Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23890 LG5 69414119 69417101 PREDICTED: receptor-like protein kinase HAIKU2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   endosperm development, endosperm development, protein phosphorylation, endosperm development, protein phosphorylation, protein phosphorylation, endosperm development
Cellular Component   is active in   plasma membrane
Cellular Component   located in   chloroplast
Molecular Function   enables   protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 69414133 stop_lost p.Ter747Trpext*?
A/T 69414135 stop_lost p.Ter747Argext*?
G/A 69414327 synonymous_variant p.Leu683Leu
T/C 69414648 upstream_gene_variant
G/A 69414807 upstream_gene_variant
T/C 69415103 upstream_gene_variant
G/A 69415164 synonymous_variant p.Ser646Ser
G/T 69415293 synonymous_variant p.Ser603Ser
T/C 69415411 missense_variant p.Gln564Arg
C/T 69415558 missense_variant p.Gly515Asp
G/C 69415639 missense_variant p.Thr488Ser
T/G 69416042 missense_variant p.Ile354Leu
T/C 69416295 synonymous_variant p.Leu269Leu
A/T 69416296 missense_variant p.Leu269Gln
G/A 69416496 synonymous_variant p.Leu202Leu
A/G 69416592 synonymous_variant p.Thr170Thr
T/A 69416623 missense_variant p.Glu160Val
G/A 69416724 synonymous_variant p.His126His
C/T 69416786 missense_variant p.Gly106Arg
A/G 69416958 synonymous_variant p.Asn48Asn

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23890.1
MVAGSNFRYCSAPIIPTAALLFLCLVASSLGDELEPLMKFKSSIQSSNVTVFNSWAQASSPCLFTGIVCNSKGFVSEINLPEKQLEGTVPFDSLCELQSLEKISLGSNHLHGRISEGLMKCTNLKHLDLGVNSFNGEVPDLSSLYKLEFLNLNFSGISGEFPWKSLGNLTSLQFLSLGDNPLKEDPFPLEVLKLEKLYWLYLTNCSITGNIPLGIGNLTQLQNLELSDNHLYGEIPADIVKLRKLWQLELYDNYLSGKIPVGFGNLTSLVNFDASYNQLEGDLFEVRSLKNLASLHLFGNKLSGEIPKELGDLKNLTELSLYANNLTGPLPQKLGSWQGMQYVDVSDNFLSGPIPPFLCKNNQINELLLLNNSFNGTIPETYAKCTSLVRFRLSRNSLSGVVPSGIWGLPNLALFDLAMNQFEGPVTSDIAKAESLAQLLLSNNKFAGELPMEISEASSLVTIQLSSNQISGNIPENIGKLKKLTTLTLDGNNLSGVVPDSIGSCVSLNEINLAGNSLSGAIPGSIGSLPTLNSLNLSSNRLSGEIPSSLSSLRLSLLDLSNNQLFGSIPEPLSISAFKDGFMGNPGLCSQTLKGIRPCSMQSRSSRRLRNLLVCFLAAVMVLLGAFFLFTKLRQNKSEKPLKTTSWDVKHFGVVLMELVTGKRPMEPEFGNNHDIVHWVCSTNRSKEEALELVDPTIAEHFKEDAMKVLRIALLCTAKIPASRPSMRTLVHMLEEADPCTPNKMIVTIDA*


CDS Sequence:
>Vu_23890.1
