Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24718 LG6 10841416 10845236 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 10841417 splice_region_variant
C/T 10841501 3_prime_UTR_variant
G/T 10841640 3_prime_UTR_variant
G/A 10841763 3_prime_UTR_variant
T/A 10842027 missense_variant p.Glu449Asp
A/T 10842289 downstream_gene_variant
A/T 10842298 downstream_gene_variant
A/T 10842315 downstream_gene_variant
T/C 10842513 downstream_gene_variant
A/T 10842567 downstream_gene_variant
A/C 10842571 downstream_gene_variant
T/G 10842576 downstream_gene_variant
A/G 10842613 downstream_gene_variant
T/C 10842987 downstream_gene_variant
C/T 10843047 downstream_gene_variant
G/A 10843213 downstream_gene_variant
G/T 10843294 downstream_gene_variant
G/A 10843333 downstream_gene_variant
A/G 10843473 synonymous_variant p.Phe371Phe
G/T 10843643 missense_variant p.Leu315Ile
C/G 10843700 missense_variant p.Val296Leu
A/C 10843974 missense_variant p.Asn204Lys
A/G 10844188 missense_variant p.Leu133Pro
A/T 10844606 intron_variant
G/A 10844683 intron_variant
A/G 10844722 intron_variant
T/C 10844759 intron_variant
A/G 10844761 intron_variant
G/A 10845012 missense_variant p.Ala2Val
G/A 10845021 5_prime_UTR_variant
C/T 10845034 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
C/T 10845044 5_prime_UTR_variant
G/A 10845046 5_prime_UTR_variant
C/A 10845050 5_prime_UTR_variant
G/A 10845052 5_prime_UTR_variant
A/G 10845055 5_prime_UTR_variant
G/C 10845089 5_prime_UTR_variant
G/A 10845102 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
T/G 10845105 5_prime_UTR_variant
G/A,T 10845140 5_prime_UTR_variant
G/A 10845150 5_prime_UTR_variant
G/C 10845215 5_prime_UTR_variant
A/G 10845218 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24718.1
