Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24519 LG6 8637824 8641192 PREDICTED: myb-related protein Myb4-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 8637877 synonymous_variant p.Ser224Ser
A/G 8638028 missense_variant p.Ile174Thr
G/A 8638037 missense_variant p.Pro171Leu
G/A 8638044 synonymous_variant p.Leu169Leu
A/G 8638050 stop_lost p.Ter167Glnext*?
T/G 8638055 missense_variant p.Tyr165Ser
T/A 8638082 missense_variant p.His156Leu
T/G 8638088 missense_variant p.His154Pro
T/C 8638158 missense_variant p.Asn131Asp
G/A 8638160 missense_variant p.Thr130Met
T/C 8638163 missense_variant p.His129Arg
G/A 8638210 synonymous_variant p.Asn113Asn
T/A 8638211 missense_variant p.Asn113Ile
C/G 8638306 intron_variant
G/A 8638308 intron_variant
G/T 8638315 intron_variant
A/T 8638347 intron_variant
A/G 8638362 intron_variant
T/A 8638388 intron_variant
C/A 8638402 intron_variant
T/G 8638467 intron_variant
A/G 8638491 intron_variant
G/A 8638535 intron_variant
A/G 8638536 intron_variant
A/T 8638826 intron_variant
A/T 8639077 intron_variant
A/C 8639093 intron_variant
A/T 8639126 intron_variant
G/C 8639151 intron_variant
G/A 8639155 intron_variant
G/A 8639410 intron_variant
T/C 8639441 intron_variant
G/T 8639535 intron_variant
A/G 8639584 intron_variant
A/G 8639743 intron_variant
G/C 8639863 intron_variant
T/A 8640808 stop_lost p.Ter46Cysext*?
G/C 8640821 intron_variant
A/C 8640887 intron_variant
G/A 8640925 intron_variant
C/A 8640937 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24519.1
MVKNTNSEKSGLRKGTWTPEEDKKLIAYVTRYGHWNWNLLPKFAGLERCGKSCRLRWLNYLRPNIKRGNYTKEEDDTIIKLLQSLGNRWSAIAAQLPGRTDNEIKNYWHTNLKKRYQLLKPQAHSKDQSPHEQGPNPNNNIAPTSQSIDSSTTATSTSTSTSSSQLSITTGTKENFFDTIPDDDDFSFVDAYQLEPVNESFFLEPYMVDISCLPSDILVPEPDYFGPVSDIELWSHSNIYYA*


CDS Sequence:
>Vu_24519.1
ATGGTGAAAAACACTAACTCTGAAAAAAGTGGCCTTAGGAAAGGAACATGGACCCCAGAGGAAGATAAAAAATTGATTGCTTATGTTACGAGATACGGTCACTGGAATTGGAACCTACTCCCCAAGTTTGCAGGTCTTGAGAGGTGTGGAAAAAGTTGCAGGCTAAGATGGCTGAATTACTTGAGGCCAAATATCAAAAGAGGAAACTACACTAAAGAAGAAGATGATACCATTATCAAACTTCTCCAAAGTCTCGGTAACAGATGGTCTGCCATTGCTGCTCAGCTGCCAGGAAGAACAGACAATGAAATTAAGAATTATTGGCACACCAATCTCAAGAAACGATATCAACTTCTCAAACCTCAAGCCCACTCAAAGGATCAATCACCACACGAACAAGGACCAAACCCTAACAATAATATCGCACCAACTTCTCAATCCATCGATTCAAGCACAACAGCAACATCAACATCAACATCAACATCCTCGTCCCAACTATCTATAACTACTGGTACCAAAGAAAATTTTTTTGATACCATTCCTGATGATGATGATTTTTCTTTTGTGGATGCATACCAACTAGAGCCTGTGAATGAAAGCTTCTTCTTGGAACCATATATGGTTGACATATCGTGCCTTCCTTCTGATATTTTGGTGCCTGAACCCGATTACTTCGGCCCTGTTTCTGACATAGAACTTTGGAGTCACAGTAATATATACTATGCGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_24519::LG6:8641192-8643192(-)
