Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24530 LG6 8768792 8772520 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 8769028 synonymous_variant p.Val79Val
G/T 8769378 missense_variant p.Arg196Leu
G/T 8769593 stop_gained p.Glu268*
T/A 8769822 missense_variant p.Phe344Tyr
C/T 8769932 stop_gained p.Gln381*
T/A 8770012 synonymous_variant p.Ser407Ser
G/T 8770611 missense_variant p.Arg557Met
G/C 8770703 intron_variant
G/T 8771212 intron_variant
T/A 8771703 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24530.1
MRSEEIVLSFSFLLLWLPICFDICLGGDALKANQNITQDSQGNLVSSNATFELGFFSPAEKSGGKYLGIWYHALEPQTVVWVANRDHPVPDSGGVFRIAEDGNLVVEYAFRSLWSSELGASSSSNRTLQLLDSGNLVLKEDDSEATYLWESFQNPTDTFLPGMKMDATLSLTCWRDSSNPAPGNFTFKLTQKAETRSFVVQYQSQIHLALDEYDTEAASQKVFNLLNNDIWSAKTYNYSNKTLFVSKPYVYYKSRLLMNSSGEIVFLEWDEAESNWTKIWSAPENNCDLPDYCGSFSLCNRDNFIQCKCLPGFSRIHDSRSDGESESKGCVRKSGSCTNKDVMFLNLTKIKVGDPDQQIYAQTEAECQSICIDMCPESQCQAYSFNISTNRDDNLYSCRIWTRPLPSLVEKYARGSDLSILVKTSDIAPTAKSCEPCGTYVIPYPLSTGPNCGDPMYNKFNCDNSTGKVSFMIPGRISYPVTWIDEDSRMFAIQTDDFYSFNYSFSSQNSTDFPFKVAQYNEDAVIKISWLPAPEPPCSQRTDCISWPNSTCRATGEGGSREEQSGNHSTRLELILLATLGSLAAVTCIIAFGFVWRKKKPRKHDRASTRIQESLYESERHVKASTGRVMGTYGYMAPEYALDGLFSVKSDVFSFGVVLLEILSGKKNTGFYESKQISSLLGYAWNLWSENKILDLMDSSLGETCNENQFFKCAVVGLLCIQDEPSNRPTMSNVLYMLDVETTTMPIPTQPTFFMNKRYSSSASSSSKPETSLQFESGYEQGR*


CDS Sequence:
>Vu_24530.1
ATGAGAAGTGAAGAGATTGTGTTGTCTTTCTCCTTTCTTCTTCTCTGGCTGCCGATATGCTTCGATATATGTTTGGGTGGAGATGCTCTGAAGGCTAACCAGAACATAACTCAGGACTCCCAAGGAAACCTTGTTTCATCTAACGCCACATTTGAGCTGGGCTTTTTTTCTCCTGCTGAGAAAAGTGGAGGGAAATACCTGGGGATTTGGTATCACGCCTTGGAACCACAAACAGTCGTGTGGGTTGCCAACAGAGATCATCCTGTTCCAGATTCCGGTGGAGTTTTTCGAATTGCGGAGGATGGAAATCTGGTGGTAGAATATGCATTCAGAAGCCTCTGGTCTTCTGAACTTGGAGCATCCTCGTCCTCTAACAGAACACTGCAGCTCCTAGATTCTGGGAATCTAGTACTAAAAGAGGATGACTCTGAAGCGACATACCTGTGGGAAAGCTTCCAGAACCCAACAGACACGTTTCTTCCCGGCATGAAAATGGATGCGACTTTGTCGTTGACTTGTTGGAGAGACTCCTCTAACCCAGCACCTGGGAACTTCACCTTCAAGCTGACTCAAAAGGCTGAGACACGGAGCTTCGTTGTGCAATATCAATCACAAATCCACTTGGCACTTGATGAATATGACACAGAAGCGGCTTCCCAGAAGGTATTTAATTTGTTGAACAACGACATCTGGAGTGCTAAAACGTATAATTATTCTAACAAAACACTATTCGTATCAAAACCTTATGTGTACTATAAATCAAGGCTTTTGATGAATTCTAGCGGGGAGATAGTGTTTCTGGAGTGGGATGAGGCAGAATCAAATTGGACTAAGATATGGTCGGCGCCAGAGAACAACTGTGACCTACCTGACTATTGTGGGAGCTTCAGCCTATGTAACAGAGATAACTTCATTCAGTGCAAATGTTTGCCAGGATTCAGTCGTATTCATGATTCTCGTTCTGATGGAGAATCCGAGTCCAAAGGATGTGTGAGAAAATCAGGATCGTGTACCAACAAGGACGTGATGTTCCTGAACTTAACCAAGATAAAAGTGGGCGACCCAGACCAACAAATTTATGCTCAAACAGAAGCAGAATGCCAATCCATCTGCATCGACATGTGTCCCGAATCACAGTGCCAAGCCTATTCATTTAATATTTCGACCAATCGCGACGATAATTTATACTCGTGCAGAATCTGGACGCGGCCTTTACCTTCTCTTGTTGAGAAGTACGCGCGCGGTAGTGATCTTTCTATCTTGGTTAAAACATCAGATATAGCACCAACTGCTAAATCGTGTGAACCTTGCGGCACATATGTCATTCCCTATCCGCTGAGCACTGGACCAAACTGTGGAGACCCCATGTACAACAAGTTCAATTGCGACAATTCCACTGGCAAAGTTAGTTTTATGATTCCCGGACGTATATCATACCCAGTAACTTGGATCGATGAAGATTCCAGAATGTTTGCCATTCAAACAGACGATTTCTATTCCTTCAATTACAGTTTCAGCAGTCAGAATAGCACTGATTTTCCGTTTAAGGTAGCTCAGTACAATGAAGATGCCGTAATAAAAATCAGTTGGTTACCAGCGCCAGAACCCCCCTGTAGTCAGCGTACAGACTGCATTAGTTGGCCAAATTCAACATGCAGAGCAACAGGGGAAGGTGGAAGTAGAGAAGAGCAATCAGGAAATCACTCAACTCGACTAGAACTGATTCTTTTAGCAACTCTTGGTTCCCTGGCTGCTGTGACATGCATAATAGCTTTTGGCTTCGTGTGGAGAAAGAAAAAGCCCCGTAAACATGACCGAGCAAGCACCCGAATTCAGGAGAGCTTGTATGAGAGTGAAAGACATGTGAAAGCAAGTACAGGGAGAGTGATGGGAACCTATGGATACATGGCTCCAGAGTACGCTTTGGATGGACTTTTTTCAGTGAAATCTGATGTTTTCAGTTTTGGAGTGGTCCTACTGGAGATTCTTAGTGGAAAAAAGAACACAGGATTCTATGAGTCCAAACAAATTTCTAGCCTTTTGGGTTATGCATGGAATTTATGGTCAGAGAACAAGATACTGGATTTAATGGATTCTAGTCTTGGTGAAACATGCAACGAAAATCAATTTTTCAAATGTGCAGTTGTTGGATTATTATGCATACAAGATGAACCAAGTAATCGACCCACTATGTCAAATGTTTTGTACATGCTTGACGTAGAGACAACAACCATGCCAATTCCCACGCAGCCAACATTTTTTATGAACAAGCGTTATTCAAGTTCAGCTTCTTCTTCTAGTAAACCAGAAACAAGTCTGCAATTTGAGAGCGGTTACGAGCAAGGTCGATAG


Promoter Sequence:
>Vu_24530::LG6:8766792-8768792(+)
