Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23912 LG5 69617435 69619510 PREDICTED: L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1-like
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SNP Position Effect Amino acid change
G/C 69617437 start_lost p.Met1?
T/C 69617731 synonymous_variant p.Phe99Phe
T/A 69617741 missense_variant p.Phe103Ile
T/C 69617782 synonymous_variant p.Asp116Asp
A/T 69617984 missense_variant p.Asn184Tyr
G/A 69618008 missense_variant p.Asp192Asn
G/A 69618015 missense_variant p.Arg194Lys
G/A 69618016 synonymous_variant p.Arg194Arg
G/C 69618106 missense_variant p.Lys224Asn
A/G 69618194 missense_variant p.Ile254Val
G/T 69618451 missense_variant p.Arg339Ser
A/T 69618475 synonymous_variant p.Ser347Ser
A/C 69618479 missense_variant p.Ile349Leu
G/C 69618683 missense_variant p.Ala417Pro
A/T 69618690 missense_variant p.Glu419Val
A/T 69618698 missense_variant p.Ser422Cys
C/T 69618790 synonymous_variant p.Tyr452Tyr
T/C 69618973 synonymous_variant p.Asn513Asn
T/G 69619242 missense_variant p.Leu603Arg
G/T 69619247 missense_variant p.Val605Leu
G/T 69619249 synonymous_variant p.Val605Val
T/A 69619252 synonymous_variant p.Val606Val
A/G 69619304 missense_variant p.Ile624Val
G/A 69619310 missense_variant p.Gly626Ser
C/A 69619404 missense_variant p.Pro657Gln

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23912.1
MNSFTEMAPGHVGLRATNHLFCVMMFLFLMISFANPLSFRHQGFEYNDIKIEGDAILSESEIQLTKTTRYQSNAYSVGRVTSFERLHLWDNITGKLTDFTTQFSFVIFSNETSFGDGLAFFLADPGLPLSNQIQQGGGLGLLDGKQLLNSAKHPFVAVEFDTFQNLWDPPGTHVGINFNSMKSNKTVPWSLDIRQMKACYCVIEYNATTHILNVSFSGNNLNAKPTKRYISCNVDLRDYLPEWVIFGFSAATGIMFELNTVLSWSFHSTLQSNQNLSNKIPPIAVSPSPNPSPSPFSTDTISPKQEENKGLLMGLEVGVGIAATFLIVGLVCVLMWKRRARGKREDSIIDLSMDDEFQKGIGPKRFFYKELASATRNFAESQKIGQGGFGGVYKGYLKELNTNVAIKRISRESRQGAKEYASEVKIISRLRHRNLVQLIGWCHMKKDLLLIYEFMQNGSLDSHLYSGKSILTWQMRYNIAMDLALAVLYLHEEWEQCVLHRDIKSSNIMLDSNFNAKLGDFGLARLVDHEKGSQTTILAGTRGYIAPEYFTTGKARKESDIYSLGIVLLELATGRKPVDLNAMEGQITIFEWAWELHQLGKLLEVVDKKLGGAFDEEQMKRLVIVGLWCANPDHTSRPSVRQLIQVLKFEAPLPVLPQKLSEPYYHSPTMSTIFASISSPLSGYMVEPNTM*


CDS Sequence:
>Vu_23912.1