MAEDRSEVSDYSSEDEGTEDYRRGGYHAVRIGDTFKNGCYVVQSKLGWGHFSTVWLAWDTNKSRYVALKIQKSAQHYTEAAMDEIKILKQIADGDPDDKKCVVKLLDNFKHSGPNGQHVCMVFEFLGDNLLTLIKYSDYRGVSLPVVKEICFHILVGLDYLHRELSVIHTDLKPENVLLLSPIDPSKDPRKSGVPLILPNTKDNAVTKNGITIANKNVNGDLTKNQKKKLRKKAKKLAQGCVGREHAEEAEEDSKAPDEQDDCSTDVKPSVESGDNKPNSPGSKDESSKTSENKDVPQGSHGHRRGSRSTRKKLLASVDLKCKLVDFGNACWTYKQFTNDIQTRQYRCPEVLLGSKYSTPADLWSFACICFELATGDVLFDPHSGDNYDRDEDHLALMMELLGMMPRKIALGGRYSRDFFNRYGDLRHIRRLRFWPLNKVMMEKYDFSEEDANGMAEFLLPLLDFVPEKRPTAAQCLQHSWFSAGPRTLEPSVTTSQHAAIDGEISEKMQREKEQEGVEVGMGNMAIDGNSKQL*


CDS Sequence:
>Vu_24718.1
ATGGCGGAGGACCGGAGTGAGGTGAGTGATTACAGTTCGGAGGACGAAGGAACTGAAGATTACAGGCGCGGAGGGTACCATGCGGTTCGAATTGGTGACACTTTCAAGAATGGGTGCTATGTGGTACAGAGCAAGCTTGGTTGGGGTCATTTTTCCACTGTGTGGCTCGCTTGGGACACTAACAAATCGCGATATGTTGCCTTAAAAATTCAAAAGAGTGCTCAGCATTACACTGAGGCGGCAATGGACGAAATAAAGATTCTCAAACAAATTGCTGATGGGGATCCAGATGACAAAAAATGTGTTGTAAAGCTTCTGGATAACTTTAAGCATTCAGGGCCCAATGGCCAGCATGTTTGTATGGTTTTTGAATTCCTTGGTGATAATCTTCTTACCCTTATCAAGTATAGTGATTACCGAGGTGTTTCGCTTCCTGTGGTCAAGGAAATTTGTTTCCATATTTTGGTGGGTTTGGATTACTTGCACCGTGAGCTTTCTGTAATACACACTGATTTGAAGCCTGAGAATGTCCTGCTTCTGTCTCCCATAGATCCATCTAAGGATCCTAGAAAATCAGGTGTTCCACTTATCCTTCCAAACACGAAGGATAATGCTGTGACAAAAAATGGGATAACAATAGCCAATAAGAATGTTAATGGAGATCTAACCAAGAACCAGAAAAAGAAATTACGAAAAAAGGCTAAAAAGTTAGCCCAGGGCTGTGTTGGAAGGGAGCATGCCGAGGAAGCTGAGGAGGATTCTAAAGCACCTGATGAGCAAGATGATTGTAGTACTGATGTGAAGCCAAGTGTAGAATCTGGTGACAATAAACCTAATAGCCCTGGCAGTAAAGATGAATCATCAAAGACTTCTGAAAATAAGGATGTTCCCCAAGGAAGTCATGGGCACAGGAGAGGTAGCCGCTCTACAAGAAAGAAGTTGCTTGCATCTGTCGATCTTAAGTGCAAGCTAGTTGATTTTGGTAATGCTTGTTGGACCTATAAACAATTCACAAATGATATTCAGACAAGGCAGTATAGGTGTCCTGAAGTTCTTCTTGGATCTAAATATTCAACCCCAGCTGACCTTTGGTCCTTTGCTTGCATTTGCTTTGAGCTTGCCACCGGAGATGTTCTTTTTGATCCTCATAGTGGTGACAACTATGACAGGGATGAGGATCATCTAGCACTGATGATGGAGCTTCTTGGGATGATGCCTCGCAAGATTGCACTTGGTGGCCGCTATTCCCGTGATTTTTTCAACAGATATGGCGATTTGAGACACATCCGGCGATTGCGTTTCTGGCCTCTTAATAAGGTGATGATGGAGAAGTATGATTTCAGTGAAGAAGATGCTAATGGCATGGCTGAGTTCCTTCTTCCATTACTTGATTTTGTCCCTGAAAAGAGGCCAACCGCTGCACAATGCCTTCAGCATTCATGGTTCAGTGCTGGTCCCCGGACTCTTGAGCCCTCAGTAACTACTTCACAGCATGCTGCAATTGACGGGGAAATATCTGAAAAGATGCAGAGGGAAAAAGAGCAGGAGGGTGTGGAAGTTGGTATGGGGAATATGGCCATAGATGGAAATTCAAAACAACTCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_24718::LG6:10845236-10847236(-)
