Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23878 LG5 69322398 69327306 probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g48380 isoform X2
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 69322467 missense_variant p.Gln622Arg
T/A 69322619 downstream_gene_variant
G/A 69322645 downstream_gene_variant
A/G 69322769 downstream_gene_variant
G/A 69322895 downstream_gene_variant
T/C 69322991 downstream_gene_variant
C/A 69322996 downstream_gene_variant
G/C 69323217 missense_variant p.Ala582Gly
G/A 69323255 synonymous_variant p.Cys569Cys
G/A 69323407 missense_variant&splice_region_variant p.His553Tyr
T/C 69323420 downstream_gene_variant
T/G 69323585 synonymous_variant p.Ile524Ile
A/G 69323586 missense_variant p.Ile524Thr
C/*,T 69323655 downstream_gene_variant
G/A 69323703 downstream_gene_variant
C/T 69323713 downstream_gene_variant
C/T 69323718 downstream_gene_variant
G/A 69323720 downstream_gene_variant
G/A 69323832 downstream_gene_variant
T/G 69323837 downstream_gene_variant
G/A 69323840 downstream_gene_variant
G/C 69323841 downstream_gene_variant
C/T 69323842 downstream_gene_variant
T/C 69323852 downstream_gene_variant
A/G 69323855 splice_region_variant&intron_variant
T/A 69323858 splice_region_variant&intron_variant
G/C 69323865 missense_variant p.Ala513Gly
G/T 69323966 synonymous_variant p.Pro479Pro
C/A 69323991 missense_variant p.Arg471Ile
G/A 69324163 downstream_gene_variant
A/T 69324166 downstream_gene_variant
A/T 69324552 downstream_gene_variant
G/A 69324608 downstream_gene_variant
A/G 69324622 downstream_gene_variant
T/C,* 69324639 downstream_gene_variant
G/A 69324683 downstream_gene_variant
A/G 69324737 downstream_gene_variant
T/A 69324788 downstream_gene_variant
C/A 69324814 downstream_gene_variant
G/T 69324904 downstream_gene_variant
G/T 69324960 downstream_gene_variant
C/G 69324964 downstream_gene_variant
T/A 69325441 missense_variant p.Glu424Val
C/G 69325559 missense_variant p.Gly385Arg
G/A 69325759 missense_variant p.Pro318Leu
T/C 69325802 missense_variant p.Asn304Asp
