Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24381 LG6 6933100 6935343 PREDICTED: transcription factor ILR3-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 6933105 5_prime_UTR_variant
G/A 6933169 5_prime_UTR_variant
A/G 6933269 5_prime_UTR_variant
T/A 6933413 stop_gained p.Leu15*
T/G 6933549 upstream_gene_variant
G/A 6933559 upstream_gene_variant
G/A 6933565 upstream_gene_variant
G/A 6933570 upstream_gene_variant
G/T 6933634 missense_variant p.Ala61Ser
A/C 6933685 upstream_gene_variant
G/A 6933688 upstream_gene_variant
A/G 6933767 upstream_gene_variant
T/C 6933772 upstream_gene_variant
T/C 6933792 upstream_gene_variant
T/G 6933797 upstream_gene_variant
A/T 6933807 upstream_gene_variant
A/T 6934001 upstream_gene_variant
A/G 6934007 upstream_gene_variant
A/G 6934010 upstream_gene_variant
G/C 6934074 upstream_gene_variant
C/T 6934118 upstream_gene_variant
A/T 6934177 upstream_gene_variant
A/T 6934229 upstream_gene_variant
T/C 6934303 upstream_gene_variant
C/A 6934416 upstream_gene_variant
T/A 6934454 upstream_gene_variant
G/A 6934634 synonymous_variant p.Leu144Leu
G/A 6934662 upstream_gene_variant
G/C 6934718 upstream_gene_variant
T/C 6934882 upstream_gene_variant
G/T 6934934 missense_variant p.Glu154Asp
T/A 6935018 synonymous_variant p.Pro182Pro
A/T 6935193 3_prime_UTR_variant
G/C 6935197 3_prime_UTR_variant
A/G 6935246 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24381.1
MVSPENSNWLFDYPLIDDDITVGDGSFTVSASAFSWPPPPSNVSVEIDASLVDSDGLKDPALKKRGRSDSCTASSSKACREKLRRDRLNDKFVELGSILEPGRPPKTDKAAILMDAVRMVTQLRDEAQKLKESTTSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKVEKEKLELQVKSMSAQPAFLPPPPAIPAAFAPQGQAPGNKLVPFISYPGVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA*


CDS Sequence:
>Vu_24381.1
ATGGTTTCCCCGGAAAACAGCAATTGGCTCTTCGACTACCCGTTGATCGACGATGACATTACTGTCGGAGACGGCTCCTTCACCGTCTCCGCTTCCGCCTTCTCATGGCCCCCGCCTCCCTCCAATGTCAGTGTTGAAATTGATGCTTCACTCGTTGATTCTGATGGCCTCAAAGACCCTGCTTTGAAGAAGAGGGGTAGATCTGATTCATGTACTGCTTCTAGCTCCAAGGCGTGTCGGGAGAAGTTGCGAAGGGATAGACTTAATGACAAGTTTGTTGAATTGGGCTCCATCTTGGAGCCCGGAAGGCCTCCCAAAACAGACAAGGCTGCCATTCTTATGGATGCTGTCCGAATGGTGACGCAGCTCCGGGATGAAGCCCAGAAGTTGAAAGAGTCAACTACGAGTCTTCAAGAGAAGATTAAAGAGTTGAAGGCTGAGAAGAATGAACTTCGTGATGAGAAACAGAGGCTCAAGGTGGAGAAAGAGAAGCTGGAGCTACAAGTAAAATCAATGAGTGCCCAACCTGCTTTCTTGCCACCCCCTCCCGCAATTCCAGCCGCGTTTGCTCCACAAGGTCAAGCCCCGGGCAACAAGTTGGTGCCTTTCATCAGTTATCCGGGTGTTGCCATGTGGCAATTTATGCCTCCTGCCGCAGTGGATACATCACAAGATCATGTACTCCGTCCACCAGTTGCCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_24381::LG6:6931100-6933100(+)