TCGTAATAAGATTTTCAAAACTAATTCAAGATATGAAATAAAACAATATATCACAATTTTTTTCATAATACAAGTATAAGAGAAAATATTAATTTAGGTGTCAAATCATCATATTAATTAAATCCATCATCTAATCCATACAAGAGTGAATTAGTTAGTTAGAATTGTATTAGATTTAACTAAATAATATATGAAAACAAATCCAATTTAAATGGGTTAAATTGGGTCATTGGATAACCCAACCCAATGAACATTCACATTTTAAGAAATATAAGAGATAGTGCATTAATAGTTATAAGTGATTCGTGAAAGCGCTCTATAAATATGATAACTTCGTCATTCATCTTATTTTCAACCAAAGCATTAAGAAACTCTTGTTATATTAAGTTAACATTAATATTATCTTTAATTTTATATTAAACACCGATAACTTTTTAGCAAGTATACGAAATCATTTAAATAATACAGGAAATTAAGTTAAAAGTATAGTTCTCCCAAAAGAATTGGAGTCAAGTTTATTCAATTAAGACTATTTATCAAAATCTAACATCCTGGACAAAATACTTTATCTGTTCAAGCATTCACATAAGCGTATCTTGATTTAAGTAATTCCTTAAAACAAGTTCTAAAATTATCCATTAAATTATTAATTCCTTAATTAATTCAACAGATAATTTTGCATTAAATTCAGATGACCAAAAACACAGAAGTTATTTCTAGCATACCTTTTCTTACGTTTCTGTTGTAAAAAATACTTTCCAAAAGAAAGTTTAAAAATAATTATACTTCCGTATAATCATAAGCAAGTCAAGAAAAGAACAAGAACATAGACATATATTACACAGGAAATTTACATGAATGTATTGTCATACGACTAATTCTAATGAACATAAAAACCAGCCTCTCCTAGACATCTAGAACGTACTTACAGCAATTCCTTGCAGAAGTGAAGTCTTGATGCCTTGAAGTGTCTCATGAGCGTCTCCTGAAGTTCTCAAGTATTTTTCTCCTTTTGTTTGTGTGTCAGAAGATCGTTTTTGTCTTTCTGTCACGTCTTTTTAAGCCATTTAACTTCATTAATTCGCTTCGCACACATATGTGTATGCGCTGTGCGAATTTTCTTAACTACTGCACTTCAACTAATGCTATTCGCACAACGCTTAGCGAGAATTGGCTGACAACAGTCCAAATAATACAACCTTTCATGTACAATGTTTTACATAACATCTACTTCCTATTTCCTATTACAACTTTCACTGAGTAATAACATGAATAATTACCATATTAAGTTTATTTATAAGTGTAAAAACAACTCTTTTTCACCCTTATCAAACACACAATATTTTTTCAATACATAGACATATAAGTAAGCAAAATTAAAAGATAAAAATAAGATAAATCATCCAATTAACGAAAAAATAATACAGTAATAACTTAATAAAAAAAATATAAAATTTTTAATTAGTCAATAGATTAAAAATATTAATAAAAATTGAATTGAAAATAATTAATTTTTACCGGGGTCTCGATACTCAATTAAACACATATTTAAATTTACATATCATTTCTAGTAAATGGGATTAAATATAATTATAAATATATATAATTTTATAAAAACAAGAATATTAAATAAACTTATTAAGATGCTAAATGAGTGTAAAATTAAAAGAAAAATGGTTTATATTAAAATTGACTAGTAATAGTTACTGTAACTACAGATGTGTGTCTTCTCTCCCCTTACGTAAGATTTTTCTTTGACTAGTGATGATTGCCTTAGAATATCTTTGTTGGGCATGCCGAGTGAGACTTAAACATGACTGGTAAATTGTAGCTCGTTGAAAGATCAACAAATTCTATTTTTTATTTTTTATTTTTCTGAGAAAGAAGATGAACAATTAAGAAATTAACGAGAGGTTGAAATAGTAGTTGATTTTATAGCATTTGGTGTCAAAATTTTGGGAAGAAGGATCACTTAGATCGTAGAAGGCTTGTTATAGCAA


