Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_24052 LG5 70732005 70734693 hypothetical protein Ahy_A04g021413 isoform B
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 70732367 downstream_gene_variant
G/T 70732510 downstream_gene_variant
T/A 70732516 downstream_gene_variant
G/T 70732687 downstream_gene_variant
G/C 70732833 splice_region_variant&intron_variant
A/C 70732834 downstream_gene_variant
A/T 70732835 downstream_gene_variant
G/A 70732871 downstream_gene_variant
T/C 70732995 downstream_gene_variant
T/C 70733024 downstream_gene_variant
C/T 70733187 downstream_gene_variant
C/A 70733320 downstream_gene_variant
A/T 70733324 downstream_gene_variant
A/G 70733932 downstream_gene_variant
A/T 70733986 downstream_gene_variant
G/A 70734164 upstream_gene_variant
A/G 70734177 upstream_gene_variant
T/C 70734185 upstream_gene_variant
T/G 70734187 upstream_gene_variant
A/T 70734194 upstream_gene_variant
G/A 70734228 upstream_gene_variant
A/T 70734315 upstream_gene_variant
T/A 70734368 upstream_gene_variant
T/C 70734375 upstream_gene_variant
T/A 70734418 upstream_gene_variant
A/T 70734660 missense_variant p.Ser12Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_24052.1
MEKYELVKDIGSGNFGVARLMRHKETKELVAMKYIERGHKQICHRDLKLENTLLDGSPAPRLKICDFGYSKLADVWSCGVTLYVMLVGAYPFEDQDDPKNFRKTINRIMAVQYKFPDYVHISQDCRHMLSRIFVANPARRITIKEIKSHPWFLKNLPRELTEVAQAAYYRKENPTFSLQSIEDIMNIVEEAKIPPPASRSVGGFGWGGEEDEDETKEAEVEAEEDEYEKRVKEAQASGEFHVS*


CDS Sequence:
>Vu_24052.1
ATGGAGAAGTACGAGCTCGTCAAGGATATAGGATCTGGGAATTTTGGGGTGGCAAGGCTCATGCGGCACAAAGAAACCAAGGAGCTTGTTGCCATGAAATACATTGAAAGGGGTCACAAGCAAATCTGTCATCGAGACTTGAAGCTTGAAAACACCTTATTGGATGGCAGCCCTGCCCCACGGCTCAAAATTTGTGATTTTGGTTACTCTAAGCTAGCTGATGTATGGTCCTGTGGAGTGACTCTTTATGTAATGTTGGTGGGAGCATACCCATTTGAAGACCAAGACGATCCCAAAAATTTTAGGAAAACCATCAATAGAATTATGGCTGTTCAATACAAGTTCCCCGACTATGTTCACATATCTCAAGACTGCAGACATATGCTATCTCGCATTTTTGTTGCAAATCCGGCTAGGAGAATTACCATTAAGGAAATCAAGTCCCACCCATGGTTTCTAAAGAACTTGCCTAGAGAATTAACAGAAGTAGCTCAAGCTGCCTACTACAGAAAAGAAAATCCAACCTTTTCACTTCAGAGTATAGAGGACATCATGAATATTGTTGAGGAGGCCAAGATTCCACCTCCGGCGTCCAGGTCAGTTGGAGGATTTGGTTGGGGGGGAGAAGAAGATGAGGATGAAACAAAAGAAGCAGAGGTTGAGGCTGAGGAAGATGAGTATGAAAAGAGAGTCAAAGAAGCACAAGCAAGCGGGGAATTTCATGTTAGTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_24052::LG5:70734693-70736693(-)
