Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24529 LG6 8753708 8757461 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 8753956 synonymous_variant p.Asp83Asp
G/A 8754145 stop_gained p.Trp146*
A/T 8754189 missense_variant p.Lys161Ile
A/G 8754233 missense_variant p.Asn176Asp
T/C 8754584 missense_variant p.Phe293Leu
C/T 8754586 synonymous_variant p.Phe293Phe
A/T 8754681 missense_variant p.Gln325Leu
A/G 8754710 missense_variant p.Thr335Ala
T/C 8755190 synonymous_variant p.Pro444Pro
A/T 8755191 stop_gained p.Lys445*
A/T 8755340 missense_variant p.Lys494Asn
C/T 8755458 missense_variant p.Pro534Ser
C/A 8755460 synonymous_variant p.Pro534Pro
G/T 8755463 synonymous_variant p.Leu535Leu
A/C 8755465 stop_lost p.Ter536Serext*?
A/G 8755548 missense_variant p.Lys564Glu
A/T 8755549 missense_variant p.Lys564Ile
G/A 8755588 missense_variant&splice_region_variant p.Arg577Lys
G/A 8756159 intron_variant
A/G 8756877 intron_variant
T/A 8756884 intron_variant
T/A 8756887 intron_variant
C/T 8757122 intron_variant
T/C 8757296 synonymous_variant p.Pro813Pro

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24529.1
MRSEEVVLSFSFLLLCLPICLGGDTLKANQSITHHHSNGNLVSSNATFELGFFSPAEKSGGKYLGIWYHGLEPQTVVWVANRDHPVPDSTGVFRIAEDGNLVVEYAFRSLWSSGLGASSSSNRTLQLLDSGNLVLKEDDSEATYLWESFKNPTDTFLPGMKMDATMSLTCWKDSANPAPGNFTFKLTQQAEKRSFVVQYHSKIHWAPDEFDTEAASQVVFNLLNNDIWSTKTYNYSNKTVFVSQPYMYYKSRLLMNSRGEIVFLEWDEAESNWTKIWSGPENKCDIPDYCGSFGLCNKDNFIQCRCLPGFSSIQGFPSDRESESQGCARKSTTCTSTNEGVMFLNLTNIKVADPDEEINTETEGKCQSMCINMCPQSQCQAYSFNSTTYGDRGSYSCNIWKRPLSSLVENYLRGHDLSIMVKKSDIAPTAKSCEPCGTYAIPYPLSNGSNCGDPMYNYFNCNKSTGKVSFMIPGGIPYPVTWIDEDSRMFSIQTNYFNSFNYSFSSQNSTDFPFKVQYNEDAVIKINWLPAPEPPCSQLTDCMNWPHSTCRATREGGSRCHCDSNYNWNNTLMSCTQEEQSGNHSTRLELILLATLGSLAAVTCIIAFGIVWRKKKSLKHDRASSQIQESLYESERHVKDRSRTILLDWPMRFEIIVGIARGMLYLHQDSRLRVIHRDMKTSNVLLDEEMNPKISDFGLAKIFGGKETEASTGRVMGTYGYMAPEYALDGLFSVKSDVFSFGVVLLEILSGKKNTGFYESKQISSLLGYAWNLWSENKILDLMDSSLGETCNENQFFKCAVVGLLCIQDEPSNRPTMSNVLYMLDVETTTMPIPTQPTFFMNKRYSSSASSSSKPETSLQFDSSYEQGR*


CDS Sequence:
>Vu_24529.1