A/T 69325851 synonymous_variant p.Ile287Ile
T/G 69325853 missense_variant p.Ile287Leu
C/A 69325856 missense_variant p.Gly286Trp
T/A 69326216 missense_variant p.Thr166Ser
T/G 69326256 intron_variant
G/A 69326292 intron_variant
A/T 69326312 intron_variant
A/T 69326320 intron_variant
G/A 69326543 downstream_gene_variant
G/T 69326602 downstream_gene_variant
A/G 69326680 downstream_gene_variant
C/A 69327039 missense_variant p.Asp90Tyr
A/G 69327225 missense_variant p.Cys28Arg
A/T 69327248 missense_variant p.Ile20Lys
A/T 69327253 synonymous_variant p.Arg18Arg

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23878.1
MDTSDLLSSWDFESNTERGICRFGGVECSSNYVEDRVIGIWLSNMGLKGQFPRCIEDFIWLQTLILSHNDLSGYIPNDISAKLPYLTTLDLSNNYFSGEIPKGIANLSGLITLLLDGNRLTGQIPQDLGLLPRLRDFSVANNLLEGSVPVFVNNLNLSILLERFITRMSFKELCKATDYFCIDNVLGIGKTGIMYKAKVSNSCILAVKRLYDADKYKWKFLLEIMIPGRHRHRNIVLPHGFCIEKHERVLVYEYISNGRLSDWLQSDEGHQPTKLEWSERIHIALGIARGLSWLHKRCNIVHLNLDSECVLLDKYFEPKISNFGKAKFLNQTVEDHVRMKFFLVDRLGVKGYAEKDVYDFGIILFELLTGKRLSPSTDSSDSINGHLMKYISKNFFTDPADFYDAIDDSIMGKGFDDKILRLLEVACDCVKTSLKQRPKMVDIHQTIRAMWEGYKPCFHSERQDDTQEMWQDSIQKPSNPAPELLGWVARLASLRRHLPKGKTLLSLTLRQELLRSIFCDILEQDIHMLELIKDVDGTCSQILRLQEGDKEAKSHSFALSPSHRSGVLGYIAAIILIQGLVVPMLGFLFYSSISMLSPLVLLQGFLQMKFLKGFSADPRKKCLEPEKQGVHLGLVNGAGFAFSTLAL*


CDS Sequence:
>Vu_23878.1
ATGGACACTTCTGATCTCTTATCTAGCTGGGATTTCGAGAGCAACACCGAGCGTGGCATATGCAGATTCGGCGGTGTTGAATGCAGCAGCAACTATGTGGAAGATAGAGTAATCGGTATATGGCTATCTAACATGGGGCTGAAGGGTCAGTTTCCTCGTTGCATCGAGGATTTCATATGGTTGCAGACTCTGATCCTCTCACACAACGACCTTTCTGGATATATCCCAAACGATATATCAGCCAAGCTGCCATATCTGACCACACTTGATCTCTCAAATAACTATTTCTCTGGTGAAATTCCAAAGGGTATTGCCAATTTGTCAGGCTTAATTACCCTTCTACTTGATGGCAACCGGTTAACAGGCCAAATCCCACAAGATCTTGGGTTGCTTCCCAGGCTGAGAGATTTCAGTGTTGCAAATAACTTGTTGGAAGGGTCAGTGCCTGTTTTTGTGAACAATCTTAATCTATCAATATTGTTGGAGAGATTTATTACTAGAATGAGCTTCAAGGAATTATGCAAGGCAACCGATTACTTTTGCATTGATAACGTGTTGGGGATAGGAAAGACAGGGATTATGTACAAGGCAAAGGTATCAAATAGTTGTATTCTGGCAGTTAAGAGACTGTATGATGCTGATAAGTACAAGTGGAAATTCTTACTTGAAATAATGATTCCGGGAAGACACAGGCACAGAAACATAGTTCTACCGCATGGATTCTGCATAGAGAAACATGAAAGGGTTTTGGTGTATGAGTACATCTCTAATGGAAGACTCAGTGATTGGTTACAATCTGACGAGGGACATCAACCAACAAAATTAGAATGGTCCGAGAGGATTCACATTGCACTTGGGATTGCAAGAGGTTTATCTTGGCTCCACAAAAGGTGCAACATAGTCCACCTCAATTTAGATTCGGAGTGTGTCTTGCTGGACAAGTACTTTGAGCCAAAAATTTCGAATTTTGGCAAGGCGAAATTCCTAAACCAGACTGTTGAAGATCATGTGAGGATGAAATTCTTTTTGGTTGATAGACTTGGAGTGAAGGGTTATGCTGAGAAGGATGTCTATGATTTTGGAATAATCCTTTTTGAACTTTTAACGGGGAAAAGACTAAGTCCATCCACTGATTCTTCTGACAGTATTAATGGCCATTTGATGAAGTATATCAGTAAGAACTTCTTCACTGATCCTGCTGACTTTTATGATGCCATTGACGATTCTATAATGGGGAAGGGTTTTGATGATAAAATCCTACGTCTTCTTGAAGTTGCATGTGACTGTGTTAAGACATCTCTAAAGCAAAGGCCAAAGATGGTTGACATTCACCAAACTATAAGAGCTATGTGGGAGGGCTACAAACCCTGCTTTCATTCTGAAAGACAAGATGATACACAAGAAATGTGGCAAGATTCGATCCAAAAGCCGTCCAACCCTGCCCCTGAGCTGCTGGGTTGGGTGGCAAGGTTAGCATCCCTTCGTCGCCACTTACCCAAAGGCAAGACATTGCTTTCTTTGACACTGAGACAAGAACTGCTGAGGTCCATTTTCTGCGACATCTTGGAACAAGATATTCACATGCTTGAGTTAATCAAGGATGTCGATGGTACTTGTTCTCAGATTCTTCGCCTACAGGAAGGAGATAAGGAAGCGAAGTCGCATAGCTTTGCTCTTTCTCCTTCTCATCGAAGTGGGGTTCTCGGATACATTGCTGCGATTATACTTATACAAGGTCTTGTGGTCCCTATGCTTGGCTTCTTGTTTTACTCATCAATATCTATGCTTTCACCCTTGGTCCTATTGCAAGGATTTCTTCAGATGAAGTTTCTTAAAGGATTCAGTGCAGATCCAAGGAAGAAATGTCTAGAGCCAGAAAAACAAGGGGTTCACTTGGGGCTTGTGAATGGTGCAGGATTTGCTTTCTCTACTCTGGCTCTGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_23878::LG5:69327306-69329306(-)
CATGGAGATTCAATTCCTGAAAGACGAGTTTATTTATAAAATAATCATAAAAAAATAATTTTTTAAATTTGTAAAAATAAAAAAGAGAAATGAAAAATATATCAAGTAAAAAAAAATTTGAATGTCAAAATACAATTTACTTTTTTATATTTATCATCGTGCTGTTCAGTGAATTTTGTATAAATCAAAATGAATTAGTGTACATATCGGATTATTACACCTTGTCTAGAAACATCAACTAGTTATTGTCCGGTGTTTTCCTTCAAATTATCTACAAATTGTTTTACTTAAACATAAAAATTTGAAAACTTGAAATTAAATCATTGTTTAAAATGAAATCCCAAATAATAAATTAGTTTTAAAATATAATCAAAGTAAAATTATATTATAAAATATTAATTAAAATAAATCAAGTTTTTTAAAAATAAATTCAAATAAACTACAGAGTTACTAAATATAAATTTAAATAAAATTATAATTTTTTAATGTTTAGTTATATAGATTTAAATAAAATTAAAAATATATAAACTCAAATTATAACTTTTTCATCATTAATATTTTTCTTTAATTTTAATTTTATCACTTGATTTTAAAAAAAATTCAAATAAATGACTTTTTGTTATCACTTGATTTAGAAATATTCAAATAAACAACTTTTTGTTATCACTTGATTCAAATAAATGACCTTGATAATTCATTTAAGAAATTTAAAAATTACTTAATATTCAAATAAATGACCTTTTGTTATCATCAAATCAAGTGATTTATTCCAAAAGTCATAAATATGTTACTTTTGTGGGTATGGCCAGGGAAGACCGAGTCCACATAACTTCACATACACACATAATAGTAAGAAGTGTGAGAACATGGTCATATAATTTTTGTTAAATAAATGCCTACAAAATTTATTGTAAGGATATTTTATTCAAATATAGTTTTATTCATATAATGAAGTGGTGGTATTTTGATACGATTTTAAAGTTAAATTTAATGAAATTATTTAGATTTTTTTTATAAAATTGTGTCAATACGACAATTTGTCGAACTTCAAATATTTTTTTAAAATTATATTATCTTTATAATTTCAAAAGCAAATTATCTCAAATTAGTACAAAAAGTAGAGATGAAAAAACAAAATGTTGTGCCAGTGCTTTTAAATATGAAAAATTATATTTTGATGCCATCTTACAAACAAAAACCTATTTCACAATTAGTTTTATAATGTAACAATAAATATTAATATTTTAATTAAAAAAATGAAAATATATTATTAAAATATGAATATAATAAATTGTTTTAAGGTGTCAAAATATAAATGCTTTTAAATATATTGTGAGATCAAAGAATAAAAATTAAATATTAAAATATTTTAGTCTCTGCTATTGCTAGGAGTAAAATATTGTTTGATTGGTTAGCCTTACCTGGTCCAACAAACCGGATTAGTAAAACCACTTAGAAAAATAAAATAAAAGGATAAGCAGAAACAGTGCATCAATAATTTTCATATGAGAAATCTGCCTCTAATTATGCATTTTTAATGTAGAATGTCAAAATGTAGCAGTATAATTAATTAATGTTCTAGAGTCATAGTGTTTATGAGAAAAATCAAATATACTTCTGGGAAATTTCAATGCATGAATGAGTTTATTAACTGAAATTCTGACGCAGTCAAGGTGTTTGAAAAGTCTTCGCTATGACTAGGAAAATACAATACACAGCAACTTATTCCGATGTTGCTTTTGGCAAGCACGTCATGATATTAATTCTTGATCTTTGAGATTTCAATAGAGGCAAACTTCTGCAGAAAGTGAAAACTCAAATATGAACCATGCCTCAATTTGTCCATTTTACTAGTTCTGTTGTACTCCTATGTGTCTACAAAAATGAAGCCTACCTCAAGAAATTATTATCCTCTTGTTTTCTTTGGGTCATTATTCTGTCTCTTTATGGCCAGATTTGGTGCTGAAAGTGACATTTATTGCTTGCAAACTATCAAGAAC


Gene Sequence:
>Vu_23878(-)
ATGGACACTTCTGATCTCTTATCTAGCTGGGATTTCGAGAGCAACACCGAGCGTGGCATATGCAGATTCGGCGGTGTTGAATGCAGCAGCAACTATGTGGAAGATAGAGTAATCGGTATATGGCTATCTAACATGGGGCTGAAGGGTCAGTTTCCTCGTTGCATCGAGGATTTCATATGGTTGCAGACTCTGATCCTCTCACACAACGACCTTTCTGGATATATCCCAAACGATATATCAGCCAAGCTGCCATATCTGACCACACTTGATCTCTCAAATAACTATTTCTCTGGTGAAATTCCAAAGGGTATTGCCAATTTGTCAGGCTTAATTACCCTTCTACTTGATGGCAACCGGTTAACAGGCCAAATCCCACAAGATCTTGGGTTGCTTCCCAGGCTGAGAGATTTCAGTGTTGCAAATAACTTGTTGGAAGGGTCAGTGCCTGTTTTTGTGAACAATCTTAATGTGAGTTTGAGCTATGCAAATAATAGTGGACTCTGTGGGGGAATACTAGGAAACTGTGATGAGAGCTTGTTTGGTAGATCGTTCTGGTATAGTTTTATTGTTGCTTTTGCTTGCTCAGCTACTTCTGTTCTAGTTTCTTTCATGTACTATTATGCACCTTGGACAGAATTCAAAAAGAGGAGGAGTAACGCTATTCATCCCCTAGTCAAGAAGCAGAACACTGAACAAGAAGCTGACTTGCTACCACTGGCCTTTCATGAGCAAGGAAGCAAAGAGGTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCAGTTGTGTGAGCCGACTATATTTGATATCAAACAAAGTCACAAATATTAAATGAACAAATGTTCAAGTTATTTAAAAAAAAAACCACAAAGATTGGAAACACTTCTGTTGTCTCGATCACACCACTTTTCTTATAATTAAGAAATTCTAAGTTGCAGTTTGTCTCTTATATCAAAGTCATATATATGTATTACATATTTACCTTCAAAATTTAACTGCCATGCATGATACGGGCTGATGTATAGTGTTACATTACATCATCTACAGCTATCAATATTGTTGGAGAGATTTATTACTAGAATGAGCTTCAAGGAATTATGCAAGGCAACCGATTACTTTTGCATTGATAACGTGTTGGGGATAGGAAAGACAGGGATTATGTACAAGGCAAAGGTATCAAATAGTTGTATTCTGGCAGTTAAGAGACTGTATGATGCTGATAAGTACAAGTGGAAATTCTTACTTGAAATAATGATTCCGGGAAGACACAGGCACAGAAACATAGTTCTACCGCATGGATTCTGCATAGAGAAACATGAAAGGGTTTTGGTGTATGAGTACATCTCTAATGGAAGACTCAGTGATTGGTTACAATCTGACGAGGGACATCAACCAACAAAATTAGAATGGTCCGAGAGGATTCACATTGCACTTGGGATTGCAAGAGGTTTATCTTGGCTCCACAAAAGGTGCAACATAGTCCACCTCAATTTAGATTCGGAGTGTGTCTTGCTGGACAAGTACTTTGAGCCAAAAATTTCGAATTTTGGCAAGGCGAAATTCCTAAACCAGACTGTTGAAGATCATGTGAGGATGAAATTCTTTTTGGTTGATAGACTTGGAGTGAAGGGTTATGCTGAGAAGGATGTCTATGATTTTGGAATAATCCTTTTTGAACTTTTAACGGGGAAAAGACTAAGTCCATCCACTGATTCTTCTGACAGTATTAATGGCCATTTGATGAAGTATATCAGTAAGAACTTCTTCACTGATCCTGCTGACTTTTATGATGCCATTGACGATTCTATAATGGGGAAGGGTTTTGATGATAAAATCCTACGTCTTCTTGAAGTTGCATGTGACTGTGTTAAGACATCTCTAAAGCAAAGGCCAAAGATGGTTGACATTCACCAAACTATAAGAGCTATGTGGGAGGGCTACAAACCCTGCTTTCATTCTGAAAGTCTGACAGTAAAAATAAAATAAAATAAATTATATATATATATATATCAGACTAATCTCAGTTCTTAATCAGATACGTAAGATCTCAAATAAATCCATGAAGGTGTGAGAGGACGGAAAACTGAGATGACTTTTTCATTGTTTACGTAAATTACAAGTCTTCTATATTTTAAAACTTACAACTAGTTTAGCATGAGTGCTAGAGAAATAGTAAGGAAATTAAAACCGCTGCTAAAATGATAATTAAGAGCCTCAATGATACAGATAACTAATTTTAATGAAAACAACTTTGGCTCTAATTACAATTCTTCTTAGTATTTATAATATTAAAATATAGCAGTGGCTGATGTTGTAGCCATAGAGTGGGCCAGCGTGGCGAAAATTCAAATTGAAGTTCTAGAAATTTGGTACGAGGTTTTATCCACTTTATTTATTAAGGAGAAATCAAAACTATGAAACGATCATCGCGATAATTTGGAATTTGGCTGATAAAACTGACTAAGAAATTACAATGGAGCACTTCAAAAGTGAAAGTCAATTAAACTTATTTTTTTTATATTTTTTACATGCATGCCATAATATTTATAACATTAAGGGTGATAACCTAATTAACCTTAATTATTGGTTAATTTATTAAGATTCCTGCACTCCATCAAATTTCTTCAACCACCCTATCATTTTGGATGGATAAGAAATTTGATAGGGGTGTAGAAAGCAATCCTCTTTGATAAAACGGTGATTTGAGCCTGTTTTGGTGACGGATTAGAAATTTTGTCTCGTTAGAGGTTGGGTTTGCGGACTGATCCTTTATATTTTTTTTATTTAAAAATACGTGGTCGTCCACTTTGGTACCAAAATTCTAGTGGCTGTTTTATCTTATACCTCTAATGATTTTATCCTGAATCTCCAATTTCCGAAAAATATTCTAATTTCGAGAATTGATTTGAACATGGTTACACTAAAATAAAGGCATTCCAAAATGTTGCCATGGATAAATTATAAAAGATTTAATTAATTATAATAATAGATTAAAGTGATTCCACTAGTCTCCATCATTTTAAACTTAGACAGTAATACGAAGTTCTTTCGTAAACCTCCCAAAGAATCAAACTTGAAATCACTACAAAGCAACCTTGACCACGTATCTATTATTCGAAATCTTTCCCTCTAAGATGACGTTGTTTTTGGGAATACAAATGCAAACCATAGGACAAGGATGTTGTAATCACAAATCTTTGCTTTGTACGATCATCGGGTATGGTGATCATTTCAAAATCTTTGCTTTGTACCATCGTCGGGTAATCACAGGACAAGATGATACACAAGAAATGTGGCAAGATTCGATCCAAAAGCCGTCCAACCCTGCCCCTGAGCTGCTGGGTTGGGTGGCAAGGTTAGCATCCCTTCGTCGCCACTTACCCAAAGGCAAGACATTGCTTTCTTTGACACTGAGACAAGAACTGCTGAGGTAATTGGAAGAATGTCTGCCGAAACCACTCTCATTCAAGATTCCATTGGAGAAAAGGTATATCATACTCAAGAAAATATTAGCTGTTATTTTGCTACATGATCTGCGAGCCTTACATTAACTAGTCTAGAAAATTTTAACAGTGATGATAAGGATTCAAAAACACTGGTAATGAGGAAAATTAAATATCAAACTGTTTGTTTGTGTAAAAGCAGTTTTGATCCGTTTTCTATATCTTATTAAGGTCCATTTTCTGCGACATCTTGGAACAAGATATTCACATGCTTGAGTTAATCAAGGATGTCGATGGTACTTGTTCTCAGATTCTTCGCCTACAGGAAGGAGATAAGGAAGCGAAGGTAGTCAAGCAACAATGTTGATTTAGATAGTCACAGATCTTCCACCCAGAAATAAGTTTCAATGAAAGGTTCATCGGGTAGACACTCCCAGTCGCATAGCTTTGCTCTTTCTCCTTCTCATCGAAGTGGGGGTACATGAGTCTATAGAGAGAAGATGTTTGACCTAAGAAGCCAATAAAGAATTCTTTGAGACGTTTGACCTACTTAACAAGCCTGAAGTTCCTGTCCTAGTTCTCGGATACATTGCTGCGATTATACTTATACAAGGTCTTGTGGTCCCTATGCTTGGCTTCTTGTTTTACTCATCAATATCTATGTTCTTTGAACCTCCAGAAAAAACAGTGGAAAGATTCTAGGTTCGGGACATTCTACACGACGGTTTGAGTTCAGTTACCCTTGTGGCCTTGATTGTGCAAAATTACTTCGTTAGCATTGCTGCGGGAAAATGAGTAGAAAGAATTCATTCACTAACATTTGAAAAGGTTGTGCATCAAGAAATCAGTTGGTTTGATGATCCTGCAAATTCAAGATATTTTTAGCAAGATATTTTAATTATCATGTTTTGCAGTTTCTTATACCGATCAACTAAGGAAACCATTCACTTTCCTGTGGTGGAGTTAGTGCAAGGTTGTCTACTGATTCTTCAACAGTGAAAAGTCTAGCTGGTGACACATAGGCTCTCATTGTGCAAAACTTATCAACAGTAATGGTTGGTCTAGTTGTATCAGTCAATGCTAATTGGATTTTTGTTTTCAAAATTCAGGCTTTCACCCTTGGTCCTATTGCAAGGATTTCTTCAGATGAAGTTTCTTAAAGGATTCAGTGCAGATCCAAGGTTAGTGTTCCTTTCGATTTGCTTAAAATTATGCATTATGGAATATGAATGGACATCAAGAGAATCTTGTCAGCTGTATAGGTAAAGCGTGAAGGGGCAAGTCAGGTGGCAAATGATGCTGTTGGTAGCATCAGAACCATAGCAACATTTGTGCTTAATCAAAGATAATGGACGTGTACAGGAAGAAATGTCTAGAGCCAGAAAAACAAGGGGTTCACTTGGGGCTTGTGAATGGTGCAGGATTTGCTTTCTCTACTCTGGCTCTGTAA