Gene Sequence:
>Vu_24530(+)
ATGAGAAGTGAAGAGATTGTGTTGTCTTTCTCCTTTCTTCTTCTCTGGCTGCCGATATGCTTCGATATATGTTTGGGTGGAGATGCTCTGAAGGCTAACCAGAACATAACTCAGGACTCCCAAGGAAACCTTGTTTCATCTAACGCCACATTTGAGCTGGGCTTTTTTTCTCCTGCTGAGAAAAGTGGAGGGAAATACCTGGGGATTTGGTATCACGCCTTGGAACCACAAACAGTCGTGTGGGTTGCCAACAGAGATCATCCTGTTCCAGATTCCGGTGGAGTTTTTCGAATTGCGGAGGATGGAAATCTGGTGGTAGAATATGCATTCAGAAGCCTCTGGTCTTCTGAACTTGGAGCATCCTCGTCCTCTAACAGAACACTGCAGCTCCTAGATTCTGGGAATCTAGTACTAAAAGAGGATGACTCTGAAGCGACATACCTGTGGGAAAGCTTCCAGAACCCAACAGACACGTTTCTTCCCGGCATGAAAATGGATGCGACTTTGTCGTTGACTTGTTGGAGAGACTCCTCTAACCCAGCACCTGGGAACTTCACCTTCAAGCTGACTCAAAAGGCTGAGACACGGAGCTTCGTTGTGCAATATCAATCACAAATCCACTTGGCACTTGATGAATATGACACAGAAGCGGCTTCCCAGAAGGTATTTAATTTGTTGAACAACGACATCTGGAGTGCTAAAACGTATAATTATTCTAACAAAACACTATTCGTATCAAAACCTTATGTGTACTATAAATCAAGGCTTTTGATGAATTCTAGCGGGGAGATAGTGTTTCTGGAGTGGGATGAGGCAGAATCAAATTGGACTAAGATATGGTCGGCGCCAGAGAACAACTGTGACCTACCTGACTATTGTGGGAGCTTCAGCCTATGTAACAGAGATAACTTCATTCAGTGCAAATGTTTGCCAGGATTCAGTCGTATTCATGATTCTCGTTCTGATGGAGAATCCGAGTCCAAAGGATGTGTGAGAAAATCAGGATCGTGTACCAACAAGGACGTGATGTTCCTGAACTTAACCAAGATAAAAGTGGGCGACCCAGACCAACAAATTTATGCTCAAACAGAAGCAGAATGCCAATCCATCTGCATCGACATGTGTCCCGAATCACAGTGCCAAGCCTATTCATTTAATATTTCGACCAATCGCGACGATAATTTATACTCGTGCAGAATCTGGACGCGGCCTTTACCTTCTCTTGTTGAGAAGTACGCGCGCGGTAGTGATCTTTCTATCTTGGTTAAAACATCAGATATAGGTAATTTATATATTGTTAATTCGAATAGTTGAAAGTTCTAGATGATATTCATAGGTCATATTGTATTGACTCATCAGTTTAAGGGATGGATTGAAAGGTAAACTATGGAACATGATTTATGGCTGAATTATTAATTGTTGTTGTGTAGCACCAACTGCTAAATCGTGTGAACCTTGCGGCACATATGTCATTCCCTATCCGCTGAGCACTGGACCAAACTGTGGAGACCCCATGTACAACAAGTTCAATTGCGACAATTCCACTGGCAAAGTTAGTTTTATGATTCCCGGACGTATATCATACCCAGTAACTTGGATCGATGAAGATTCCAGAATGTTTGCCATTCAAACAGACGATTTCTATTCCTTCAATTACAGTTTCAGCAGTCAGAATAGCACTGATTTTCCGTTTAAGGTAGCTCAGTACAATGAAGATGCCGTAATAAAAATCAGTTGGTTACCAGCGCCAGAACCCCCCTGTAGTCAGCGTACAGACTGCATTAGTTGGCCAAATTCAACATGCAGAGCAACAGGGGAAGGTGGAAGTAGGTGCCTTTGTAATTCAAACTATAAATGGAATAACACATTAATGAGCTGCACCCAAGGTTAGGATTTTGTTATAATCCTCTCGACTTTTCTATTTTTCTCCTTTAATACCCAAAAAATATTGCCAGATTAAAATGATTATAATGGTGTTTGCCCTCATACTTTCTGCATATTTTTTTTCCTTTCTGCGAGAGAAGAGCAATCAGGAAATCACTCAACTCGACTAGAACTGATTCTTTTAGCAACTCTTGGTTCCCTGGCTGCTGTGACATGCATAATAGCTTTTGGCTTCGTGTGGAGAAAGAAAAAGCCCCGTAAACATGGTAATAATATGAAGTTTTGCATGTTGAATTAAAAATCTTTTATCTTCACACAGATAATGAAATGCTATTGATCTGTTGGTACGGAGTTCAGACCGAGCAAGCACCCGAATTCAGGAGAGCTTGTATGAGAGTGAAAGACATGTGAAAGGTTTGATTGGCTTAGGAAGTTTAGAAGAAAAAGACATCGAAGGCATTGAAGTTCCCTTTTACACTTTTGCAAGCATTCTCGCAGCTACAGATAGTTTCTCGGATTCTAACAAGCTTGGAAGAGGAGGTTATGGACCTGTTTATAAGGTGATTTGTTCAGTTCATCAAACTTTATTACCTACCTTGCATTGAATCCTTGCAAAATCTTCTCATGATATAATGTATGGAAACCTTTTATCCAGGGAACGTTTCCTGGAGGTCAAGAAATAGCTGTAAAGAGACTTTCAAGTGTTTCCACTCAAGGCCTGCAAGAATTCAAAAATGAGGTTATTTTGATTGCCAAACTTCAACATCGGAACCTTGTTAGACTGAGGGGCTACTGCATAAAAGGGGATGAAAAAATCTTACTTTATGAATACATGCCAAATAAGAGTTTGGACTCATTTATATTTGGTGAGACTCCATATTCCATCATACAACCTATTCTCTAATTATTACAATCATAACTTCGCTAACCTCGTTCTTGATTTGAAATGTGAAATGCATACGTTGAAAGACCGTAGTCGAACTATACTGTTGGATTGGCCGATGCGGTTTGAGATAATAGTAGGCATTGCACGAGGCATGCTATACCTTCATCAAGACTCTAGATTGAGAGTGATTCATAGAGACATGAAAACCAGCAACGTTCTCTTAGACGAGGAAATGAATCCAAAGATATCTGACTTTGGTCTTGCCAAAATATTTGGAGGAAAAGAAACTGAAGCAAGTACAGGGAGAGTGATGGGAACCTAGTAAGTTCACCATGTACTCTGACATTGTTATTTTTCTGAATATGATGTTCCATACATTCTTGCTACACATAAAAATTTTTATTGTTTTTTTCTTGAAGTGGATACATGGCTCCAGAGTACGCTTTGGATGGACTTTTTTCAGTGAAATCTGATGTTTTCAGTTTTGGAGTGGTCCTACTGGAGATTCTTAGTGGAAAAAAGAACACAGGATTCTATGAGTCCAAACAAATTTCTAGCCTTTTGGGTTATGTATGTTTATTGTGTTGCTGTCTTGTGTTGTTTTTGTGACTTATATTGATTTCTGATTCATTTTTTCTTGACATTATATTTATCAGGCATGGAATTTATGGTCAGAGAACAAGATACTGGATTTAATGGATTCTAGTCTTGGTGAAACATGCAACGAAAATCAATTTTTCAAATGTGCAGTTGTTGGATTATTATGCATACAAGATGAACCAAGTAATCGACCCACTATGTCAAATGTTTTGTACATGCTTGACGTAGAGACAACAACCATGCCAATTCCCACGCAGCCAACATTTTTTATGAACAAGCGTTATTCAAGTTCAGCTTCTTCTTCTAGTAAACCAGAAACAAGTCTGCAATTTGAGAGCGGTTACGAGCAAGGTCGATAG