Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24608 LG6 9729023 9737125 PREDICTED: putative axial regulator YABBY 2 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 9729089 5_prime_UTR_variant
A/T 9729144 5_prime_UTR_variant
A/G 9729367 intron_variant
G/T 9729424 intron_variant
G/C 9729637 intron_variant
T/C 9729638 intron_variant
T/A 9729946 intron_variant
T/A 9730016 intron_variant
A/G 9730037 intron_variant
A/T,* 9730286 intron_variant
T/A 9730295 intron_variant
A/C 9731129 intron_variant
G/A 9731269 splice_region_variant&intron_variant
T/A 9731319 intron_variant
T/G 9731328 intron_variant
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C/A 9732110 intron_variant
T/G 9732278 intron_variant
T/C 9732333 intron_variant
A/T 9732467 intron_variant
C/A 9732518 intron_variant
A/T 9732550 intron_variant
G/T 9732651 intron_variant
C/T 9732738 intron_variant
C/A 9732822 intron_variant
A/T 9732825 intron_variant
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A/C 9733068 intron_variant
A/T 9733101 intron_variant
A/T 9733102 intron_variant
G/A 9733452 intron_variant
C/T 9733457 intron_variant
G/C 9733570 missense_variant p.Ser141Thr
G/A 9733613 intron_variant
C/T 9733631 intron_variant
G/A 9733842 intron_variant
T/C 9733843 intron_variant
T/G 9733854 intron_variant
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A/G 9734082 intron_variant
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C/T 9734107 intron_variant
C/T 9734182 intron_variant
C/T 9734346 intron_variant
C/G 9734521 intron_variant
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C/T 9734756 intron_variant
G/C 9734857 intron_variant
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A/G,* 9735014 intron_variant
A/G 9735165 intron_variant
G/T 9735367 intron_variant
C/G 9735443 intron_variant
C/T 9735446 intron_variant
T/A 9735492 intron_variant
C/A 9735806 intron_variant
A/T 9735967 intron_variant
G/C 9735981 intron_variant
C/T 9736543 intron_variant
T/C 9737095 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24608.1
MSMDMMATERVCYVHCNFCNTTLAVSVPCSSMLTIVTVRCGHCANLLSVNMGASLQPFPSQETQHLSTVAKLQRQHLSVQEACSKELGSSSKCKSFESVDHEQPRIPPIRPPEKRQRVPSAYNRFIKEEIQRIKASNPDISHREAFSTAAKNWAHFPHIHFGLKLDGNKQAKLDQGDATQKSNGFY*


CDS Sequence:
>Vu_24608.1
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Promoter Sequence:
>Vu_24608::LG6:9727023-9729023(+)
