Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24741 LG6 11098869 11100379 PREDICTED: transcription factor RAX2-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 11098981 stop_gained p.Trp38*
A/C 11099442 intron_variant
A/G 11099495 intron_variant
T/A 11099851 missense_variant p.Leu157His

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24741.1
MGRAPCCDKANVKRGPWSPEEDSKLKDYIEKHGTGGNWIALPQKAGLRRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGEFSDEEDRIICSLYANIGSRWSIIAAQLPGRTDNDIKNYWNTKLKRKLMGLVPASHQRIAPYQHSSSQNPPSPFSSQTSIYRDYCNNSPYYIPAPTSSFPCLQQISVPSSNYTNTTSSLPFYQNQEPLVGVSPMQYYPTTDSSMLVFGSETSCSSSDGSCSQVSLCREIKQEEMGFQNLMLADQHMNKLMLSQGNVNHDGGEEYVNQWTEKPNGWVFQTQETALDYDLEVIKQLISSNSSSNNSNNGYFSIDENKTEKGVYYNY*


CDS Sequence:
>Vu_24741.1
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Promoter Sequence:
>Vu_24741::LG6:11096869-11098869(+)
AGATTTGAATATGAAATTTTATTAAATTAATCTGAGACAAATTCTACTGGAATTATTATATTGATTACTGTAGCTCTAAAATCCAAGGGAGGGGGAAAAATTATGAACCCTGATAGTATAAGAAGAAAAAAAAAACTTGTAAAAGAAGAAATGTGCAGAATCCTTGTCATTATGTATTATCTACAGAAACAGATCGAATGTGTACTTAAACAGGTGAATAATCTATTTAATGCTGCTAATACCATATAAAATTATCATAGATGATGAGAACCACATACAGTATGGTTAGCTGGCAGAGAGGCATGCATACGTTAGCAATGACGCAGCTGGGTTCATTAAACAAATCAAAGTATGCAGCTGCATAATTGGTGAGTTTGTTTAATTATTTTCAAAACATAACATGAAAATTAAAAATAATAGTTAGCCTTAAACCCATAATTGATACCATAAAGTAGTGCCTAATTCTATAAAACCATTTAATAGCTTCCACCCTTTGTACACAGAGAGAGTACAACGTATAGGGATGTTTATCTACGACGTACAAGAAAAAGATAGATATACAGAAGAAGTGATAAATAAAAGGAAAAGAAGGAATATATGATCCATTAAATTGAATAGGGCCATTGCATCAGACCTAGGTCTCTTCTGTATTTTTATATGTCGTCAAGCAACAAAAAACTCCCTATACTAGGAATGTTATTCTAGTGTACTCGACAGCACAGATATATGATAATTGTTTTGCCTATATATTTTTCATATGCTGCTCTATGCATTCCACTGATTAATTAGTCAATCTAAACACAACACCTGACCAGATGAATTTAAGGGCAATCCCTGATCCGTAGGACCCTATCAGATATGAAACATAATCATCACACTCACCATTATAGCCACATAATTTTGCATAGTAGATGTGAAACTCTTTTAACATAGTTTTTCTAATACCAGTTAAAAAGAATAAGAAAAAAGTAATCAACGAGAAGTATGAAAATGTGAAAGAAATATAATTTATATAGTATAGTTCATCGTTCATGCTGACTAGTTTCCTCAAAATTAACGTGCATGCAATTCTCTGAAACACCTATGTTTCTGTTTGCTAGGGAAAGAGTGTAAGGAGAGACAACTCTTTATGCATCACAAAGTTGTGTAATTTAGCATCTACTAATGCATATCCAGCTATATTTCATTTTCTGCTTCTTTTGTTGTAAAGTTTAAGGAGGTGGTCGTGTGCAGTTCCAAAAGATACACCTACTGCTACATAATGATTTTCTGACAAGTTAAATAATACTACCATATAATCAAGTCCATCAATATCTTCAATATATATATATTAGGTGCGCCTTTGTCACACATGACTGCCAGTTAGATGTTGATTTAATTAAATCATACTACAGATATATTTTTAATATATTGCGTGCACCTTTTCAATTTTTTCTTTCTGTCTTTTACTCTCGTAATGTTTTACTTTAGCAAGAGTGTCAATGCTTTAATTAACAAAAATGATTAAATATTGAGCCACCGCACTAGACGAAGAAAAACTTGGACAATTAATTCCACATTTTGGTTCCTGCATTTGGATAGAATCACAAATCTGGTAGCTGTAACCATCACCACAATAAACCTGTTGGGTTATGTTTCTTTCTGTATGACAAACTTTGGATACTTTTTTATCTGTGATTACATATTAATTATAGAAGAGATTAAAAGGAAGAAATTATATCAGTTAGAAGGTTAGAAAGTTCGCCTGAGAATGAGTCCACATTAGAATAATGTTCACAGATTAAAATATTTCGTACATAAACGTCCTATCCATGCTTTTTCATTTCAGTTTTGTTTCTTACTGGGAGAATAAAATAGTAATATTTTAACTGTTCAAGAGCTAGGTCTCTTGTTATAAGGCTTAGCAGTCCCCACCAAAGTCTCGTTAGAAAGAGTCAGGATTTGGAATTCGGATCGTGAGAGAGGTTTTGTGAAATTGTTGCAGAGAGAAGGAGAGAAGA


