Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24774 LG6 11568885 11572214 PREDICTED: auxin response factor 18
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 11569000 5_prime_UTR_variant
G/A 11569639 synonymous_variant p.Ser144Ser
G/T 11570024 missense_variant p.Ala273Ser
T/A 11570440 intron_variant
T/C 11570478 intron_variant
C/A 11570613 intron_variant
C/A 11570708 intron_variant
T/C 11570714 intron_variant
C/T 11570816 intron_variant
G/C 11571314 missense_variant p.Arg511Thr
T/C 11571726 intron_variant
A/C 11571738 intron_variant
A/C 11571745 intron_variant
T/C 11571967 missense_variant p.Ile673Thr
A/G 11572037 3_prime_UTR_variant
T/C 11572152 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24774.1
MKETEKSLDPQLWHACAGGMVQMPPVNSKVFYFPQGHAEHAQSNLDFGASRIPIPPLVLCRVAAVKFLADPETDEVFARLRLVPLRNTELDHEDSDKVDGNGPEGSEKPASFAKTLTQSDANNGGGFSVPRYCAETIFPRLDYSAEPPVQTVIAKDVHGEVWKFRHIYRGTPRRHLLTTGWSSFVNQKKLVAGDSIVFLRAENGDLCVGIRRAKRGGVGGPEAPCGWSSGGGGIGPYGAFSAFLREETKVVRNGCGRPKVSGESVREAITLAANNQTFEVVYYPRANTPEFCIRTSAVRGAMRIQWCSGLRFKMPFETEDSSRISWFMGTIASVQVLDPIRWPNSPWRLLQVTWDEPDLLHNVKRVSPWLVELVSNIPVIHLAPFSPPRKKLRFPQHPEFPLDVQFPIPTFSGNPFGPSTSSPMCCLSDNAPAGIQGARHAQIGISLSDLHLNHNKLQLGLLPTNVRQLDLQNGISNVNITNHGKSKESLSCLLTMGSPRKSLEKSDQVKRHQFLLFGQPILTEQQISRSSSDVLSQNGTATDDENKEKKETGFLSDSQSSVSPGKSSSTAEFSWQLGSDTSHCKVFMETEDVGRTLDLSCLGSYEELYMRLATMFGIERSEMLSHVLYRDATGALKQTGEEPFSEFTKTAKRLTILSDSSSKDSRRVWITGIRNAEHGLDATSNKTGPMSIFA*


CDS Sequence:
>Vu_24774.1
ATGAAGGAAACCGAGAAGAGCTTGGATCCGCAGCTGTGGCACGCATGCGCCGGCGGCATGGTTCAGATGCCGCCGGTGAACTCCAAGGTATTCTACTTTCCTCAGGGGCATGCGGAACACGCGCAGTCCAACCTTGATTTTGGAGCCTCCAGGATTCCGATCCCGCCGCTTGTTCTCTGCCGCGTGGCGGCTGTTAAATTCCTCGCCGACCCCGAAACCGACGAGGTCTTCGCCAGGTTAAGGTTGGTTCCTCTCAGAAACACCGAGCTTGACCACGAGGACAGCGATAAGGTTGACGGTAACGGCCCGGAGGGTTCTGAAAAGCCAGCGTCGTTCGCGAAGACGTTAACTCAATCGGACGCGAACAATGGTGGGGGATTCTCCGTGCCGAGATACTGCGCGGAGACCATTTTCCCGCGGCTGGATTACTCGGCGGAGCCGCCGGTGCAGACGGTGATCGCGAAGGACGTGCACGGCGAGGTGTGGAAGTTCCGGCACATTTACCGAGGGACGCCGCGTCGGCACTTACTTACCACCGGCTGGAGCAGTTTCGTGAACCAGAAGAAACTGGTTGCTGGGGATTCTATAGTGTTTCTGCGGGCAGAGAATGGGGATCTCTGCGTTGGGATTCGTAGGGCGAAGAGAGGGGGTGTTGGTGGTCCCGAGGCGCCGTGTGGGTGGAGTTCTGGTGGTGGTGGGATTGGCCCTTACGGGGCCTTTTCAGCTTTTTTGAGGGAGGAGACCAAGGTGGTGAGGAATGGGTGTGGGAGGCCGAAAGTGAGTGGTGAGTCTGTGAGGGAGGCTATTACTTTGGCGGCTAACAACCAAACCTTTGAGGTTGTTTATTATCCTCGAGCCAACACTCCTGAGTTTTGTATTAGGACTTCTGCTGTGAGGGGTGCTATGAGGATTCAGTGGTGCTCTGGGTTGAGGTTTAAGATGCCCTTTGAGACTGAGGACTCTTCCAGGATAAGCTGGTTCATGGGCACCATAGCTTCTGTTCAGGTTCTTGATCCTATCCGCTGGCCCAATTCGCCTTGGAGGCTTCTTCAGGTTACGTGGGATGAACCAGATTTGCTCCATAATGTGAAGCGCGTAAGTCCATGGTTGGTTGAGTTGGTATCTAACATACCAGTGATCCATCTGGCACCGTTCTCTCCACCAAGGAAGAAGCTGAGGTTTCCACAACACCCAGAGTTTCCCCTTGATGTTCAATTTCCGATACCAACGTTTTCAGGCAACCCCTTTGGGCCTAGCACTAGCAGCCCCATGTGTTGTCTATCTGATAATGCTCCTGCAGGCATACAGGGAGCCAGGCATGCTCAAATTGGAATATCTTTATCAGATCTCCACCTTAACCATAATAAGCTGCAGTTGGGGTTGCTTCCAACCAACGTTCGCCAGCTTGATTTGCAAAATGGGATTTCTAATGTCAACATCACCAACCATGGTAAGAGTAAAGAAAGTCTATCGTGCTTGCTGACCATGGGAAGTCCACGCAAGAGTTTGGAGAAATCTGATCAAGTGAAGAGACACCAATTTTTGCTTTTCGGTCAACCGATACTCACCGAGCAACAAATTTCTAGATCTTCTAGTGATGTGTTGTCTCAGAATGGCACCGCAACAGATGATGAGAACAAGGAGAAGAAGGAGACGGGATTCCTCAGTGACTCCCAGTCTTCAGTTTCCCCAGGAAAATCATCTTCCACCGCCGAGTTCTCTTGGCAACTCGGTTCTGATACCAGTCATTGCAAGGTTTTCATGGAAACAGAAGATGTGGGACGGACCCTTGACTTGTCCTGTCTCGGTTCTTACGAGGAACTTTACATGAGACTGGCCACCATGTTTGGAATAGAACGCTCTGAGATGTTGAGTCATGTTCTCTACCGCGATGCAACCGGTGCTCTGAAACAAACTGGAGAAGAACCATTCAGTGAGTTCACGAAGACCGCTAAAAGATTGACAATTCTAAGCGATTCAAGCAGCAAAGATAGTAGAAGGGTTTGGATCACAGGAATTCGGAATGCTGAACATGGATTGGATGCTACTTCGAATAAGACAGGTCCTATGAGCATATTTGCTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_24774::LG6:11566885-11568885(+)
AGATTAATGGATTATTGATGTTACATCGAGTCTGGTATTGGCGACGTTGTCGGTTCACCTAAAGGACTTGTTTGGAGTAAGCCAAGTTGGTCTGATTAATTCCTAAGCTTTTTCCTCAGCAGCATGGAAAGTTATTCCTTTTAACTCTTACAGGATAATCTACCCTATTTTGACTATCACTATATGCATATGCCCTTACAATACTTCCTGAATTATGCTATGTATCGTACATGCTGGTGCTTTCTCTTGTTGTTGTACCTATTGTTTTTGTCGCCATCTGCCTAGTTATAACTCATTTTTCTCTCTTTCAGCCTTTTTCTTTTTCCTTACATTTTTTCCATTCAGTTCAACTTTCATTGATTTGATATCTCATCACCATCCAATATTAATGTTAATGTTGATGTGTATGTACGTGCATTTTCTTGCAGTTCAGATGGGAAAAGGGAAAATGGAGTATGAGTTTTCTGTGAGGTATATACACGTAAGGAAGAATTTAATTTGTAGGGTTATTGCATTTGCATGTAAGTTATAGGTACTTTTATTATCATTAAGATTTGTCTGTTAATTAATTTCTGCATAAAGTCAAAAGGGCATAAAGAAATGGGGTGTCTTGCAGTCGGCAAGAAAAGAACAAGAACAACTTTCCGTGTCCTCCTTCTTTGTCATAATTCATAATCAAACGAGGTTTTCGAGAGCCATATATATCTTGGCATATGAAAGTGGCGTTTTATTAACACAATCACTCATCAGTGGACACAACCTACCCTTCACCATGTGACCATCTCCATCTTCCTTTCTGTGATCGATGTCCTTTTCAATGCAACTTATATTCTCTCCTTATTCACCTTTTCATTAAACATCTCACAGAACCACTTCACCAGTATTTTTGTTTGTTCACTGTTTCTTATTTGTTAATTTCATAAATTCAGAGGTGATTAATAAAAGCATGGAAAAGTTCACAGAAAAGGGTCCAACTCTTAAAAAGCTTGTGCGGTGCATGCTTTTAGTAGAAAAAAAATACTGCACTTCGTGACTGTTACAATTACAACAGACAGGTGAAATATGCAGCAGTTCATGCGCATGAGCAAGAGGCCCACATATCTCACTTTCTAGTTTCTTCCTTCATTAAAATTTTACCTTTTTTTCATTTTATGTGTGCAGTGCAAAGTGTAGATTAGACACAGAGATCAACCAAATATAATTAATAGACACTTTACTTATTTGACATCTAACAAAGAAAGGAAGAAATGTAGTATTACGTGATAAAATAAATAAAAGAAAACAATAAATACTAATTGTTAAGAAAGCTGTTTAGAGATAAAAAGTATTTGTGTTCCATTAACCTGATCCGACAAAAAAATCGCGGGTCTCACTTCCGTGGCAACGATCCTCACTAGCCTAGTAACGCGTGGCATGTACGCGTGAACAGCACTGGCTGAGTCTTTGAGTTCACTTTTTCTGTTTTTGTTACTTGGTAAGGTGGTGATGTTATCTAGTTAGAGGAAGAGGCAGAAAGAGTAAAGAAGAGAGAGGTTAACATAACATTTATTTTGTGTATTATTATCATTAGTATAGAGAGAAAGTAAATGTAAAAATGCGTTATCTTGTCAGGTTAGGACTTATTGCAGAGAGAGACAGAGTCAGAAGTAGTAGGGATGTTGAGTTGAGTTGGCAGTTAACAGTGCCATAATAATAATATAATGAATCAGTGATTACCACTGTCACCTTTCCAGGTAATTTTAACTTCACCACATATCCTTTTCTTTTAACTCTTTAACTCCTCATTCTGACACCATACCCTCACATAATAGAAACAATAATACTAACAGTATTAATGCGATGCTGCTGCTAATTACCTCTCTAACTATCTTTATTGCATCATGTCATGTCACCATAATTTATGGCCTTACTATTAAACAATTCCATTCCTCTTCTTCAAATTAAAAAATACTTTTTTATTTACCATTATAATAATGAAATAAATATGCTTTGGCTGGCTC


Gene Sequence:
>Vu_24774(+)
CAGCAATAGGCATAGGCTTTCTTGCTTCTGTGCAATTGTTTAGTTTATAGGCTCCCCAGAGAGAGAGAGTGTGCGTGGGTAAGAGAAAAAAATTGTCTTTTATTTTGCTTGTTTCCCTGAGATCTGAGCCAACCCAGATAATAATAAGCAGAAGAAAAAAATTCAGTGAGGAAAAGAAAAAGAAAAAGTCTTGTATGTGAGGGAAAAAGTTAGGCCTTTTGATTTTGCATTCACTGACAGAAAAAGAGAGAGAGAAACATAAAACATCAGCAGCACCTATACAGAGAGTGTTTAATTCAATCAGTTTTGGTGTGTGCGGCCCAATGAAGGAAACCGAGAAGAGCTTGGATCCGCAGCTGTGGCACGCATGCGCCGGCGGCATGGTTCAGATGCCGCCGGTGAACTCCAAGGTATTCTACTTTCCTCAGGGGCATGCGGAACACGCGCAGTCCAACCTTGATTTTGGAGCCTCCAGGATTCCGATCCCGCCGCTTGTTCTCTGCCGCGTGGCGGCTGTTAAATTCCTCGCCGACCCCGAAACCGACGAGGTCTTCGCCAGGTTAAGGTTGGTTCCTCTCAGAAACACCGAGCTTGACCACGAGGACAGCGATAAGGTTGACGGTAACGGCCCGGAGGGTTCTGAAAAGCCAGCGTCGTTCGCGAAGACGTTAACTCAATCGGACGCGAACAATGGTGGGGGATTCTCCGTGCCGAGATACTGCGCGGAGACCATTTTCCCGCGGCTGGATTACTCGGCGGAGCCGCCGGTGCAGACGGTGATCGCGAAGGACGTGCACGGCGAGGTGTGGAAGTTCCGGCACATTTACCGAGGGACGCCGCGTCGGCACTTACTTACCACCGGCTGGAGCAGTTTCGTGAACCAGAAGAAACTGGTTGCTGGGGATTCTATAGTGTTTCTGCGGGCAGAGAATGGGGATCTCTGCGTTGGGATTCGTAGGGCGAAGAGAGGGGGTGTTGGTGGTCCCGAGGCGCCGTGTGGGTGGAGTTCTGGTGGTGGTGGGATTGGCCCTTACGGGGCCTTTTCAGCTTTTTTGAGGGAGGAGACCAAGGTGGTGAGGAATGGGTGTGGGAGGCCGAAAGTGAGTGGTGAGTCTGTGAGGGAGGCTATTACTTTGGCGGCTAACAACCAAACCTTTGAGGTTGTTTATTATCCTCGAGCCAACACTCCTGAGTTTTGTATTAGGACTTCTGCTGTGAGGGGTGCTATGAGGATTCAGTGGTGCTCTGGGTTGAGGTTTAAGATGCCCTTTGAGACTGAGGACTCTTCCAGGATAAGCTGGTTCATGGGCACCATAGCTTCTGTTCAGGTTCTTGATCCTATCCGCTGGCCCAATTCGCCTTGGAGGCTTCTTCAGGTACCCCTTTTCTTTTCTTCATCATATTCAGACATACGGGCCTTAACTCTCTACCTTTTGTTCCTTGATTCTTGATTCTGTTAACGTGTGCAAAACAAGATTCGTGTATTAAATTTATCTGTAGCAGGGTTTTCCATTCCTTGAACCTTTTTTCTTTCCTTTTGGAATTGGTTGGGGGTTGTTGTAATAAAATGATTCACCTGCATCTGTCAATTCATGACTTTTATGGTTGGTTTGTTACCTTTTCAATTTGTATGCATATACTTCTATTTTGAAACGCCATGTTTTCGGGATTAAACTTATACGCAGTTCGATAACTGTTTTTCAATCAGAAGTTCAGTTTATTCGGGTACCAAAGCTCTGCGTTAAAGGTTAGAAATAGACTTCTGAGGTAAATTTCTAATTGGGATAATGGAAAAGCACCAGAAATACCTCTAGAACGGTATTCGAGTTTTTTTCTTTTTTCTTTTATTGGGAGATGTTCTTGATTGTATTCAAACAAAAGTTGAGACGAGTTTAATCTTGTGGACAAGCTTACGAGGCAACCGTGACTTACGGTGGTGATATTGATACAGGTTACGTGGGATGAACCAGATTTGCTCCATAATGTGAAGCGCGTAAGTCCATGGTTGGTTGAGTTGGTATCTAACATACCAGTGATCCATCTGGCACCGTTCTCTCCACCAAGGAAGAAGCTGAGGTTTCCACAACACCCAGAGTTTCCCCTTGATGTTCAATTTCCGATACCAACGTTTTCAGGCAACCCCTTTGGGCCTAGCACTAGCAGCCCCATGTGTTGTCTATCTGATAATGCTCCTGCAGGCATACAGGGAGCCAGGCATGCTCAAATTGGAATATCTTTATCAGATCTCCACCTTAACCATAATAAGCTGCAGTTGGGGTTGCTTCCAACCAACGTTCGCCAGCTTGATTTGCAAAATGGGATTTCTAATGTCAACATCACCAACCATGGTAAGAGTAAAGAAAGTCTATCGTGCTTGCTGACCATGGGAAGTCCACGCAAGAGTTTGGAGAAATCTGATCAAGTGAAGAGACACCAATTTTTGCTTTTCGGTCAACCGATACTCACCGAGCAACAAATTTCTAGATCTTCTAGTGATGTGTTGTCTCAGAATGGCACCGCAACAGATGATGAGAACAAGGAGAAGAAGGAGACGGGATTCCTCAGTGACTCCCAGTCTTCAGTTTCCCCAGGAAAATCATCTTCCACCGCCGAGTTCTCTTGGCAACTCGGTTCTGATACCAGTCATTGCAAGGTTTTCATGGAAACAGAAGATGTGGGACGGACCCTTGACTTGTCCTGTCTCGGTTCTTACGAGGAACTTTACATGAGACTGGCCACCATGTTTGGAATAGAACGCTCTGAGATGTTGAGTCATGTTCTCTACCGCGATGCAACCGGTGCTCTGAAACAAACTGGAGAAGAACCATTCAGGTATCATTCTATTTCTTCTTCATGTCTAATTTTTTAAGAGTCTTCATGTTTTATTCAGGGTTTTGGCTTTGTGCAGTGAGTTCACGAAGACCGCTAAAAGATTGACAATTCTAAGCGATTCAAGCAGCAAAGATAGTAGAAGGTGTATAGAATAATATAGCTTTTGAATATGTGCATCTTGAACTGTTGTTGGTTCCTCTTTGTGACTTGAAAGTTTGTTTTTTTACATGCAGGGTTTGGATCACAGGAATTCGGAATGCTGAACATGGATTGGATGCTACTTCGAATAAGACAGGTCCTATGAGCATATTTGCTTAAAAAGGTGTTTTTTCCATCTCAGAAGTTGAAGGATTTGGAATATCAACAAAATACACAAACAATCGATGTTGCCGTCTTTGTTTCCTCCGACTGTAGACAACAATTTTTTTTGTTGTATGATGGACTATTGTTATTCTAATATTAATTAATTAATTAATTAACGTAGATTTTGTTTCCATC