TAAGATTTTGTGTAAAAATCACTGTAGACATGAGAAAAGAAAGAATAAAAAAAAGAGAAAGGGAAATCAAACTGTTTATGCCGAATGGGATCGGGTAGAGTTCCTGCTACCTCCGTCCGGAAACACTCCTCCTATTCCGATCGGTCCTGCTCTCCTCGCACCTCTTTCTCACACAAATAGGTTGACCTGCAGCAAATACTCATTTGACTACTATTTATATGATTTCAGATAATATTACCCATTAATTTACCTCTTAATGGCTTTCAATGCATACTTTAAATACTCGACAATGACCGTTATCTCATTAACTACACATTCATGAGCATTCAACTGCTGTCTCCAGTCCACAGTTTTATACATCTGCCCGATCGGACACGTTGTGCTAAGGAGTTTCGGACTTATCAAGCTAGAATACCCGATCGGTTATGTTTAGCCTTTCCGGTCGGTTGCCCGCCCTCGATAGTAACACAAACATTTCATATTATTTTTGTCTTTAGACTGTGTAAAAATATCAATATATTAACATAAATAATATATACATAAAACAAAATTTATATAAAACTGTGTAACAGAAAAAACTGGTCAAATTGTTATAACTGCAACAAGGAAAACTATCTAATAAGAGCAAATTTTTAGACTATTGAATTTGTAATTTATATCATCTTTCTCACTTTAACATTTTATATCCCATATTAAAAATGTTATTAAATAAGAAAAGTATAAATTTTCTCCAACTTAAAAGTGTTGATAAATAAGAAAATGATAAATTTTCTTAGTCATCTTTAAAAGTTTATCTTTACTAAATATAAAACATTTTTTTTAAATTATTTTGTGATATTTGTTATTATTTTCAACAAAATGTCAAATATGGCAGTTAGAGATGTAACACTTTTAAAACTTTTCAACTTTTTAAAACAAATACTATTTTTTCATGTAAAATAAATACAAATTGTTAGAATTTTTTTAAATCTCTAATTTTGTGAACTGTTTGTATTAATTAATAAACAAAATGTTAAATTTATATATTTTAAGATATACATTGTAAAGTTTAATAAACTTATCGCATGTAATAATTTGTGATTGAGTAGTGTTGTAAAAATGTGTAGTCCTTTACATTATAATTGCATGTTTTTCTTTAAAAAATTGGTAGTTTTTTTAAACGACGACTTAATACAAATTTATAAATAATGAAAAAAATGCAAATTATTTAACTGGAGAAATAAACTATAACATCATATGAGATAATAATTTTTTAAACCACATGGTTATCTCTTTTTTTTACAAAATTTGAACTAATAATACTGAATATAAGTAGCTTTACATGTTATTTTTTTAACAAAACTATATTTGTCTATTTTTCCTCGATACTGTTACGCAAACAAAAAAAAAAACACATCTCTTTACGTATTTGTATTTATTAAGCTTAAATTTAATAATCTTAATATTAATGTATCTATTAGTTTTAATTTGAATATAAGTATTGCAATATTTATTCATATAAATTTTTATGTTATTTGTTTAAACTTGATATATTATTTAATATATTTAAAATTTAAATAAAACAATTTCAAATCATTAATTAGAAAAAAAAACTTTTATTACCAAGGAAAAAAAATGAGATAATAAGAAACTTGAAAGTTATAAAAAAAACAACTTTTCATTACATATATTAAATAATATATTAAGATGTAAAATATGTAAAAGAAAAGAACATAAATACTTTAAGTTATTCTTTCTAAAATTTACTTTTTTCAATTTATTTTTAAATTAAATTTTAATATCTTTTAAAATATCAAAACTCAAAATAAAATTTGAATATATTATAAACTGTTTATCATAAATTTATTATTTTATAATATTTAATTGCAATATAATTTATATATTAAAAATATTTATTTACTATAACTTGTAGTTATAAAAGATAAGCATTTATCTTTTATTTTTATTTTATTTAAAATGAAAACAACGTAACTTATGTATGAATTCCCTTCTTAGTTCTT


