Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24534 LG6 8814794 8816467 PREDICTED: putative dehydration-responsive element-binding protein 2H
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 8814858 3_prime_UTR_variant
T/A 8814917 3_prime_UTR_variant
A/G 8815066 synonymous_variant p.Ser162Ser
A/G 8815697 intron_variant
A/T 8815833 intron_variant
G/A 8815896 downstream_gene_variant
C/G 8816118 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24534.1
MHMLAKAHSKGDGTKSLAKILAKWKEYNAQLDSCDDADKPVRKVPAKGSKKGCMKGKGGPENSRCNYRGVRQRTWGKWVAEIREPNRGNRLWLGTFPTAIGAALAYDEAARAMYGSCARLNFPNVSVSSFSEESSKDSPLANHSGSSKAVSANESMVSLSNSKGGGAEEDVDMEPISLSLSVKHENGEGESGISSSPPSSS*


CDS Sequence:
>Vu_24534.1
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Promoter Sequence:
>Vu_24534::LG6:8816467-8818467(-)
CTGTAGTTCCAACTAAAAAAATCAGAAACACTCGCCCAACCCTAATCCACCTTCCTTACTTATCCAATTTATTTATCTCTCATCTCCATACTCTCTCTCTCACCCACACAATTCCAATTGAAGTGAAATCTTTCAAATAAATCAATGCAATTAGGAGGATTCAATGAAAGGACATCAATTGAAATCCTGAATTTTCGAATTGAGAGAAATCAAGAATTCTCGCTATTTCTTAGATTCATGGATAGGTTGGGGCAACAATATCATAAAAAATACTTAAAAAAAGAACTAAAATACTGACAATTTGAAACGAAATATAGTTCCAGATTCATGTACTCTTCTTGTACTAACTTTTTTGTACTAGATTCAATTAAATTGGAACAAAATCTTTCATCATTTTTTGAATTCTTCCTTTTTATCATAATTATTTTCATATTTTTCTTAGATTCGAATCCAAAAAGAGATATAAGTTAATTAAAAGCAACCCGCGACATCGCAATTTGTTGCTATTGCTCTGTTCGTTCATTTTTTTTCACTTCAATAACAAAATAATTTTGTGTGTGGGTGAGAGAGAGTACGGAGATGAGAGATAAACAAATTTGATAAGTGAAGAAGGTGGATTAAGGTTAGACGAGTGTTTCGGATTGGAGTGAGAGAGATAAAAGAGAAGGAGTTGAGAGAAATAAGGGAGGTGAGTAAGAGTTTGAGGGTTTCTTGAATTTTTTTTTAGTTTTGAGAATAAAGATTATTCAAATACCCCTAACCTTAAAGCTTAGAATCAATAATATATGAGAGTATTTTTGTCTACTAAAACTCGATACACATTGCTAAAATGTAACAACTAAAAAAAGAGCGTTAACAAATTAGCAAACCCATATATATATTCGACGTGAAAGGCCAAAAATATTCGACGTGATACGTTGTTTTTGTACTAGTGGACTTTTAAATTCGACGTCAAAAGGTTAGTGCATTCAATAAAAATTTGAGCGGAAGATTGAAAATTCATTCACTTTATCTTAGTGCGCGATACTCTCTTCTCAAACTTTTCTCAAACGAAGTTTGACGAGCATCACATGTAATCTTTCTTTCATTTGATATTAATGCATGTTAATTAATTACTTTATGTATGATTTTTGTTTGTTTTAACCGATTATTTTCGTGCTTTTGTCCTTCATAGGCGCATTCTGTTTTCTCTCACACTGTGACAAAACTTTATTCCGACGAATCCACTTTTTGAAGGTTAGTTTTCGTTTTGGAGAACTTATTTGTAGAACTTGTTTGTTGTTTTTTTGTTAAACTTGTTTATTGTTGTTGTTTAGTTGAACTTGTTTGTTGTTGGTTATTATTGTTTGTTGTGATACTATACTATACGTTCATAGTTCATGCTTTATAAAATACCAAACATTGTGTGTTGTTTTTTTTCTTTTCAGGTCTTGTAAAGTTGTAAAAATGGATCACAATTAATTAAAAAAAATAAAAAAATTTGATTAACGTCAAATATTAACAAAATTCGACGCGTCAAACTTTTTAAATTCGACATAAATTTAACGTCTTTTAATATGACGTCGTTCGCGAATTCTCCTATGACGTCGTGCGAATTCGTCGTTTAAACGAGAGATTGGTAGTATTGTTGAGAAATTTAACATGAGAACAAAAAATCATAATAAATTTTTTCAACCGAATTTAAAATATAAAATAAAAAGTATAATACAATTTATTTACAATAAAATATAAGAGTCTGAAATATGTTAAACCCACATGTACAAAAATAAAATTAGTTTGATTTATATTAAGTTTAACTTAATCATTAATAAAAGCTAACCTAATTTAATTAGGTTAAATTTGGTGGGAGTGGATGAGGAATTCATTGAAGGTCGTAGTGTTTGACTAAAATGTAAATATGGCAGAAATTAAAAACAATTAGAATGTTAAAATGAAAGATAAGCAAAAGACAACAGTAACACTGCAATTAAAGAGTGATGGAAGTAATATTAATTTTCTTT


Gene Sequence:
>Vu_24534(-)
ATTGCCACATTTATTATTGATTACCTTCTTTGTTTGTTAGCATATTCTTGAAAATGATGACCAAAGCGAAGCGGCTGGTGAACCCTAATTAGTTGTCGGTGTTTGTTGGCAGAGCTCGTCTCTGTTTTCTTCGTCATCTCCCATCCTCGGCCAGAGATGCGCCGAACACACTAAAGCTTTCGACTTTCCGACACCCTCTCAGGTTTTACCTCTTTCATCTTTTTTTTTTTCTTGTTTTTTCCTTCTCAAAGGGCTTTTATTTTCTCTGGTATTTTTTTTTAGTCTGCCCCTAAGTTTTTCTTATTCCCAATTGTACTGATGAACCGAGGAAGGGGACTGATCACTTGCTGACATTTGCATTAGATATTGTTTGGATAATTTTCGTAGTAATTGTATTGGTGATTGTAGAGTTGGGTTAGCACAAATATGTGTAGAGTGGTGTGATGTTTGCTATGTTATTGAAGGGACAGTGGAATGATAAGCATGTTAAATGGGGTTATTTGTTTCAGTTTCTCATCGGAGATATGTTACAATTTGAGTTACAGCGAGTGAGCACTTGAATTTTTATTACCTGTGTGTTTGGGTTCACATTAAGTTATCTAGAAGCACGTTGAAGTACCAGCTAAATGCCTTGTTGTTTGATTGCACACTGAATATTTGATCTTGAGTTCAAGCAACTTTATGGAGCTTTGATAAAAATAATTTATACAAAGTTTTACCATTGCTTTAAGAATAAAAACATCCACACGTGAATCACATCCTCTTTTCTTTCAAAACCAGTTTTGCAAAATAATTACTCAAGCACACATAAGCTTGAAGACTTGTTTTCTTGACAGGTGTTTGATTAAGTGTTGCTATGTTATAATGTTAACATTGTAGGTTTTTCCTGTTCATTACATAGTGCAACTTGAATTGGATGCACATGTTAGCGAAAGCACATAGTAAGGGGGATGGAACCAAGTCCCTGGCTAAGATACTGGCGAAATGGAAAGAATATAATGCCCAGCTTGATTCCTGTGATGATGCGGATAAACCAGTTCGCAAAGTTCCTGCCAAGGGATCAAAAAAAGGGTGTATGAAAGGTAAAGGTGGGCCTGAGAACTCGCGGTGTAATTACAGAGGTGTTAGGCAGAGGACTTGGGGAAAGTGGGTTGCTGAAATCAGAGAGCCGAACAGAGGGAATAGGCTCTGGCTAGGTACTTTTCCCACTGCCATTGGAGCTGCCCTTGCATATGATGAAGCAGCGAGGGCAATGTATGGATCCTGTGCCCGTCTTAACTTTCCCAATGTTTCTGTTTCCAGTTTCTCTGAGGAATCCTCCAAAGATTCTCCATTGGCGAATCATTCTGGTTCCTCAAAGGCAGTGTCTGCAAATGAATCCATGGTTTCACTTAGTAACTCTAAGGGGGGAGGAGCAGAAGAGGATGTCGATATGGAGCCCATTTCCTTATCCTTAAGTGTAAAACACGAGAACGGTGAAGGTGAATCAGGGATAAGTTCATCTCCTCCTTCTTCTTCATAGTGTACATTTGAACATGGCTAAAATTCTTAGCTCATGTACTTGTTAATGGTAGCTTAGGTTTAATGAATCCTGATATGTGGTCCCTGGAGATTAACTGCTGTAAAACTAAAATGAACTTGGTTGCAAAATGGTCATTCTTCTGATTTTGGCCC