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Promoter Sequence:
>Vu_23912::LG5:69615435-69617435(+)
TTTTTTTTTCAGTCTCTAATTTTATTTTTAACAAACACACAACCAACGTCATCAACCTTAAAACTAGTTCTATTTAAAATAAAATAAAATTATCATTAGAAAATAAGTTTTCTAAGACTATATTAAAAGTCAATCTACCTCGTAAAAAATTTATATTTTTCAAGAAAATAATTCAAAAGATTTTTAACATGTTTTTAAAAGAGCATTTTATAATAATTTTAACACTCTTTTAATTAAAGGTTATTTTGTAATAGTAAATCTTATTAAAGGTATTATGAAATTAGCTTTTTAAATATTGGAGAGCGCATTTCAGACTTTGTAATGGTCCAATTTGATTAATATGCATTTCGTTTACACGTTATTATATAAACTCATTTTTTAACCAATGTTTCATACCACATTTTTAATTAAAATTTGTCACCTTCATTGCTATAAGGATAGCTTCTCTTTGATTGAAAAAAAAGAAGAATTTTCTTATTGGATTTTAGCATTTGTCGTATCTTACAATAGGGAAAGAAATAAATCTGTGATATAATGAAAACTAAAATATATAAAGGGAGCGTGTAACTGGTATCAAACGTATTATATTTAACACGTAAATCAAACTTTTTTCTGAAATAATATATATTCCAAGAAAAGTTTATCAAACTAAATTCATTTCTATTTTATTTTCTAAAGTATACGTTTTTATTGTTCATGGTGGTAATTCAATTTTCTATAATCAATTTTGATATTCATTTGTCCATTCCAGTGTGGAAAAGCGAGTCAATCAAAATCTTCAGCCTAAGAATGAATAAATAAATGTCAGAATTCTATTTTCCCGTTATCTAATTCTGACCCTCAAAAGTAAAAAAAGGTCTACTTAATAAATACGATACAGCTAAATTTAGTTGGTAATTTTTTTATGATATATATTATTTCAGAAAAAAAATCACGTAAATCTTATTTATAAAATTGTACATTAATATTTATTATTCTTCACATAAATTTTTTTAAAAGACATTCATGACATCATTTTTATATATCAAAACAGCAATTTTCTTAAAAAAGGTTGGAGTTGTTTTTTTATTCTTAAAGGGGATTAATGAACCTTCCTCCTATTACTTCCCCTGACGTAGTGCTATAATTGCCTCTCTTTCATTATTGATTATTGTCTTTTTCAGCCTCTCACCTTCTCCTTTTCCACGAAATTTCATTTTTAGATAAAAGAAAAAATAGTTTATGTGTGAGTTTGGTCAAGAAGTAGCATTCGTGTTGAGAAATGTGATGCAACTTTTATTTATCTAATAGCAAAATGTTAATATGCTACATTATATTTCATAAAATAAAACAAGCTACCCAAAGGTGGTGTTATTAAAAAAAAAAGTCTCAAAGGGCATAAATTTTTATTGCTTAAAAAATTTTAAATTAAAAACAAGAGATACTAAGTTCACCTTAGTTTCTTGTAATTTTTTTCTATTATTAAATTAATAATAAAAACTATATTTTTTAATTGAATATTTAGCATTTAATCTTATTAATTAGAAAATTTGATATTTATTTTATTTTGCAACTTCTTTGTTTGTCTTCATTTTTTTTATAATTTTCATGTCATCCCCTGCATTTAATCTTCATTTTTTTTTTAATTTATGATAATTTAATTGAAAAGTATAAATTTAGAATAAAAATTATAAAAATATCTAAAATAAAAGGAGTTAAAACTTAATAAATAAAGACTAATTTGATAACCGGAAATTGTATGATCAGCAGGCCTAGCCGTTTGGACTTACACGGTGAGTATGGGTCCTGTGAGTGTGACTTGGTCGATTTGATTTTGATCAGAACAATTTAACTCCAACTAACCTGTTTTTCTACATTGCAAGGTTCGTTAAGGCATAACTACAAGACAGTAATACAAATCCAAAAATCATTAAAAACAACGAATAAAATCATTGTCAAAGTTACATAAATAAGAAAATCAAAGTATCATATGATTAGTATAGCCAAGAAAGGTTTCTAAA