GACATGGGTAAATTGAGGACATGATGCAAAGAGAGGTGTAAGAGATAAGAAAAACTTAATTATTTAAAAAATAATATATATTATACATTTGGATACTGACGTAATAGTGCCATTAAGAAGGCCTATCATTATTGAATATAATAATCTAAATATTTTATTAATATAAATAGATAATTAGATTTAAAGGGAATTAAATTGTAATTAGGCTAAACATAATTAAACGGTCATGAGAAAAACAATAAATGAGTAGTATATGGTTAAGACTTTTATTATGTATTTATTGTAGCATTAACTATTTCAATTAATTAAACTTATGTTGACTTAGCATAGTCCCTTTAACTTTTATTATGTATTTATTGTTGGATCAGTGAGTAAACAAATTACCTTCTACGAATTAAATTAAATTGTTTTAAGTAAACTTTTGAAATACAATTATAGACAATTTATCTGTAACTGTAAGATAATTATTATAATAATAATATAAAAGCTAAAAGTATTAACAAAGCTGTTTGATCAGGGTAACAGTAATAAATTATGGAATAATGATATTATGACACACTTTTATATTCACTTAACTCAAATTATAAGAGTGAATTAATTAAAAAAATGTAATTTTTTGTATTATTTTAAAAAGAAAAAATAAAAGAAAAAGTAAAGATAGTATAAATGAATATAAGATATTTAAACGTGTTAAATTTTTTTTATTTATAAGTTATTATTACACTGGTGTAATAGTAACAATGAACAAAACAAGAGCAATAGTCATCCAATATCAAAATGATAACAAGTCAACAATTGTGGATTGAGAAACGTGGCCGAAAAACTTTTCTAAAAAATAACTTGGATTAAATCAAGTAATTCTTAGTTCGACTCATTTAGATTTTAGCTTAAATCGATCCAAGACAGAGCAAGTTATTACCAGTTAATATATTTTATAAAATAATAGTTATATTTTTTTAAGGTTTATATATTTACATACACACACTAATATTTATTTATATATAAATAATCATGACTGAAAGTTTATTAAAATTTCAAAATTTCAGTTTTAACTTTAAGTTTAATTTTTTTTTAAAGTGTACTAAATGAGTTATTGTTATGTCATGGGGTCAACTTAAAGCAAAAAAACAAAAAATTACAACTCATTTACAATGGACTAAGTTAATTTGAACAAATTCTTCAGTTGGATTGGACCAACCCAATCCTTCTACCCACTAAAGTTTAGATTATTTTTTCTAAAAAATATTTATTAATTAATATTTTTAATGGAGAAGATAAATTTTCTATAAATTAAATCCATATAGTATGGCTATAATTTGATGGAATATATTTATATTAAATAAGAACATTATAGTAGGCAAGAAGTCAAAAAACGAAGGCGAATGATGGGACAACATGGCACGCATTGAAATGTGGTTCCTTCCATAATCATGGAAATGGAAATTGTGTTAGAAAAAAATATAAATACAAAAACTTGAACTCAATCGCTTCTTATAATTATATATAAGAAGATGAATTTCCAAAAAATAGAAACATATTATATTAATTTAAAATAGCATAATTTTGTAGGATAATGATAAGATTAGAGTGAGATTAATTTAAAGAGGATGTGTGAAGAAGGTGCGATATAGATAGATACGATATTCATATTCTCTTTTTGTATCAATCGCTTTCTGTAGTAACATACACCATACTGCCACGCTATGCACATAACACAACAATTCCTTTGTCCCATTCTCTACTCTCTCTTTCTTCGCTGAAAAACCCTTTCTTCAACAAATTATTCAAACTTTTTTGTCTTGAAATCCGGATTTGATTATTATTAATTTGCTGCAAATTGCGATTCTTTGCTTTCCTTTAGAACTCTCCCAAATCCCAGTATCTTTGGATTCGCCACCTTTATTTTGCGTAGCTGCACCTTATTCTCTCTCCATTCCCCATTTGGAACTCTATCGATCTGGAGCTAACCGCATTCAAAGCTCTCAAATTTCCGGTTCAGG


Gene Sequence:
>Vu_24052(-)
ATGGAGAAGTACGAGCTCGTCAAGGATATAGGATCTGGGAATTTTGGGGTGGCAAGGCTCATGCGGCACAAAGAAACCAAGGAGCTTGTTGCCATGAAATACATTGAAAGGGGTCACAAGGTTCTACTCCTTTCACTTTCACTTTAACTTTAACTTCTTATCTTAAAATTCATGTTATTGTCAATTTTTATAACCCAAAAAGGATTCAATTCAAGTTAACATGTATCACCGGTTTCGTCTCTTTTAGGCCTTGTTCACTTGAGTGGATTTGAGGGAGAGTAATTGAAGGGATTTGAGGATTTGAGGGAGAGTAATTGAAGGGATTAGAGAGGATTTGAAAATAAATTTTTTTGTTGTTTATTTGAGTCAATTTGGAGGTAAGTGAGAATGAAGTTGGAAGTAAAGTTTGTGAGAATCAGTGTAGGATTTTATTGACGTGACAGATTAAAAAATTTACTTCCAAATCCAATCTCATTTACCTCCAAATTCACTCAAATAATCAACAAAAAAATTTATTTTCAAATCCTCTCAAATCCCCTCAATTACTCTCCCTCAAATCCACTCAAGTGAACAAGGCCTTAGTTTTTTATTTTTTATGTTCGTGTTGGCTGTGACTGAGTTTATTGATGTGTGTTTCCTAGATTGATGAGAATGTTGCCAGGGAAATCATAAACCATAGAAGTCTTCGCCACCACAATATTATTCGGTTCAAGGAGGTTTGTACTCTGTACAGATGATATGATCTTAGTGAGAGTACTATTTGTGTCATGTTTAGGTTATTTAATATGTGATTTCAGCTTCGCAGGTGGTTTTGACTCCTACTCATCTGGGCATTGTTATGGAGTATGCAGCTGGTGGAGAGCTCTTTGAGAGGATTTGCAGTGCTGGAAGATTCAGTGAAGATGAGGTTTGTTCACTTTCTCTCTTTTCATCTGTCCACAAATTCTTTTTTCACTTCTCTACTCATCACTGACATGAAGCTACTTATCTCCCTTCCCTCACTTCATTGTTGGCAACCGAGTGCTTGGAAATTCAATTGTTTGATTTTTCATTCTTGTTATCTCCTACTTTTCCAGGGTCGATATTTCTTCCAGCAGCTCATCTCAGGAGTTAGCTACTGTCATTCCATGGTGAATAGAATAATTATATTGGGAATGAGTTGTTTCGGATGGTAATTAGTTTTTGGCTTCCTTTGCGGTTATTTTCTTTGTAATTTCTTTCTTTTGCAGCAAATCTGTCATCGAGACTTGAAGCTTGAAAACACCTTATTGGATGGCAGCCCTGCCCCACGGCTCAAAATTTGTGATTTTGGTTACTCTAAGGTTCGATTATGGGAGCGATATCAACGCTTATTTCTTCAAATGAATTATTAAGTCATTTTCTTTAAGCAGTTTTGCATCAGATAACCTTTTATTTTCCCAGTCATCCCTGCTTCATTCAAGGCCTAAGTCAACTGTGGGAACCCCAGCCTACATTGCGCCTGAGGTTCTTTCACGCAGAGAATACGATGGAAAGGTAACTTTGTTTCTATTGTGGTATAAGAGTAAGGATGCCTTGAAATGTCTAAATGTGTTGTAATATTGTGCATTGTATGCAATGACTTGATGTGTCGACATTTAATTATCTGAATAATGTGGACAAAATAGTATGTGCGAATGGGATAGTTTACAATACAAAATGCTCTTACAAAATAAAGCCATATTGTACTTATTTGTGTGATTTGCTCTGAATTTTTTTTGCAAAGGTGACACAGGAAATATTTGAAGTGGCCACGGATAGATTAAATTTTTCTTGATAAGTTTCCTGTGTATGATAACATCAACGATGTTCATTTTCTAGTTCTTCTTTGCTGTTTTGTTTCTATTCAGCTAGCTGATGTATGGTCCTGTGGAGTGACTCTTTATGTAATGTTGGTGGGAGCATACCCATTTGAAGACCAAGACGATCCCAAAAATTTTAGGAAAACCATCAATGTACATTTCTTCCCATCATCCATCTCAGTTGACCAATTATTAAATGCCTGCACTTTCTGACTGTGTAACATTCTTATACAGAGAATTATGGCTGTTCAATACAAGTTCCCCGACTATGTTCACATATCTCAAGACTGCAGACATATGCTATCTCGCATTTTTGTTGCAAATCCGGCTAGGGTATGCACATACTGCCTGCAAAAGATATTACTTGAAGTTGGCTCATAATTGTTCAACAATTTTATAGTGTTAGTTTGGTAATATTTTTCAGTCATTTGCTAAGTTTCAGATTTGAACTGATAAGGGCATGTATGCTTAAGCTACCCTCTTTCTCTTCCATCACAACAAGTGGATATTGTTTGGTAAAATAAATTGTCACTCTAGATATTGATTTACTGCAGAGAATTACCATTAAGGAAATCAAGTCCCACCCATGGTTTCTAAAGAACTTGCCTAGAGAATTAACAGAAGTAGCTCAAGCTGCCTACTACAGAAAAGAAAATCCAACCTTTTCACTTCAGAGTATAGAGGACATCATGAATATTGTTGAGGAGGCCAAGATTCCACCTCCGGCGTCCAGGTCAGTTGGAGGATTTGGTTGGGGGGGAGAAGAAGATGAGGATGAAACAAAAGAAGCAGAGGTTGAGGCTGAGGAAGATGAGTATGAAAAGAGAGTCAAAGAAGCACAAGCAAGCGGGGAATTTCATGTTAGTTAG