Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24729 LG6 10968420 10969971 PREDICTED: zinc finger protein ZAT5-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 10968422 splice_region_variant
T/C 10968760 3_prime_UTR_variant
G/A 10968761 3_prime_UTR_variant
C/A 10968910 3_prime_UTR_variant
G/A 10968917 3_prime_UTR_variant
A/G 10969276 synonymous_variant p.Leu187Leu
A/G 10969282 synonymous_variant p.Val185Val
C/T 10969384 synonymous_variant p.Lys151Lys
T/A 10969606 missense_variant p.Glu77Asp
A/C 10969708 synonymous_variant p.Val43Val
C/G 10969729 synonymous_variant p.Leu36Leu
C/G 10969870 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24729.1
MLSEISDMEGMAMEELVSCNNDPTNIAKGKRTKRRLRPLSPCVVTAVTATAAAMTSSCSSASGGGGGSFSSITLEEEEEDMANCLILLAQGRGGSDPLHHKDLCDDVKTEKGGSKIEFYVYECKTCNRTFPSFQALGGHRASHKKPKVEEKKSPPPSLPPPPSSSSQLFNFEETKPNHMKISPSVSLQLGCGNNRGGLNFHGNKSKIHECSICGSEFTSGQALGGHMRRHRSSNNNNTNNINTVVVQTTTTSDGAVEVKPRNVLQLDLNLPAPEDDLRDSKFQFSGNQNSMMLSAAPALVGCHY*


CDS Sequence:
>Vu_24729.1
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Promoter Sequence:
>Vu_24729::LG6:10969971-10971971(-)
AAATACCAGACTAAAAAATATTTCCTAACCTGTATAATCCATCTAGAAATATATTATGTAACAAATCAATTTGCATAGAAATAAATCTAAAACATCCATTCAAATTTTCAAAAATGGCATGACCTCATATATTATGAATCAATGTTACATTTCTGATATAAAAATATTATAAATTTCAACCAAAGCTTAAAATACCTGATATGGTAATAAAATAAATTAATTGAATGGTATAAAAAGTTGACAGTTGGTAGAATACCCTTTTTTGACAGTAAGTATTTTTTTAATTTTAATTTTATTTTTTATCCATAAAAAACAGATTAGTTATTAATATTTAATTTTTAATAGATAAATAATATTGATCTTAAAATAATCTTGAAAAGCATCTAATGTCAAAATTATGTCACAAACACTTGCCATTTAAAAAAGTTAATTAATATTTAAGTATAGAGTGAATAAAAAAACAATTTAATTTTATAGATAAAAAAACAAATAAATCATGGTTACAAAAATTAAAATTTTTCTCTAAAGGAAAATTGAAGCCTATGTATTATTACTATATATTAATTATAATTATCTACATTAACATATAGCTTATTTTTTATTAAATAAAAGATTAGAGGAAAGGAATATATTTAATAATTAAGTTCTTTTAACACATGTCTGACCTTTTTAAAAAAAAATGCTTACAAGCCCCTTAACCGGTACAAATTGCAGAAAAAACAAAGACAAATAAAATCAAAGAAGCTCGTAGTATTACACAATGTAACATATTTTTTTTTTTGTTAGGCACGAATATTTATTAATAAAGTATTCATATTATATCGTGATTTAACCAGCTTTCGAAGCTCTCATTCTGCATGAAATCACATTAACATTTTTGGTTTTGCCATAAATGATGGTTATTATGATGACAGATTAGCTGCAACATCAACTCCTGAACGTTACTTTAAGCAGAAGATTAAGCTTTTTATAATAAGCTAAAATTTTACATTGAAAAAGAAAAAAGATTAAATGTTTAAATTTAATTTAATTATAAAATAAATTTATCAAATAAAATTTATTTGTGTAAAAAAACAAAATTAAATCTACTTCAATCTCACACCATTCGTATGATGATGTTTGCAACAATATTTATTTATATTATAATTTAATTTAACTTTTAATCTAGAATTAGAGAGCTTTAATGAGAAGATTAAGTATAAATGAGGAATTTAATAAAAGTAGGAACCGTCCTACAGTGGTTATGTGATAGAGTTGTATGTTACATATACCCTCCTTAGTCCATGCATCTTACCCGAATCCTATACTTAATCACATGCTACTTATCTCCTTTTCTTTTCTTCTTCCACTGCTAATTATAGTATACATCAGTGTTTGCTTCAAAGCCACCACCATCTCCATCTAGATTATTACTTTTATGTTTTAACATAAACATTTTACAAAAACAAATAATCATACATTAAATTTATCAAACAATATTTTTAATAAAAGGCATTTAACAAATTGACATGCTCCTTCTCATTAAATTCGAACATTAACTGCAAAATGCAAAGCATGTTTAATCATTGATGAATCATACGCATGCAGAGTCTGTGTGTGAAAACAGTGTGCTGTTCTGGAGCACAAACTGGCGAGAAAATATAATATTCTTTCGTAAAAAGTACTTCCACCATACACAGAAATAAATAAAAGAAAAGAAAACATTAATTGCAGCAGTTAAACAAGGCAAAAAAAAAGTATGGTCATGATTGAAGCGTGCTTCCACACGCTGTTAAAGACGCGTGACCAAACACAAGAACTTTTCTTGTTTCCAACACTTCCAAGGTTAGAAAAGCAAGGAAGATTTTGGGTGGCTGACTATTTGGAGTAGCTACTGTAACATATTATCATAACATAACAAACCCTCTTCTTGCCCATTCACTACCAATATTTATAAATATAAATATATATATAAATATAAATATATATATATATAAAAGCTGTTCACACACTCCTCCTCC


Gene Sequence:
>Vu_24729(-)
ATATAAATTCTACATGTCTCTGTGTCTCTTTCTCTCCACTACTACTGCATCTCTTATTGCAAAGCCAAAAACCTCTGTGCTGTTCATAGAGCTCACTGTTTGATTGTCTTTGTTTAGTACCGTATAGGATATCTAATGTTGTCAGAAATATCAGACATGGAAGGCATGGCCATGGAGGAGCTTGTCTCATGCAACAACGATCCCACCAACATAGCCAAAGGGAAGCGAACAAAGCGACGCCTGAGGCCTTTGTCACCTTGTGTTGTCACCGCCGTTACTGCCACGGCCGCCGCCATGACATCAAGCTGTTCGAGTGCTTCTGGCGGCGGCGGTGGGTCGTTTTCGTCTATCACCTTGGAGGAGGAAGAGGAAGACATGGCAAACTGTTTGATTCTCCTGGCACAGGGAAGAGGAGGAAGCGATCCTCTTCATCACAAGGACTTATGTGATGATGTGAAGACGGAGAAGGGTGGCAGCAAAATTGAATTTTATGTTTACGAGTGCAAAACATGCAACAGAACATTCCCTTCTTTTCAAGCACTCGGTGGCCACAGAGCGAGTCACAAGAAGCCCAAGGTTGAGGAAAAGAAATCCCCACCACCGTCGTTGCCACCGCCACCGTCTTCGTCCTCGCAACTATTTAATTTTGAAGAAACGAAACCGAATCACATGAAGATTAGCCCTTCCGTTTCGCTTCAATTAGGGTGTGGAAACAATAGGGGTGGCTTAAATTTCCATGGGAACAAGTCCAAGATTCACGAGTGTTCCATTTGTGGGTCAGAATTCACATCAGGACAAGCATTGGGTGGCCACATGAGGAGGCACAGGTCATCTAACAACAATAATACTAATAATATCAATACTGTTGTTGTTCAGACGACAACAACTTCTGACGGTGCCGTTGAAGTTAAGCCTCGGAATGTTCTACAATTGGATCTCAACCTGCCGGCGCCGGAGGACGATCTCCGGGACTCGAAGTTTCAGTTTTCGGGGAATCAGAATTCCATGATGCTGTCGGCTGCTCCGGCTTTGGTGGGATGCCATTATTAGAAGCCAGAGTGGGAATTGGACGGAGAGGGGGAGAAAAGTTATATTATTTGATCAATGATCATTGTGAATTATTAGCTCTATTTTAATTTACAATTATTCTTAATTATCGATTCTTTGGATTATTTTTTCCTTTTATTAATAATTTCCCATTTGGATTATCCACTCGTTCAAGTTTTGGAATACTTTGAGTAAGTAAGTGGTTAGTGTTGATGGTTGCCTTTCATTCACGAAAAGTGATATCGAGTCATAGAGCATCTTCATTTTCCCTTTTTTTTTCCCTCTCTCTTTATTAATTTTAATGTATCTTATTATAGTTTGGATGTTTCTTAGTAATGAATCATAAGAATTAGAGTAGAAGATGAATGGATCGGTGGAATGGATTGGCATGGCCAGAGTTTGATTGCACCATATCCACAACCAAAAGTCATGGGATAGGCTTCCTCTGTTTGCCTTTTTATCTATATCATTATCACTTCAATAATACTTAAACAATTTCTCTATC