ATGGTCGCCGGAAGTAATTTCCGGTACTGCTCGGCGCCCATTATTCCCACTGCTGCCCTGTTATTCCTCTGCCTCGTTGCTTCTTCCCTCGGAGATGAACTTGAACCACTCATGAAGTTCAAGTCCTCCATACAAAGTTCAAATGTAACTGTTTTTAATTCATGGGCACAAGCAAGTTCTCCGTGCCTGTTCACTGGGATTGTATGCAACTCCAAAGGCTTTGTTTCAGAAATCAATCTTCCGGAGAAACAGCTGGAGGGTACTGTTCCCTTTGATTCACTTTGTGAGCTTCAATCGCTTGAGAAAATATCTTTGGGGTCTAACCACTTGCATGGAAGAATCAGTGAGGGGTTGATGAAGTGCACCAACTTGAAGCACTTGGATTTGGGTGTGAATTCATTCAATGGAGAAGTTCCTGATTTGTCGAGTTTGTACAAGTTGGAGTTCTTGAACTTAAACTTCAGTGGAATTTCAGGGGAGTTTCCATGGAAATCATTGGGAAATCTAACTAGTCTTCAGTTCCTGAGTCTTGGGGATAACCCGTTGAAGGAAGATCCTTTCCCTTTGGAGGTGTTAAAACTTGAAAAATTGTATTGGCTTTACCTCACAAATTGCAGCATCACTGGGAACATTCCATTGGGGATTGGGAATCTTACTCAGCTTCAGAATCTTGAGCTTTCTGACAACCACTTGTATGGTGAGATTCCTGCTGATATAGTTAAGCTTCGCAAGCTGTGGCAACTTGAGTTATATGATAACTATCTGAGTGGGAAAATCCCAGTTGGATTTGGAAACCTGACTAGTCTAGTTAACTTTGATGCTTCTTATAATCAACTTGAAGGTGATCTTTTTGAGGTAAGGTCCTTAAAAAACCTTGCATCCCTTCACCTTTTTGGGAACAAGTTGTCAGGAGAAATTCCAAAGGAGCTTGGAGATCTCAAGAATCTCACAGAGCTTTCTCTTTATGCTAACAACCTCACTGGTCCTCTTCCTCAAAAGCTTGGCTCTTGGCAAGGCATGCAATACGTTGATGTTTCAGACAATTTTCTTTCTGGCCCAATACCACCTTTCCTGTGCAAGAACAATCAAATCAATGAACTGTTACTCTTGAACAACAGCTTCAATGGAACAATACCAGAAACGTATGCAAAATGCACATCTTTGGTTCGTTTTCGTCTGAGCAGGAACTCACTTTCGGGTGTAGTTCCTTCAGGCATATGGGGCTTGCCAAATTTGGCTCTGTTTGATCTTGCAATGAACCAGTTTGAAGGTCCAGTGACATCTGATATAGCCAAAGCAGAATCTCTGGCTCAACTGTTGTTATCTAACAATAAGTTCGCAGGTGAGTTACCGATGGAAATCTCTGAAGCTTCTTCATTGGTGACAATTCAGCTAAGTTCAAATCAAATTTCTGGTAACATCCCAGAAAACATTGGAAAGTTGAAGAAACTAACCACTCTTACTTTAGATGGGAACAATCTTTCTGGTGTCGTACCAGATTCCATTGGTTCTTGTGTTTCTCTTAATGAGATAAACCTTGCTGGCAACTCTCTTTCTGGGGCTATACCAGGTAGCATCGGTTCTCTTCCAACTCTCAATTCATTGAACTTGTCCTCAAACAGGCTTTCTGGTGAAATTCCATCCAGTTTATCGTCTCTGAGACTTAGCCTTCTTGACTTATCAAACAATCAGTTGTTTGGTTCCATACCAGAACCTCTGTCTATTTCAGCCTTCAAAGACGGATTCATGGGAAATCCTGGCTTATGCAGCCAGACTTTGAAAGGTATCAGACCATGTTCAATGCAATCCAGAAGCTCCAGGAGACTCAGAAACCTTTTAGTCTGTTTCCTTGCTGCTGTAATGGTTCTGCTTGGAGCGTTTTTCCTCTTCACAAAACTAAGGCAGAATAAGTCTGAGAAGCCACTGAAGACTACTTCCTGGGATGTCAAGCACTTTGGTGTTGTTCTGATGGAGTTGGTAACTGGGAAGAGGCCAATGGAGCCAGAGTTTGGAAACAATCATGACATTGTGCATTGGGTATGCAGCACTAACAGGAGCAAAGAAGAGGCTCTTGAATTGGTGGATCCTACTATTGCAGAACATTTCAAAGAGGATGCCATGAAGGTGTTGAGAATTGCATTACTGTGCACTGCCAAAATTCCAGCTTCAAGACCATCAATGAGAACGTTAGTTCATATGCTGGAAGAGGCAGATCCATGTACCCCAAACAAAATGATTGTGACCATTGATGCTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_23890::LG5:69417101-69419101(-)
