Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24338 LG6 6230357 6234486 PREDICTED: transcription factor bHLH123-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 6230451 3_prime_UTR_variant
A/G 6230577 3_prime_UTR_variant
C/A 6230578 3_prime_UTR_variant
T/C 6230995 3_prime_UTR_variant
A/C 6231389 downstream_gene_variant
A/C 6231500 downstream_gene_variant
A/G 6231773 downstream_gene_variant
C/T 6231879 downstream_gene_variant
C/T 6232271 synonymous_variant p.Ser367Ser
A/C 6232337 intron_variant
T/C 6232869 intron_variant
G/A,* 6232876 intron_variant
A/G 6232885 intron_variant
T/C 6232962 intron_variant
G/T 6233291 missense_variant p.Pro207His
C/A 6233375 missense_variant p.Ser179Ile
T/A 6233379 missense_variant p.Thr178Ser
C/T 6233382 missense_variant p.Val177Met
A/G 6233413 synonymous_variant p.Phe166Phe
C/T 6233467 synonymous_variant p.Ser148Ser
A/T 6233631 intron_variant
C/T 6233632 intron_variant
C/A 6233659 intron_variant
T/G 6233712 intron_variant
A/T 6233728 intron_variant
T/A 6233752 intron_variant
G/A 6233886 intron_variant
C/G 6233892 intron_variant
C/A 6234193 missense_variant p.Gly10Val
G/C 6234305 5_prime_UTR_variant
T/C 6234313 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24338.1
MADDQFQASGNWWDTARNVRYESGASQSSSSAITNIANYAWQASDMADMKPRSSMDSSSVVFHDSQNKLQPPDSTTSTDPNLHMMGLGLSSQAMDWNQASLLRGEKGTENSFRSMLQESRTNFQQETGVELSQQVQWRSEKMFSTESSTNEFKHVNRGFSLDQSKFSPQYSSGDSTVTSQGLPSSNFQMDSSALYGTPSILQGLLGPDHNNQQPSSFENRSMSFPYPTTYGLNSNNELIPSWSKVPQFLRGSPPKQPPNNQLHFTNNAPFWNASEAANFKDVRSSFFPSLQPPFSTPNFEVQSKNISEVRESGTVGKKSGNEPAPKRTRNETPSPMPAFKVRKEKMGDRITALQQLVSPFGKTDTASVLSEAIEYIKFLHEQVTALSTPYMKTGAPIQIQQNSGKCKETEGPKQDLRSRGLCLVPVSSTFPVTHETTVDFWTPTFGGVSR*


CDS Sequence:
>Vu_24338.1
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Promoter Sequence:
>Vu_24338::LG6:6234486-6236486(-)
