Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24363 LG6 6664068 6664548 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 6664143 missense_variant p.Ile117Thr
C/T 6664259 synonymous_variant p.Leu78Leu
C/T 6664377 missense_variant p.Ser39Asn
G/A 6664389 missense_variant p.Pro35Leu
G/A 6664394 synonymous_variant p.Thr33Thr
T/C 6664406 downstream_gene_variant
G/T 6664468 synonymous_variant p.Gly27Gly
C/T 6664470 missense_variant p.Gly27Ser
A/G 6664504 synonymous_variant p.Leu15Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24363.1
MTGPFPLAIAAMPLLRHLHLGSNFFSGQIPPKNLTALCELYIGYYNAYSDGILLEIGNLSQLVRFDAAYCRLSGDISADLGRLQNMDMLFLQVNALSGSLTPKLGNLESLKLMYLPNKVLSGEVPTSFVELKNLTLLLLQL*


CDS Sequence:
>Vu_24363.1
ATGACTGGTCCCTTCCCCCTCGCCATCGCCGCCATGCCCCTCCTTCGTCATCTCCACCTCGGCAGCAACTTTTTCTCCGGCCAGATCCCTCCCAAAAACCTCACCGCGCTTTGCGAGCTCTACATTGGCTACTACAACGCTTACTCCGACGGCATCTTGCTAGAGATTGGAAACTTGTCCCAGCTTGTCCGTTTCGACGCCGCGTATTGCAGACTCTCCGGCGATATTTCGGCTGACCTCGGAAGGCTTCAGAATATGGACATGCTCTTTCTTCAGGTGAATGCGCTCTCCGGCTCGCTCACTCCTAAGTTGGGGAACCTGGAGAGTCTCAAGTTGATGTATCTGCCCAATAAAGTTCTCTCCGGCGAGGTTCCGACGAGCTTTGTGGAGCTCAAGAATCTAACTCTGCTCCTGCTACAGCTCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_24363::LG6:6664548-6666548(-)
AATTATCAATCAATATCAAACACAAACTGAACCTGATTGATTCACTTCAACGTTTCAGTTTATCCTATCTCTTCCAACAAGAAATTAATAATCTATTGGAAAAAATTCACCACAGTTTTATAAAAGATAACACCATCATTGAAGATAACAATTATCACTCTCTTGCTCTACTCTTTCGATTGCTTAGACAACAGAGATATCCAATTTCATCAGGTACGTGTATACTTTTTCTTTACTATTTGGATGTGAAAATCACAATCTATACATATAATGTTATATATACGTCAAAACACAAAATCAATTAACTATTGTGTACCTTCCATTGTGTAAGCTGCCTTAGCAATTGATAAAGTAAAACGAGATGACAATATGAACCGAGTCCTAAAATCTGAAAAAGAAAACACCCTACTGCCTCGGTTATCTAAGAACCGAGACATAATCCTATCTCGTTTTATCTCGGTTCGTGACCTACTTTTTTACGTCGCTCATATATGTCTCGATTTCAGAACAGATGTCTATAAGCAAAAATAATCGGTGTCTTTTCTTACTGTACTAGTGTATGCTCCATGATAAAAGTTACTATAGTCATAATAATTTATTATTCAGTTAACGTTTATTTTTCTTTGTACCGTTTAGAGACAAAATTTTACTCCTTGAAACTAAATTCACTTTTAACCGAATTCTATTTTGGAATTAGTCCTTCGAATTATAATATTTTGATCTTTGGGAAAGTATAATATTTTGATGTTTACTATCAATGTTTTTATCATAGAGAGAGTTGTGTCTTAATAATATGTAATAATAAACTCTTTAGGCTATTTATGAGAGTTGTTCCTTTTGAAGTACTTCTATATTTTATAATGACGATTGTTGCTTTAGTCTATTTTTCAACTTCAAACTTCAACAATTGTTTACTTTTGATGTCGCAAGTACTTACGTTTATTTCAAATCTTTTGTTCTGTCATCATATATAGTGTTTGATAAAATTAATTAAAGTTTAAGAGAGTGAAATTAATGGGTTAAATAAAGTAGTTTAGAAAAACTAAAATAAAATATATTATGTAGGGACTTATAAAAATAAATTAAGATAAATATAATTTTATTTTATTATATTATGAAAATAATGATTTTTTACAAAATATTTCAATAAATAAACTCAACAGGGTTAGATACACTACAAAAATATTAAATTTTAGCATAGGTTAGTTTTCGAGGTTATAAAAACCTTCTTAAGTTTCTGGCAGTTTCCACAAAACCGCACTTAAATAATTTTTTTAAAAGAATTTCAGCGATTTCTAAATAAACCGCCTCTAAGTGAATTTTTTGTTTGTTTTAATTTCTCCAACCTGTGTTCAGACTTTTCCTTCTTCACTTCCAACCCTCTCTCCTCTTCCCAAACCCTATAAAATATTCCATCATTACCATTTTCGTCATTGGTGGAAGCGAGCGTTGGTGGGCGGTGCTTTTTGGCCGTCATTTTCATTGGAAGGTGTGGCGACATTTCCCTGTAAGCTCTCTCTCACTCTCTATGTTTGTTAGGGTTTTACTCTAGGTCTAGACACACTAGTGCAATCGGAGGAAACGACAGCGGTTATTTTCGCTAATAGGCACCGGTTTTTAAACCGAGACATATTCAGACGAGGTAAAAAGTGATAGACTTTATGAATCGATTCAGAACCGAGTCATAAAATAGTAAGATTATGTCTCGGTTTAAAATTAACCGAAGTAGTAACATTTTTTATTTTTTTAAATATTTTTTTTCGCTGGCCTTTATGCCTCGGTTCCTAACCGAGGTCGTTTCTCTCCCTCTCCTGAACCCCCATTTCCTCTCCTACCTTTCCCTCGTCGAGAACCAATTTTTCGGCCCAATCCCCGCCTCCTTCTCTGCACTCTCCGCCCTCCGCCATCTCAACCTCTCCAACAACACCTTCAACGCCACCGTCCCCTCCAACCTCGCCCGCCTTGCCAATCTCCAAGTCCTTGATCTCTACAACAAAAAT


Gene Sequence:
>Vu_24363(-)
ATGACTGGTCCCTTCCCCCTCGCCATCGCCGCCATGCCCCTCCTTCGTCATCTCCACCTCGGCAGCAACTTTTTCTCCGGCCAGATCCCTCCCAAGTATGGCACCTGGCAACACCTAACGAACTCATGGGAAACATCTCCCGAAGCTTAGAAACCTCACCGCGCTTTGCGAGCTCTACATTGGCTACTACAACGCTTACTCCGACGGCATCTTGCTAGAGATTGGAAACTTGTCCCAGCTTGTCCGTTTCGACGCCGCGTATTGCAGACTCTCCGGCGATATTTCGGCTGACCTCGGAAGGCTTCAGAATATGGACATGCTCTTTCTTCAGGTGAATGCGCTCTCCGGCTCGCTCACTCCTAAGTTGGGGAACCTGGAGAGTCTCAAGTTGATGTATCTGCCCAATAAAGTTCTCTCCGGCGAGGTTCCGACGAGCTTTGTGGAGCTCAAGAATCTAACTCTGCTCCTGCTACAGCTCTAG