Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24255 LG6 4698797 4701941 PREDICTED: plant intracellular Ras-group-related LRR protein 6 isoform X2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   signal transduction
Cellular Component   is active in   cellular_component
Molecular Function   enables   molecular_function
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 4699525 downstream_gene_variant
T/G 4699672 downstream_gene_variant
T/C 4699693 downstream_gene_variant
A/G 4699880 downstream_gene_variant
G/A 4700006 downstream_gene_variant
T/A 4700012 downstream_gene_variant
G/A 4700161 downstream_gene_variant
G/A 4700192 downstream_gene_variant
T/A,* 4700296 downstream_gene_variant
A/G 4700297 downstream_gene_variant
G/A 4700356 downstream_gene_variant
T/A 4700665 downstream_gene_variant
T/G 4700750 downstream_gene_variant
T/C 4700795 downstream_gene_variant
C/T 4700988 downstream_gene_variant
C/T 4701042 downstream_gene_variant
A/G 4701064 downstream_gene_variant
G/T 4701576 downstream_gene_variant
A/C 4701604 downstream_gene_variant
A/C 4701626 downstream_gene_variant
G/A 4701630 downstream_gene_variant
A/T 4701814 downstream_gene_variant
A/T 4701818 downstream_gene_variant
T/A 4701891 stop_gained p.Leu238*
G/T 4701898 synonymous_variant p.Gly240Gly

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24255.1
MNRLLKAARASGSLNLSNRSLTEIPDEVYRNLEGLGGGGGDDDDKWWEAVELQKLILAHNSIGSLKEDLRNLPFLVVLNLSHNCLTQLPAAIGELPQLKMLDVSFNSIIEIPEEMGSAASLVKLDCSNNRLTELPSSLGRCLELSDLKGSNNLFTSLPEDLANCSKLSKLDMEGNKLSMISENLISSWTMLTEFNASKNLLTVLPVSIGGLSRLIRLDLHQNRISAIPSSINGCHSLTELYLGSNSNLFRCKSSYY*


CDS Sequence:
>Vu_24255.1
ATGAATCGGTTGCTGAAAGCGGCGAGAGCCTCTGGTTCTCTCAACCTCTCCAATCGTTCCCTCACAGAAATTCCCGACGAGGTTTACCGAAATCTGGAGGGGCTCGGCGGCGGCGGCGGCGACGACGACGACAAGTGGTGGGAGGCTGTGGAGCTTCAGAAGCTTATTCTGGCTCACAATAGCATTGGATCGTTGAAAGAAGATCTGAGAAATTTGCCTTTTCTCGTTGTGCTGAATCTCAGCCACAACTGTCTCACGCAGCTTCCCGCTGCTATCGGAGAGTTGCCTCAGTTGAAGATGTTGGATGTTTCGTTCAATTCGATAATTGAAATACCGGAGGAGATGGGATCGGCAGCATCGCTTGTGAAGCTTGATTGTTCAAATAATAGGCTCACGGAGCTTCCAAGCTCGCTTGGCAGATGCTTAGAATTGTCGGACTTAAAGGGATCAAACAATCTTTTTACCAGCTTGCCAGAAGATTTAGCAAATTGCTCTAAATTGTCTAAGCTAGATATGGAGGGCAACAAGCTATCAATGATATCAGAAAATCTCATTTCATCATGGACCATGCTTACCGAATTCAATGCATCAAAAAATTTGCTGACAGTGTTACCAGTGAGCATTGGAGGCCTTTCACGTCTAATTCGTCTTGACCTTCATCAAAACAGAATATCGGCAATCCCTTCATCAATCAATGGTTGTCATTCACTTACAGAGCTTTATTTGGGGTCAAATTCTAACCTATTCCGATGCAAGTCTTCATATTATTAA


Promoter Sequence:
>Vu_24255::LG6:4696797-4698797(+)