TTCGGCTTTTTCTTTTTAGTTTTTCTTTTGTTTGGCATTCTAAATTCTAATTTAAAGAAAGAACAAGGCATGTATGGTTATATATTTATACTCTTTTGTCATAAAATATATATAGGTATATGAATAAAAAAAGAGTAATTTTAAGAGTAAAGTGATATTTTATACTTTTAAATGAGTAGTTTAATCATTAACTTTTTTCACAAATCTGTGGTGGCAATATAGATAAATCTGGAGAAGTGGTTTGACAAAAAGTTAACAACACAGTAGTGATGCTTAAAGTACAATGAATAGAATCCTTCGGAAAAAAGAAATAAAAAAGAAAAAAAAGGAAATAAAGAATGCAACCTAACTCAACAAAAATAGTTAAAGGAAGCAAAACTTCTGTAGAATCCTAGAAGAGGCAACCTGGGATGAGCCAGGCCAGTCCAATAATACATGCTTTCTTTTTCAATTATTTTACTAGCTATATTTTCAACTTCTAATATGAAAAAATATAGGTGATTTATGAAACTTTTGTTTTTTATTTTTTGGTTAAAAGAAAGGAGAAAATATGTTATGACGTATGTTAAAATTAGTTGTTTTTGCAACAATTATCTTTAAAATTATATTTGCTTTTTTTTATTGATTAATGATGTAAAAACTTTTAGATTGACAATTCATAATTATTAAGCTTCGAAACTATGTTTTTTAGTTTGACTGCATATAGCATACACACTCATGTTTGATTAAGAAAAACATTCACAAAATGCTTTAATGCCATTTTTTTTTATTAAATTGACAGACAAGGAAAGCACATCTGTAATATAATAAAAAGATATAAAAATTATGTGGCAATATAACCAGAATTCATGAAATTAAATCATGAAATAAAGAAAAAACAGATTTCAAATCTATTTCTATTAATGAGATTAACTGGTCTATTTTGTAGAATTTTTTTTCCAAAAGCAAAAGCTTTGTTTTGTATATAGAAATGTGAACGAATTAACTGTTCGTTGATTTGAAATTATTTTTAAGATTTACACTTCTGGAGTCTTCAATTATTTTTTATTCTTTTGATACTGTGTAAGTTTTTTCTTTATTGAGTTTATTTAATTATTATTTACTCTTTTTATGTCTGCTATTTTTACATTAATTATTTGTTTTTAACTTTTTAAATATTTTGTCAGCATTAATTTTATATCTAATTTTAATCAATACTCCTAAATTTTATCTATATACATCATAAAAAAATTATTAAATAACAATTTAATTTAAAGAACAAAATAATTAATTATTATATTGACTTATAAACTAAAAGTTATTAATATTTAAAATATGTTCTATTATTAATAAAAAATTATTATTAATATATGAACTAAAATTAAATTAGTCACCAAGATTAATTAGTTATTTACTTCTAAATTAGTTTCTATTTTTTAATTAATGATTAATTTAGAATCAATAATAAGTAAATGTTAGAGATTATTTAAACTTTAATTCATAAATGAATTATAATTTTTAATTAATAATAAGATTAGTTTAGATACTAATAATTTTGTTTATAAAATAATTTATAATTTAATAAATATAATGATTAGTTATGTTTTTTTTCTAAATTTGATTATTATTTCATGATTTTTTTAAGAATAATCTATAAAAGTTTTCAATAAAATTCATTTTATTCACAATTTGTACTTTAGAGGCTGAGAACAGCTTAAAAAAAGTAAAAAGAAAAATTAAAACATCTTATAAAATAATAATAAAAAATTTAATTAAGTTTTGAGTAAATGTCTTTAATTGAGTCTTTATTGAAACAATTACTTAATATATTAACACTAAAATTAAAAGTGGTAAAATTTAAGAAGAATTTAATTCTTAATTAATGATAATAAATAATAATAATAATAAGATAAAGGAAAAAGCCAAATTGAATTTGAAAAAACTGAAGATGTAATTAAATTCCAGTGTCTTATCAATGACCCCTTTGAATTATGAAAGTGTCAACCATAATCCGGTTAGTC


Gene Sequence:
>Vu_24338(-)
