Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24657 LG6 10216505 10217501 PREDICTED: NAC domain-containing protein 90-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 10216605 missense_variant p.Gly112Val
C/T 10216609 missense_variant p.Glu111Lys
T/C 10216760 synonymous_variant p.Leu60Leu
G/T 10217084 intron_variant
G/A 10217230 intron_variant
G/A 10217235 intron_variant
A/T 10217281 intron_variant
T/C 10217375 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24657.1
MADLPPGFRFYPTEEELVAFYLHNQLEGQRHDTSRLRHEFSLCRVYVISGSFRSFDRRPLEIGRAELRVDGDRGGAASTSGQERAAVVDGSSSPDTGHSGDGHIHEAEAGEGSSGTHCNTSNRVEEPLWEWEHLIGHEPYVKHA*


CDS Sequence:
>Vu_24657.1
ATGGCAGATCTCCCACCTGGTTTTCGATTCTACCCGACAGAGGAAGAGCTCGTTGCCTTCTATCTGCACAACCAGCTCGAGGGACAAAGACACGACACCAGCAGGTTGAGGCACGAATTCAGCTTGTGTCGTGTTTATGTTATATCGGGAAGCTTTAGATCGTTTGATCGACGACCACTAGAGATTGGAAGAGCTGAGTTACGAGTTGACGGTGATAGAGGTGGTGCTGCTTCAACAAGTGGTCAAGAGAGAGCAGCGGTGGTGGATGGATCAAGCTCTCCCGATACCGGTCACTCCGGTGATGGTCATATCCATGAGGCTGAAGCTGGAGAAGGGTCAAGTGGTACACATTGTAATACAAGCAATAGGGTTGAGGAACCACTCTGGGAATGGGAACACTTAATTGGACATGAGCCTTATGTCAAGCATGCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_24657::LG6:10217501-10219501(-)
TTTCAAAGTGAAAGTTGGTTAATTCAAAGTGTAAAGTTCAAAGTATGGTTAATGAACGTAATTCCATGATCCCAAGGAGAGGATACATGGTGGTGTCCTACGTTGTGATTCAAAGTGTAATCTCTTGTTGAGATTCAAGTAAGTTTAGAATGAATGCAGGAGCTTAGTCTTGGGGGTTATCCTGAAACTCCAATGTTCTTTCATTCTCAAGTAGAGAGGATTGATCCATGTCGTGAGGAGTAGCAGGAGGTTCTAGTCTTGGGTGCTTCCAGTATGGCCCAAGGTGAGTGATAACGGACTAACCTCGTGAGTGTGGTAGGGTGAAACCCATTGACAATGACTTTGCAAAGCAGTAGAAGTCATCACGAGTGCACGACCCGCCATAGCTCGACAATCATTCTAAGTTCGGACAGTCAAAGTCAGTGTGGTGTTATGTGTGAAGAGTTTATGTGATGTGAATGAATAATATGATTGTATGAAGTTAAATAAATTAGTGTATGATTAACCTTTGTTTAAACTAGTTTACCCTGTTGTGTATGAAAATGAAGAAAAATAAGAATAAAGTTTCTAAAAATTATTGAACATGGGTTTGATATATTACAGAAATATATCACTTATTAAAATTAAATTATGACAATTTTACCCTTATTTATAAATTGTTATTATTATTATTAATGGTCTTGGTTTTGATTTTTAATTTTGTTCAAAAACTAAGTAATTGAATTTTTTGGGTGCAAGAAAACCATAGTCTCGATGGCTAGGTCTAGGAGGAGCTTGGACTACTCTCATGCGGCAGTTGGCAACCCCATTGGTGTCACACTGTGATTTAAAACGAGTATCCTCTAGATCATCTTCATCGCTAAGAATCGATTTTACAGACAAATGAAGATAGGAGAATCAGATCACTATGCACAAATGGAGAAAAGATAATTGATTCTCTTATCAAGTGTAATTAAGTTATTTTGCAACTATTGATGTTTCTCTTTAAGTATCTCTCTTCACTAATTAATGTGAAAGAGCTACATCTACTTTCTCTTGCATTTCTACACTCCTAAATTATCTTTAGTTATTTGATGAAATACGTCGGTTCTCCTTTTGAATATATAATATATGCTTAAAAACAAGCATAGGCTCATAGAGAATAACCTACTTCAAAAATAAATACAAAAAGTTTAGAATGCAATAATTGATCATAATAATTTAGATTTTAAAAAATAATAATATTCAAATACCTATCTTTTTATACTATATAGTTTTCTTCTTATTACATTATATATCTTATAAATATATATTATTATTATTATTTTAAGTAATTATTTTCTTTAAAAAAGTAATTAAATCTAACTATTTTTATTATTATTTAAGTAATTACTGTAATGGGTAGGAGGCGACCAACCACCTAAAGCAGTTGAGTAAGATATGATTGCTATGCTATACTTATTGATCTGGATTTGTGGCAGAGTGAGTGCAGCTGGAAAGTTCTCTGATGACATCATCAACGGGGTACAAAACAAAACACAGCAAGACAAGAAGACAAAGACATTATTAGACAGACTCGAAAATTTAGACTTGTTCCACCCACAAGATGGCCCAGCTCACGTAAACAGAAAAACCATTAATCATCATGGACGAAATGAAGATACACCAAAAAAGTTTAATTGGGTTGGGCTCACACAACAAAACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGATGATGACCAATTCAAAGTTGATGTTTACGGCACAAAAACATCATAAGATAAATATATAAAATATACACATGAAAAGGAAATAACAGGTTTTGGGGGCACAAAGACGTTTTCTTACTCCCTGCAACCGCGTGGAAGTTTCCAACCAATCTCTACTCAATAGCTTTTTCATTTCACTCGGCGAACCTTTCTGCCCCACTCATCTATGGCCACGCCATTTAAGTTTTTTCTCTCCATATATATATACTATCATACTTCATTACCACAATAATATTCAAACGGTAACAAAAAACCAACC


Gene Sequence:
>Vu_24657(-)
ATGGCAGATCTCCCACCTGGTTTTCGATTCTACCCGACAGAGGAAGAGCTCGTTGCCTTCTATCTGCACAACCAGCTCGAGGGACAAAGACACGACACCAGCAGGGTTATTCCAGTCATTGAAATCAATGGCGTAGAGCCTTGGAACCTCCCAAGTATAATTTACCTTCAACTTTTTCAACTCTTTGTTTAATCAGTACGTTTCAAGCCTAAAATGTTCCTTCTTTTTTTCATCAGCACTTGCAGGGGAGCGTTGTCGTGGAGACACGGAGCAATGGTTCTTCTTTTCGCCCAGACAAGAGAGAGAGGAGAGAGGAGGTAGACCCAACAGAACCACCGCAAGTGGGTACTGGAAAGCCACCGGCTCTCCTTGCCACGTTTACTCTTCCGACAACAAAGTCATCGGGATGAAGAAAACCATGGTGTTTTACAAAGGGAAGGCTCCATCCGGAAGGAAAACCAAATGGAAGATGCATGAGTACAAAGCCATTCAACACTCTCACCAATCCAACGCAACCCCTCCCAAGGTATATTCATCATTTCTATCATAAAACCTTGTATATTTTAATACATTTGAACTTGTTATAAGCTGGTTGTGTGGTGGTAGTTTTCACATTTAACACAAAGTACGATGTTGTTATAGTTTTTGTTTTTTTTTATGTGTGCAGTTGAGGCACGAATTCAGCTTGTGTCGTGTTTATGTTATATCGGGAAGCTTTAGATCGTTTGATCGACGACCACTAGAGATTGGAAGAGCTGAGTTACGAGTTGACGGTGATAGAGGTGGTGCTGCTTCAACAAGTGGTCAAGAGAGAGCAGCGGTGGTGGATGGATCAAGCTCTCCCGATACCGGTCACTCCGGTGATGGTCATATCCATGAGGCTGAAGCTGGAGAAGGGTCAAGTGGTACACATTGTAATACAAGCAATAGGGTTGAGGAACCACTCTGGGAATGGGAACACTTAATTGGACATGAGCCTTATGTCAAGCATGCTTGA