Gene Sequence:
>Vu_24741(+)
ATGGGAAGAGCTCCTTGTTGTGACAAGGCAAATGTGAAGAGAGGACCGTGGTCACCAGAAGAAGACTCAAAGCTGAAGGATTACATAGAGAAACATGGAACTGGAGGGAATTGGATTGCTCTTCCTCAGAAAGCTGGTACGAAACACAGTGTTACATGCTAAACCTAGATATCCTTTCATATGCATGTATTCTTTTTTTCTTTGTATGTCTGCAATACTTAGACTCTGATATATGTTTGTAGGTCTAAGGAGATGTGGAAAAAGTTGCAGATTGAGATGGCTTAACTATCTTAGGCCCAACATTAAGCACGGCGAATTCTCCGACGAGGAAGACAGAATAATCTGCAGCCTTTATGCTAATATTGGAAGCAGGTACTACTTATTGCTACCCATTTTTATGCACTATGCATAGCTAGACCCACTAACTGTACTCAACAAATTCTAAAATTAGTTATTCTCCAGATCTAGGATATTCAGATGGACATTCTTTTTCTTTCCATTTTTACTTCAATCACATAATAAAACACATTCTCCGGTGAAATGTCCTGAACTCTGTCCATATTTATCTAAAAGAGGCAAATAAAAACACAACAAGGGATTTGACAATGTGAGAAAACTATGTACTTATCTAGAATATCTGTCTGTATTTGGGGAGCTGGTCTTCAACTTGGAAGCCAAAGTTTAGATCCAGCCACTGCATGCACTCAAAGATGTTGGGAAAATGAAGACATTGATATATATTTATTTTTTGTCAATTTTTCCATGATGTTTTTAGGTGGTCAATTATAGCTGCTCAGTTACCAGGGAGGACTGACAATGATATCAAGAACTATTGGAACACCAAGCTGAAGAGGAAACTCATGGGGTTGGTTCCTGCATCTCATCAAAGAATAGCACCCTATCAGCACTCCTCCTCCCAAAACCCTCCCTCACCATTTTCTTCTCAGACATCAATCTACAGAGACTACTGCAACAACTCTCCTTATTACATCCCAGCACCAACCTCATCTTTCCCATGCCTTCAACAAATTTCTGTTCCTTCAAGTAACTACACAAACACAACCTCCTCTCTTCCCTTTTATCAGAACCAAGAGCCTTTGGTCGGTGTTAGTCCCATGCAGTATTACCCCACCACAGACAGTTCCATGCTTGTGTTTGGAAGTGAAACAAGCTGCAGTTCCTCTGATGGGAGCTGCAGCCAGGTGAGCCTTTGCAGAGAGATAAAACAAGAAGAAATGGGATTTCAGAATTTGATGCTTGCAGATCAGCACATGAACAAGTTGATGCTGAGTCAAGGCAACGTGAATCACGATGGAGGTGAAGAGTACGTGAACCAATGGACAGAGAAGCCAAATGGGTGGGTCTTCCAAACGCAAGAAACAGCACTGGATTATGATCTTGAGGTTATTAAGCAACTGATTAGTAGTAACAGTAGCAGTAATAATAGTAATAATGGGTATTTTAGTATTGATGAAAACAAGACGGAGAAGGGAGTGTACTACAACTACTGA