Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24695 LG6 10585567 10586376 PREDICTED: dehydration-responsive element-binding protein 1F-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 10585587 synonymous_variant p.Tyr7Tyr
T/C 10585634 missense_variant p.Leu23Pro
C/G 10585635 synonymous_variant p.Leu23Leu
G/T 10585665 synonymous_variant p.Pro33Pro
T/G 10585710 synonymous_variant p.Ser48Ser
G/C 10586053 missense_variant p.Glu163Gln
G/A 10586130 synonymous_variant p.Thr188Thr
G/A 10586191 missense_variant p.Asp209Asn

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24695.1
MNFEIEYPFSFQSSSTIFQSSSLTPPNNNNTNPNLLSHPLVHAQFVVSPKRKGGRKKFKETRHPIYRGVRQRKGKWVCELREPKKTTRIWLGTYPTPEMAARAHDVGALAIRGTSAILNFPNSASFLPILNSSSPKDIRAAAAEAAESFRPISLSSLSNSRNEKTGRKTKCRRVCKKVSSMEEKTQTTVLESSLNNMQNLDREKCDVIDSGMEKNNCDLSSTVFFDEEALFNMPGLLDRMAESLCLFPLPSVDYWDDHAYFTDFNLWTD*


CDS Sequence:
>Vu_24695.1
ATGAATTTTGAGATTGAATATCCTTTTTCATTTCAATCTTCTTCCACCATTTTCCAATCATCATCACTCACACCACCTAATAATAATAATACTAACCCGAACCTACTTTCACATCCTTTAGTTCATGCACAATTTGTAGTTTCTCCCAAAAGGAAAGGTGGGAGAAAGAAGTTCAAGGAAACGCGCCACCCTATTTATAGGGGTGTCCGACAAAGGAAGGGAAAGTGGGTTTGTGAGCTCAGGGAACCCAAGAAGACCACAAGGATTTGGTTAGGGACATACCCTACACCTGAAATGGCAGCTAGGGCACATGATGTGGGTGCCCTAGCAATTAGGGGCACCTCAGCGATTCTAAACTTTCCAAACTCAGCTTCTTTTCTTCCAATCCTTAACTCCTCTTCACCTAAAGATATTCGAGCAGCCGCAGCAGAAGCTGCTGAGAGTTTCAGACCGATCTCGCTTTCTTCCTTGTCCAATTCTCGTAACGAGAAAACCGGTCGCAAAACTAAGTGCAGGAGGGTTTGTAAAAAGGTTTCATCAATGGAGGAAAAGACACAGACAACGGTGTTGGAGTCGTCCTTGAATAACATGCAGAATTTGGATCGTGAAAAATGTGATGTTATCGACAGTGGCATGGAGAAAAACAACTGTGATTTGTCTTCGACTGTGTTCTTCGATGAGGAGGCATTGTTTAACATGCCTGGTCTCTTGGATAGAATGGCAGAGAGTTTATGTCTTTTTCCACTACCTTCGGTAGATTATTGGGATGATCATGCTTATTTCACAGACTTCAATTTGTGGACTGATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_24695::LG6:10583567-10585567(+)
CAACCAAAGATTAAATTTTATATAGCACATAGAAAGAAAAACTTCCTCTCCTTCCAACTATAATACCACTTTACATAATTCTTCAATTTCTCTTTATCAAATTTTCACTGTATTTCTCACTTATATATTATTAAAATAATTACATATCTCCAATCTATCTCGATTATTTTGAAAGAGTATAAAATTTTGAGTTATAGATACAAACTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATAAGAAATTCATTAAATAAAAGTTGATTTAAAATATATTTTACAAATTATTTTCAGCATTTAAATTATGTTTTATTGTTATTAAATAAGATTATTAAATTAATTTTCAAAATTAGCGATTAAATTTTTTTTTATCTCTTAAAGTTTTAGTCGATCTGACTTTAGAGTTGGTCTAGTTTATAATTACTTTAACATTCTTTAAATTTAATATCATTAAGTCAATTGTGTTCAAAAAGATTACATGTTTAGTTTTAAACTAGTAGAAAAAATTGATTTGTTCACAAAAATAAATATAAAAACACTTGTTTTCTTTTTATCAGTGAAGAAAAAGTAGTTTACATTAAATATTTAATGTTTATTCTTATAAGATCTAACATGTAAGATGCAAGCATCATATATATAGGTCGAGAATCAAATGTAAGTCTAAATACCAGGTCTAAATTTTATATTAATAAAAAATTAAAATTACTATATAAAAGTAAATTCTTTTATAAAAAGTGATGTTAATTCCTTATATAATTGGATTCGAATAGTATTAGTATGGTATCATTTCATTAGTCTTTTTAGTGAAGTCTCTCCTCCCTACACCTAACAAGATATCAGTAAGTTGATGTAAACTTTTTATAATTCCTGCTCAGTTTTTTTTTTCGTTCTCTCCTTTCTATCTCGATTTTTCCTTCTCTAATGTTGCAGTGAATTTATTTTTCCTTTGATTGGTGATAGAAAAGATGTTCTTCTTTCATTTTTGTGAGTGATTTTGAATGAGAAGTTTATGTCCAATTGGATTTCGTTTGAGTATTATTAATTGAAGTTGGTGATCTAAATCTCTATTTTGTTTTTGAAATTAATTGTTTTAGGAATTCAATCATGGAAATGTCTTGTTATTATTAAATGTTTAATTTTTGTTAATATTGAAGTTGATGATTATAATAGTTCCAAGAACTTCAAACTCGAACTAGAGACACCCACGCAATAGGTGCACTCTTTTGTTGGCACTACGTACAGAATATTGAAACACAAATCAATATTAAATATTATTTTGAAATTTATATTAAATTTGTCTAGATTTAACATAAATCTATGTCAAAGTTTAGGTCCAACATAAATTTACATTATACATACATTGAAATTGAATTACATAATTTATATAAAAATGCATGATTTAGTAAAATAATTTAATTGAAATATTATTCTTTTATTGTTAAGACATATAATACTATGTATATATATAAAAGACATATCCTTAAATCCTGAAACTCCAGCCAGCGTTATTTGGAAGACTTGGGGAAATTCCCCTCAGTACACAGTACAGTTTCTTTATAAAAAAGCATAAAGAATGCATCTAATGAGAAAAGTTCATCCTAGCCATTCATTAAAACGTTTTACACACATATTTATATATTACTATTTTTTTCATTCTTTTAATATCTCTTTTTCCATAACAAAAACAAATTGAAAGCACAAAGAACACAATAGATGAATTATTCAAACATAGTGTGAAAATAAAACAAAATAAAGTAGGTTGAGTCTACTCTTGCACTATGAAAAAGATAGCTCTAGAAATTATTTACAGCACATGCAAATGTCAAATCATCGTACCTCCAACACACTTTCCTCTTCCCTCTCTCTTTATAAACCCTTCTCTCCATGAACCCTACCTATGCTCACACTACCAAAATTCACACATAACTCCAATTTCCACTCTCAATTTCTCTTGTTATCACCACAAAAGTTACAATCTACCA