Gene Sequence:
>Vu_23912(+)
ATGAACTCTTTCACAGAGATGGCTCCTGGCCATGTTGGTCTCCGTGCAACAAACCATCTATTCTGTGTAATGATGTTCTTATTTCTTATGATCAGTTTTGCAAACCCACTTTCATTTCGTCACCAGGGATTTGAGTATAATGATATCAAGATTGAAGGAGATGCTATTTTGTCAGAATCAGAAATCCAACTCACTAAAACCACCAGGTATCAGAGCAATGCTTACAGTGTTGGGAGAGTCACTAGTTTTGAAAGATTGCACCTTTGGGACAACATCACAGGAAAACTGACCGATTTTACTACCCAATTTTCCTTTGTCATTTTCTCAAACGAGACTAGTTTTGGAGATGGCTTGGCTTTTTTCTTAGCAGATCCAGGGCTTCCTCTTTCGAATCAAATACAACAAGGAGGTGGTCTTGGTCTTCTGGATGGTAAACAGTTATTGAATTCAGCTAAGCATCCCTTTGTAGCTGTGGAGTTTGACACATTCCAAAATTTATGGGACCCACCTGGCACTCATGTAGGTATAAATTTCAACTCCATGAAATCTAACAAAACTGTTCCATGGTCCCTTGATATTAGGCAAATGAAAGCTTGTTATTGTGTGATTGAGTACAATGCAACTACTCACATTTTGAATGTTTCTTTCTCTGGAAACAATCTCAATGCCAAGCCAACAAAAAGATATATCTCATGCAATGTTGACCTGAGAGATTACCTACCAGAGTGGGTTATATTTGGTTTCTCAGCTGCTACAGGAATTATGTTTGAGTTGAACACAGTGCTGTCATGGTCATTCCATTCAACTTTACAAAGTAATCAGAATCTGTCAAATAAGATACCTCCAATTGCAGTCTCACCAAGCCCAAATCCTAGTCCTTCACCATTTTCCACTGACACTATTAGCCCTAAACAAGAGGAAAACAAAGGTTTATTGATGGGACTAGAAGTTGGGGTAGGCATAGCTGCAACTTTCCTTATTGTAGGGTTGGTTTGTGTTTTAATGTGGAAGAGGAGGGCTAGAGGAAAAAGAGAAGATTCAATTATTGATCTGAGCATGGATGATGAATTCCAAAAGGGCATTGGACCAAAAAGATTTTTCTATAAAGAATTGGCAAGTGCAACAAGAAACTTTGCAGAGTCACAAAAGATTGGACAAGGTGGTTTTGGGGGTGTGTATAAAGGCTATTTGAAAGAATTGAACACCAACGTTGCTATAAAGAGGATATCAAGAGAATCTAGACAAGGAGCAAAGGAATATGCAAGTGAAGTTAAGATCATCAGCAGACTAAGGCACAGGAATTTAGTGCAATTAATTGGTTGGTGCCACATGAAGAAAGATCTCCTTCTTATATACGAGTTCATGCAAAATGGTAGCTTAGATTCCCACCTATATAGTGGAAAAAGCATCTTGACATGGCAGATGAGGTACAACATTGCCATGGACTTGGCTCTGGCAGTGTTGTACCTTCATGAAGAATGGGAGCAGTGTGTGCTTCATAGGGACATTAAATCCAGCAACATTATGTTGGATTCAAATTTCAATGCTAAGCTTGGGGATTTTGGCTTAGCCAGGCTTGTTGATCATGAGAAAGGATCCCAAACTACAATTCTAGCAGGGACAAGAGGCTACATAGCCCCTGAATACTTCACTACAGGGAAGGCTAGGAAGGAATCTGATATATACAGTCTTGGGATTGTTTTACTGGAGTTAGCCACTGGAAGAAAACCAGTTGATCTCAATGCCATGGAAGGCCAAATAACCATATTTGAGTGGGCTTGGGAGCTCCACCAATTGGGAAAATTACTTGAAGTGGTTGACAAAAAGCTTGGAGGAGCATTTGATGAGGAACAGATGAAACGTTTAGTGATTGTTGGCCTTTGGTGTGCCAATCCAGATCATACATCCAGACCATCAGTAAGACAATTGATTCAAGTGCTTAAGTTTGAAGCTCCTTTGCCAGTTCTCCCACAAAAGTTGTCTGAGCCTTATTATCATTCTCCAACTATGAGTACAATATTTGCTTCAATCTCTTCTCCCCTCTCTGGCTACATGGTAGAACCAAATACAATGTAA