CCATTAACAAATAAATAATGAATTTGTAAAAAAAGTATACATATATTATATAAAGTATTGCAAAAAAAAATCTATATTAAAATATCCTTTTTATTTAAATTAAGTCGTGACTTAAATAATTTGCATCTCACTAAGTCAAGTAATCAAATATAAAAATTAAAATATTAAATTTAAGTCATAATGGGTTAGTCAGATTAAATTCAAAATCAAATCTGACCAATACTCATGTATACTTTTAATATCTATAAATTTGGTGATATATTTTGCATATTAGATTTTATTTTTAGTATGATATTTTTTTAAGATTTAGTAGTAAAACATTTATAATTTATTATAAAATGAATTATTAAAATCAGGCCTATGATATATTTTACTAAAAAGTATTAGTATTTTAAATTTAACCGAATATAAACTTGAATTTTTTGTCAAATTAACCCACTATTTAAATAACACATAAAAAATAAGTTAGTTATAATTTTAAAATATTAAATTTAAATTATACTGAATTAATAATCTTAGATTCAAATGAGATGGACACTTGAACTTAATAAAAAATATTAAATATATTTTTAGTTTTTATATTATAATACAAAATTAAATTTCGTTTCCAGTCCCAAACTTTGATAGTGTTTAATCTTTTACTTTTAAAAATAAATAAATATATTCATAGTTATTAAACAGATTAAGAATTTATCGACTTAGTTAATAGTATTGCTATGTGTATGTGTCTATGTTGATATGTATGTGTTCATATGTTGACATATGTATATTCAGGTCATTACAATGTATCATGTTATTTGTCACATCAATAAATTTGTAATGAAATTTAATAATAAAAACTACGTCTATTCATTTATAAAAATTAAGATAAAACAATCAAAGTTAGAAATGAAATTTAATTTTGCATAATAAATTAAAAATTAAAAATATATTTAACTCAATTAATTAATATAATGGTGAATATATGTTTAACTTTTATGCATACTTAATCTAACGTTAAAATATATTAATTAGTTTCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATTTAAATGAATATTTTTTATATTTACTAAAATGATGCAATGAAATATTGATTATTAACTCTTAAATTCATATAATTATTTATAAATTAAAATGGGTTTAATGTTTGACATTTAGTCAAGTAATCTTCTAAGTATTTTTTCACGCAACAACTACCATCCATTATATTTAGAAAAGGACTTAAAAAATATATCACAAATATTCATAAATAATAATATCATTATACACACTTTAGGTGCCGCTTTGTTGCTTCGAAATCTTCTTACAATTTTTTCTTTTTATTTCTCTTACTTTCCTTACAAGATAGATACAAAATACATTTTATATTTTAAAACATTAATTATATTTATTTTATTTAAATTTTATATAAAGATGACTGAAAATAAAACACATTCATAATATTTGATACAAATAAATAAGGAAAATAAATTCAATGTGATTAAAGCTACATTTTTTAGGTATCATTTAAGGTTCTTTTACATCAACCAATGAATACAATTTTTCATAATTTTAATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACAGATTTATAAATCTTTAATATCATTCAAGAAGAATACTATATTCATTTAGTTTTTTTATTTTTTAAGTTTAAAAATTAAATACTTTTAAAATAATAAAAAACGAATTCTAATTTTACGTTATAATTTGAAAACTAAAAACATATATGTAATAAAAATATATTTTTGATGTTTTAAGGTTAACTTATATCTATTAGAAAAATTTAGAAAAAGAAATGTATATATATGAAAGATATAGCCTTCCATGAAAAAAAAAACAATTAAAGTGTACATCCTTACAGATTTAATAATTTGGTAGTTGATGATTAGAACAATATTTAGGAAATTTGGGTTTTATAAGAGTGGGAAGTGGTTGAAGTTAGAATTTTG