Gene Sequence:
>Vu_24695(+)
ATGAATTTTGAGATTGAATATCCTTTTTCATTTCAATCTTCTTCCACCATTTTCCAATCATCATCACTCACACCACCTAATAATAATAATACTAACCCGAACCTACTTTCACATCCTTTAGTTCATGCACAATTTGTAGTTTCTCCCAAAAGGAAAGGTGGGAGAAAGAAGTTCAAGGAAACGCGCCACCCTATTTATAGGGGTGTCCGACAAAGGAAGGGAAAGTGGGTTTGTGAGCTCAGGGAACCCAAGAAGACCACAAGGATTTGGTTAGGGACATACCCTACACCTGAAATGGCAGCTAGGGCACATGATGTGGGTGCCCTAGCAATTAGGGGCACCTCAGCGATTCTAAACTTTCCAAACTCAGCTTCTTTTCTTCCAATCCTTAACTCCTCTTCACCTAAAGATATTCGAGCAGCCGCAGCAGAAGCTGCTGAGAGTTTCAGACCGATCTCGCTTTCTTCCTTGTCCAATTCTCGTAACGAGAAAACCGGTCGCAAAACTAAGTGCAGGAGGGTTTGTAAAAAGGTTTCATCAATGGAGGAAAAGACACAGACAACGGTGTTGGAGTCGTCCTTGAATAACATGCAGAATTTGGATCGTGAAAAATGTGATGTTATCGACAGTGGCATGGAGAAAAACAACTGTGATTTGTCTTCGACTGTGTTCTTCGATGAGGAGGCATTGTTTAACATGCCTGGTCTCTTGGATAGAATGGCAGAGAGTTTATGTCTTTTTCCACTACCTTCGGTAGATTATTGGGATGATCATGCTTATTTCACAGACTTCAATTTGTGGACTGATTGA