AGTTAATTTATGGTTATAATTCTCTTTTTGATTGAAAAATATATTTTGGTATGTATTTCTATGTTGTACATACTTTATTTCATATGGAGGTATGTTTTTGTGATGTAGGATGTTACATAAACAAAATCATCTTTAAAAGGAAACACATACTTTAATCAACGATTGAGGTAAGTATCAAGGCAAAAAATGGTCTATGGTTTCGATTTTGGATCAAATTGAGACCATAAACCTTTACGTTAAAAAAATATTTAAAATGAAATTAGACCTATGACAACGGTTGTTCCAATAATCGAAACATAAACGACTTTTAGCAACGGTTCCAAAAGTAACAAAAGTCTTGTGACTTTTAACTTTTGTAAAATATTTTTATTTATTTCTTTATTCTTCCAAAAATGTAAATAATTGATTTTACTTTATTAATATTTATTTAAAATAAGTGAATAATATTTAGCTTATTAATTTTAAAAGTTTATAAAATAATACAAACTAACATTGTATTACAAGTAATTAATCAATTTTTCATCTACTATTATATTATAAATAAAAAAATTCATAATTTTCTTTCAAAAAAACCACAATAAAAGTGTATTCATTTTACCATAGGAATACATATTCGATTTGTTAAATTTTAATGTAGTTGTTCATTTTTTCCCTATGTGTTCAATCAGGGTCAAATTTTTGTTAATTTTGTTCAATTTAGTTATTTTTACTAACACTCCTAAATAATTAACCGTAGAGTGTATAACATGGTTCATTATTGTTCTAGTGACATTTTACCTTCTTCGTTTCTTCATCACACGCTCACCTTCATGCATCATCATCTTCCTCACCTCCATTATCACCTCTATCTTCGAAACCTTATTCATCTCCACAATTTTTATACACAAATTTTAATTTATGTTTTGCTCTTTAGTTTTAACTGTTTCGAGATTGTACATTTAGGGTGGAGGAGAAGAAATTGGAATGCCGAAAAGCACAATAAATGTGCATATTTTATTTAAGAGGAAACAACATTAACACTAAATTATGCTTCTCTAGATCACTCAGAATCACAATGACAATGTTATATTTAATTATAATGATTGGAAGTGAAAAAAGGTATGTCCCTTAGAAGTGATTGGAAAAGGAAATGAAAGGCGCGTTTATGATGTTAATGAATGTGTTTCTTAGGTTGCTTCTCTTAAAGTGTACTCCTGAATTAGGATTTTAGGTGTGTCATGCTTCTTTATTAAATCTTTAAATTAACAATTTCCCCACTAAAGTTTCTTGGTACACTAAGTGGAGAAAAAAAAAGTAGATAATCAATGGTTGGGTGGAAGGTGTTTGAGAGGATGGAAGTGAATGAGTTATTGAGAAAAAAAATAAGAGAAAGAGTTTAGGTGGAAGGGTGGAGAGGAAAAGGATAATGAAGGTGAATTAGATTATATTGAAGGAGATGATGAATACTTTAATGATGGAGGTGAGGAAAAAGATGATGAAGGTGGAGAAGATCATGATACTTGGAGGTGAGCGAATGATGAAGATATAAAGGAGATGGAATGTGGCAAAATGATAGATAAAAAGCTCTCTACTATTCAGTTAATTATTCAGATAATTATTTCGACAATGTTATTAAAAAATGATTAAATTAAATAAAATTAACAAAAATAAAAACTTAACTAAGCAAAAATAAGAACCAAATTTAACAAATTAGATTAAAATAGAGACTAAATTAATATTTTAGTCTAAATACAATGAGATATCTTAAGTTTTAGTTTAGCCATTCCTTTTAACATTATTAGTTATGTTTTAACAGCAAGATGAATTGAAATTGCACCAAATCGGAGACAAGCAGTTCATTTAAACACTGTATTGTCATGTTCTTGATTTCATAAGCAAGCTTGTGAAGTTCTGATGCTATGAAAGAATCATTGTTATAATTATTATTCTTCTTTCGAAAATCATTTGAAATTTGGAACGCATTCTTCGTCTCCGCTGGATCTGATCTGAACACGGTGCCA


Gene Sequence:
>Vu_24255(+)
ATGAATCGGTTGCTGAAAGCGGCGAGAGCCTCTGGTTCTCTCAACCTCTCCAATCGTTCCCTCACGTAAGCCCTAGCCAACTCTTTCCACTGCTCTGTTCATTTTTATGTTTTCCGTTATTTCAATTCATTCGAGGATTGCTATTGCTGTTGTTTCGATTTGCAGAGAAATTCCCGACGAGGTTTACCGAAATCTGGAGGGGCTCGGCGGCGGCGGCGGCGACGACGACGACAAGTGGTGGGAGGTAACGTACATTTCAAATTGAACAGAAGTTTCATTTTGAATAGGAAAACGGAATGAAATTTAAAAGGAAATGAAATACAAGTGAACGAAATTTACAGGCTGTGGAGCTTCAGAAGCTTATTCTGGCTCACAATAGCATTGGATCGTTGAAAGAAGATCTGAGAAATTTGCCTTTTCTCGTTGTGCTGAATCTCAGCCACAACTGTCTCACGCAGCTTCCCGCTGCTATCGGAGAGTGAGTTTTTGTTTTCAGTTGTGCTTTTTACTGTTTTCAGTTTGAAAATGTGTTGCTGGATTTTTCATTGTTGTTTGTTTCTTATTTGTAGGTTGCCTCAGTTGAAGATGTTGGATGTTTCGTTCAATTCGATAATTGAAATACCGGAGGAGATGGGATCGGCAGCATCGCTTGTGAAGTATGCTCAATTCTGTTTCTTTTTTTTTCGTAGGTTGGTTGATATGAGGAAGTTTGCTTCCCTTTGTACTTATTCTGTTTGCATGTGTGACTTGCGTGCTGCTCGGCTTTTGCATTTGCTTGTCTAGGCTTGATTGTTCAAATAATAGGCTCACGGAGCTTCCAAGCTCGCTTGGCAGATGCTTAGAATTGTCGGACTTAAAGGTAATGACTATGTCTTTCTGAAACTTCGGAGAGTAGATGTTATTTGTGCAATTGGCTTATGCTGCTCATCTTACAGAAAAGAGGTTTTTTCAAATTGTGCTTGTGATATTGTGAATTACACCTTGAAATGCTATCAAGTTTATTTATTATTTTGATGCCTATAAAAGGCATTTGTTTATGGAGCCCACTAGAAAGTATGGACACAACATGGAACAGTGATTATTACTGACAAATTTTAAAAATTATGGAACTTCAAACATCTATTATAGTTTTAAAATATAAAATTAGTGTAACATTAAAATAAATCACAAGTCTTAAATAAATATGGGGAAATGTGTAAAAAGAAAAAAGAAAAATCAAAGAGAACCAATGCTTTAAAAGTGAACATTCATTGTAGGAATAATAAAATGTTATAAATATTACTAATACTAATGTAATTATTGTGATATTTCTCATTTGTATTGTAATAAAATTGTAAAATATAAAAGAAAAAAAAATGGGCACAGCTACTTCTTTGAAGTGTTCAAGCTTCTTTAGGGGTTCACTTTGTTCTATGTTAATGTTAGACATTCTAATTGATAATATTTGGATACTTCTAAGACCAGTATCCAAATTCCAAACTGCACTACAATTAATGGAGTAATTTTTCTTTTGGGTGCATGATTAAGGAAGTAGTTTCCTTTCTGATAACAACAGTGATGTACTGCAATTTGTTGGCCAAATTATTTTCTTGTTCCAAGAAGATTTGTTCAATTCCTGTCACTGGCACTGCCAAAGAATTAGTTACTTTCCTGTTAACTGTCACATGCTTGTGGCATTTCTCTCTACAAGCGTATGTCTCCTTTTGACATAAATTACCCTTTCATTTGCGAAGTTTCTTCTCGCCACTTCAAAATGGTGGATTTCTTAGAAGAGAATTAAGCTTGAACCTATTTTTGTGGCATCACATGCATGAACTCAAGCTGATGCTGTGCAGACTGTCGATTATCTTTCTCTTTACAGCTACAGTTGCTCATTACCTCTTGACTTTAAAATCTAATTGGACATTGATATTGATGATAGATTCTGTCAAGATCCCCTGACTGCACTAGAATTTAATAATATGAAGACTTGCATCCAAGACTCTTGATAATGGTCTTTGCCTAATATGTATTATGTCTCTATGACCCCAAAGTCAAAACGAATTGAGCACAATTTTAGCGAATAGATTCTGTAGTTTACCTTTTTTTGGTTATATATTTTTATTTCTTGGTCCTTGATTTAGGTCATTCAGCATATTAAATCTATTGATGAAGATTGTGTTTACTTTAAATTGGGGGCTGTGAAATTTTCCTTACATACATTACCTGGCTTTACAATTGAACTAAAATTAATTACAACTTTTTTCTATTTATTGGTGTAAGTCTTTATTCATGTAAAATTCTTGATTTAGGTCATTCAGCATACTTAAATCTATTGATGAAGATTGTGTTTAGTTTAAATTGGAGGCTGTGAAATTTTCCTTACATACATTACCTGGCTTTACAATTGAACTAAAATAAATTACAACTTTTTTCTATTTATTGGTGTAAGTCTTTTTTCATGTAAAATTCTTGTACGTGCTGTTTGATGAAGTGAGGCTTATAATGCAGGGATCAAACAATCTTTTTACCAGCTTGCCAGAAGATTTAGCAAATTGCTCTAAATTGTCTAAGCTAGATATGGAGGTAGTAATTAGTAGCAAAAAATTAGTGTATTAGTTGACTGCAAACATCTCCTTAAACCTTTCAAAAATTAGGCTTTCATTAACTAGTGATCTCTGTACATTACCTTTTTGTCTTTGCCAGGGCAACAAGCTATCAATGATATCAGAAAATCTCATTTCATCATGGACCATGCTTACCGAATTCAATGCATGTAAGGGTCCTTTATTCTCTAAAGGACGTGCATAATATCAATTAATTATTTTATTCCTATTTGTAAATCTTTTGATGTGGCAAATGTTTTTCCATTATTACACTTGCTACAGCAAAAAATTTGCTGACAGTGTTACCAGTGAGCATTGGAGGCCTTTCACGTCTAATTCGTCTTGACCTTCATCAAAACAGTGAGTTTTTTAAACAATGGTCAACTTTTTTTTTATTTCTTTTGGTTTCTCCATTATACATTCTGACTTATAAATTATATGTGTCAATCTGTGCAGGAATATCGGCAATCCCTTCATCAATCAATGGTTGTCATTCACTTACAGAGCTTTATTTGGGGTCAAATTCTAACCTATTCCGATGCAAGTCTTCATATTATTAA