTTATTTAGCTTCCTCTTTCTCTTGTTACATTGATATGTTTTCGCTTTGGTTTAGACTGACTCATGAAATGATTTAAAACAGGCCTGCATTGGATCAAGCAGTTGTAGTGTTGGAGTGTCAATTGATACATTTGGAGATCCTTGTAGAGGAGTTGCAAAGAGTTTAGCTGTTGAAGCTACCTGTGCATAGACAGAGACATGTTGCTACAAGAACACTCCTCAATTGTCTCAAGATGATTCCTGCTAATAAGTCACAGTAGATTTGCAATCTAGGAACATCCATGAAAAATTGTCAACTATAACTGTCTAGTCTCAAGTCAAATGCAATAAAAGAAAAAAGTCTTAGCCGATGCAAGATACGCCACAAATGGCATTTTTATTTATGAAAAAGATGACTGATTTCCCAACTTGCAAGACAAGTTGTTCTCATGATTGGTGTGAGGAAAGTGAACAGTAAAATGTTGAAACTAAGGAATACAGACTTTTCTTCATGAGACAAGTTGGATTGACGTAATCGTATGGTAAAATTTACTGAAATGTAAAAGGATGTGTTGAGCATTTGAAATTAACAAGTTTCATCGGTAGAAATCAACTTCATGCGTTGCAGTTTCATCAAGAAATTAACAAGTCTTGGATGCATACATATGCATTACACACATGTGACGATTTGTTCCTGAAGAATGTCTTATTTGTCGTGACTGATATCAGTATTACAAGTTAGTATAGCAAACTGTGAAAACATAAGAAAGAAGAAAACCCTTCTTCGAATATAAGATGTGATTTATATTTTTAAAGTATTAAATAATATGTGTAACAAAATGTTACATTAGTTGGTAAAAAGAAATAAAAAAAATCTCATATTTGAGTCTAAAGAAAACTATACTCCCCAAATAGCTGACTTCAAGATTAAAATTTCGACCTCTAAAAAGTGATTTTGATATAAATGGCTATAAGTTATTATTAAAATTTAATAGCTGAAGAAATTGGATTTTGATTATAATTGTGATGAAGTATTAAAATTGATTTAAAGTAGAAAAATGCGTTTATGGCGTGGCTAATAATAATGAGAAATGGCGTGCAAGAAACAGTTATAAATTGTATTTATAGTCTGAAAAAATGAGT


Gene Sequence:
>Vu_24791(-)
GATGCCCAATGTGGCCAACCTGTTACCGTTGTTGGATTCCTCCTAAAAATTGAACAAAATTTTTAATTGCTATACTGCCCCTCTTTTTAGCTTCGCACTTTCACAATATCCTGTATTTATTCATTTTTTTCTTCACTCTCTTCCTGCCCGACCGATCGATTTCCTCCGCCTAGGGTTTTTCCCATTCCGATTTTCCATTCCAACTTTTCTCCTCCCCATCCACAACTCCAATTGCAATAGGGTTTTCCTTTCCTTCGGTTTCCTTCTGTGGTAATTGCAACTCTCTCGATTCAATTTTGGATTTAGGGTTCCGAGTCTTACTCTAAAGGCCGTCGATTCGTGCTGGAATTCTAGACTTTCGGAACCGCAGGGATAGGGTTCTTCCATTTTGTCATTTTCCCCTGGAGGAACAGAGGGAGGGGTAAATTATTGAACTTTTATTTATAATTATAATTATAATAATAATAATAATGGACTCAGCCGTTGACGTTTCTCTTTGATGGCGTCCAGAGCTTCTGTTCTCTTCTCATTTCTACTTTCCTTTATTTTATTAATCTTTAGTTTTTATTTTTTATCATTTTAAAAAAAAATTCCTGTTCCTGTTTGTGTAAAAGGTCAACGAATTGTTGGTGGTGAGTTGTGGGCTGAGCCTACAACCGTTACTATAAACTGGAGTTATCGCAATGTTGGGTGTGAATCGCTGCGGCTTTAATTTCTGTAGCCGTTTTCTCCACCTAGCGGAATGGCATCCCTTAGAATAGTAATGTTAAACGGGGCTTGAGGCCCTTCTCTTCCTCTCATATCAGGTAATCATCTTCTCTTTAAGGGATAAGTACAATCCATGTTTTTGTGATTGTGCTTAATCCTTGCAACTGTGTTGAGGTAACCTACTCATTTGATGAGATTCCTATTTTGAAAGCAATTTGCAGGGTCAGCAGAGACAATTTAGTAATTAGGATATTGACTTTGGCCGTTTGAGGTGAGTTACTGCTGTGATGGGAGATTATAAGAGATTTTCATTTTCCAAAATGATTGGCTGCTGTGGTTGCTTCGGATTTGTGAAAAAACCTAGACGGCGTCGGGCTAAGCGTAGCATCAACAATTTCCTCTCCCATGGCCTATTATATGATGGAGAAACTGAAGGTGATGAGTCGTTTAGTGGTGATGTTACTAGTAACGCCACCAGTGGAGATGATAATGAGGCGCATGCTGTACGGAATCGTTCCGAGGATATTTTGAACTTTAGAGCTGAGAATGGCATGGTTTGTAGGCCACATCCTGTCAAGGAGACTTTTGAACTTGTTCGCTCAGAGGTATATGTGGAGATAGCTTTTTAGTTTTTTCTCAGTTTATAGTCAAACGTAAAACGTCGAGACTAGGTTGACTAGTTTTGATATGCGAGTGATATTGGAATCATTATTAGTGAACAGTGAAGTCATGTGTGTTTTGATCACTTTATGATATTCAAACCTTTGCCTGAATATTTGTGAACTTTATTTAATATAGTTAGAAAAGAATTGCTTTTAATTTTTAATGACCCGTACATGATAAAGGGAAGTTGGGTTTCACACTATTTTACCATTTTTGGTCATATGACATTTTATTAAGACTAAACATTGAAATGGTTGGTATAAATTTTTTTCTGTCTAGTTGTTGATTTGTTCTACTTTCCTGCATTTGCAAGTTGTAACCATAAATTTAGAGAGATTACTTTACATCTTACATGGCAATCTTGGTCTCGAATTTTTCGTCCATCCTTACCTGACAGTTGTTAACTGTATTCAGGCAAAACGTCTGCACTGTGATGAATATCTTGATTTTTTTTTATCACGGTCTTTATTTAAATGTTTTAATTCCTTCAGGATGAACATGGGAACAAGATGATAAATGAATACATCCGAGAGTACAAAATTGGTTCTGGAAGCTATGCCAAAGTGGTAAGCTTAGTTTTTGAGAAGTTATGCTTCGTCCTCATTGGATCCATTGTCCTGAGTCCCTTCCCTTATACAAATTGCAGGCTCTTTATCGAAGTTGCTTTGACGGAAATCACTATGCAATTAAGGTATGAACACTTTTTGGAGTGAATATGCAGATTATTTTATTATAGCAGGTTTTTAACAGGACAGTAGTCACTGCTCCTGATAGTCGGGAAGTGTGACACTGGTAGATTGTTGAGCCAGCTAAATTGCATTCTATATTACTTTAAGAGACTGAAAAGAACATAAGAACTCAAATCAAAAGCTCTCTTCTTCATGACAACATGCATGTGTGAAATGTCATTATCGTGACAAAGGGCAAAGATAGTCATTTATTGAGGTTAACTTGTTTGAACTGCAGTCCTTTCACAAGTCTCATTTACAAAAGCTTCGCGTTGCACCCTTTGAGACGGCCATGACTGATGTTCTAAGGGAGGTATGTATTTAGTATCTTTCTATGAACAATTAGGGAGTTCTCATTTCATGGTCGGATCATTGGCCTTTTCTTTTTAACAACTTCAATCATAATTTGTGGTAGAAATAGTCCACGTGTGAATTTTCATTGAACCTGATAACACGTTGGTTGTTACCTGGCCGCTATTGGCTAGCCACCAACTGCTTCATATGGCTCTTTAACTTCACTAACAGTATATGGAAACTACTAAATTTTCTGCTCCTATAGCTTTTCTGTTCTTATGGAATGTATTGTCGTCTGTGATTTTTTTATACCATAGCATGCATATAGGTCAGTTTTGGAAAATGGAAGCTTTTTTTTTCCTGGTGCTTTTTTATGTTCCATTTTCTTAGAATTTTAGCTTAGGGCATGACACAACCCCAAAAGCTAGCTCATAGGGTAAGGGTTGTTCCCCATTTATATATTCTATCTAGGCACTATTCCTAGTTAGTGTGAGACTTGAGCTTTTCCTTATATGTTCTTAAAATTTGTTCTTAACCTAATTCAACCTCAAAAGCTAGTCATGTGCAATTTGGTTCTTCCAATAAATTTTAATATTTTTAATCTTTTGCCAAGAGCTTGCTTTTTATTTTTCTTCCTATGTTGTTTATTTTATGATTTATTATAATGTTTAACTCATTTATTGGGATGTTCTTTACTGTCCCTGCAGTATTTTAATAGGCATACATTATTTTCAGGTACTGATTATGAAAATGGTGGAACATCCTAATATAGTCAATCTCATTGAAGTTATTGATGACCCAGAGTCGGATGACTTCTACATGGGTACCAAATACTAGTGTCTTGGTTTTTTAAAATTTGGATAGATTGTTCCTGTAATTTGTTCTTATGTATTTGAACCTGAACCTCAAGTTTTAATAACAATCACTATTAAGTACTCTGTTTAACTACTGTTTTTTACTTTTACAGTACTTGAATATGTGGAAGGCAAATGGGTCTGTGAGGGTACAGGTCGTCCTTGTGCATTAGGTGAAGAGACCGCTAGGAAATACTTGCGTGATATAGTCTCAGGATTAACATATCTCCATGCTCACGTATTATCTCTCGACCAAATCTTATTGTGGTTAATGATGACTCAGTGCCCCTCTCACACAAACGCACATTTTGACCTTCAATCACATGATTGTAGTTTTTATAGTTATTTTAGTTCATGTCTTTCACATTTCTATGCTTCTTATGTAGAAAAAAAAACATTTATGAGTTGAATTGCAAATAGACACTGCTCAATTTTTTGTTCAGGCGATTTGTACGTACGTTGATGTATGTTATCCTTCTCAGACTTTCAATCAGTTTTGTCTGTCAACTTGAAGCTGCTAATATTTATTTATGTTTGCCTATATTTGGCTGAAACATATTTTTCCATATTAATAGAAATACATATATTTGATATGTGTGCTTAAAAACTGGAACCAGCATATCATTTATTGGACATGCACAGACTCATTGATGTAACATGCTTCAAAATAGTTTGACTATGTTACTATGATGATTCAATATTTGTTTCAATGCAGAATATAGTGCATGGGGATATAAAACCTGATAATCTGTTGATTACTCGTCATGGCAAAGTAAAGATAGTGGATTTCAGTGTCAGCCAGGCTTTTGAGGTGATCTAATTAATATACTCAAAAGTTCTTGAAAAGATGTGAAAGCTGATTATTTACTCCAGGCTTCTCATATTATTTTACTTGTGTATTGGAAATTTGATACTTGAAAGGACGTTATTTTTTGAGGGAGTTTGAAATTTGAATGGTTAAAGGAAAGCTGGTGAATGTATCTTTTAAGGCGTCCTTGAAAGCTGGAAGTCATTAATATGTGAATTACATAATTTTAGAGGCAGAAGCCTTATTTTTGTTGGTTTTTTTACTTCATTGTGCTGATAGCACACGTCTCTGCAACAAATCCATAGGATTCTGACTCCATTCTTGAAACTATCATGGAAATAGGTCCATAGTTTTTATTATGACACTTAGTTTTCTTTCTTGGGGGTAACTATAAGAATCTAGCTGGTATGAGAATGGGGGCAGAACCTAGGAAGTTGAAAATGATCAATCAGGGAGAAATTTTCTTACTACTAATTAATGTGTTCGACATCTCCTAGCACATTCCTGTGATATATTGGCGACATCATATGTGTAGATATAATATCAACTAATAAGGAATCAATACCTTACCTTGATTTCATTTTGCAGGATGGCAATGATGAACTTCGTCGATCACCTGGCACCCCTGTTTTCACTGCACCAGAATGTTGTTTAGGTTAGAGGTTTGCTTTCAAGCTTGCAAGGCCCTTCTTTGTGGACTATATCATCTCACTGCAGTTTTGTTTTTGATATTATTTAGGTCTTACTTATCATGGTAAAGCTTCTGACACGTGGGCCGTAGGAGTTACTTTGTACTGTATGATATTGGGTGAATACCCATTTCTTGGAGATACACTTCAAGATACATATGACAAAGTATATTAACTTAACCTCAGATATTGTTACGTAGAATTCATGTTACGGGTTTTTATCCTATCACAGAAATCTAAGCTTGCTGCTTTCTTCCTTGTCCAGATAGTCAATGATCCTTTAGTTCTGCCAGATGACATTAATCCCCAGTTAAAGAACTTAATAGAAGGATTACTGTGCAAAGGTACGCGGCATTCAAGTTTTCACAGGCGTAACTGTATATATTTCCTGTGATTTTGCTCACGTAATTTTATCATCATCCTATTTTTTATTTTTTGGGGGCATCATTTTATATTGTTCCCACCTTACCTGTGTCATGCAGACCCAGAAAAAAGGATGACATTGGGCGATGTTGCCGAGCATGTCTGGGTTATTGGAAATGATGGGCCGCTTCCTGGGTACTTATGTTGGTGCAAACGCAAGAGCCTGTTGGCTGCTGATTGTGATGAGAGCAATATACCCTTGCTTGATCCACATTGATTTTAAGTTGGGTTTCTTATGTACAGTGTGAGAAGGCCCATTAATTTATCTCCTACTTGGACCCCACGGAAGGAGGGATGATATGATTAAAGGGAGTCTGCAAAGAATCCTTGGAATTTAAGCAAATACAGCTCATTTTGTCGACGATAAGTAGCCAACTAAATCATGTTTATTTTTGTGTTATGAAAAGAAGCATCTGGTCTCTGCGGACATAGAGGTCTTGTATACGGCTCTTTCGCATAGAACGAGTTTTTTTTTTCCTTTTTGTCTCAAACACGTGCCGAATTGTGTTCAGTTCATATTCTATACATCATATATAATATATAATATTACATTCCTTGGAGTGTTTTGCTT