TAATGATATTTTCTAGATAATAAATTTAACTAACATGTTATATTTAATTACATTACTTTAAAATGTATTTTTTGTTTTACAAGAATAATATTTAAAGAAGGACATTAAAAAACATTTATAAAATTTGTTACAATTATAACTGCTTTTTAATATGTGAAGTTATTTATTCTATATGAATGAGAATATATTTATTAACAAAGGTTTGTTTTTTACAATAAAAAGGGTTTAATTATACCAGTTAACAAAGTTATTTGAAGGAAAGAGAAAGATCTGCATATTTGAAAGGATGTTGATGTACTTAGCATAAGCTTATCTAGCAGCTTTTCTTTGTCTTCTAGGAAAAAAAGGTAAATGTCCTTGCTCCTTCCAAGAAAAGAGGAGGAATCTCTTCGTCGGTAAAACGATGTTTCTTGAAGAGGAAAACTACAGCTCATTTAATAAACTAAATATGATGAATAAGTGAAGAACATATGGAACTTTGAAGTCAGAAATTATTGATCGCATTTCTTTCAGGACATTTTACTACTTAAATTGATCTAATTCTTTTACATCCATTGGTGTTAAAAATTCAAGTAATTTGGAAGTATTTCATTGAATAAAAATAAATAACATGAATAATATATAAGTAAAATATTCATAAATTTATTGTCATTAAGATTTTGAGAGTTAAAAATGATGTTATATTTGATTTGTTATAAAAAAACTTTACAATGATACTAAACTCTATAGTTTATCTTGGTAATTACTTGAATATGTATCTCGTCGTAAAACAAAATTATAAAAGAATATTACCACTAAAATTTATATGGATTTACTAATCACTCATACTTCACTTTAAATTTATACGTATTTGTTTACTTATTCTTGTAAACAAGTTATTTCAATCAATCTTTATTATTTTATGCATTTACTTTAATTTTTCAAAATGAAAACTTGTTTTTTTCTTTTTAAAAATTCATACCATAAAAGTAGCATAAATAGACGAAAGATGGTTAAATACGGTTTATATTTTTTAATTAAGATGATACAATTATGATAATCATAAATGCAATTTTTAAATTTTATAATAATAAATTAAGTATTGTAATTAATATGCTCCTTTTGATCTATAAAAGGTCATAAAAATTACTAAGTTGAAAGTGGTAAAATATTTTTACTACAATTCATATTCTATTTTTACAAAAAATGTTTAATTTATATTTCTATAAAAGATATAAATATCTAAAGGGATTTAAATTATGTGATAACTAAGGCACTAGTATGTAAGATATTTGAATTTGATAAATATATTGCTTCTGAGGTATGTGTTGCTCTCTGCAACATCCTATAAATCTATCATTGTTGATTGTAAATTAAAAACTGAAATTTAAAAAAAAAAAGTGCTTAAATACAATATTAATTTTAAAATCTATATATTTTGTGGCAACTGTGTATTGATTGTTGTTTAATAAATTGTTTATTAAAAATCAAAGAATATGAACTTTTAACTTATGATTATCACGACTTTAAAATCTTTTATTTTCTTTTCAGGTATGCACGGTTAGAAGTTTCACATCAGGTCAAATTATAATATATAAGTGAAATTGAGTTACGTTTAAATGCAATTTGTTGTTTAGTTAAACTTTTTTGTTGTTGTTGACGTTGATATCAAATTAGTTAATTTTATTCCATTCGTTGTGGAGCTGTTATCGGACTACCATTAATTCTATTAAGTTAGGTGAAAATCTCACAAGCTGAAAACAAATTTGAATTTGTATGTATAAATTGGTTCATATAACATTGTATTACTCACGTCACGTAGAAAGATATCAAATCTACGTGGACCCTGATTTTGAATGAATCGTTCGTATATATAGGTCAGAATATAGAAACTTTTGGTAGAGATATAGCCAAAAAAAAAACCAGAGACTTGGTGCTCTACCCGTCACTCTTTTCTCAATCAGATTGTCACTCATACATAGTTACAGATATAGACACTGAAAGATAAGGAGCTTGTAGAG


Gene Sequence:
>Vu_24519(-)
ATGGTGAAAAACACTAACTCTGAAAAAAGTGGCCTTAGGAAAGGAACATGGACCCCAGAGGAAGATAAAAAATTGATTGCTTATGTTACGAGATACGGTCACTGGAATTGGAACCTACTCCCCAAGTTTGCAGGTACCTCAAAATCTCTAATTCTTTCATTTCTTCCTTCTCTGTCAACACTCTGCTGCATGAATTAGTTTCTCTCACTCATCATCATATAAGAAACTCCGACCACCGTGTCGTATGTTTTATAAGGAATCAAATTTCCATTTGAAACAAAATTCCCTGTAATGTTGCAGAAACCTAATTAATGTCGACTATGTAAACCAATGAATCTGGTGCTGTCATATGTATGTATAACTCGATTAATCTTTTAGGTCTTGAGAGGTGTGGAAAAAGTTGCAGGCTAAGATGGCTGAATTACTTGAGGCCAAATATCAAAAGAGGAAACTACACTAAAGAAGAAGATGATACCATTATCAAACTTCTCCAAAGTCTCGGTAACAGGTATATGAATTGGGGAACTGGAGTAAATAAAATGCAGGTTTTTTTCTTAGGAAACCTGTCTGTTTTCTTCTCAGTAGATTATTGCAATAACAATATAATTTTTATATATGGATTCTATTACTAGTTTTCTTCACAACCTCGTTTTCGATATTACCACAAAATTTTGAGGGTCCCATTTTGGACTATAAGACTTCTTAACTCAAAGACTTAATTACCCTGTAACCCTCGGAGTTGCGTGTATCCATTTGGGTATTCACGATACAACTTTCAGTACATATTGAAATGAAGCTCCTGTTCGTAATCTTACATCTGTTAGAAATAAATAAAGTGATTTTATAATATACAAGTGGACGTAAATTTTACTTTATAAAATGAAAAATGAAAAATGAAATTAATTTAAGTCTATTTCTTAAAAACATTTACTATAATTTTAGTCAAATGCTTTTTTGCATGCATTTTTCAGATTTGGTTCCTTTAATAAATTGTCATCACGTGTACCCAAAATATAAGAGCTATAAATTTAGAATTTTCCACTTATCTATTTAATTTCAAATTCTGTAATTGATATTATTCAACAGAAACTCTCCACGTGGTTATATTAATAGTTAGGTCCGATATTGATGTTAGATAATTAGGCTTAGAATAGCTTCTTGAAGTTGTGATACCCACAAATCAATTATTTAGGTTTTTGTCATATTTTTAGATGTCCAAAGAAGGTTAAAAGATTATCATGGATTAGGGTTTCGGAAAGAAGTTATGGGAAGGTAAATATGACAAAGTTTTAGATGAATTGAAGTAAATATGAATTGAAACATGTAAAACACTATTGCCATGTATTGATTAAAAGAACATTACGTTTTAGATTCATAAGTATACTTTTTTATTTAATGGAAGTTAAATAATAAGTGTAAATATTTGAGGTTTTCTCTAATATTATATTATATTAACATTTAATGTACCAAATATGCATGCTGCTATGCTAATAGAATTGTCTATTAATATCTAAATGATCATAATATTAAGCTACAACATTATTAATATAAGTTTTTATAGATAAATGACATATTAATAGAAATTAAGGTAATGTTAAATCACTCGAATATAATTTATTTTACCTAATTATAGTTTATTTCTATATTATAGTACATGCGAAATTTTATATCCGATTCCTAATCATTTAAATCAAGTTTTGAATTCAAATCAATAGATTATGGTCCTACTACTAGTTACTGTTAGTTCTAGCAACTAATATAGACCTAATAAATATTTTTTAACTCAGTTTAAATATTTTTTAAATACAAAAAATTATACGTTTAAATATTTGTATTGAAATAACAAAACCGTACTTTTAATATCCCATAAAAACATATTTTTTAAAAGGGAAGTTAACTAACCATAATTCACTTATATTCTATATCTATAATACACAATAAAAATTAAAATAAATATAAAAAATACACATATTTAAATAATAATTTTTTAATTTTTATTAAAATTATTTATTAGAAAATGGCCCAGTGATTAAGCACCAGTCTTACTAATTTTAGTAAAAACAGATTGTTGTGGAATTGAAGTGACATGGCTCTTACCATAAAAGGAATTCTAAGTCATGAAAGTGTCAAGTTATACAATATGATTTTTGTAAGCTATTTATGTTAATAACTACACACACAAAAATAATTAAGCTGAATATATTATGATGTCACTTGATTTATCACAAAACAAAATATCTACATATCAAATGTAAAAGTTGGATAAATCATTAAGGCAGGACCAAATTGATTTATAAAGTATAAAGTGACCTAATTTAAATATTGGAAATCTTTTATTCTGTTATTTTTTCAACTAAACGAGAGAATTTTTTTTTCTCTACCAATTAATTTTTAATCTACATTTTCCTTTCAAACAAAGACACCCAGGAGATGAGGTGGGAGCAATAAATATTTTATTTCTCGTATTTATTTTAAATATAAGAATACTTGTATTCTTCTCTTACATCTTGTTTTTTTTTAATTTGTGGTTGATATTGTCAGGAATATAAATTATGTAATCAAAAAGATTTTCTTCCAAATTTGAAAATATAGAGCATGTATTATAATCTCTGTTCTTATTTTAAAACACATAAATGAATATTTTTTATTTTTTTTATCATTTTTCTTGACAGTATTTACGAAACCCTAAGATGTTTATGATTTTGATTGAAAAATAAAAAAAAGTAAATTTAAATTAAGAAAATGTGTATTCTTCTCTAATTTAAATAATTTCCGTGAACAATCATTTTTGAAATAAGTCTTCGATATGTGATTTTTGTTAGAAGAATATTTGTGAAAGAAAAAATTGTTAAAAAGTTTAATCAGTATTATTGAGGTCTGATTTCCGTTTCTTCTTAACGCAGATGGTCTGCCATTGCTGCTCAGCTGCCAGGAAGAACAGACAATGAAATTAAGAATTATTGGCACACCAATCTCAAGAAACGATATCAACTTCTCAAACCTCAAGCCCACTCAAAGGATCAATCACCACACGAACAAGGACCAAACCCTAACAATAATATCGCACCAACTTCTCAATCCATCGATTCAAGCACAACAGCAACATCAACATCAACATCAACATCCTCGTCCCAACTATCTATAACTACTGGTACCAAAGAAAATTTTTTTGATACCATTCCTGATGATGATGATTTTTCTTTTGTGGATGCATACCAACTAGAGCCTGTGAATGAAAGCTTCTTCTTGGAACCATATATGGTTGACATATCGTGCCTTCCTTCTGATATTTTGGTGCCTGAACCCGATTACTTCGGCCCTGTTTCTGACATAGAACTTTGGAGTCACAGTAATATATACTATGCGTGA