TTGAATAATATTTATTCTCTTACAAGTGTTTCCAAAATATAATAATTTGTAAGTGGATATACTAAACATAAATTCCTCTCATATAGACACTTATGTTGAATAATATTACAAACATATATACTCCGAATAAATTAGGCTAACGAAAACTATACCAAAATATTGTAAACTGTTATTGTTATTCTTTTTTGTTAATCATAATTTTTAATGACCTACAATGTTGGGCTTCCTTATTTAATATGCTTTTAATTTTAAGAAAATTAGCCTAACTATTTAATTATTATGTTTGACTTCACCTATGCTTGATGTGAGTAAGGAGAAAGCCGCTTAATCAGAAAATATTATTTACAAACAATTCCAAAATAAATCATAAGAGAACGGAAAGAAAAAGTAAATAAGGATAGGAGTGAATTAGAGAAAAGAAACATTTCCGATGACATGGTGTAGAATTATATTGATTAAATTTGAGTATTTTCATACATATGATTTTTTAATACCACTATTAGTAATAAGATATTTAAATTTTTTTGATTACACAATAAGATATAGAATAAAAAGGTTTTTACAACATTAAATAGTGCCCTAATTTCATACAAGTATAAAGTTTTCTACCCCTTTATCCGAATGGTTTAATGAACTACTGCAGCTTACTCGTCCAGTTTCTGTTCATCAGCTTCTGCTAGAATAGTTCAATAAAATAGTTGGAGTTAATACAAATAAGGTCCTTGTATAACTAGAATAAAGTTAATTTTGTATATGCCTTAAAATTAATATAAAAAAATAAAAAATTTATGGATGTATGCAGTTAGCAAACATTCCTGTTTTAAACACGCCTTGGATGTTTCAAATATGGTGTCTGAAATGAAACTGTATAAACAAGACCTGACCAAGGTAGTGGTGGAAACGCAGTGTACGTACACAGAGGAAGTTATTTGAGTGAAAAGAAAAGTAGAGAAAATGCAAAACACTAGTTCAGGTTGAAATTAGAAATCAGCGGAAACCTGAAGAATTAAGTGAGGAAAAATGAAAATCCCACGTGTAAGAAGTTCACAGGAAAAAACATGAATAGGTACAGTAAAATGTCTATTCACTTTTCTGTTGAGAAAAAAAGAAAAAGATGTCAATTCACTTTGCAAAATAGTACAGCGCAATAGAAAATCCGAGACACAAAAATGGAGAAAAGCCAATTTACAATCCTTGCTATTTCCACGGTCCTTCGACGTCATTATTATTGTTACTAAGCTTTGTTGACTTACTGTGTAATTAACACTCAGAATTATGTGATTTAGACTTGAAACCCGTGGAGGGTCAGAAATCAGAATAGACATATTGAAAAAAAAAAGTGGTAAGAAAACAAGCATTTGTCAGACTATCTATGTATGTAACTAACTAACTATCTTATCTATCTTTCAGATGCATAGATTTGAATGACAAATTCTAAACATGTCTCTGATCGATGTAAGCTTTCTCATACTTACATGAGTAGTAGTAAGTAACTACCATTGTGTTGTAATAAGAGCTGAGAGAGAGAGAGGAGATAATGTTATGTCTCATAATATGATAATATGATAATAAATATCATCTCGTGTTAAAGATAGGAAGCATTAATATCTCGCCCCCCTCGTCCGCTACAGAAAGGCAGAGAGGTTAGAGAGAATGGGTCACTCCCACCCACTCATTTTCTCAATCATAACACATCCATCCCCACACACCTTCTTTCCCCACTCTCTGCTTCTCTGTCTTTCACAAACGCGCACATAAAAACACACACCAAATATTTTTTCACACTTCCCATAATCCATCTTTTCTTCATTATTCTAAACTGTCACTAATCCCACTCCACTTCACTGGTTTTTCCCGACCAGAATAGTCCCATCTTAACCATTCACATTTTTCTACACTTTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTATCCGCATTAAAAAAACAATAATAACAAAGTTTCTTTTCTTTATTTAACCTTTATGATTCTCTGTCTTATATTCTTC


Gene Sequence:
>Vu_24608(+)
CTGGGTCTTCTGTAAATCCTTGATCTAGCTTGTTCGCTTTGTTTCAGTCAAGGAATTCTCCTCTTTGATCTGCCTATAAATCTACTAAGCAAACACCAAGGACAGTCACAATTTCTTTTTTAAAAAAATGTCAATGGACATGATGGCAACCGAACGTGTTTGTTATGTTCACTGCAACTTCTGCAACACCACTCTAGCGGTACAGTTCTGAATTCTTTCTTCTCTCCTCTTTCTATCTATCTTTCTATCTCTTGTTCTCTTTCTTTCTTTCTCTTTTTTCCCTGAATTCTTTTAAGCTTGTTTCTTGTTATTATACCATGTGTTTCACCAGCTAATAATTTGTCAATACGAGTTTTGTTTATCTCTTGAATCGAGATCAAGAAACCAAAGAATTCAAGAACGGTCACTTCCCCAAGGACTTGAAATCCATCGTTGAAGTGAATTTTTCTACTGGAATGTACTTTAGATCAACGATTAATTGTCTCTCGTCTTATATTTTATGGGAAACCGTGACTGGGTTTTTCTTTATAACCTCTATTTATGCTAAAAAGTTCGGCTGTGGTGTTAATTTGGTTAGAGGTCAGCACTCTCGTGAGTAATGGCAGAAGACAATTGTTAAGCTCGAAAGCCAGAAACTTTCAATAATTTTAAGCAAGCATACTGATTTCGAAAGGTAAAAGACGATTCGTGAGCCTGAGTGAGATGTTTTACAAACAAAACGCACACACCCATAAGAAATTTGAGGGCTGTGAAAAGGTAGGGCTACTCCCAGGTATTAGGGTTCTTGTAATATACGGAGCCCTTTCCCCTCTTTTTGTTCGTTTCATTTAATTTTTCGTGAGGATATATATAGCATCGTATGATCTCACATGCTATATATGTTATGTTGTGTAAAAAGTCAACCGTTGTCTTAATTTATCAGTTCTTTTTATTTCTTGTTTTCTCTGGGAAGTACTGATAAACAGCTCATAAAATGAAATCTATACAAATCTGTGTGGTGATTTGTCTTTCCTCAGTCTACTTGGATTGATTCCTTTTCACTGAGGAGTGATGAGGTTGAAGGTGGTGTATTCTGTTCATCATGATTTGCCAGTGAAGCGTCATTTTTTGATGATCAAGGTTTTTTCACAATTTCAGACTTGTTGCTACCTTTTAAGTACTGAGACAGTGTCCTCTCTTTCTTTCTACAAGAACTTGTGGCGATTATGACGTCCAGACAAATCCATTTACGCACCAGAAAATGCCATGCTCTCTCTCTCTCTCACACTCTCTTTATTTTCCTTTACCTTTCTTTCCTTTCATCATAATATCTCTGTTGAGTTACTCCTTTTGAGAAAGCATTATCTTTCTTTCTTTCTCTCCTCCGATCTTGACACTGCACAAGGAGCAGTAAATTTAATCTGCTTCATGATGGTGATCACTTTTCTTTAGTCATATCTGTTTGGTAGCAGTAGTGGTTAACGGTGTTTGTGTTTTAATTTCATTTTCATGGTTTCCGTTCCAGTCATGTCATTTTCATCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTCTTTCCTCCTCGATCACTATGAGCTACAATGTCTATCTTTTTTCATCTTACCTTGCAGTGTCAGCCAAAAAGTGAATGGAGACATTGTGAGAGTGCTAACTTTTAAATTTGCCATGTCAGTTCCTCAGCTTCCTGCTAACATGTAGTATTCAATATGCTAGCTGCGCTCGCTTGCTCTCTCTCATAATGAAAGAGAAAGAAAACATTACTTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCAACCTCACCAACCAATTTGTTTTCTTATTGCAATGCTGGTGCTTGGAACCACCTTTCCATTGAATGTGATAGCTTCAATTCTCTAACATATATATAAATACTTTAACATCGACAAGTGTGAAGCTCTGATATTAATTCGGTTATGGCGATGGTCCAAACAATTATGTACGAAACAATTTAAAACATTGAGAATTCCAATTCATCTGATTTACCCTTTTTCATTTCCCTTGTGTTTGTATATGAGAGACGCATTAAGATTACATATTCAGCTTACTTAGTTTCTAGGGAATGCCCAGTGAAATTGAAAGTGATGATATTTGTTTGCTTTTCCATCCGAAAATGGGTTTTGGCAGGTCAGTGTTCCATGCAGCAGTATGCTCACCATTGTTACGGTTAGATGTGGACACTGTGCCAATCTGCTATCAGTTAACATGGGAGCATCACTTCAACCTTTTCCTTCTCAAGAAACTCAGGTATGATTTCAAACCCTCCTGCATCTTTCATTATCATTTCAATCTTCTTCATTTTGCACTCTTTTTGCTGAGTAACTTCTGGACTTCATACTTTTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCGCTTAGCATCTTTCTACCGTTGCTAAGTTACAGAGACAGCACCTGAGCGTTCAAGAAGCATGCAGCAAGGAACTGGGATCATCTTCAAAATGCAAATCATTTGAGTCCGTAGACCATGAGCAACCTAGGATTCCTCCAATTCGTCGTGAGTCACGCTCGTTAATTCTTGTTTAGTTTTTGGCATACATATAACTACAAGTTAATTTGAATGAAGAACACGGATCCTATAGCCATAGGCCAGCCTGAACTTTTCCGTTATACTCTGAGAAGGTATGAGAACACAATGATTCAAACTACGTTATTCCACGACTGGCACATGTTAATTAATGAAACCAAGCAGAACAATATGTGCCATCATTGAGGCCACATTGTTAAACTCAGTTTTTTCATGAGAGTGGGCGTCCATCTTTCTGAGTATCAAGTTTTTTGTGGTACAAAGATACCCAATTTGGCCTATATTTTCTTCATCTCTATTTAAGTGTCCCCAACCAGATGGTGACCTTTCGCAACAAATTGACCCATCCTTAATTGAATGCAATCATGTTGTGCCCTAGCTACATACTACACGTACTACTATGAAAATTCATTCTCCATCTTACAGTAAATACTTCTTTCTAGTGATGTTTATTATAATCACTTAATTAATCAACCAGGTATGTGACTTAATACAAATTTAACACACACACACACACACCTATTGATTTGATTAATCATAATTAAACTGAGCCTTGGTAACAATTTTTACCTCGTCCTACGTACCTGATGATGATATAATTGATATTGATAGTGGTACTTCAGTAAGAAACTTTTTGGAGAATTGAATTTGCCACTGCGCCAGTTTGTCCAACTATGGGGCCAGCTCTTGTTAAAAGTTACCAGATTTTGGTTCTTAGAATATCTCATTTAGTGTTAACTATAATATTTAATTGCTAATCTGTGGTGAATATGTATTTAATTACAGTCTATGCAATTTTTTTGAGTATGATAAACTAAATTAATTCATTATCAATACAGCTCCAGAGAAGAGACAGCGTGTTCCTTCGGCTTATAACCGGTTCATTAAGTAAGTGATCTATCAATTACAATGAACTATTCCTTACATTTCACATCTTCTCTTGTATCTATACTTATATTTCGTATATAGAAATTGGTTAATGTTTAAAATTAAAAGAAAAATAGTTGAATGGAAATGAGAATGACGATTCATTATTCAAATGATTGGTTAGTGATGGACATTTGGACGAAATCACATAAATACATACATTTGTGAATAAATTACATATAGTATTATGAAGAGTTATATACACATGTAAATTCTTATGACTAATAAAATTTTAGAGAATGTTTTTACATAACGATAATAAAAAAAACTTGGACCCTAATAACCAGAACAACATGAATGATATAGCCGGTTTTAAAACACTGTCACTGTGCAATATCTGACATATATTTCTATCTTTTTCCTTTTCATTTATCTTTAAAGATACCCTACAAATAAATAAAAAAAAGTGGTATATATATTAAATTATTCTTTTAAACTTCTTAATATTCACTATTTTTTTTTCCTTTATGATAAACATGTAAGATATTGGGAATCAGGTAAAACTAAGTGCATCTTTTAAAGTAATAATTTTTTTTATCAACTTTTTAAAACAAAGGTACGAAAATTTCTTAAAAATGGAAATATAAAGAAACTGAAGGGAGAAACTTCATTTTTTAAAAAAATGTTATGGTTTAACAATCAGTGCATGCCATTGTTTTATAGCTCAAGAAAAATGAAAAAAAAATACTATGCATGTAGGGAAAGAGAAATTTAACAAGTTATACTTTTAAATTTGTTAAACTATCTTTTTTTCTTTTAAAAAAAAGTTGAAATTGTATTAATACATCATATATCCTATTATTTTCTTAAAAAAATATTTATATAGGAAATTATAACTTGAATTTGTTAAATTACTTAAAGTTATATATAATCAGCTATATAACATTTTTTTTCAAAATATTTACAATCACATCATATAAACCACAATATTTACATATATGTGTGCATTAGATATGTACTAGTGATGGTTTTCATAACATTGTGGTTGTTCCCTTGAATACAAGTGCAATATATATGTAGATATATAAATAACTCTTATTGCAGAGAGGAAATACAAAGAATTAAGGCCAGTAATCCAGATATCAGCCACAGAGAAGCTTTTAGCACGGCTGCAAAAAACGTGAGTTTGAGCTTTATCACTATTTTCCTTTTCTATTTTTGCATATGCATTCTGGTATATGAATGCACGCAAGTTTTGTTTCTGTTCTTTCCCTCTCACATGTGATGATTGCACAATAAAAAATGAGTTTGTCGTTTACGTTAACATGGTGAAGATTGAAACCCAATGCCCTCTCAATTATTGTAGAAACATTACCAATAAAGCCAATGCCTTCTTTCTCTTTGTGGCTATTGCTTTGTATCAAACTTTTCTGTAGTAATGGCATATGATCATGTCCTTCCACTGCTTCATACAACGAGGGTTGCTCTTGTTTAAACAATTAATACACTGATAAATTCGAACATGCATGTAGAGCTCAGAAAATAGTTTGTTGAGAAAGACCAAATGACAAATAAAGAAACTGTTGCTACATAAATAA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