ATGAGAAGTGAAGAGGTTGTGTTGTCCTTCTCCTTTCTTCTTCTTTGCCTGCCAATATGTTTGGGTGGAGATACTCTAAAGGCAAACCAGAGCATAACTCATCACCACTCCAATGGAAACCTTGTTTCATCAAACGCCACATTTGAGCTGGGCTTCTTTTCTCCTGCTGAAAAAAGTGGAGGGAAATACCTGGGGATTTGGTATCACGGCTTGGAACCACAAACAGTGGTGTGGGTTGCCAACAGAGATCATCCTGTTCCCGATTCCACTGGAGTTTTTCGAATTGCGGAGGATGGAAATCTGGTGGTAGAATATGCATTCAGAAGCCTCTGGTCTTCTGGACTTGGAGCATCCTCGTCCTCTAACAGAACACTGCAGCTCCTAGATTCTGGGAATCTAGTACTAAAAGAGGATGACTCTGAAGCGACATACCTGTGGGAAAGCTTCAAGAACCCAACAGACACGTTTCTTCCCGGCATGAAAATGGACGCGACTATGTCGTTGACTTGTTGGAAAGACTCCGCTAACCCAGCACCTGGGAACTTCACCTTCAAGCTGACTCAACAGGCTGAGAAACGGAGCTTCGTTGTGCAATATCATTCAAAAATCCACTGGGCACCTGATGAATTTGACACAGAAGCGGCTTCCCAGGTGGTATTTAATTTGTTGAACAACGACATCTGGAGTACTAAAACGTACAATTATTCTAACAAAACAGTCTTCGTATCACAACCTTACATGTACTATAAATCAAGGCTTTTGATGAATTCTAGAGGGGAGATAGTGTTTTTGGAGTGGGATGAGGCAGAATCAAATTGGACTAAGATATGGTCTGGGCCAGAGAACAAGTGTGACATACCTGATTATTGCGGGAGCTTCGGCCTATGTAACAAAGATAACTTCATTCAGTGCAGATGTTTGCCAGGATTCAGTTCTATTCAAGGTTTTCCTTCTGATCGAGAATCGGAGTCCCAAGGATGTGCGAGAAAATCAACGACGTGTACCAGTACCAACGAGGGCGTGATGTTCCTGAACTTAACCAACATAAAAGTGGCCGACCCAGACGAAGAGATTAATACTGAAACAGAAGGAAAATGCCAATCCATGTGCATCAACATGTGTCCCCAATCACAGTGTCAGGCCTATTCATTTAATAGTACGACATATGGTGATCGTGGTTCATACTCGTGCAATATCTGGAAGCGGCCTTTATCTTCTCTTGTCGAGAACTACCTGCGCGGTCATGATCTTTCTATCATGGTTAAGAAATCAGACATAGCACCAACTGCTAAATCGTGTGAACCTTGCGGCACATATGCTATTCCTTATCCCCTAAGCAATGGGTCAAACTGCGGAGACCCCATGTACAACTACTTCAATTGCAACAAATCCACTGGCAAAGTTAGTTTTATGATTCCCGGAGGAATACCATACCCAGTAACTTGGATCGATGAAGATTCCAGAATGTTTTCCATTCAAACAAACTATTTCAATTCATTCAATTACAGTTTCAGCAGTCAAAATAGCACTGATTTTCCGTTTAAGGTTCAGTACAATGAAGATGCCGTAATAAAAATCAATTGGTTACCAGCACCAGAACCCCCCTGTAGTCAGCTTACAGACTGCATGAATTGGCCACATTCAACATGCAGAGCAACAAGGGAAGGTGGAAGTAGGTGCCATTGTGATTCAAACTATAATTGGAATAACACATTAATGAGCTGCACCCAAGAAGAGCAATCAGGAAATCACTCAACTCGACTAGAACTGATTCTTTTAGCAACTCTTGGTTCCCTGGCTGCTGTGACATGCATAATAGCATTCGGCATCGTGTGGAGAAAGAAAAAATCCCTTAAACATGATCGAGCAAGCTCTCAAATTCAGGAGAGCTTGTATGAGAGTGAAAGACATGTGAAAGACCGTAGTCGAACTATACTGTTGGATTGGCCGATGCGGTTTGAGATAATAGTAGGCATAGCACGAGGCATGCTATACCTTCATCAAGACTCTAGATTGAGAGTGATTCATAGAGACATGAAAACCAGCAACGTTCTCTTAGACGAGGAAATGAATCCAAAGATATCTGACTTTGGTCTTGCCAAAATATTTGGAGGAAAAGAAACTGAAGCAAGTACAGGGAGAGTGATGGGAACCTATGGATACATGGCTCCAGAGTACGCTTTGGATGGACTTTTTTCAGTGAAATCTGATGTTTTCAGTTTTGGAGTGGTCCTACTGGAGATTCTTAGTGGAAAAAAGAACACAGGATTCTATGAGTCCAAACAAATTTCTAGCCTTTTGGGTTATGCATGGAACTTATGGTCAGAGAACAAGATACTGGATTTAATGGATTCTAGTCTTGGTGAAACATGCAACGAAAATCAATTTTTCAAATGTGCAGTTGTTGGATTATTATGCATACAAGATGAACCGAGTAATCGACCTACTATGTCAAATGTTTTGTACATGCTTGACGTAGAGACAACAACCATGCCAATTCCCACGCAGCCAACATTTTTTATGAACAAGCGTTATTCAAGTTCAGCTTCTTCTTCTAGTAAACCAGAAACAAGTCTGCAATTTGATAGCAGTTACGAACAAGGTCGATAG


Promoter Sequence:
>Vu_24529::LG6:8751708-8753708(+)
ATTGACATGTAATAAGAAAAATGTTTTTTTATTTCAAAAGGTCTATCGATTGAGTGTAAACGGTAAATTTTGTTATATTGTATTGTATTTTTGTTATAAAGAAATATCATAATATGCGATTAATCACTAAATTCACTATCAATTTAAGAGTTTATGAATCCAAATTAACAATTAAATTAGTAACAAAATTCAATTAATAACAAAATTAGAAGTAAATCTTTGACACCTTGAAAATGACTTATAAGTGGGTGGTATAAACAAGTGGGTGGTATAAACATATTTTATATACACTTTTAGCTTAGAAATTTTTTTACAAATATTTTTTTACTTCAATGTTTGCCTTTAGATTAATATTGGTACATAAGTTTTAAAAGAGGATTTAGTCATAAATATTCTTAATTATGTGTATTTAGCGATTTGGATTAAGTTTCTTAATCTTGGTAGACAAAGACAAAATTTTGAACAAGAAACTCTTGAAAAATAGAGAATGTGTTTAATGAACCTATCCTTCCAAAGAATCTTTGTAATATTTATTTTAAAGGTCAATCTACTAAAAAATGACCTATTAATCCAAATGAATGTTTCATAATTGCAAATAAGATAATTAATTATTAATTCGCCTAGTGAATATGCATTTGTCGAGCAAACATATTCTATAGAGAAATAATTAACTCAACGACTGCTATGCTTAGAAAATTTGGATATACTGCATGAAATTCTATAAGTTAATTTTTTTTTATTTGAATTTTAATTTATAGGTTAATATTTGATTTTCTATTGTTATAAATGATCAAATTTCAATCTTCTTTTTTACATGTAGTTGGATTTGTTAAATAATTTCAATTACATTATGAATTGAATTTAGGTATTTGATGTTGCTTGTTTAACTCTATATAATCAATAAATGTGTTACATATTTGTAGTATTTTTATGAATCTTTTAACTAAATGGACATATATTAAATATAACCATTTATCTTAATACTCGATCAATCTTTGATTACTTAATTATGTTTATACTTTATTTTTATCAGCAATAACTAATATAAATTAAAAAGGACAATATGATTTACCCAACCATTATACAAAGAACATTTAAGAGGGGAAAAAAAAGTAAAAAAGAAGAGAAAAAGCAAAAGATAAGCACCTCATGTCATGCCCATAAATATTCTTTGTATAGTTCATGCCAAAATTTGAACTGATGTTTACTTAAATAATCCAAAATTTTATAGTTCGCAGTACTCGACAAGTTTGGCAGCCCAAACGATAAACTTTCTAAATAGAATTGTATTTCTCACATAAAACCATTCCGTGTGAGAAAAAATACAATAAGAAACACAAATCCGAAATGAAACAACTATACTCTCTAACTTGTCAACCAAAAAAAGTAATACTATCTAACCTTGAAAAGTTGAGAATTGGTCCAAATTTTTATTTTTTGATATATTTTAATAATGGACAAAATAGACGTTTTTCTATACAATTTTTAATATTAATTTGTTTTGCAATATAAATTAAGAAATGGAAAATGTGATTGCACCGTATGAATTAAATGCTCACTAAGCTTTTAAATTGATAGGTAAGTATTTTTTTTTCCACCTTTCCTTTTTGTGTGGGTGTAAGCAGGACATGCACCTCCCTGACTTATGATTATTATATTTTTTTAGAGTTCTGATATTAGTATTTTAATTAAAGGTTTTGAAATTGAATTTTAATTAAATAAGAGAAAAATTAGTTAGTAATTCATGGATTACATATATATAAGTTGTAATACTTTCAGTTCACAGTTGAATTGTAATCCAACCAGATAACAATTTTATACACACAAAAAAAATTAGTAAAATGTGTTTTTTGTCTTTTAAAAGAACAAATTTTATTGTAATGAAAACCTAAAAATCTGTTTGGGGGAATAATGCTTGAAATAGTAGTTGATGTTATAGCATTTAGTGTCAAAATTTTGAAATAAGCATCAGAAAGACCATAGAAGGTTTGTATTAGCAA


Gene Sequence:
>Vu_24529(+)
ATGAGAAGTGAAGAGGTTGTGTTGTCCTTCTCCTTTCTTCTTCTTTGCCTGCCAATATGTTTGGGTGGAGATACTCTAAAGGCAAACCAGAGCATAACTCATCACCACTCCAATGGAAACCTTGTTTCATCAAACGCCACATTTGAGCTGGGCTTCTTTTCTCCTGCTGAAAAAAGTGGAGGGAAATACCTGGGGATTTGGTATCACGGCTTGGAACCACAAACAGTGGTGTGGGTTGCCAACAGAGATCATCCTGTTCCCGATTCCACTGGAGTTTTTCGAATTGCGGAGGATGGAAATCTGGTGGTAGAATATGCATTCAGAAGCCTCTGGTCTTCTGGACTTGGAGCATCCTCGTCCTCTAACAGAACACTGCAGCTCCTAGATTCTGGGAATCTAGTACTAAAAGAGGATGACTCTGAAGCGACATACCTGTGGGAAAGCTTCAAGAACCCAACAGACACGTTTCTTCCCGGCATGAAAATGGACGCGACTATGTCGTTGACTTGTTGGAAAGACTCCGCTAACCCAGCACCTGGGAACTTCACCTTCAAGCTGACTCAACAGGCTGAGAAACGGAGCTTCGTTGTGCAATATCATTCAAAAATCCACTGGGCACCTGATGAATTTGACACAGAAGCGGCTTCCCAGGTGGTATTTAATTTGTTGAACAACGACATCTGGAGTACTAAAACGTACAATTATTCTAACAAAACAGTCTTCGTATCACAACCTTACATGTACTATAAATCAAGGCTTTTGATGAATTCTAGAGGGGAGATAGTGTTTTTGGAGTGGGATGAGGCAGAATCAAATTGGACTAAGATATGGTCTGGGCCAGAGAACAAGTGTGACATACCTGATTATTGCGGGAGCTTCGGCCTATGTAACAAAGATAACTTCATTCAGTGCAGATGTTTGCCAGGATTCAGTTCTATTCAAGGTTTTCCTTCTGATCGAGAATCGGAGTCCCAAGGATGTGCGAGAAAATCAACGACGTGTACCAGTACCAACGAGGGCGTGATGTTCCTGAACTTAACCAACATAAAAGTGGCCGACCCAGACGAAGAGATTAATACTGAAACAGAAGGAAAATGCCAATCCATGTGCATCAACATGTGTCCCCAATCACAGTGTCAGGCCTATTCATTTAATAGTACGACATATGGTGATCGTGGTTCATACTCGTGCAATATCTGGAAGCGGCCTTTATCTTCTCTTGTCGAGAACTACCTGCGCGGTCATGATCTTTCTATCATGGTTAAGAAATCAGACATAGGTAATTTATATATACTCTTAATACCATTAGTTGAAACTTCTAGATGATATTCATAGGTCATATTGTATTGACTCATCAGTTAGAAGGATGGATTGAACGGTAAACTGATGAAACATGATTTAAGGCTGAATTAATGTATTGTTGTGTAGCACCAACTGCTAAATCGTGTGAACCTTGCGGCACATATGCTATTCCTTATCCCCTAAGCAATGGGTCAAACTGCGGAGACCCCATGTACAACTACTTCAATTGCAACAAATCCACTGGCAAAGTTAGTTTTATGATTCCCGGAGGAATACCATACCCAGTAACTTGGATCGATGAAGATTCCAGAATGTTTTCCATTCAAACAAACTATTTCAATTCATTCAATTACAGTTTCAGCAGTCAAAATAGCACTGATTTTCCGTTTAAGGTTCAGTACAATGAAGATGCCGTAATAAAAATCAATTGGTTACCAGCACCAGAACCCCCCTGTAGTCAGCTTACAGACTGCATGAATTGGCCACATTCAACATGCAGAGCAACAAGGGAAGGTGGAAGTAGGTGCCATTGTGATTCAAACTATAATTGGAATAACACATTAATGAGCTGCACCCAAGGTTAGGATTTATAATCCTATCCACTTTTCTATTTTTCTCCTTTAATACCGAAAAAATATTGCCAGATTAAAATGATTATAATGGTACTTTGGCATTTTGGTAGTACAATTATAATGGTGTTTGCCCTCATACTTTCTGCATTTTTTTTCCTTTCTGCGACAGAAGAGCAATCAGGAAATCACTCAACTCGACTAGAACTGATTCTTTTAGCAACTCTTGGTTCCCTGGCTGCTGTGACATGCATAATAGCATTCGGCATCGTGTGGAGAAAGAAAAAATCCCTTAAACATGGTAATCATTTGTAGTTTTGCACGTTAAATTAAAAATCTTTTATCTTCACACAGATAATGAAATGCTATGTATCTGTTGGTACGGAGTTCAGATCGAGCAAGCTCTCAAATTCAGGAGAGCTTGTATGAGAGTGAAAGACATGTGAAAGGTTTGATTGGCTTAGGAAGTTTAGAAGAAAAAGACATCGAAGGCATTGAAGTTCCCTTTTACACTTTTGCAAGCATTCTCGCAGCTACAGATAGTTTCTCGGATTCTAACAAGCTTGGAAGAGGAGGTTATGGACCTGTTTATAAGGTGATTTGCTCTGTTCATCAAACTTTTTATTACCTATCTTGCATTGAATCCTTGCAAAATATTCTCATGATATAATGTATGGAAACCTTTTTATCCAGGGAACGTTTCCAGGAGGTCAAGAAATAGCTGTAAAGAGACTTTCAAGTGTTTCCACTCAAGGCCTGCAAGAATTCAAAAATGAGGTTATTTTGATTGCCAAACTTCAACATCGGAACCTTGTTAGACTGAGGGGCTACTGCATAAAAGGGGATGAAAAAATCTTACTTTATGAATACATGCCAAATAAGAGCTTGGACTCATTTATATTTGGTGAGACTCCATATTCCTTCACACAACCTATTCTCTAATTATTACAACCATAACTTCGCTAACATCGTTCTTGATTTGAAATGTGAAATGCATACGTTGAAAGACCGTAGTCGAACTATACTGTTGGATTGGCCGATGCGGTTTGAGATAATAGTAGGCATAGCACGAGGCATGCTATACCTTCATCAAGACTCTAGATTGAGAGTGATTCATAGAGACATGAAAACCAGCAACGTTCTCTTAGACGAGGAAATGAATCCAAAGATATCTGACTTTGGTCTTGCCAAAATATTTGGAGGAAAAGAAACTGAAGCAAGTACAGGGAGAGTGATGGGAACCTAGTAAGTTCACCATGTACTCTGACATTGTTATTTTTCTGAATATGATGTTCCATACATTCTTGCTACACATAAAAATTTATATTGTTTTTTTCTTGAAGTGGATACATGGCTCCAGAGTACGCTTTGGATGGACTTTTTTCAGTGAAATCTGATGTTTTCAGTTTTGGAGTGGTCCTACTGGAGATTCTTAGTGGAAAAAAGAACACAGGATTCTATGAGTCCAAACAAATTTCTAGCCTTTTGGGTTATGTATGTTTATTGTGTTGCTGTCTTGTGTTGTTTTTGTGACTTATATTGACTTCTGATTCATTTTTTCTTGACATTATATTTATCAGGCATGGAACTTATGGTCAGAGAACAAGATACTGGATTTAATGGATTCTAGTCTTGGTGAAACATGCAACGAAAATCAATTTTTCAAATGTGCAGTTGTTGGATTATTATGCATACAAGATGAACCGAGTAATCGACCTACTATGTCAAATGTTTTGTACATGCTTGACGTAGAGACAACAACCATGCCAATTCCCACGCAGCCAACATTTTTTATGAACAAGCGTTATTCAAGTTCAGCTTCTTCTTCTAGTAAACCAGAAACAAGTCTGCAATTTGATAGCAGTTACGAACAAGGTCGATAG