TGTCTTCATCATGTGCAACATTTTTATGAACTTTTTCACGATCATGCTTAAAAAACAGTGAAGCCTGCTTACTCGATTAAAGAGTGTAACTTACCTTTATTATATCCATGATTATGTTACACAAATGTAATCCAATCCATTGACAAATCTGATCACATATGCTAGAAAATCCATGTATCCTACAAATTCATCATTTTCCTTGTTTCCATATCCCTACATGCAAACATGATTTTAGTTTTCGATCTGTCCGAACCAATTACATCAAATAATAAATTCCGTTCAAATGAATAAAGTCGAAATCTTCCTCAAACTTCTACTTCGAAAAAAAATATATGAAATCAAATTCATCTAAAAAAAATTTAAGCATAAATTTCTCATGAAATAAACACAAAATTTTATAACAATACAAATAATTTTTTTTAATAAACATGAAAACAATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATTAGAATAGTTTTATAACTATTTTAAGCTTTTTTAATTTTTTTATATGATAATTTATATTTGAGGATAATATTTTGTATGGTATGTATTTAATATTTATTTTCGGTTTTAAACTCACTTTAATAAAATTTGATATTTATATTTTTTTGGTGGTAACTTTTTTCAAACTTTTTGTAGTTAATTTAATTAAATTTATTTAAAAATTACAATCGGTTATTATCAATGAAGGATGTTAATAAGCCCACAAAAGCACACTTAAACAAAAATTAATCAACATTTTTTAAAATATAATGTTACTGATTAAAAGTAATTTTAATAACGTTTTTAATTTCTAACATTCGAGATAAATACACATTTCTCTCTCAAATTAGGAAAAAAAAATCATTTTTAGTTTTTCAATATTCAAAAAATACAATTCTAATCTTTGAAGGCTAGAAGAAGGTAAAAACTATGTCAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACAACATATTACTTATTATTACTTTAACCTATCAAATTTTATTTTGATAACTCGCGTACTTAAAATTGTCTTAAAACATAATTTCAACGATTAGGTAAACGAATCTTAACCAAATAACACATTACCACAAATGAAGTCAGAACACTAGGCTTACATAAATATTTCTCTTATAATATAATATAATTTTATATCCAATTGGCATTTGTATTATATTTAAATTTAAAATGATATACGATACAAATGTTAACTGTGAATAATATAATAATTCAATAAATAATCGAAGTATACACCGTTTTCTTCTTCTTCATTTTCTTAAAAAAAAAACTTATTTATAATTCACGTCTTAAAAGTAATTTTTAATTAAAAAACTTAAAAATAGAAATTGTGTGTCGAATTTCTTCTTTTAGACTAAAAGCCCTTTGAAGCTACAAGTTATTTTGATTTTTTTAACTTTAGTTTTATTTAAAATACGTCCTTTAACAAAAAGCTACGTTGTTTAAAAAGAATATAACATAATGATATATATATATATATATATATTTAAGTAAAAGAATTTTAAATATAAAAAATTCTTTAATCAAAATACTTATGCAAGTAATATATATGATTTCAATTAAATAAATTTAGAATTTAATTATAAATTATAAAATATTTAAGTTGCATTTATTAATTTTCTGTAATATTTTTAATCCAAATATATTAGGGAAAAAATCAATAATATTGAATTATAATAAGAAATATCTAATAAATACTTTCTAGTTAATATATAAATGATTATTCAACCACATGTGCAATAAAGAAGAGTCTCATGAGAAGGCAGCATAGTCAAAGTTGAGACCGACTTTGTCCTTATTTGCCATTATGTGTTGTTTCCATTCCATGCACGTGGATAATTTTCAAGTGTGAAACCAAACAAAACCCAAAATTCAACGTAAAACCAAACCAAACCAGCCTCTCTAGTCCATTCTTCTCCCACCAACTCTTGCACTAACTCGACACTAACAACCTGCCCTTACCGCCGGT


Gene Sequence:
>Vu_23890(-)
ATGGTCGCCGGAAGTAATTTCCGGTACTGCTCGGCGCCCATTATTCCCACTGCTGCCCTGTTATTCCTCTGCCTCGTTGCTTCTTCCCTCGGAGATGAACTTGAACCACTCATGAAGTTCAAGTCCTCCATACAAAGTTCAAATGTAACTGTTTTTAATTCATGGGCACAAGCAAGTTCTCCGTGCCTGTTCACTGGGATTGTATGCAACTCCAAAGGCTTTGTTTCAGAAATCAATCTTCCGGAGAAACAGCTGGAGGGTACTGTTCCCTTTGATTCACTTTGTGAGCTTCAATCGCTTGAGAAAATATCTTTGGGGTCTAACCACTTGCATGGAAGAATCAGTGAGGGGTTGATGAAGTGCACCAACTTGAAGCACTTGGATTTGGGTGTGAATTCATTCAATGGAGAAGTTCCTGATTTGTCGAGTTTGTACAAGTTGGAGTTCTTGAACTTAAACTTCAGTGGAATTTCAGGGGAGTTTCCATGGAAATCATTGGGAAATCTAACTAGTCTTCAGTTCCTGAGTCTTGGGGATAACCCGTTGAAGGAAGATCCTTTCCCTTTGGAGGTGTTAAAACTTGAAAAATTGTATTGGCTTTACCTCACAAATTGCAGCATCACTGGGAACATTCCATTGGGGATTGGGAATCTTACTCAGCTTCAGAATCTTGAGCTTTCTGACAACCACTTGTATGGTGAGATTCCTGCTGATATAGTTAAGCTTCGCAAGCTGTGGCAACTTGAGTTATATGATAACTATCTGAGTGGGAAAATCCCAGTTGGATTTGGAAACCTGACTAGTCTAGTTAACTTTGATGCTTCTTATAATCAACTTGAAGGTGATCTTTTTGAGGTAAGGTCCTTAAAAAACCTTGCATCCCTTCACCTTTTTGGGAACAAGTTGTCAGGAGAAATTCCAAAGGAGCTTGGAGATCTCAAGAATCTCACAGAGCTTTCTCTTTATGCTAACAACCTCACTGGTCCTCTTCCTCAAAAGCTTGGCTCTTGGCAAGGCATGCAATACGTTGATGTTTCAGACAATTTTCTTTCTGGCCCAATACCACCTTTCCTGTGCAAGAACAATCAAATCAATGAACTGTTACTCTTGAACAACAGCTTCAATGGAACAATACCAGAAACGTATGCAAAATGCACATCTTTGGTTCGTTTTCGTCTGAGCAGGAACTCACTTTCGGGTGTAGTTCCTTCAGGCATATGGGGCTTGCCAAATTTGGCTCTGTTTGATCTTGCAATGAACCAGTTTGAAGGTCCAGTGACATCTGATATAGCCAAAGCAGAATCTCTGGCTCAACTGTTGTTATCTAACAATAAGTTCGCAGGTGAGTTACCGATGGAAATCTCTGAAGCTTCTTCATTGGTGACAATTCAGCTAAGTTCAAATCAAATTTCTGGTAACATCCCAGAAAACATTGGAAAGTTGAAGAAACTAACCACTCTTACTTTAGATGGGAACAATCTTTCTGGTGTCGTACCAGATTCCATTGGTTCTTGTGTTTCTCTTAATGAGATAAACCTTGCTGGCAACTCTCTTTCTGGGGCTATACCAGGTAGCATCGGTTCTCTTCCAACTCTCAATTCATTGAACTTGTCCTCAAACAGGCTTTCTGGTGAAATTCCATCCAGTTTATCGTCTCTGAGACTTAGCCTTCTTGACTTATCAAACAATCAGTTGTTTGGTTCCATACCAGAACCTCTGTCTATTTCAGCCTTCAAAGACGGATTCATGGGAAATCCTGGCTTATGCAGCCAGACTTTGAAAGGTATCAGACCATGTTCAATGCAATCCAGAAGCTCCAGGAGACTCAGAAACCTTTTAGTCTGTTTCCTTGCTGCTGTAATGGTTCTGCTTGGAGCGTTTTTCCTCTTCACAAAACTAAGGCAGAATAAGTCTGAGAAGCCACTGAAGACTACTTCCTGGGATGTCAAGCAGTACCATGTGTTAAACTTCAATGAGAGTGAAATCGTTAACGGGATCAAGGCTGAGAATTTGATTGGCAAGGGAGGATCCGGCAATGTTTATCGGGTTGTGCTTAAAGGTGGGGCTGAATTAGCAGTGAAACACATATGGACTTCAAATGTAAGCGACAGGGGAAGTTGCAGGAGCACCTCAACTATGCTTAGAAGGAGTTCAAGGTCACCAGAATTTGATGCAGAGGTGGCCACTCTTAGTTCTATAAGGCATGTAAATGTTGTGAAGCTCTATTGTAGCATCACAAGTGAAGACAGCAGTTTGCTTGTTTATGAATTTTTACCAAATGGGTGTTTGTGGGACAGGTTGCACACCTGTAAAGAGAAGTCTAAGATGGGGTGGGAGGTTAGGTATGACATTGCATTGGGTGCTGCTAGAGGATTGGAGTACCTGCACCATGGGTGTGATAGACCAGTTATACATAGGGATGTCAAATCCAGTAACATATTGCTGGATGAAGAATGGAAGCCTAGGATTGCAGATTTTGGCCTTGCCAAGATTCTGAGTGGAGGAGCAGGCAATTGGACCAATGTCATTGCTGGAACACTTGGTTACTTACCTCCTGGTAAGCTTTAAATCACTTTATTTTTTGTATTAGGCAAAACAAAATGTCATGTTAACTTCTATCTATTGTTTTGCAGAGTATGCCTACACTTGTAAGGTGACGGAGAAGTGTGATGTTTACAGCTTTGGTGTTGTTCTGATGGAGTTGGTAACTGGGAAGAGGCCAATGGAGCCAGAGTTTGGAAACAATCATGACATTGTGCATTGGGTATGCAGCACTAACAGGAGCAAAGAAGAGGCTCTTGAATTGGTGGATCCTACTATTGCAGAACATTTCAAAGAGGATGCCATGAAGGTGTTGAGAATTGCATTACTGTGCACTGCCAAAATTCCAGCTTCAAGACCATCAATGAGAACGTTAGTTCATATGCTGGAAGAGGCAGATCCATGTACCCCAAACAAAATGATTGTGACCATTGATGCTTAA