Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24371 LG6 6833939 6837850 PREDICTED: calcium/calmodulin-regulated receptor-like kinase 1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 6834057 5_prime_UTR_variant
A/T 6834260 intron_variant
A/T 6834453 intron_variant
G/A 6834667 intron_variant
A/C 6834679 intron_variant
T/C 6834777 intron_variant
T/G 6835468 intron_variant
C/T 6835507 intron_variant
T/A 6835546 intron_variant
A/C 6835547 intron_variant
C/T 6835616 intron_variant
T/C 6835817 intron_variant
G/T 6836208 intron_variant
C/T 6836350 synonymous_variant p.Leu161Leu
A/G 6836511 upstream_gene_variant
C/T 6836519 upstream_gene_variant
C/T 6836535 upstream_gene_variant
T/C 6836559 upstream_gene_variant
T/C 6836568 upstream_gene_variant
C/A 6836616 missense_variant p.His213Asn
A/G 6836617 missense_variant p.His213Arg
C/T 6836723 upstream_gene_variant
T/A 6836755 synonymous_variant p.Pro231Pro
T/G 6836881 upstream_gene_variant
G/C 6837145 upstream_gene_variant
C/T 6837197 upstream_gene_variant
G/A 6837295 synonymous_variant p.Glu343Glu
C/T 6837346 synonymous_variant p.Arg360Arg
C/T 6837349 synonymous_variant p.Val361Val
G/A 6837455 missense_variant p.Ala397Thr
T/A 6837507 missense_variant p.Leu414His
G/A 6837850 splice_region_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24371.1
MKDESTGLIIGISIGVVIGVALAISALFCLRYHRKRSQIGNSSSRRAAAIPIRQNGFDSCTILSDSTLGPESPVRSGRNGTSFWLEGFKKSSNMVSASGIPEYSYKDLQKATYNFTTLIGQGAFGPVYKAQMSTGETVAVKVLATNSKQGEKEFHTEVMLLGRLHHRNLVNLVGYCAEKGQHMLIYVYMSKGCLASHLYSEENGALGWELRVHIALDVARGIEYLHDGAVPPVIHRDIKSSNILLDQSMRARVADFGLSREEMVDKQAAIRGTFGYLDPEYISSGTFTKKSDVYSFGVLLFELIAGRNPQQGLMEYVELAAMNSEGKVGWEEIVDSRLEGKCEFEEVNEVAALAYKCINRVPKKRPSMRDIVQVLTRILKSRHQRNHHHHKKSLSAAGDEVSIDVDQLETKTSLTHHHTREESIDSAADMYDL*


CDS Sequence:
>Vu_24371.1
ATGAAAGACGAGTCAACTGGGCTTATCATCGGGATTTCCATAGGTGTGGTGATTGGAGTTGCTTTGGCAATTTCTGCGTTGTTCTGTCTCAGATATCATAGGAAACGGTCACAGATAGGCAATAGCAGTTCCCGGAGAGCAGCTGCCATACCCATCCGCCAAAATGGTTTTGATTCATGCACTATTCTATCAGACTCAACCTTGGGTCCAGAATCACCTGTGAGGTCTGGACGAAATGGCACATCCTTCTGGCTTGAGGGCTTCAAGAAGAGTAGCAACATGGTGTCAGCATCTGGAATACCAGAATATTCATACAAGGATTTGCAAAAGGCAACATATAATTTTACAACACTCATAGGACAAGGTGCATTTGGTCCTGTTTATAAAGCACAGATGTCTACTGGGGAGACTGTTGCAGTTAAAGTTCTCGCTACTAATTCTAAGCAAGGGGAGAAAGAATTTCATACAGAGGTTATGCTGCTGGGAAGGTTACATCATAGGAATCTGGTGAATTTGGTTGGGTATTGTGCGGAAAAGGGGCAACACATGCTTATATATGTGTACATGAGTAAAGGCTGCTTGGCTTCCCACTTGTACAGTGAAGAGAATGGTGCTCTGGGTTGGGAATTGAGAGTTCATATAGCTTTAGACGTAGCAAGAGGAATAGAGTATCTTCATGATGGGGCAGTTCCTCCTGTAATCCATCGAGATATCAAATCTTCCAATATTCTCTTGGACCAGTCCATGCGAGCCAGGGTTGCTGATTTTGGACTCTCGAGAGAAGAGATGGTGGATAAACAAGCTGCAATTCGGGGTACCTTTGGCTATCTTGATCCTGAGTATATATCTTCAGGAACATTCACCAAAAAAAGTGATGTATACAGTTTTGGGGTTTTGCTCTTTGAACTTATAGCAGGCAGAAATCCTCAGCAAGGTCTAATGGAATATGTTGAGCTTGCAGCAATGAACAGTGAGGGGAAAGTTGGTTGGGAGGAGATAGTTGATTCTAGGCTTGAGGGAAAATGTGAGTTTGAAGAGGTGAATGAAGTGGCAGCCCTTGCCTACAAATGCATCAACCGCGTCCCAAAGAAACGGCCTTCCATGAGGGACATTGTGCAAGTTTTGACACGAATACTCAAGTCAAGGCACCAAAGGAATCATCATCATCACAAGAAGTCACTCTCAGCCGCAGGTGATGAAGTTTCCATTGATGTTGATCAGCTAGAAACCAAGACTTCTCTCACTCACCACCACACAAGAGAAGAATCTATAGACAGCGCAGCTGACATGTATGATTTGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_24371::LG6:6831939-6833939(+)
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Gene Sequence:
>Vu_24371(+)
AGTGCAAATTGTATTGATATTAAAATTATTCTTAGCGGCGACTTCGCCGTTTTCCGGTTTCTCTCTCTCTGTCGTTTGTTTATGCACTTTTTATTTTGTTGTCCGGAAACCGTGTCTGCGACTCTCTTACACATAACACATTCTTTTCTCTCGTTTTTGTTTTTGGAATCTCGTTCAGGATCTTCTACCCTTTTTTCATTCCTTCTCGCTTCTGGGTTTCTCTTTCTGTCTTTAGCAACGCTCCCACCAAAAAACGTAACTAACTGCTTTGCTTTCAGTTCAGTTTTTCCTAGTGTGTGAATTGGTGAGTGGAGGCGTCATATTTTCCCCAGAACATGTTTCCGTTTCCTTTTCTGTCTACCTTTTTTGCTGTCAGTGTTTTGATCTGTCATCTTATGTTTCTTCAAAGTGTGTTTTATGTCTCAAAGTGCCTGCTTAACTGGATATATGCATGTTTTTTTTTTTAATTTTCGTGTTTATTTTGTTGCTGCTAAAGGGTGGGGGAAAAAACGGAAGCTTTGTGGGGGTGAATGAAAGAAGAGTAAAAATGAAAAGGGTGTTGTCATTTGGTTACATGCTTATGTGAATCTGAGTTGAGATTTCAATGATGGTTTGAAACTTTTTGCGTGATTTTGATTTTGCTCTCATTTTCCTGATTTTTGTTCCTTGTTAGATTGAATGGATAGAAAAAAAGTTGATAAAGTTTCAGGATTTATGCATTTCAGATTGGTATAGAGGAGAGGATTAGGATTAGGATTAGGATTCTTTCTATTTGGGTCTTTGATGCATTTCTTGTTCCGTGTGCTAGTGGTTTTGGTAAAGTCTAGTTTTGAACAGATGTAATGGGTGGTAACTGGTGAAGTTGTTGGTGATAAGTTATGCTTGATCGATTGTTTCAATATCATGCTGATGTCATTGTCCAACTTCCAGCATTGATTATTCATGCTGAGATTTTATTTTCTTCTTCTGAGTGTTATAAACTTCCGAAGACTTTTTGACAATGACTTTGAAAATTAAGAGTAAAAGCCTTCAATTGACTGGTTCAAGTTCAATGTTGTAAACCAGGCACCAAGGAAATCTGTATATTAGTCTATTACTGGTGGCATATAATTGACCATGTTTTGTTGCTTGCTATGGCAGGTATATCAATGGATTGGATGATCAATAATAGGAAAGTCTAGCGCAGAAGAGGAAAGGGGAGAGATGAAAGACGAGTCAACTGGGCTTATCATCGGGATTTCCATAGGTGTGGTGATTGGAGTTGCTTTGGCAATTTCTGCGTTGTTCTGTCTCAGATATCATAGGAAACGGTCACAGATAGGCAATAGCAGTTCCCGGAGAGCAGCTGCCATACCCATCCGCCAAAATGGTTTTGATTCATGCACTATTCTATCAGACTCAACCTTGGGTCCAGAATCACCTGTGAGGTCTGGACGAAATGGCACATCCTTCTGGCTTGAGGGCTTCAAGAAGAGTAGCAACATGGTGTCAGCATCTGGAATACCAGAATATTCATACAAGTATGTTTGTTGTCTTGTCTTATACTGAGTTAACTTCATGTGCCGTTCCTCTCTATGTTCTTGTAAATTTATTACATGTGTTGAAACTATATGAACTAGTAATGATCTGCTGCACTGTTTTTTTTCTTATATGAAATGATTGTTTCTAAATAGAATTCAATTGCTTGGTGGTCTTGTTCTCTGAAGAGAAACTCAGAGGAGTAATTAGGTTGGAGCATTTGAATATTGGAAGAGGAAACAAAGAAATGGATGGCTTTAAACTACAATAACTGCTTGATTGGTGTCTCTTATTCCATTCTTATTCCATTCTTATTCCTGAAAATTTGTAATTTTAGTGACTACGGCATGTTTCTATAAGTGAAATCAAGTTAGCAGTAGTTTCAACAAAGAACAATTTCTTTCGTGTCATTTATCTCTTTCTTCTTTCTTTCTGTTGAAGTCTTTCATCTATGCTTCAGGGATTTGCAAAAGGCAACATATAATTTTACAACACTCATAGGACAAGGTGCATTTGGTCCTGTTTATAAAGCACAGATGTCTACTGGGGAGACTGTTGCAGTTAAAGTTCTCGCTACTAATTCTAAGCAAGGGGAGAAAGAATTTCATACAGAGGTGAAGATAATATTTGTTTTTCAGTGCTTTGGTATGAGAAGAAGGTTGATGATTTTTACCATAACCTGAAAAGTAGTTTTTTTATATGTAAAAATACCTTTGTGCAATTTTCTTTTCTAAACTTGATATGAATAATTGTCAACTTGGCATGTTTTCATTTTAGATAACTTAATTCCAATTGGTAGTAACAGTTGTGCTGTATTAAGTGTGATAAATTAAAATTTTTCTGCTTTAAGTACGAAGTTGGCATGTTCTTTGAATTTTTCTCAGGTTATGCTGCTGGGAAGGTTACATCATAGGAATCTGGTGAATTTGGTTGGGTATTGTGCGGAAAAGGGGCAACACATGCTTATATATGTGTACATGAGTAAAGGCTGCTTGGCTTCCCACTTGTACAGTAAGTTAGCTGTCTTTTCATGGTCAACTTGAGGAATGATGGTATTGTTTTCATGTTGAACTTCCATCTGCAATAATAACTGAAGCAAATATACTTGTGTTTATATTAAGGTGAAGAGAATGGTGCTCTGGGTTGGGAATTGAGAGTTCATATAGCTTTAGACGTAGCAAGAGGAATAGAGTATCTTCATGATGGGGTAAGTTTCCTGAGATCTGTCTGCACTAAGAATTCTGCTTTCTCTATATAGTTATATTACAATCATATTTGTAATCACTTCAGGCAGTTCCTCCTGTAATCCATCGAGATATCAAATCTTCCAATATTCTCTTGGACCAGTCCATGCGAGCCAGGGTATGCCATTGCTATTTCTTTCACAGTAAGTGTTTGTTGAAATGCTTCTTATACTGTTGTTGTCGGTGGTGGTGTTGAATCAACAGGTTGCTGATTTTGGACTCTCGAGAGAAGAGATGGTGGATAAACAAGCTGCAATTCGGGGTACCTTTGGCTATCTTGATCCTGAGTATATATCTTCAGGAACATTCACCAAAAAAAGTGATGTATACAGTTTTGGGGTTTTGCTCTTTGAACTTATAGCAGGCAGAAATCCTCAGCAAGGTCTAATGGAATATGTTGAGCTTGTAAGATCTCTCTCTCTTTCTCTCTGTCTGTCTCTTTCTGTACCTGACATGAAACTGTTCCATGATTCCATCAACATCACTATGCATGATTCTAATGAAGATGTTAATGAATGATCAGGCAGCAATGAACAGTGAGGGGAAAGTTGGTTGGGAGGAGATAGTTGATTCTAGGCTTGAGGGAAAATGTGAGTTTGAAGAGGTGAATGAAGTGGCAGCCCTTGCCTACAAATGCATCAACCGCGTCCCAAAGAAACGGCCTTCCATGAGGGACATTGTGCAAGTTTTGACACGAATACTCAAGTCAAGGCACCAAAGGAATCATCATCATCACAAGAAGTCACTCTCAGCCGCAGGTGATGAAGTTTCCATTGATGTTGATCAGCTAGAAACCAAGACTTCTCTCACTCACCACCACACAAGAGAAGAATCTATAGACAGCGCAGCTGACATGTATGATTTGTAGAAGATGGTTTTGCATTTAGCTCAGTTTTTTCATTAACATTGAATTTTTTGTATTTGCCTTTGGATGTCATTTGGCCATAACTTTATCGAGGCACCAGTGATTTGATGATGCCAGACATCATCTTCTGTAATTGTCATAACATTTTTTTTGGTTTCTGTTTCTTTTTTTTTTTTTTCTCTTACCTCAGTTCTGTCTCACAGAAATGACACTCAAAATTTGTATAGTAACACTTCGAAGAATGAATTTGAAGCAACAAAAGGAAAAGTTACCTGTCTTGCCCTG