Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24633 LG6 10012396 10015640 PREDICTED: receptor-like kinase TMK3
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 10012427 missense_variant p.Val11Asp
T/A 10012438 missense_variant p.Phe15Ile
G/A 10012612 missense_variant p.Asp73Asn
T/C 10012698 synonymous_variant p.Leu101Leu
T/A 10013164 missense_variant p.Ser257Thr
C/T 10013799 synonymous_variant p.Pro468Pro
A/C 10013909 missense_variant p.Lys505Thr
T/A 10013969 stop_gained p.Leu525*
A/T 10013978 missense_variant p.Tyr528Phe
T/G 10013984 missense_variant p.Leu530Trp
C/A 10013986 missense_variant p.Leu531Ile
A/G 10014018 synonymous_variant p.Leu541Leu
G/A 10014268 missense_variant p.Gly625Arg
G/A 10014348 synonymous_variant p.Lys651Lys
T/A 10014518 upstream_gene_variant
G/A 10014520 upstream_gene_variant
G/A 10014796 upstream_gene_variant
T/A 10014948 upstream_gene_variant
A/C 10014956 upstream_gene_variant
G/T 10015277 stop_gained p.Gly740*
A/C 10015340 missense_variant p.Asn761His
T/A 10015346 missense_variant p.Cys763Ser
A/T 10015412 missense_variant p.Ser785Cys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24633.1
MEGVQIEQVFVLFCFCLIATVSFGATNPNDVKVLNDFRKGLENPELLKWPEDGDDPCGPPLWPFVYCSGDRVDQIQAKNLGLRGSLPQNFNQLSELYNLGLQRNNLSGVLPSFSGLSKLEFAFLDYNKFDSIPSDFFSGLSSLRVLSLEENPLNMSSGWLFPMDLEKSVQLTNLSLVQCNLVGPLPDFLGTLPSLTNLRLSGNKLSGAIPATFAQSSIQVLWLNNQEGGGLSGPIDVIASMPFLRQVWLHGNRLTGSIPQNIGNLTSLQELNLNSNQLVGLIPESLALMDLDILVLNNNMLMGPIPKFKAANVSYDYNLFCQNEPGLECGHQVTILLDFLDKMNYPSFLVSDWSGDEPCTRSTGSWFGLSCNSNSEISIINLPRHKLNGTLSPSLAKLDSLRQIRLSGNNITGSVPTNFTKLTSLELLDLSNNNLEPPFPNFHDDLKIIITGNPLLLNKTGGSPSPMPINSPPSPQDPSQPPSSHKPPIPDQSSRANQSKPNELKRFKTAAIVAGVVLLTLVALLVVYFLLCCRKKKKASLDAPSSIVVHPRNPSDPDNIVKIAVSTATGSLSTKTGTSSLSNISGETQNSHMIEDGNLVISIQVLRKVTNEFASENELGRGGFGTVYRGELEDGTKIAVKRMEHGVITSKAIEEFQAEIAVLSKHAPDSEKSVVTKLAGTFGYLAPEYAVMGKITTKVDVFSYGVVLMELLTGLVALDESRPEESRYLAEWFWRIKSSKEKLMAAIDPVVEASEETFDSITIVAELAGHCTAREAHHRPDMGHAVNVLSALVEKWQPVDDELDCYSGIDYTRPLPQMLQIWKEAESKEFSYASSLDNSRSSIAARPTGFADSFTSADAR*


CDS Sequence:
>Vu_24633.1
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Promoter Sequence:
>Vu_24633::LG6:10010396-10012396(+)
