People Important Links Contact Us
Chickpea portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Menu

Genetic Resources

Genomic Resources

Agronomic Practice

Publications

Nutrition

Social Resources
  • Maps
  • Gene Families
  • Gene Search
  • MARKERs  
    • SSRs
    • SNPs
  • JBrowse
  • Download

Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24326 LG6 6115506 6118819 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108332817
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 6117360 intron_variant
A/T 6117389 intron_variant
A/T 6117613 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24326.1
MDFYEVIVWCSLLLSSFIPNITALSSITPNKPLHSNETLVSASGTFEAGFFSIGSSQRYYFCICYKNISPRTFVWVANRNTPLDNSTGVLKVSDWGNLAVLDGTGANVWSSNASTTVQKPTVELLDSGNLVVKDGGSNAPEKILWQSFDYPGDTLLPGMKLRSSFVTGALSSLTSWRNTEDPAVGEFSLYIDPHGFPQRVTTKGGTWLYRAGSWNGYQFSGVPWKLLPNFFNYYFVLTKEEVYYEYELLERSVVTRFVINQAGSDQRFTWSERTKSWELFASGPREQCENYGLCGVNSVCNVNSYPICECLDGFIPKFTEKWRSLDWSGGCVRRMSLSCDNEDGFVKYEGMRLPDTSSSWYDARMSLDECERVCLQNCSCTAYTNLDVRGGGSGCLLWFGNIVDMGKHLSQGQEIYIRMAASDIENTWHKRHINKKLVVVLAVLVAFIIVITLGSVLYIRRKLEKQANTKRVVGTHGYMPPEYAVYGYFSVKSDVFSFGVIVLEIVSGRKNTKFLDPLNQLNLIGHAWRLWSEGRPLELVDESLGDSVIESEVLKIVHVGLLCVQERPEDRPNMSSVVLMLNGESPLPKPKQPAFYPHHEDFSSSTKCEFSSNDMSISLEAR*


CDS Sequence:
>Vu_24326.1
ATGGATTTCTATGAGGTGATAGTGTGGTGCTCTCTCTTACTTTCTTCCTTCATACCCAACATCACTGCACTGAGCAGTATCACTCCAAATAAGCCCTTGCATAGTAATGAAACCCTGGTTTCAGCATCTGGAACCTTTGAAGCAGGATTCTTTAGCATTGGAAGTTCTCAGAGATATTACTTTTGCATATGTTACAAGAATATATCACCTAGAACATTTGTATGGGTGGCCAACAGAAACACCCCATTGGATAACTCCACTGGGGTTTTGAAAGTCAGTGATTGGGGGAATCTTGCTGTACTTGATGGCACTGGTGCAAATGTTTGGTCATCCAATGCATCAACCACTGTTCAGAAGCCAACTGTGGAGCTCTTGGACTCTGGCAACCTTGTTGTGAAAGATGGTGGTAGTAATGCCCCAGAAAAGATTTTGTGGCAAAGCTTTGATTATCCTGGTGACACTTTACTTCCTGGAATGAAACTCAGAAGCAGTTTTGTGACAGGTGCACTTAGTTCTCTGACATCATGGAGGAACACGGAAGATCCTGCTGTGGGGGAATTTTCATTGTATATTGATCCTCATGGTTTTCCTCAGAGAGTGACTACAAAGGGAGGGACTTGGTTGTACAGAGCAGGTTCGTGGAATGGTTATCAATTCTCAGGAGTTCCTTGGAAACTGTTGCCCAATTTCTTCAATTACTATTTTGTGTTAACCAAGGAGGAAGTGTATTATGAGTATGAACTCTTGGAACGTTCTGTTGTTACAAGGTTTGTGATCAACCAAGCAGGTAGCGATCAACGTTTCACATGGTCAGAGAGAACAAAGAGTTGGGAGCTTTTTGCCTCTGGCCCCAGGGAACAGTGTGAAAACTATGGCTTGTGTGGTGTAAATTCTGTTTGCAATGTAAATAGCTACCCCATATGTGAATGCTTGGATGGTTTTATCCCTAAGTTCACAGAAAAGTGGAGATCATTGGATTGGTCTGGTGGGTGTGTTCGGAGAATGAGTCTGAGTTGTGACAATGAAGATGGTTTTGTTAAGTACGAGGGAATGAGATTGCCAGACACATCTTCCTCCTGGTATGACGCAAGAATGAGTCTTGATGAATGTGAGAGGGTGTGCTTGCAAAACTGCTCTTGCACAGCATACACAAACTTAGATGTCAGAGGTGGTGGGAGTGGCTGCCTTCTTTGGTTTGGTAACATTGTGGATATGGGAAAACATCTCTCCCAAGGACAAGAGATTTACATACGAATGGCTGCTTCAGATATAGAGAACACTTGGCATAAAAGGCACATTAACAAGAAGCTTGTGGTGGTTTTGGCAGTACTCGTTGCGTTCATTATAGTCATAACATTAGGATCAGTTCTATACATACGGAGAAAACTTGAGAAACAAGCCAATACAAAAAGGGTTGTAGGAACTCATGGTTACATGCCTCCTGAATATGCAGTGTATGGATATTTTTCAGTGAAATCAGATGTCTTCAGCTTTGGTGTTATTGTGCTAGAGATTGTTAGTGGGAGGAAGAACACAAAATTTCTTGATCCACTGAACCAACTTAACCTTATAGGGCATGCTTGGAGATTGTGGAGTGAAGGGAGGCCTTTGGAGCTGGTTGATGAATCACTAGGTGATTCAGTCATTGAAAGTGAAGTGTTGAAAATTGTTCATGTGGGGCTCTTGTGCGTGCAAGAAAGACCAGAGGATAGGCCCAACATGTCAAGTGTGGTTCTGATGCTGAATGGTGAGAGCCCATTGCCCAAGCCCAAGCAGCCTGCATTTTATCCACACCATGAAGATTTTTCTTCATCCACCAAGTGTGAATTCAGCTCAAATGATATGTCCATCAGTTTAGAGGCAAGATAG


