Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24422 LG6 7525894 7526679 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 7526040 missense_variant p.Lys214Glu
T/C 7526062 synonymous_variant p.Leu206Leu
C/A 7526136 missense_variant p.Ala182Ser
A/C 7526140 missense_variant p.Asn180Lys
G/T 7526143 synonymous_variant p.Ser179Ser
G/A 7526162 missense_variant p.Ser173Phe
T/C 7526189 missense_variant p.Glu164Gly
A/G 7526206 synonymous_variant p.Pro158Pro
G/T 7526278 synonymous_variant p.Val134Val
C/A 7526280 missense_variant p.Val134Phe
A/T 7526281 synonymous_variant p.Ile133Ile
A/G 7526306 missense_variant p.Ile125Thr
C/A 7526339 missense_variant p.Gly114Val
C/T 7526368 synonymous_variant p.Ser104Ser
T/C 7526374 synonymous_variant p.Arg102Arg
C/A 7526375 missense_variant p.Arg102Leu
T/C 7526377 synonymous_variant p.Arg101Arg
T/C 7526511 missense_variant p.Asn57Asp
C/T 7526532 missense_variant p.Asp50Asn
C/T 7526589 missense_variant p.Gly31Arg
C/T 7526603 missense_variant p.Ser26Asn
A/T,* 7526607 missense_variant p.Ser25Thr
G/T 7526608 synonymous_variant p.Ile24Ile
T/C 7526610 missense_variant p.Ile24Val
A/G 7526614 synonymous_variant p.Leu22Leu
G/A 7526635 synonymous_variant p.Thr15Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24422.1
MFNNFSTQIPPEYGTWQHLQYLAISSNELTGNIPPELGNLPTLHELYCGDLTLPLPNPLLTSNLPHLLLLFHSNHIIFIFLKPRSDIPTKQHQQQSSPSPRRASLSLGRRLSSGLKVSPVVVDSIAKKKMATIVAGISKVSDALVGSKSARKNWDEQPSATPIETEHKEKGGSNFAEKSNFAAMGITIHEKGGSNFAEKSTLTHLLLLVRPHYKKNSGTLSPYTLYGSSLRPPYLHYTEQQNRSSSFSFSPYRKRGFRTRF*


CDS Sequence:
>Vu_24422.1
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Promoter Sequence:
>Vu_24422::LG6:7526679-7528679(-)
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Gene Sequence:
>Vu_24422(-)
ATGTTTAATAATTTCTCTACCCAGATTCCTCCCGAATATGGCACCTGGCAGCACCTCCAGTACCTTGCCATCTCCAGCAACGAGCTCACGGGAAACATCCCTCCGGAGCTTGGAAACCTCCCCACGCTTCACGAGCTCTACTGTGGAGACCTCACTCTTCCTCTTCCAAATCCCCTTCTGACTTCAAACCTTCCTCACCTTCTTCTTCTTTTCCATTCTAATCATATTATTTTTATTTTTCTCAAACCACGGTCAGACATTCCAACAAAACAACACCAACAGCAGTCGTCACCTAGTCCGCGACGAGCGTCGCTTTCTCTTGGGAGGAGGTTGTCCAGCGGGCTCAAGGTATCGCCGGTGGTGGTGGACTCTATCGCAAAGAAAAAGATGGCCACCATTGTCGCCGGGATCTCGAAGGTCTCTGATGCGCTGGTTGGGTCCAAGAGTGCGAGAAAGAATTGGGATGAGCAACCTTCGGCCACGCCGATTGAAACTGAACACAAAGAAAAGGGTGGTTCTAATTTTGCAGAGAAATCCAATTTTGCAGCTATGGGTATCACCATTCATGAAAAGGGTGGTTCTAATTTTGCAGAGAAATCCACCCTCACACATCTACTACTTCTTGTGCGCCCCCACTACAAGAAAAACTCTGGAACCTTGAGCCCTTACACCCTTTACGGTTCCTCTCTTCGGCCTCCATACCTACACTACACAGAACAACAAAACCGCTCATCAAGCTTCAGTTTTTCACCATACAGAAAAAGGGGGTTTAGAACACGATTTTAA