CTGCTTAAATTACAATATCATGTGCTGTGGTTCAAAATTCTCTTTCTTCTCACTTAGAATAAACTTCCATTAGCATATGCATGTGTAGGTCTTTATTCCAAACAACATAATAGAGACACATTTAAACAGTGCATGAGTTAATTTATTGTAAGTGGGTCATTCTTCAGTCCTAGCAAGTTAATGTCCTAATTAATTCTATGACCAATAATGCACCCATATCATTGACATCTACAAAGGTTTAATTAAATATTTAATGTTTAATAAATCTAGATATTTTTAAGTTGAACTTTTACTAAAAAAAATTATTATATTTATATTTAGTCTTTAAAATATTTTTCATTTTCATCTATGTAGTTTATTGTTTCGTCTTACTACATAAGAAATGACAAGACAATTCTTTACATTTTTTTAAACTTTTTTTTGAAACTTTTATGAATTTCTTTTTTGAAGAAACTTAATAATTATGGGTAATGTTTTGAAAGATGAGTGCACGTGATGATAGAACTTTTAGGTAGAAAATTTATATAAATAAGAAATTGAAAAATGTATATAAGTCTTCAAATATTTAATTTTAAAAATTATATTTTCTATCAAATGTTCATAAAGAAATGACATAAGAGGAGATAAATTTCTCAATAACTAATTATTATGAAAAAAATTAATCAAACGAACATACTTATATTTGAATGAAAAATGTATATAAGTCTTCAAATATTTAATTTAAAAAAATATATATTTCTATCAAATATTCATAAAAAAATTATGTAAGAGGAGATAATGTTCTTTTCAATAACTAATTTATATGGAAAGTTTAATCAAACAAACATACTCATGTTTGAAAGGATGAGTGTAGATCTTTGTTAGAAAAATCACATACCGACATTAGCGGAACACTTTCCTAAATTGACCCGCCACCACAATCTATGGAACTTTCCTAAATATAGGACCCACTCCTTTGGTTTTGTCTTTCAATTTTGCATGCCGACAAAACAAAACCATTGGTTCTGCAACATCACCAGGTTCCTCAAACCTCACAGCATATGTTACCTTCAACCTTAGATCTTGTTTCTACTCTCACTACAACTTCAGTTGCCTTCACAGTGTTAACATTTTTGCTATGATTTAACCAACAAAACTGTGAATACCAGATAAAAAAGCTTTTTTTTTTTTTGGATTAGTAGTTCAGTTAAATGAGAACAAAGATTCTATTTTTTGTATGGAATTTGAGCTTTAAACTTTATAAAGATCAAATCTTTTAATTTTATAAATATTGGGAATGTTTAAAGATGGAAAAATAAGTTTGTCTGTTGTTTAAAATTTGAGCACTAAATTCATTTATTTATGAAATATGGAAATACGATGCAGTTGACTGGAAATGTATAAAATATTAGAAAGATAATCTTTTTTCAATGAATGAAATTCCAAGCCCACATGATTCTACATGTCATCCATTTGCTACTAGTTAATCAAAACATGGGGGACAAAATCATTGTGAAGTTCTTTCTTTTTTACTGCCTCACAAATTTTTAATAGAAATCATAGGCCAACCAATGGTAAGAGGCAAAAAGAAAAAGGAAAAAAAAAAGAAAAGGAAAAGAGGGTTTGGAGAGGGACAATCTTTGTGAAGTGGCCTGACACTTTGTTTAGGGTTCCTTCCTTCCTTCGTAAAATGTGAAAAGTTAGAGACATTCCACATTGGCACATTCTCCTTCCTGTCTTTTTCTCAATTTTGGGAACTTCATTTTCCTGATCCGTTCAACGTTTTCTCAACAAAAGACTCTTTGTTTATGCATACCTATAGGTAAGAGTAACTACCAAGCAGGCACTCTCACATTCACACTCATGTTCTAGTTCTAAGCTTGTCATTAGTCATTTTTCTAAGTCTTGTGGCTAGTGTCTCTCATTTGGGCCTCTGATATAATGGGGTTCTGATTTTACTGGGAAAGTTCGTATACTGATTCTCTCTTTTGTTTTTTGTTTCTGTTTTACTAGGCTAACCA


Gene Sequence:
>Vu_24633(+)
ATGGAAGGTGTTCAGATAGAACAAGTCTTCGTCTTGTTTTGTTTTTGTCTGATAGCCACAGTGAGTTTTGGTGCTACAAACCCAAATGATGTCAAAGTTTTGAATGATTTCAGAAAAGGGTTGGAGAATCCTGAGCTTTTGAAGTGGCCGGAGGACGGAGATGATCCCTGTGGTCCTCCTTTATGGCCTTTCGTGTACTGTTCTGGAGACAGAGTCGACCAGATTCAGGCAAAGAATCTTGGTCTTAGAGGGTCATTGCCTCAAAACTTTAACCAACTCTCAGAACTCTACAATTTGGGTCTTCAACGCAACAACCTCAGTGGGGTGTTGCCCTCTTTTAGTGGATTATCCAAATTGGAATTTGCTTTCTTGGATTACAATAAATTTGATTCAATTCCATCTGATTTCTTTAGTGGGCTTAGCAGCCTTAGAGTCTTGTCTTTGGAAGAAAATCCACTGAATATGAGTAGTGGATGGTTGTTTCCCATGGATTTGGAAAAATCAGTGCAGTTAACCAACCTTTCTCTGGTGCAATGTAACTTGGTTGGACCGTTACCGGATTTTCTCGGCACATTGCCATCTCTCACAAATCTGAGGCTTTCAGGTAACAAGCTGTCTGGTGCCATACCTGCAACTTTTGCACAGTCTTCAATCCAGGTTTTGTGGTTGAATAATCAAGAAGGTGGTGGGTTGAGTGGTCCTATTGATGTTATTGCTTCAATGCCTTTCCTTAGACAGGTTTGGCTACATGGAAACCGATTAACTGGGTCAATTCCTCAGAATATTGGAAATCTAACTTCCTTGCAGGAACTCAATCTCAATAGCAATCAACTTGTTGGCTTGATTCCAGAGTCTCTGGCACTTATGGATCTTGATATCCTTGTGTTAAATAACAACATGCTAATGGGTCCAATACCAAAATTTAAGGCTGCCAATGTTTCTTATGATTACAATTTATTTTGTCAAAATGAGCCCGGACTTGAATGTGGCCATCAAGTTACTATTTTGCTGGATTTTCTAGATAAGATGAATTACCCTTCATTTCTCGTTTCTGATTGGTCTGGTGATGAACCTTGCACGCGCAGCACAGGGTCATGGTTTGGATTGAGCTGCAATTCCAACTCAGAGATATCTATTATCAATCTACCTAGACACAAGCTAAATGGTACACTAAGTCCCTCACTTGCTAAGTTAGATTCACTCCGTCAAATTAGGCTTTCAGGAAATAACATAACCGGCTCTGTTCCTACTAATTTCACCAAATTAACATCTTTGGAGTTGTTGGATTTAAGTAATAACAATCTTGAGCCTCCATTTCCAAATTTTCATGATGATTTGAAGATTATTATCACGGGTAATCCCCTTCTTCTGAATAAAACTGGAGGAAGTCCCAGTCCTATGCCCATTAACAGCCCACCTTCACCACAAGATCCATCACAGCCTCCATCCTCTCATAAGCCACCTATTCCAGATCAGAGTTCAAGAGCAAATCAATCCAAGCCTAATGAATTGAAAAGATTCAAAACAGCAGCAATAGTGGCTGGAGTTGTATTGCTTACTCTTGTAGCACTTTTGGTTGTTTATTTCTTGCTATGTTGTAGGAAGAAGAAAAAAGCCTCCTTAGATGCTCCAAGTTCCATTGTGGTCCACCCTCGCAATCCATCTGATCCAGACAACATAGTTAAAATTGCAGTTTCGACCGCCACTGGAAGTTTGTCTACAAAGACTGGTACAAGTTCTCTGAGTAACATCAGTGGTGAAACTCAAAACTCTCACATGATTGAGGATGGAAACCTTGTCATCTCTATACAAGTACTACGCAAGGTTACCAATGAATTTGCTTCAGAAAATGAACTAGGTCGTGGAGGGTTTGGGACTGTTTACAGGGGGGAACTTGAAGATGGGACAAAAATAGCTGTGAAGAGAATGGAGCATGGGGTTATTACCAGTAAGGCAATAGAGGAGTTTCAAGCAGAAATAGCTGTTCTTTCCAAGGTACGGCACCGCCATCTGGTATCCTTGTTGGGGTATTCCATTGAAGGCAATGAAAGACTTTTGGTTTATGAATATATGTCTCGTGGAGCTCTAAGCCAGCATCTTTTTCATTGGAAAAGCTTGAACCTGGAGCCTTTGTCTTGGTCAAAGAGGCTTGCAATAGCACTAGATGTTGCCAGAGGGATAGAATACCTTCACAGTCTTGCCCGTCAGACTTTTATTCATCGAGATCTTAAGTCTTCTAATATCTTATTGGGTGATGATTTCCGAGCTAAAGTTTCAGATTTTGGTTTGGTGAAGCATGCCCCAGACAGTGAGAAGTCTGTAGTTACCAAGCTTGCTGGGACATTTGGATACCTTGCCCCTGAATATGCAGGTATGACTTGCTTAAAATCACCTCTTCTGGCCATGATGTATATGTAGAAATTTAGCATAACTGCCAAATGGAATCATTATACCCTCTCTGTATGTTAATTTATATTCAGTTACATTGTTCTTAGATGAAAACATCTTAGTAGTGTGCAAGAGGTCTCTCTTTCTGTCTGTATTTGAAAAAGTAAAAGTTAACAAGGAATGATGTCTAATTATATGTCATAATGTTTCAAATTTGTAAGCAATGCGGTACTTGTGTCACTCATCTAACAGTTGGTCATACCATTGCAATGTGTGACGTTTTATCATATCAGTGTGTTTGATTTGCCTGCCTAGCTTTTCATACTATGTATCGATGTGTTTCAGTGATGGGGAAAATCACCACAAAAGTTGATGTGTTCAGCTACGGTGTGGTTTTGATGGAACTTCTGACTGGACTTGTGGCACTTGATGAGAGCCGACCAGAGGAGAGCCGGTACTTGGCTGAATGGTTTTGGCGAATTAAATCAAGCAAGGAGAAGCTTATGGCTGCCATTGATCCAGTTGTGGAAGCATCTGAAGAAACTTTTGACAGCATAACTATTGTAGCTGAACTTGCTGGACATTGCACTGCAAGGGAAGCACATCATAGGCCAGATATGGGTCATGCAGTCAATGTCCTATCAGCATTAGTGGAAAAATGGCAACCAGTTGATGATGAATTAGACTGCTACTCTGGCATCGACTACACAAGACCACTTCCTCAGATGTTGCAGATTTGGAAGGAAGCAGAAAGCAAAGAGTTCAGCTATGCTTCTAGTCTTGACAACAGCAGAAGCAGTATTGCAGCCAGGCCTACTGGGTTTGCAGACTCTTTTACTTCTGCTGATGCAAGATGA