Promoter Sequence:
>Vu_24326::LG6:6113506-6115506(+)
TTTTCATTTTTTTATTGATATAATAATTCAATTAAGGGTAAATAAATAATTCAAACTTTGAGACTCCTTCCAAAATAATCCAAATCCATATTGTTTTAAATCAATTTAAATTGATTTATCCCAAATTTAAATTCATATTTTTTAATTTTAAATCCAACCGCATTTAATTGGATTGGATTTTTAATCCAAATCTCAATCCTTTAATTGGATTTGGATTAGATTTAGATTGGATCATTGTTACAAAATTGACAAGTATATACTAACGCGTACAGATAATAAAGTGAATAAGTTGAGATATCATTTTTCAAGTTGGCCCCAACCAAAAGTTAATTGAATTGCCCCGTGCGAAGGTTAATTGAGTCAATCCTGGGTGAAGGTGGGTTGACTGGGCCCTGATCAAATGTTAGTTGAGTCAGTCTGAACCGAAAGTCAAACTGAATCGATCAAGATCTAAGGTCGAATCGAATCGGCCTTGGTAAAAAATTCAGACTAAATTAGCCTAAGACGAAGGGTCGAGCTGAATCGCCCCAACCCATATCTAATAAACTTAATATATTAGATCAATCTCATTCAATTTGATCTAATTGAGAAAGTAGATTAAATCTAGTTTTAATCCAATTAAATTGAATTGAAAAAAAAAAATTCAAATTTAGTTAATGTAATTGAAATGGATCTAGATTTTATTTCAGATTCATTTTAACTAAATTAACTAAATTTAGATTATAACTCTAGTCATTTTTTTATTGAATCTAGATTGGATATTGAAAAATCCAATCCATGATCATCCTTAAATTCAATAAGTAACTTATCTTTAAGAATTTGAATAATACAAAATGGAAAAAATAACGACAAGTAATTGGTAAAAGACATATTTCAATAGTAACCTAAAAAATTTCTCAATTTTCATCATTCATTTTCCTTTGCTTTATTCCTTTTGTGTCACTAACGTTAAGATGATGTCTATTCAACATGTTGCAACTTAATCACTCTATGATCTAATTTTAATACCTTTCGACTTAATTAGGTTCATCTGAGACGAAATCTTTTGAAACAATAAAAGACCATATTTATGAAATATCCATTACATGGTTGGAGGCAATATGGCATATAAAACTACAGTCAGTCTTTATCAAGTGGCTTTAGGTATCCGATGTTTGTAATAAAATAGATAGTTATGTAAAGGGCCAAGTTTTGTAATTAGCCTGTTAAATGGATTTCCTGACAAAGAATTCTGTTATGGCTTCACCTGAAAGACTATCCGAAATGGAGATTTAGAACCCAGATATTTTGAATTATATGATTAACTAATGCTTTGAGTTTGTGCTTGAATGTTGTTGTCATGCTTGCAAAATTTAACTGTAATCTCTTTTATGCTTCTAGGTATGCATGTGGTGGATATCTATTACTGGCTTATACCTCAACACTTCACCATATAAAGGTATTTATTTCATTTCAAATACTAGTATTATATAATTATATAACAATCATGAGTTGGACCCTGAGTATGCAATTACTGAGATATCATTCTTTAGAGCTGAGACATTATTTTATTACATAGTGGTACGTTATTACCACCAACGATTTCTTCTAGGTCCCAGAAAATTCTTAATTTGTTATGAATATTGGGAAAGCGTTTTGAAGTGTCAAACATGTTTCTGCAAAAAAAGCATCTCAAACCATGCCACACTTTCGATAAGTCTAATTCTTTTGCTTGACGAAATTGTTCAATGACCCCAGTTGAGTTGGAGCAGTTAAAGAGTGTTACATCCACACCAGAAACCAGAGGATGATCAAAAGTCAAATTTTTAGTGCAGGTCGCTCCAACCACTAAAAATAAAGATACTTTTTCTTATTTTCTAATGTGGATGAAGACTCTCGCGTTCATATGTGGAGTTGAAGTCACAATCTTCTTTCAAAATTTACGCTTTAGCAAGCTCTAGTCCAATATAAGTTGAATAAGTAGTTGCATATACAATACGTAAGTTATAGAATAAATTATA