Gene Sequence:
>Vu_24718(-)
ATGTTGTTTTCCCGGCAATAACACCAACTCAAAAACCCTAATTTCCCCACATTCACCTTTCACCGAATTCAAGGCCCTCTGTCGCCCCCTTCTCACCCCAATATTTCTCTTCATTGTTCAAATCCATTCATATTCGTTGAAATTTTCCTATTTGTCTTCCTCGATTTTTTTTCTTCTTCCGTCGCCGTCTCAGAGCGGGTTTGTGTTTGAAGGTCCTTCAATGGCGGAGGACCGGAGTGAGGTGAGTGATTACAGTTCGGAGGACGAAGGAACTGAAGATTACAGGCGCGGAGGGTACCATGCGGTTCGAATTGGTGACACTTTCAAGAATGGGTGCTATGTGGTACAGAGCAAGCTTGGTTGGGGTCATTTTTCCACTGTGTGGCTCGCTTGGGACACTAACAAATCGGTTCGTGCCCTTTTTGTTTTGTTTCCTCGCAAGATGTCAGAAACGAATGCTTTTGACAATTTACAATTAGTTAAGAGAGTTTAAGTTTTGTTTTTTAGTTTGGGTTGTGAAGAGTGTATGTGGTGAGGAGATTTGGACAAATTTCTGTTTATATTTATCACAATTTTTTGTCTATGAAATGATAAGTTAAGTATAGAAGTTGGTTTTAGCTTCTGGGGATGTTATATAAGAAGAATAAGTTAAGTATAGAAGTTGGTTTTATCTTATAGGAAAAGTTCAATTATTTTTTCTCCTCTTATAAAGGCTTATAAAGAAATTTATTCAAATAGAGTACATGTTATTCTTTATCATTTTAATGCCCAGCTAACATACATGTAGCAATCTATAGTTTGGAACTTTATTAGTGATGGTTTAAATTGTTTTGTTTGTAGCGATATGTTGCCTTAAAAATTCAAAAGAGTGCTCAGCATTACACTGAGGCGGCAATGGACGAAATAAAGATTCTCAAACAAATTGCTGATGGGGATCCAGATGACAAAAAATGTGTTGTAAAGCTTCTGGATAACTTTAAGCATTCAGGGCCCAATGGCCAGCATGTTTGTATGGTTTTTGAATTCCTTGGTGATAATCTTCTTACCCTTATCAAGTATAGTGATTACCGAGGTGTTTCGCTTCCTGTGGTCAAGGAAATTTGTTTCCATATTTTGGTGGGTTTGGATTACTTGCACCGTGAGCTTTCTGTAATACACACTGATTTGAAGCCTGAGAATGTCCTGCTTCTGTCTCCCATAGATCCATCTAAGGATCCTAGAAAATCAGGTGTTCCACTTATCCTTCCAAACACGAAGGATAATGCTGTGACAAAAAATGGGATAACAATAGCCAATAAGAATGTTAATGGAGATCTAACCAAGAACCAGAAAAAGAAATTACGAAAAAAGGCTAAAAAGTTAGCCCAGGGCTGTGTTGGAAGGGAGCATGCCGAGGAAGCTGAGGAGGATTCTAAAGCACCTGATGAGCAAGATGATTGTAGTACTGATGTGAAGCCAAGTGTAGAATCTGGTGACAATAAACCTAATAGCCCTGGCAGTAAAGATGAATCATCAAAGACTTCTGAAAATAAGGATGTTCCCCAAGGAAGTCATGGGCACAGGAGAGGTAGCCGCTCTACAAGAAAGAAGTTGCTTGCATCTGTCGATCTTAAGTGCAAGCTAGTTGATTTTGGTAATGCTTGTTGGACCTATAAACAATTCACAAATGATATTCAGACAAGGCAGTATAGGTGTCCTGAAGTTCTTCTTGGATCTAAATATTCAACCCCAGCTGACCTTTGGTCCTTTGCTTGCATTTGCTTTGAGCTTGCCACCGGAGATGTTCTTTTTGATCCTCATAGTGGTGACAACTATGACAGGGATGAGGTAAGTGCACCTGTTTGAACTTTGAAAGAACTGGTTGGCTTCATTTCATGCCATAATTATCTAACACTTGCTGTTACTATTATATTACTATTATTGTTATGACTATTAAAACTGGCTTGCTATCATGTTTGTTCTGAGAATGAAACTTGTCCTTGACCGTTTGGGTTGTTGTTTTTCAGTGTTAAAATTCAATTTTCTACCTTACATTTTTGAATCATATCTGCATTAAAATAACATTTCTGCTAGTTTTGTTCGGTAAATAATTGTAAAAATTGATAAGAACCTTGGGAGAGTCACACCTTCTATTGCAGAAGGCTATGATACCAATTGATTTTGAATCTTGAGAGGCCCACACCATAAAAGCTAGTTGTATTTGGAGAGCCCAAGGCCTTATAAATGTCTAAGCCATGGATGTGGATACGACACAAACACTAGGATACGGATAGATTAAAATATATATGACATGAGAACACAACATGCACACACATATGAATTGTAAGTCTAGTAAGTCGTACTAATCATGCTTCATAATCAAACAAATCAAGAGAAACAATTATAAACAAGTCTTCTAAGTTTGGGTTATCAAGAGATAAGCTAACAATCTCCAAAATCCCATTGCCATCCAATGAGAAGTCATCTCCTGCAATATCCCACAACTTTGTTATAATCTTGTTTGTTCATTCAATTGAACTTTAGAATTGATGCTTCACCATGCTCCTTTAAGACCTTTTTGAAGTTTGGACTTATTGAGGTCAAATAACTTGTTTAAAAATGAAAGGGGCTCTAAGCTCTAAAGTTTCGTTCATTTAAAATAATGTACATTATCGGTGCGTAATACTAACTGAAAATGTCTTCATTTCCTTTTCTTTTTAAACAAATATATAAAATTGTGAAATACTGCTGTGGTTATTTGGACCTGGATTTCAATCTATGGATTGTTGATAATTTGGAATCTACTCTGCAGGATCATCTAGCACTGATGATGGAGCTTCTTGGGATGATGCCTCGCAAGGTAGGCCTGTTTTTCCTTTTTGGATGTTCAACATCAGAGCTGTTCTAATAAACTTGCATGTTGATATGATCAAGAACAAAAATTTTCAACATATTTTAATCACTTTTTTCCTGATGCTATTTTATTCAACCATTTTTCTGTTTCAACAAAAAAAAACAAATATGGTAGTTTACGGCAAGATGTTATTCCAAGATCTATGGATATTTTATCTGTTCTCTTTTATAAAAGTTGAACATCTTTACCTTCAGATTGCACTTGGTGGCCGCTATTCCCGTGATTTTTTCAACAGATATGGCGATTTGAGACACATCCGGCGATTGCGTTTCTGGCCTCTTAATAAGGTGATGATGGAGAAGTATGATTTCAGTGAAGAAGATGCTAATGGCATGGCTGAGTTCCTTCTTCCATTACTTGATTTTGTCCCTGAAAAGAGGCCAACCGCTGCACAATGCCTTCAGCATTCATGGTTCAGTGCTGGTCCCCGGACTCTTGAGCCCTCAGTAACTACTTCACAGCATGCTGCAATTGACGGGGAAATATCTGAAAAGATGCAGAGGGAAAAAGAGCAGGAGGGTGTGGAAGTTGGTATGGGGAATATGGCCATAGATGGAAATTCAAAACAACTCTAAGAGTTCCAATTTGGAAAGCCATAAAAATGGAAGTTAAATTTGCTTGTTTAGGTGGGTATGCCATCTGTTTTTGTTTATATGGTAAGCCTGGGTTGTCCCTGCTGCATGATGTTATAACTGTTACATGCCACAAGGTCATACATGAGGTGGTCGTTTGGGAAGAAACCCTTTATGGGGAAGCTAGTCACACTGATATAACCACTGTTTTATCTTTTTGGAGAATTTGTATGAAGCTTCTCCCTAGGTTAGATTTTCATCTTTTTGGAAGTGCTATATTTGAGGGGTTCGAACTGTACATTTGAACGAGTTATCATCATCATTATTATTTTTATTCTTATGCTTTATTAGTATCC