Gene Sequence:
>Vu_24381(+)
GATGGTGTAATTGGTTCATTGATGTGTCATTATGGTCACATCATGGGTCACTGTAGAAGCATAGCCATAGATTCTCCTTTTCGCAGAAGGCTCTCTTTTTCTCTCTACCCTCCAACGTGCTCTCTTCAACACTGCACAGCACCCATTTCAATTCCTTCTCTCTTTCACCATATCTCCTCAACCCACACTCTCCCTTACAATCACTTCAAAGGAACAAGAAACGAATAAATACTCCAAATTCACAATTCTCCGGGAAAATCCCTACACGCCATGGTTTCCCCGGAAAACAGCAATTGGCTCTTCGACTACCCGTTGATCGACGATGACATTACTGTCGGAGACGGCTCCTTCACCGTCTCCGCTTCCGCCTTCTCATGGCCCCCGCCTCCCTCCAATGTCAGGTACTATTTCATTCCCCTAATTAGGGTTTCTGATTCATTTTCACTTTCTCTAATTCGTGTTCTGGTGATGCTGTCTGCTTCTAGTGTTGAAATTGATGCTTCACTCGTTGATTCTGATGGCCTCAAAGACCCTGCTTTGAAGAAGAGGTACACAATTCCCCCCACATTTTCTTTCGAATTATTTAAAGTTAAAGAAAGAAATAATATAACTCATAAATAACACCATGCAATTGGATCAATAGTGTGTGGTATTAATTTCAAGGCTGATTCCTGAATTAGTTGGATTGTTTTTGGTATAAGCCAGTTATGTTGTCAATCCAAAGAGAGGAAAACTTAATCGCCAGTTTGCACTTTATTTCTTTTATTTCTCAATTTCTGCTGTTTGGCGTGTGGTAGAGTCCAGCTTATTTACTTTGCGATTTTTTTTTTCTTTTAGCTTTGAAGTAACAATTGAAGACTGAAATGAAAACGGTTGCATGAATTTCTTTAATGATTTAAAAAGACAAACTATGTTATTCATAGGTTGGTCATCGATTAACTCACGGTTGTGAAGTAATATAATTAAGTGAAATGGCGATTCAACGATGTTTCTGATATGAAGATGATAAGTTCGTCAGCATTAGTTCAGCAACATCAATGAAGAAATTGCCACGACTATACTATTTCGTATAGCTTAAAGGCTTATGTTGCTTAAGTATGATATTGCGATGTTTTCTCTGGCCACTCTCACTGACAAGAGCTTAAAGATTATTGGATCCTATTCAGATACTTATTCTTGGATGAAGTTATGCTATATCTCTTGTTTATTCCTGTTGTAGGGGTAGATCTGATTCATGTACTGCTTCTAGCTCCAAGGCGTGTCGGGAGAAGTTGCGAAGGGATAGACTTAATGACAAGTAACCTTTTGAATCCTTGCCATCTTCCTGTTTGTAACTGTTTTGAGGGCTTGTATTTAAAACGATTGACATGCATAGGTTTGTTGAATTGGGCTCCATCTTGGAGCCCGGAAGGCCTCCCAAAACAGACAAGGCTGCCATTCTTATGGATGCTGTCCGAATGGTGACGCAGCTCCGGGATGAAGCCCAGAAGTTGAAAGAGTCAACTACGAGTCTTCAAGAGAAGATTAAAGAGTTGAAGGTGAGACCTCAATTTATATTCAATGCATTTCTTTTTAAGATTGGAGGACTTGTTTGGGAGGTCCTTATTCTAGGTCATTTGATTTCGTTAAATTTTTTGCCATAACAGTAGTACATTGCCCAGTGGGTAAGGCTATGTTGAATTTTGTAGCCGGACTCATCTAGCTAGTATAGGACTTTGTTGTTATAGTAGTAAGTAGTAGCCGTGATGGAAAACATGCAAACCAAACCTTACAAGACACTAATTGTTGAATTCCCATTTACTATGCAGGCTGAGAAGAATGAACTTCGTGATGAGAAACAGAGGCTCAAGGTGGAGAAAGAGAAGCTGGAGCTACAAGTAAAATCAATGAGTGCCCAACCTGCTTTCTTGCCACCCCCTCCCGCAATTCCAGCCGCGTTTGCTCCACAAGGTCAAGCCCCGGGCAACAAGTTGGTGCCTTTCATCAGTTATCCGGGTGTTGCCATGTGGCAATTTATGCCTCCTGCCGCAGTGGATACATCACAAGATCATGTACTCCGTCCACCAGTTGCCTAAGTTGGCATTTGTACAATTATTTGGGTTTCCATTTTTTGCCCAAAAGTTGTATTCATTTTACTATAGCTTATAAGTATTCCATGTAACTGGATTCAGAGGTGACTTTGACTGTATTTGGCATCTGATACTACTATGAAGTAATCGCTGGTATTTGCATGTAAATTTTAAT