Gene Sequence:
>Vu_24326(+)
ATGGATTTCTATGAGGTGATAGTGTGGTGCTCTCTCTTACTTTCTTCCTTCATACCCAACATCACTGCACTGAGCAGTATCACTCCAAATAAGCCCTTGCATAGTAATGAAACCCTGGTTTCAGCATCTGGAACCTTTGAAGCAGGATTCTTTAGCATTGGAAGTTCTCAGAGATATTACTTTTGCATATGTTACAAGAATATATCACCTAGAACATTTGTATGGGTGGCCAACAGAAACACCCCATTGGATAACTCCACTGGGGTTTTGAAAGTCAGTGATTGGGGGAATCTTGCTGTACTTGATGGCACTGGTGCAAATGTTTGGTCATCCAATGCATCAACCACTGTTCAGAAGCCAACTGTGGAGCTCTTGGACTCTGGCAACCTTGTTGTGAAAGATGGTGGTAGTAATGCCCCAGAAAAGATTTTGTGGCAAAGCTTTGATTATCCTGGTGACACTTTACTTCCTGGAATGAAACTCAGAAGCAGTTTTGTGACAGGTGCACTTAGTTCTCTGACATCATGGAGGAACACGGAAGATCCTGCTGTGGGGGAATTTTCATTGTATATTGATCCTCATGGTTTTCCTCAGAGAGTGACTACAAAGGGAGGGACTTGGTTGTACAGAGCAGGTTCGTGGAATGGTTATCAATTCTCAGGAGTTCCTTGGAAACTGTTGCCCAATTTCTTCAATTACTATTTTGTGTTAACCAAGGAGGAAGTGTATTATGAGTATGAACTCTTGGAACGTTCTGTTGTTACAAGGTTTGTGATCAACCAAGCAGGTAGCGATCAACGTTTCACATGGTCAGAGAGAACAAAGAGTTGGGAGCTTTTTGCCTCTGGCCCCAGGGAACAGTGTGAAAACTATGGCTTGTGTGGTGTAAATTCTGTTTGCAATGTAAATAGCTACCCCATATGTGAATGCTTGGATGGTTTTATCCCTAAGTTCACAGAAAAGTGGAGATCATTGGATTGGTCTGGTGGGTGTGTTCGGAGAATGAGTCTGAGTTGTGACAATGAAGATGGTTTTGTTAAGTACGAGGGAATGAGATTGCCAGACACATCTTCCTCCTGGTATGACGCAAGAATGAGTCTTGATGAATGTGAGAGGGTGTGCTTGCAAAACTGCTCTTGCACAGCATACACAAACTTAGATGTCAGAGGTGGTGGGAGTGGCTGCCTTCTTTGGTTTGGTAACATTGTGGATATGGGAAAACATCTCTCCCAAGGACAAGAGATTTACATACGAATGGCTGCTTCAGATATAGGTACTAGTAAGTTTTCAATTGAAACAGAAAAATAATGCATGACACTCAGGTTTGTGCGACCATTGCATTTAATGTTCTTACCTTTACTGCTTAATGTGTTTTCTAATATTCCTTTTGTTCTAACAGAGAACACTTGGCATAAAAGGCACATTAACAAGAAGCTTGTGGTGGTTTTGGCAGTACTCGTTGCGTTCATTATAGTCATAACATTAGGATCAGTTCTATACATACGGAGAAAACTTGAGAAACAAGGTAAACTTTTAGATTAGGTGAGTTTTTATGTAATGTTCACTACACGAATTGGCAACCACCAAAGTAAAACAGGGCTAACCTACAGTTTGGTCCTTCATCTCATTTATTTAGTTTCAAGGTCTTTAAGTTTAAAAAGTGCCACTTTAGTCTTGGAAGTGTTTTTGTCAAACTAAATTTGTTTTTCCCTTTGTCTTATTGCACTAAATTTCTTGATGTGTCATCTTTCACACTTTGCCATACTATCAAGTTGACCATGTTAGTATGGTGAACTGATATAAAAACCAATTTGGACTAACACATTTTAAGAGACCAAAATGCAAAAAAGTAAAAACTAAAATAAGAGACCAAAGTATATTTCAACCATAAAACAATAATAGGCTGTCATTTGCTTACAATTTGCTGCTGCCATATCAGGAAAGACAAATACAGTGGACCAGATGCCTCACACTATAAAACATGGGAAGAAAGACATTGACTTACCAACCCTTGATTTATCAACCATTGATAATGCCACTCGTAATTTCTCTGTCAATAACATATTGGGAGAAGGTGGATTTGGACCAGTTTACAAGGTAACATCAGAATATCCCACCAATGTTACACTTAATATATTTTGAATATTTGTCCACATTTAATTATCAGGGTGTTCTGGCAAATGGACAAGAAATAGCTGTTAAGAGACTTTCCAAAAATTCTGGACAAGGATTAGATGAATTCAGAAATGAAGTGGTGTTGATTGCCAATCTTCAGCACCGGAATCTTGTAAAGATTCTAGGATGTTGTGTTCAAGAGGAGGAGAGAATCTTAATCTATGAATTCATGCCTAACAGGAGCTTGGATCTTTACATTTTTGGTTTGAGGCTTTTACTCAGATTTTTTTGTACTCTCATTTCTGCCAAAATCATTTTAACTTAAATTAGGCAACGACATGCAGATAACACAAGAAAGAAATTATTGGATTGGAGCAAACGCTTCCAAATTATAAGTGGCATAGCTAAAGGTCTTCTATATCTTCATCATGATTCTAGACTAAGGATCATTCACAGAGATATCAAAGCAAGCAATATTCTTCTTGATAATAATATGAATCCAAAGATATCAGACTTTGGACTAGCAAGAATGCTTGTTGGTGATCACACTAAAGCCAATACAAAAAGGGTTGTAGGAACTCAGTAAGCTTGTTTATGCTTTGATAGTTGAACTAGATACCATGAATGTTGTATACTTTTTCTTTTATCTGAATCTGTTCTACTTTGTCTTGCAGTGGTTACATGCCTCCTGAATATGCAGTGTATGGATATTTTTCAGTGAAATCAGATGTCTTCAGCTTTGGTGTTATTGTGCTAGAGATTGTTAGTGGGAGGAAGAACACAAAATTTCTTGATCCACTGAACCAACTTAACCTTATAGGGCATGTAAGCATAAATTTATTACTATTCTAACAAGAGTTTAATTTCTATATACTTAACCTCAAAGGTTGTATTTAATTTTTGTTCAGGCTTGGAGATTGTGGAGTGAAGGGAGGCCTTTGGAGCTGGTTGATGAATCACTAGGTGATTCAGTCATTGAAAGTGAAGTGTTGAAAATTGTTCATGTGGGGCTCTTGTGCGTGCAAGAAAGACCAGAGGATAGGCCCAACATGTCAAGTGTGGTTCTGATGCTGAATGGTGAGAGCCCATTGCCCAAGCCCAAGCAGCCTGCATTTTATCCACACCATGAAGATTTTTCTTCATCCACCAAGTGTGAATTCAGCTCAAATGATATGTCCATCAGTTTAGAGGCAAGATAG

NIPGR © 2020

This project is funded by the Department of Biotechnology
Ministry of Science and Technology
Government of India

Visits: 1575359