Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_23855 LG5 69199618 69202882 PREDICTED: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g27290 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 69199680 synonymous_variant p.Phe21Phe
C/T 69199835 missense_variant p.Pro73Leu
A/T 69199848 synonymous_variant p.Val77Val
A/C 69200476 missense_variant p.Ser287Arg
G/T 69200503 missense_variant p.Ala296Ser
G/A 69200615 missense_variant p.Gly333Glu
T/C 69201160 missense_variant p.Phe443Leu
G/T 69201650 upstream_gene_variant
C/T 69201938 upstream_gene_variant
A/C 69201992 upstream_gene_variant
C/T 69202311 upstream_gene_variant
T/C 69202440 synonymous_variant p.Cys594Cys
A/G 69202574 upstream_gene_variant
G/T 69202611 missense_variant p.Arg623Met
T/C 69202616 synonymous_variant p.Leu625Leu
T/A 69202652 missense_variant p.Ser637Thr
T/C 69202708 synonymous_variant p.Leu655Leu
A/T 69202713 missense_variant p.Glu657Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_23855.1
MEKTKFTLLFLVTCCYFLSLFPTALEAEDEITPPQTISGNQTLVSPSQNFELGFFSPGNSTHIYLGIWYKRIPNKTVIWIANRDKPLVNSGGSLAFSDDGKLILLSHTGGVAWSSNSSGPAKNPVAQLLDSGNFVLKDYGNERYLWESFDYPSDTLIPGMKLGWNFKTGLNRHLTSWKTTFDPSSGEYTYSVDPRGLPQLFLHRGNKQIFRSGPWYGQQFKGDLALSANPVFKPIFVFDSDEVSYSYETKDTIISRFVLSQSGLIQHFSWNDHHSSWFSEFSVQGDSCDDYGLCGAYGSCYINSSPICKCLKGFEPKLPQEWERSVWSDGCVGKDTQVCSNGDAFQQFTGMKLPDAAEFRTNYSISIDHCEKECSKNCSCVGYAKLDINASGKGCIAWFGDLLDIREVSVNGQDFYLRVAASEVGKNIKGSNADGSKRKKIILFPVAASVTSTIIVSAFWLIIKKCRRNGAAKQTGSQFSVGRVRSERNEFELPIWKTRLDIIIGIARGILYLHRDSRLRIIHRDLKASNVLLDGEMNPKISDFGMARMFGGDQTEAKTKRVVGTYGYMAPEYAIDGHFSFKSDVYSFGVLLLEVLSGKKNKGFFHPDHKLNLLGHAWKVWNEERALELMDPLLEGEFSTCEALRCIKVGLSCVQQLPEDRPTMSSVVLMLDSENVLIPQPGRPGIYSERFFSQSNSSSHAASNHTTVTSLEGR*


CDS Sequence:
>Vu_23855.1
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Promoter Sequence:
>Vu_23855::LG5:69197618-69199618(+)
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Gene Sequence:
>Vu_23855(+)
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