AGTTACTCTTCTCATTCATTCATTCATTCTCATTTATGCACTTTCTCTCTTCAGCTGCCGATAATATAAATACTGAGAAGCAGCGAACCGTTTTCCATTCATTTTTCTCAAACAACAAAACACAACACACATAGACACACCTTTGAAGAATCTGATGCAGTCCTTATAGCACCATAGTTTACTTCTCATCATTTAACACTTATTTTCTAGTTTATAGATACACAGTGGAGGCTGAAGCAAACAACATTTCTTGGATTCTTCAACCATGGCAGATGATCAATTTCAGGCAAGTGGAAACTGGTGGGACACGGCAAGGAACGTCAGGTATGAAAGCGGGGCGTCACAGTCATCTTCCTCTGCCATCACCAACATAGCAAACTATGCTTGGCAAGCTTCAGATATGGCAGACATGAAGCCAAGGTCTTCCATGGATTCTTCTTCTGTGGTTTTTCATGACTCACAGAATAAGCTTCAACCCCCAGATTCTACAACTTCCACTGACCCCAACTTGCATATGATGGGTCTAGGCCTCTCATCCCAAGCCATGGATTGGAATCAAGCATCTTTGTTGTAAGTGCATGCAATCTGTGTAAAGTCCAACACAATCAAACCAACCCACTAAAAAAGAACACATTTTCGTCTCTTTTGCTATATTTTTATTATTTTTGAAAATAATAGCTTTAAAAATCAGGTTTTTAACCGTGTCAAATAACATGGTGTGTGATCTATGTAGCAGGTATCGGAAAAGGCTTTTATTCTTGTTATATTTTTCATAACTCTGCAATATAGCATGATAGGATTGAGTAAATGGTTTATCAATCTTCAAGGGGTATTTATGTTGTGAGTTTTCTTTTGTGGTTGTGTTTGTTCGATGGTGATAGACGAGGAGAGAAGGGTACGGAGAATAGTTTCAGATCGATGTTGCAAGAATCAAGAACAAATTTTCAGCAAGAAACTGGGGTGGAGTTGTCTCAACAAGTTCAATGGAGGTCAGAGAAGATGTTCTCTACAGAATCTTCGACGAATGAGTTCAAGCATGTGAATAGGGGTTTCTCCTTGGATCAAAGCAAGTTTAGTCCACAATATAGTTCTGGGGACAGCACAGTGACAAGCCAAGGGTTACCCTCTTCTAACTTTCAGATGGATTCCTCAGCCTTATATGGGACCCCTTCAATATTGCAAGGACTATTGGGACCTGATCACAATAACCAACAACCTTCTTCCTTTGAGAACCGCTCCATGAGTTTTCCATACCCAACAACCTATGGATTAAACTCTAATAATGAACTCATCCCTTCCTGGTCCAAAGTTCCTCAATTTTTGAGAGGTTCACCTCCAAAACAACCACCCAATAACCAGTTGCATTTCACTAACAACGCACCCTTTTGGAACGCTTCTGAGGCTGCAAACTTCAAAGATGTTCGGTCCAGCTTCTTCCCTTCATTGCAACCCCCCTTCTCTACGCCAAATTTCGAAGTACAGTCTAAGGTATACTATTTCTTTAGTACTACAAAACATGACAACATAGTTTAAAAACATCATACGTATACCAAGTTGTAAAATTTATTGATACATGTGTATATATTCTCTACGGAGCCTTATTAATTATGCAGTATTATATATGGTATTAGGGTTTAATTGAAGTACTGCATTGGATGTGGTGTAAAGTAAAGTTTAGATTTAATTGATATAGGCATGGTTTTTAATTTGCAGAATATATCTGAAGTTAGGGAGTCTGGTACTGTGGGAAAGAAAAGTGGGAATGAGCCAGCACCCAAAAGGACCCGTAACGAAACACCATCTCCTATGCCAGCTTTTAAGGTACAATAAGTGCAACTAACCTTTTAACAAGAAGGGAAAAAGCTTTAAACTTTTTATCTTTATCTTTATTTCTTTCCTTTGAATCCATAAACATGGATGTGAACCTGTAATTCTACTTTCTTGCCTCTTAGGTGAGAAAAGAGAAGATGGGGGACAGAATCACTGCACTCCAACAATTGGTGTCGCCTTTCGGAAAGGTGGCCTTCCAATAAAATTATCTTCAGCTTATTTATTGATGATCATTTCATTTGTGAATTTATGTGATATAATAAGTGCGGATAAGGAAAATAAATAAATGATCATAGCAGTCTTGATAATGCTGCTTTATTAGTATAATTATTATAGATAAAAGATTAAAACTCTGTTGTATATTGTGTCAGACTGATACAGCCTCGGTGCTCTCTGAAGCCATTGAATACATCAAATTCCTCCACGAACAGGTCACTGTAAGTCCCATAACCCATTAAGATATTCTTATTAAAAAACTAGAAATAGTGGCAAGACTTTCATCTTGTAGCTATATTTTTTCGTTTTTCTTTTTCTGCAGGCCTTAAGTACACCGTATATGAAAACTGGAGCTCCAATACAGATTCAACAGGTACCATACTTACATAAAGATACTGCAATTAAATCTCTTGTTTCTTTCTTTCAATCTCTAAATGAGTAGTGATAGACCCTCTTTTAAATATCAACTTTCTCTCCTAAATTTCACTTTAGTTACAATCCTGATATTTTTAACGTCGTTGTTATAGTTTTTCTTCACTCCATTACAGACCTTCAGCACATGTAAGCATTAAAAATTTCTAAGTTTGCATGAACTTTGTTTAACAGAAGGTAAATTATTTGTACAACTATTATACTAAATATTTAATGTAAATATCTCAAATTACTATACTAACAAATTTATTTAGTTAAACTGTTAACCGAATAATTATAAACATATACATATACTTTATCTTTCTTTCCATCATGCATTTCGTCTTTACATCTTTCTCCTCTTTTCTTATCTCATAATTTATGTCTATTATGTTTTTCTGGTTTTTGGTTCTTACATGTCTTATATCCACTGTAATGTTGAATCATTGTTATATCATATGCTTTCGCATAATGCACTCACAGTACAAGACATTTTTTGTCTCTCTCTTCTCTTAAAAAAGATTTGATATATATGAAAAAGAGGGTAAAAGAAGAAAAAATGTGAAATAAGCATTACTCTAATAGGAAGGGAAAGGAAAGAGATGGGAAAGGGCGAGTAAGATGCAGATAAAAAAAAAGATGAAGATTTGATTCTCAGGCACTGATGCTGATAAACTTTTTCCAAATTTGGCAAATTATAATGCATATTTTGGCTTTTGATGCAGAATTCTGGTAAATGTAAGGAAACTGAGGGTCCAAAGCAGGATCTAAGAAGCCGAGGGCTATGCTTGGTGCCTGTTTCAAGCACATTCCCAGTAACTCATGAAACAACAGTGGATTTTTGGACACCAACATTCGGAGGAGTTTCCAGATAGCAATAATAATAAGGGTAAAATGTGTTTTAAGTCTGAAAATTTTTGATGAAAAGATGTTTTAGTCCATATTTTTTAAAGAAGGATTGTGGTCTTTGTGCTTTTATAATTGATGAATTTCATCTTGTTTGTGAAACCTATATATATGGTTGAAAGCGAGGGATGAAATTCAGTAATTATAAAAGTATTTGGATGGAAATTAAAGAAGTTAAAACACATTTTGCCCTAATGATTATAATAATATAGATGGATGGAGAGTTGGGACACGGAACCAATATCCTGCAAGTAGGTAGCTAGGACATGCATGTACCTTGTCACACACCTGGCCAAGTTGGGAATGATATGATGAAAGAAAAGAGAAACAAGAAAGAGGACACGGAAGCCCACATAAATATGTAAAGGTAGTTAGTTCTGCTGGAGAGTGGAAAAGATGTATAAAAAAGAGAAGGGAGAAAATGTGTTTGAAAGAGAAAGAAAGGGAAATGACCCTTCAAAAGATAGCCATTGTTGGACCAACTACATTCAGAATTATGCAGTGTTTGGGAAATATTGGGACCATTGGGAGCAGAATAAGTTGTTGTAATAATTGCAGAATTGTGCTTAGAATAGTGGGATTAATTAAGCATGACAAAAATGCTGAATATACTGAAAATTCTTACTTCCAAGACTAAACAAGAGGGAGAGAAATTTTTGTTATAGCAGAGATAAAGGAGCTTTATTATTTGTTGTTGCTATATTGTGAATAGAGCTGGCACTACCTACCTTTAACTCAAGAGAAAAAGGAATTTTAATTGAGAGAAT